High-throughput sequencing of cDNA (RNA-seq) is a widely used method that allows for transcriptome profiling and annotation. However, questions about the accuracy and performance of different protocols and platforms remain. To address this issues, synthetic RNA controls can be used as spike-in controls. Jiang et al. in 2011 reported the use of a pool of 96 synthetic RNAs with various lengths, and GC content covering a 220 concentration range as synthetic RNA spike-in controls to measure sensitivity, accuracy, and biases in RNA-sequencing experiments. The standard curves for quantifying the abundance of transcripts were also derived. The linearity between read density and RNA input over the entire detection range was observed as well as excellent agreement between replicates. However, the researchers observed a significantly larger imprecision than expected under pure Poisson sampling errors.
In summary, synthetic RNA controls are very useful to allow the evaluation of reproducibilities of RNA-based assay protocols. Ussing synthetic RNA controls allows to determine biases due to GC content, transcript length, and heterogeneities in coverage across transcripts. In addition, synthetic RNA controls can help establishing the limits for RNA-sequencing discovery experiments. Furthermore, synthetic RNA controls, when used externally, allow evaluation of the sensitivity and accuracy of RNA-sequencing based transcriptome analysis. {Jiang et al., 2011; Genomic Research 21:1543-1551}
The following is a list of synthetic constructs used for the experiment derived from the genbank.
Results of BLASTN 2.2.23+ Query for the constructs:
Query= ERCC-00002_genbank |92111308|gb|DQ459430.1|
Synthetic construct microarray control MC28 mRNA, complete sequence
Length=1134, Subject= ERCC-00002, Length=1061
Score = 1919 bits (1039), Expect = 0.0
Identities = 1055/1062 (99%), Gaps = 3/1062 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 69 TCCAGATTACTTCCATTTCCGCCCAAGCTGCTCACAGTATACGGGCGTCGGCATCCAGAC 128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCCAGATTACTTCCATTTCCGCCCAAGCTGCTCACAGTATACGGGCGTCGGCATCCAGAC 60
Query 129 CGTCGGCTGATCGTAGTTTTACTAGGCTAGACTAGCGTACGAGCACTATGGTCAGTAATT 188
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CGTCGGCTGATCGTGGTTTTACTAGGCTAGACTAGCGTACGAGCACTATGGTCAGTAATT 120
Query 189 CCTGGAGGAATAGGTACCAAGaaaaaaaCGAACCTTTGGGTTCCAGAGCTGTACGGTCGC 248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CCTGGAGGAATAGGTACCAAGAAAAAAACGAACCTTTGGGTTCCAGAGCTGTACGGTCGC 180
Query 249 ACTGAACTCGGATAGGTCTCAGAAAAACGAAATATAGGCTTACGGTAGGTCCGAATGGCA 308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ACTGAACTCGGATAGGTCTCAGAAAAACGAAATATAGGCTTACGGTAGGTCCGAATGGCA 240
Query 309 CAAAGCTTGTTCCGTTAGCTGGCATAAGATTCCATGCCTAGATGTGATACACGTTTCTGG 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CAAAGCTTGTTCCGTTAGCTGGCATAAGATTCCATGCCTAGATGTGATACACGTTTCTGG 300
Query 369 AAACTGCCTCGTCATGCGACTGTTCCCCGGGGTCAGGGCCGCTGGTATTTGCTGTAAAGA 428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AAACTGCCTCGTCATGCGACTGTTCCCCGGGGTCAGGGCCGCTGGTATTTGCTGTAAAGA 360
Query 429 GGGGCGTTGAGTCCGTCCGACTTCACTGCCCCCTTTCAGCCTTTTGGGTCCTGTATCCCA 488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGGGCGTTGAGTCCGTCCGACTTCACTGCCCCCTTTCAGCCTTTTGGGTCCTGTATCCCA 420
Query 489 ATTCTCAGAGGTCCCGCCGTACGCTGAGGACCACCTGAAACGGGCATCGTCGCTCTTCGT 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ATTCTCAGAGGTCCCGCCGTACGCTGAGGACCACCTGAAACGGGCATCGTCGCTCTTCGT 480
Query 549 TGTTCGTCGACTTCTAGTGTGGAGACGAATTGCCAGAATTATTAACTGCGCAGTTAGGGC 608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TGTTCGTCGACTTCTAGTGTGGAGACGAATTGCCAGAATTATTAACTGCGCAGTTAGGGC 540
Query 609 AGCGTCTGCGGAAGTTTGCTGCGGTTTCCGCCTTGACCGCGGGAAGGAGACATAACGATA 668
|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AGCGTCTGAGGAAGTTTGCTGCGGTTTC-GCCTTGACCGCGGGAAGGAGACATAACGATA 599
Query 669 GCGACTCTGTCTCAGCGGATCTGCATATGTTTGCAGCATACTTTAG-TGGGCCTTGGCTT 727
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 600 GCGACTCTGTCTCAGGGGATCTGCATATGTTTGCAGCATACTTTAGGTGGGCCTTGGCTT 659
Query 728 CCTTCCGCAGTCAAAACCGCGCAATTATCCCCGTCCTGATTTACTGGACTCGCAACGTGG 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CCTTCCGCAGTCAAAACCGCGCAATTATCCCCGTCCTGATTTACTGGACTCGCAACGTGG 719
Query 788 GTCCATCAGTTGTCCGTATACCAAGACGTCTAAGGGCGGTGTACACCCTTTTGAGCAATG 847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GTCCATCAGTTGTCCGTATACCAAGACGTCTAAGGGCGGTGTACACCCTTTTGAGCAATG 779
Query 848 ATTGCACAACCTGCGATCACCTTATACAGAATTATCAATCAAGCTCCCCGAGGAGCGGAC 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 ATTGCACAACCTGCGATCACCTTATACAGAATTATCAATCAAGCTCCCCGAGGAGCGGAC 839
Query 908 TTGTAAGGACCGCTGCTTTCGCTCGGGTCTGCGGGTTATAGCTTTTCAGTC-CGACGGGC 966
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 840 TTGTAAGGACCGCCGCTTTCGCTCGGGTCTGCGGGTTATAGCTTTTCAGTCTCGACGGGC 899
Query 967 TAGCACACATCTGGTTGACTAGGCGCATAGTCGCCATTCACAGATTTGCTCGGCAATCAG 1026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TAGCACACATCTGGTTGACTAGGCGCATAGTCGCCATTCACAGATTTGCTCGGCAATCAG 959
Query 1027 TACTGGTAGGCGTTAGACCCCGTGACTCGTGGCTGAACGGCCGTACAACTCGACAGCCGG 1086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 TACTGGTAGGCGTTAGACCCCGTGACTCGTGGCTGAACGGCCGTACAACTCGACAGCCGG 1019
Query 1087 TGCTTGCGTTTTACCCTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 TGCTTGCGTTTTACCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1061
Query= ERCC-00003_genbank |103488731|gb|DQ516784.1|
Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-67 genomic sequence
Length=1000 Subject= ERCC-00003 Length=1023
Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGCGATTAAGGCAGAGGCGTTTGTATCTGCCATTATAAAGAAGTTTCCTCCAGCAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CAGCAGCGATTAAGGCAGAGGCGTTTGTATCTGCCATTATAAAGAAGTTTCCTCCAGCAA 60
Query 61 CTCCTTTCTTAATTCCAAACTTAGCTTCAGTTATAAATTCCCCTCCCATGATTGGGATTT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTCCTTTCTTAATTCCAAACTTAGCTTCAGTTATAAATTCCCCTCCCATGATTGGGATTT 120
Query 121 TATAAACTTTTCTTCCATATAATTCATCTTTCTTCTCATAACCGTCTCCGAAAAACTTCA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TATAAACTTTTCTTCCATATAATTCATCTTTCTTCTCATAACCGTCTCCGAAAAACTTCA 180
Query 181 ACTTAAATCCAACCTTTAACTGCTCATCAGCCATGTCTCCCATAGCATCAAAAATAGCAG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ACTTAAATCCAACCTTTAACTGCTCATCAGCCATGTCTCCCATAGCATCAAAAATAGCAG 240
Query 241 TTGTTGGACATGTTAAGACACACTGCCCCAATCTCTCTAACATTTGATGCTCTAACTCTG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TTGTTGGACATGTTAAGACACACTGCCCCAATCTCTCTAACATTTGATGCTCTAACTCTG 300
Query 301 ACTTTTTAGGGTGGCATATCTGTATTATAAATCCTGGTCTTCCATCTGGTGTTTTTGATG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ACTTTTTAGGGTGGCATATCTGTATTATAAATCCTGGTCTTCCATCTGGTGTTTTTGATG 360
Query 361 GAGGGACATATTTCTCAATTCCTGCTTCTGCTGGACACATTATAACTGAACAACCAAAAC 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAGGGACATATTTCTCAATTCCTGCTTCTGCTGGACACATTATAACTGAACAACCAAAAC 420
Query 421 CTGTTGCCTCTGTAGCTGCAATCTTAGCCCACTTCTTTGTAGCTGCTGTTATTAAAACTC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CTGTTGCCTCTGTAGCTGCAATCTTAGCCCACTTCTTTGTAGCTGCTGTTATTAAAACTC 480
Query 481 TTGAAACCCATATTGGGAATGCTTCTGCAAATGTATCTTCAATATATACTCCATTTATTT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TTGAAACCCATATTGGGAATGCTTCTGCAAATGTATCTTCAATATATACTCCATTTATTT 540
Query 541 CCATAGTTTCCCTCCATTAAGATTTTAACAATTATAGTTTATCTTAGGGGCTATTAATAT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CCATAGTTTCCCTCCATTAAGATTTTAACAATTATAGTTTATCTTAGGGGCTATTAATAT 600
Query 601 CTTATCATTTGGtttttaatattcgataaatccataaataaaaatatatcaacaataatt 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CTTATCATTTGGTTTTTAATATTCGATAAATCCATAAATAAAAATATATCAACAATAATT 660
Query 661 ttaaataatctaagtataggtaatataacaattaaaaaGATTTAGAGGGATAGAATTGAA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TTAAATAATCTAAGTATAGGTAATATAACAATTAAAAAGATTTAGAGGGATAGAATTGAA 720
Query 721 CGGCATTAGGAGAATTGTTTTAGATATATTGAAGCCGCATGAGCCAAAAATAACAGATAT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CGGCATTAGGAGAATTGTTTTAGATATATTGAAGCCGCATGAGCCAAAAATAACAGATAT 780
Query 781 GGCATTAAAATTAACATCATTATCAAACATTGATGGGGTTAATATTACAGTCTATGAAAT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GGCATTAAAATTAACATCATTATCAAACATTGATGGGGTTAATATTACAGTCTATGAAAT 840
Query 841 AGATAAAGAGACTGAGAATGTTAAAGTTACAATTGAAGGGAATAATTTAGATTTTGATGA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AGATAAAGAGACTGAGAATGTTAAAGTTACAATTGAAGGGAATAATTTAGATTTTGATGA 900
Query 901 GATTCAGGAAATTATTGAAAGTTTGGGAGGGACTATTCACAGTATAGATGAGGTTGTTGC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GATTCAGGAAATTATTGAAAGTTTGGGAGGGACTATTCACAGTATAGATGAGGTTGTTGC 960
Query 961 AGGTAAAAAGATTATTGAAGAAGTTAGAACACCACAAGAT 1000
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 961 AGGTAAAAAGATTATTGAAGA-GTTAGAACACCACAAGAT 999
Query= ERCC-00004_genbank |103488699|gb|DQ516752.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-35 genomic sequence
Length=500
Subject= ERCC-00004
Length=523
Score = 917 bits (496), Expect = 0.0
Identities = 499/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCTTGCTTCAACAATAACGTCTCTTTCAGAAGGCATTGGTATCTTTTCCCCACTTCCAAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCTTGCTTCAACAATAACGTCTCTTTCAGAAGGCATTGGTATCTTTTCCCCACTTCCAAG 60
Query 61 CATTTTTTCAACTAATCTTATGTTATTAACCATTTCCTTAAATTCTTCTGGGTCTGCTGA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CATTTTTTCAACTAATCTTATGTTATTAACCATTTCCTTAAATTCTTCTGGGTCTGCTGA 120
Query 121 CAAAGCATGATCAGGACCTTCCATATTTTTATCTAAGGTAAAGTGCTTCTCAATAACATC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CAAAGCATGATCAGGACCTTCCATATTTTTATCTAAGGTAAAGTGCTTCTCAATAACATC 180
Query 181 CGCTCCTAAGGCAACAGAAACTACTGGGGCGAGTATTCCCAATGTATGGTCAGAATATCC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CGCTCCTAAGGCAACAGAAACTACTGGGGCGAGTATTCCCAATGTATGGTCAGAATATCC 240
Query 241 CACAGGGATATTGAATATACTTTTCAAGGTTTTAATAGCGTTTAAATTGACATCTTCATA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CACAGGGATATTGAATATACTTTTCAAGGTTTTAATAGCGTTTAAATTGACATCTTCATA 300
Query 301 AGGGGTTGGGTAAGATGAAATACAATGCAATAAAATAATATCCCTGCATCCATTATTTTC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AGGGGTTGGGTAAGATGAAATACAATGCAATAAAATAATATCCCTGCATCCATTATTTTC 360
Query 361 TAAAACTTTAACTGCTTCCCAAATTTCCCCAATATCAGACATTCCTGTAGATAAAATCAC 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TAAAACTTTAACTGCTTCCCAAATTTCCCCAATATCAGACATTCCTGTAGATAAAATCAC 420
Query 421 CGGCTTGCCTGTTTTTGCCACTTTTTCTAATAAGGGATAAAAGGTTAAATCACCAGAGGC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CGGCTTGCCTGTTTTTGCCACTTTTTCTAATAAGGGATAAAAGGTTAAATCACCAGAGGC 480
Query 481 AATTTTAAATGCAGGCACAT 500
|||||||||| |||||||||
Sbjct 481 AATTTTAAAT-CAGGCACAT 499
Query= ERCC-00007_genbank |116733904|gb|EF011068.1| Synthetic construct
spike-in microarray control hypothetical protein (ysdC) gene,
complete cds
Length=1121
Score = 2052 bits (1111), Expect = 0.0
Identities = 1111/1111 (100%), Gaps = 0/1111 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 TTTATTGGTACGTAATTTCGTCAACCGTTTTTCGGTCTAACTTCTTAATGACTTCTGTAA 69
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTTATTGGTACGTAATTTCGTCAACCGTTTTTCGGTCTAACTTCTTAATGACTTCTGTAA 60
Query 70 TTAACTTTACCGCGTTTTCATAATCATCACGATGCAGCATGGCCGCGTGCGTATGAATGT 129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTAACTTTACCGCGTTTTCATAATCATCACGATGCAGCATGGCCGCGTGCGTATGAATGT 120
Query 130 AGCGGGTTGCAATGGTAATGGACAGCGCAGGAACGCCATTTGCCGTCAAATGGATGGCAC 189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AGCGGGTTGCAATGGTAATGGACAGCGCAGGAACGCCATTTGCCGTCAAATGGATGGCAC 180
Query 190 CCGAATCAGTTCCGCCGCCGGCAATGGCATCAAATTGGTACGGAATGCCGGCTTCCTCCG 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CCGAATCAGTTCCGCCGCCGGCAATGGCATCAAATTGGTACGGAATGCCGGCTTCCTCCG 240
Query 250 CAGTGGCTACAACTGCATCGCGCAAACCTTTGTGAGAGACCATGGATGCATCGTAAACGA 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CAGTGGCTACAACTGCATCGCGCAAACCTTTGTGAGAGACCATGGATGCATCGTAAACGA 300
Query 310 TAATCTGCGGGCCTTTGCCCATTTTGCTCTGCGCTTCCTTCTCGGAAATGCCAGGCGTGT 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TAATCTGCGGGCCTTTGCCCATTTTGCTCTGCGCTTCCTTCTCGGAAATGCCAGGCGTGT 360
Query 370 CTCCTGCTATCCCTACATCAACACCAAACGCAATATCAGGCTGAATGGTGTGTGCAGCCG 429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTCCTGCTATCCCTACATCAACACCAAACGCAATATCAGGCTGAATGGTGTGTGCAGCCG 420
Query 430 TTTTCGCTCCCCTCAGCCCGACTTCCTCCTGCACGGTTCCGACGCCATACACTATATTTG 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TTTTCGCTCCCCTCAGCCCGACTTCCTCCTGCACGGTTCCGACGCCATACACTATATTTG 480
Query 490 GATGATCTGTGTTTTGTAAGTTTCTTAACACATCAATAGCAATCGCACAGCCGATGCGGT 549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GATGATCTGTGTTTTGTAAGTTTCTTAACACATCAATAGCAATCGCACAGCCGATGCGGT 540
Query 550 TGTCCCAGGCCTTTGCGAGTAGGAATTTTTCATTGTTCATGACCGTAAATTCAAAATGCG 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TGTCCCAGGCCTTTGCGAGTAGGAATTTTTCATTGTTCATGACCGTAAATTCAAAATGCG 600
Query 610 GAACGATCATATCTCCCGGAAGTACACCCCACTCCAAGGCTTCTTCCCGGCTTGAAGCTC 669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GAACGATCATATCTCCCGGAAGTACACCCCACTCCAAGGCTTCTTCCCGGCTTGAAGCTC 660
Query 670 CAATATCAATAAACATGTCTTTTATTTCCACTGAtttttttCTTGCTTCAGGAGACAAAA 729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CAATATCAATAAACATGTCTTTTATTTCCACTGATTTTTTTCTTGCTTCAGGAGACAAAA 720
Query 730 TATGAGGCGGCTTAGATCCGATAACCCCTGTGATTTCTCCtttttttGTGACAATGGTGA 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TATGAGGCGGCTTAGATCCGATAACCCCTGTGATTTCTCCTTTTTTTGTGACAATGGTGA 780
Query 790 CGCGCTGAGCAAGCATAACCTGAGCCCACCAGCCGCCAACGGTTTGAAAACGGATAAAGC 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CGCGCTGAGCAAGCATAACCTGAGCCCACCAGCCGCCAACGGTTTGAAAACGGATAAAGC 840
Query 850 CTTTATCTGTGATTTGTGTCACCATAAAGCCGACTTCATCCAAATGTCCGGCGATCATAA 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CTTTATCTGTGATTTGTGTCACCATAAAGCCGACTTCATCCAAATGTCCGGCGATCATAA 900
Query 910 TTTTCGGGCCGTTTTCTGCACCAGttttttttGCAATTAAACTGCCCAGGCGATCTGTTG 969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TTTTCGGGCCGTTTTCTGCACCAGTTTTTTTTGCAATTAAACTGCCCAGGCGATCTGTTG 960
Query 970 TCACCTCATCAGCAAATGGTTCTATGTATGATTTCATCACTTGCCTTACTTCTCTTTCAT 1029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TCACCTCATCAGCAAATGGTTCTATGTATGATTTCATCACTTGCCTTACTTCTCTTTCAT 1020
Query 1030 TGCCCGGTATGCCTTTTGCATCTGTTAAATCTTTCAGCATGGTCAATGTTTCATCTAATT 1089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TGCCCGGTATGCCTTTTGCATCTGTTAAATCTTTCAGCATGGTCAATGTTTCATCTAATT 1080
Query 1090 TTGCCATGTTCCAAACCCTCCTTGAGCTCGG 1120
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 TTGCCATGTTCCAAACCCTCCTTGAGCTCGG 1111
Query= ERCC-00009_genbank |110339337|gb|DQ668364.1| Synthetic construct
clone TagJ microarray control
Length=960
Subject= ERCC-00009
Length=984
Score = 1773 bits (960), Expect = 0.0
Identities = 960/960 (100%), Gaps = 0/960 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAATGATAGGCTAGTCTCGCGCAGTACATGGTAGTTCAGCCAATAGATGCCTAGTACGCT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 984 CAATGATAGGCTAGTCTCGCGCAGTACATGGTAGTTCAGCCAATAGATGCCTAGTACGCT 925
Query 61 GACGGCATTCAGAGTACGCTGATCGGCTTATGACGTATGTGACGCAGCTCTTAGCGCAAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 GACGGCATTCAGAGTACGCTGATCGGCTTATGACGTATGTGACGCAGCTCTTAGCGCAAT 865
Query 121 GTATGTGCTGTTATCGAAGCCTATGGCTGAGTATGTAACGCTATGGCGTGCTAGTCGTCT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 864 GTATGTGCTGTTATCGAAGCCTATGGCTGAGTATGTAACGCTATGGCGTGCTAGTCGTCT 805
Query 181 CATATACGTCTGATGACCTCGTATCATGTTATAGGGCTGCGAACTGTCGATGATGGTCAC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 804 CATATACGTCTGATGACCTCGTATCATGTTATAGGGCTGCGAACTGTCGATGATGGTCAC 745
Query 241 GACTCTGTCGATAGCTGTGTGACTCATTCAGAAGGTGTGCAGCCTATATGATACGCAGTC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 744 GACTCTGTCGATAGCTGTGTGACTCATTCAGAAGGTGTGCAGCCTATATGATACGCAGTC 685
Query 301 GCATCCTATCTTACGTGTCAGTACTATGTGTGAGTGCTCCGCCCTAGTGCTGATGTATGC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 684 GCATCCTATCTTACGTGTCAGTACTATGTGTGAGTGCTCCGCCCTAGTGCTGATGTATGC 625
Query 361 CCCATAGTGCTCAGTGGAGTCTCTCTTAGCATAGTGTCCGCTCATACATTAGATGGACGG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 624 CCCATAGTGCTCAGTGGAGTCTCTCTTAGCATAGTGTCCGCTCATACATTAGATGGACGG 565
Query 421 CTCATTAGTATCATCGTCGGCTGATATAGGTCGTGGCTCCCTGTATATCGAGGTGAGTCT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 564 CTCATTAGTATCATCGTCGGCTGATATAGGTCGTGGCTCCCTGTATATCGAGGTGAGTCT 505
Query 481 ATCTGGATCAACGTCGCACTATGATGTGCAAAGTGTCGTCCATGTATAGACAGTGCGCGT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 504 ATCTGGATCAACGTCGCACTATGATGTGCAAAGTGTCGTCCATGTATAGACAGTGCGCGT 445
Query 541 ATCATATAGGATGCGGCGATCTCATACAGCGTTACGGTCGCTGCGTACTGTATAAGGATG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 ATCATATAGGATGCGGCGATCTCATACAGCGTTACGGTCGCTGCGTACTGTATAAGGATG 385
Query 601 CTCTGTGAACTGTCATCGGTCCGATCAATTAGTCTAGTGTGCGTTATTCAGATCGAGTGA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 CTCTGTGAACTGTCATCGGTCCGATCAATTAGTCTAGTGTGCGTTATTCAGATCGAGTGA 325
Query 661 GTACATGATTCGTCAGTGTGGATCAATTACAGTTAGGCCGCTGACACATTAGTAACGTCG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 GTACATGATTCGTCAGTGTGGATCAATTACAGTTAGGCCGCTGACACATTAGTAACGTCG 265
Query 721 GCAAGCACTTAGTCGTGTCGTAAGCCAGTGTGTCGTGTCTTAGACGACTGTGTGTGATTC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 GCAAGCACTTAGTCGTGTCGTAAGCCAGTGTGTCGTGTCTTAGACGACTGTGTGTGATTC 205
Query 781 TCGAGCGATTTATACATCCGTGACAGCGTTTATAGTGTGCTGACAGACTGGTTGGTTATC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 TCGAGCGATTTATACATCCGTGACAGCGTTTATAGTGTGCTGACAGACTGGTTGGTTATC 145
Query 841 CAATGATCGACCTGGAGTCTAATATCTGACCACGCCTTGTAATCGTATGACACGCGCTTG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 144 CAATGATCGACCTGGAGTCTAATATCTGACCACGCCTTGTAATCGTATGACACGCGCTTG 85
Query 901 ACACGACTGAATCCAGCTTAAGAGCCCTGCAACGCGATATACAGGCGCTGCTACCGATAT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 ACACGACTGAATCCAGCTTAAGAGCCCTGCAACGCGATATACAGGCGCTGCTACCGATAT 25
Query= ERCC-00012_genbank |114976952|gb|DQ883670.2| Synthetic construct
clone NISTag29 external RNA control sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00012
Length=994
Score = 1836 bits (994), Expect = 0.0
Identities = 994/994 (100%), Gaps = 0/994 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGAGAGATGTTTGTAGGTGCGGAATGTGTGCGGTCTACCTTAGCTGTAGTGTGCGATGAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CGAGAGATGTTTGTAGGTGCGGAATGTGTGCGGTCTACCTTAGCTGTAGTGTGCGATGAA 60
Query 61 CCTACACACAACGTGGTATAGTGGCCGATCTTAGAGTGATCCTATCACTCCTTACGCACC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CCTACACACAACGTGGTATAGTGGCCGATCTTAGAGTGATCCTATCACTCCTTACGCACC 120
Query 121 AGAAGGGATCTGCATACCAGGCGGAGAACTTGGAAGGCGGCTAGATCACTGAATTGCGGG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AGAAGGGATCTGCATACCAGGCGGAGAACTTGGAAGGCGGCTAGATCACTGAATTGCGGG 180
Query 181 AATCGGCATTTCGCATTCTTAGGATCTAAACCTTAGACCTCCGCGTGCGATTGCACCTGC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AATCGGCATTTCGCATTCTTAGGATCTAAACCTTAGACCTCCGCGTGCGATTGCACCTGC 240
Query 241 TTGGTACAGAGTTACAAGCCCCCCGCACTTTCTTTGCGGTCGTTAAGAGGGAAATCGCCC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TTGGTACAGAGTTACAAGCCCCCCGCACTTTCTTTGCGGTCGTTAAGAGGGAAATCGCCC 300
Query 301 AATTAGCAGAGTGTCAGGTGTTACGCGCGATTGAGCCGTCAGAAGAATCGATAGAGCCGC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AATTAGCAGAGTGTCAGGTGTTACGCGCGATTGAGCCGTCAGAAGAATCGATAGAGCCGC 360
Query 361 GTCGGGACCTTGATGGTATCTCTGCCTCAGCTAACCTGCTAGGTCCGTCCCCTGGGGATG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTCGGGACCTTGATGGTATCTCTGCCTCAGCTAACCTGCTAGGTCCGTCCCCTGGGGATG 420
Query 421 ATCAGGACTGCGGATAGTAAATTGCGGGTTTGAAGCCGGACTTGCCGCCTAGGCAAAGCA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ATCAGGACTGCGGATAGTAAATTGCGGGTTTGAAGCCGGACTTGCCGCCTAGGCAAAGCA 480
Query 481 CAAAAACATCGGACATGTAGAAGTCTCATCGAACTCCTTTCCCGTTCATGCAGATACTTC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CAAAAACATCGGACATGTAGAAGTCTCATCGAACTCCTTTCCCGTTCATGCAGATACTTC 540
Query 541 AACTGTGACTAGTGGGGTTCGGGAGCACCCGCACTACTTCATTCTTGGCGGTGGGCCACT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AACTGTGACTAGTGGGGTTCGGGAGCACCCGCACTACTTCATTCTTGGCGGTGGGCCACT 600
Query 601 TTATGTGACTGTACATGGGACTTCTACTCATACCAATGTAAAGTATAGTTAACGCCCTGT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TTATGTGACTGTACATGGGACTTCTACTCATACCAATGTAAAGTATAGTTAACGCCCTGT 660
Query 661 CCACTCTACTCAGGCGTAATCATCGCGGAAGGCTATCCACAGCCCATCAGCGGTCTACAT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CCACTCTACTCAGGCGTAATCATCGCGGAAGGCTATCCACAGCCCATCAGCGGTCTACAT 720
Query 721 GTCCCAGCAGATTCACCTGTCCTGCGGGTCCGCGTCACAGCCTATTCTGAGGCTCTAAAG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GTCCCAGCAGATTCACCTGTCCTGCGGGTCCGCGTCACAGCCTATTCTGAGGCTCTAAAG 780
Query 781 ACTATGCGAACCAGGTGTCCCAGTCGATCAGACGACGAAGTCGGGAAGGAAGCATGGATA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 ACTATGCGAACCAGGTGTCCCAGTCGATCAGACGACGAAGTCGGGAAGGAAGCATGGATA 840
Query 841 CCAAAAAGGCTTTATATACTGGGTTATCCTAGGGGATGTTTTTACCGGACTGGTCAGCCT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CCAAAAAGGCTTTATATACTGGGTTATCCTAGGGGATGTTTTTACCGGACTGGTCAGCCT 900
Query 901 CGGTGCGCTCGGCCTAGGCGCTTACTGCATGGGGGCTGTGGGCAATTTGGTATTTCTCAG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CGGTGCGCTCGGCCTAGGCGCTTACTGCATGGGGGCTGTGGGCAATTTGGTATTTCTCAG 960
Query 961 GACTATGGACaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 994
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GACTATGGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 994
Query= ERCC-00013_genbank |116733893|gb|EF011062.1| Synthetic construct
spike-in microarray control methionine aminopeptidase (map) gene,
partial cds
Length=794
Subject= ERCC-00013
Length=808
Score = 1437 bits (778), Expect = 0.0
Identities = 783/785 (99%), Gaps = 1/785 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCGAGCTCAGATGTGAAGGATCTTCTTGGAGGATTaaaaaaaTGATTATCTGTAAAACC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACCGAGCTCAGATGTGAAGGATCTTCTTGGAGGATTAAAAAAATGATTATCTGTAAAACC 60
Query 61 CCACGTGAACTTGGTATCATGCGGGAAGCAGGGCGAATCGTGGCTTTAACTCATGAAGAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CCACGTGAACTTGGTATCATGCGGGAAGCAGGGCGAATCGTGGCTTTAACTCATGAAGAG 120
Query 121 TTAAAAAAGCACATTAAACCAGGAATCTCGACAAAAGAATTGGATCAAATTGCCGAACGT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TTAAAAAAGCACATTAAACCAGGAATCTCGACAAAAGAATTGGATCAAATTGCCGAACGT 180
Query 181 TTTATTAAGAAGCAGGGTGCAATCCCATCTTTTAAGGGGTATAATGGGTTTCGCGGGAGC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTTATTAAGAAGCAGGGTGCAATCCCATCTTTTAAGGGGTATAATGGGTTTCGCGGGAGC 240
Query 241 ATTTGCGTATCAGTTAATGAAGAACTCGTTCACGGCATACCTGGCAGCAGGGTGCTGAAG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATTTGCGTATCAGTTAATGAAGAACTCGTTCACGGCATACCTGGCAGCAGGGTGCTGAAG 300
Query 301 GACGGTGACATCATCAGTATTGATATCGGTGCTAAATTAAATGGTTATCATGGTGACTCT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GACGGTGACATCATCAGTATTGATATCGGTGCTAAATTAAATGGTTATCATGGTGACTCT 360
Query 361 GCATGGACATATCCGGTAGGAAACATCAGCGATGATGACAAAAAACTTCTGGAAGTGACA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GCATGGACATATCCGGTAGGAAACATCAGCGATGATGACAAAAAACTTCTGGAAGTGACA 420
Query 421 GAGGAGTCTTTATATAAAGGCTTGCAGGAAGCAAAACCAGGTGAACGTTTGTCGAATATT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GAGGAGTCTTTATATAAAGGCTTGCAGGAAGCAAAACCAGGTGAACGTTTGTCGAATATT 480
Query 481 TCCCACGCAATACAAACGTATGTCGAAAATGAGCAGTTTTCAGTTGTTAGGGAGTATGTC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TCCCACGCAATACAAACGTATGTCGAAAATGAGCAGTTTTCAGTTGTTAGGGAGTATGTC 540
Query 541 GGACATGGTGTTGGTCAAGACTTGCATGAGGACCCGCAAATTCCTCATTACGGTCCGCCC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GGACATGGTGTTGGTCAAGACTTGCATGAGGACCCGCAAATTCCTCATTACGGTCCGCCC 600
Query 601 AACAAAGGACCACGGCTTAAACCTGGCATGGTTCTCGCTATTGAACCTATGGTGAACGCT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AACAAAGGACCACGGCTTAAACCTGGCATGGTTCTCGCTATTGAACCTATGGTGAACGCT 660
Query 661 GGCAGCCGCTACGTGAAAACATTGGCTGATAACTGGACGGTTGTAACGGTAGATGGGAAA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GGCAGCCGCTACGTGAAAACATTGGCTGATAACTGGACGGTTGTAACGGTAGATGGGAAA 720
Query 721 AAGTGTGCTCATTTTGAACATACGATTGCGATTACGGAAACGGTTTTTGATATACTGACG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 721 AAGTGTGCTCATTTTGAACATACGATTGCGATTACGGAAACGGGTTTTGAT-TACTGACG 779
Query 781 AGAGT 785
|||||
Sbjct 780 AGAGT 784
Query= ERCC-00014_genbank |112819960|gb|DQ875385.1| Synthetic construct
microarray control DAP gene, complete sequence
Length=1937
Subject= ERCC-00014
Length=1957
Score = 3567 bits (1931), Expect = 0.0
Identities = 1936/1938 (99%), Gaps = 1/1938 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAAAGAAGAAGGAAAGTAGAGGAGATCAAGATGTCAAACGAAACAATTAAATTAGTCATT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1957 AAAAGAAGAAGGAAAGTAGAGGAGATCAAGATGTCAAACGAAACAATTAAATTAGTCATT 1898
Query 61 GCGGGACCGCGTGGAAGAATGGGGCAGGAAGCTGTTAAATTGGCAGAACGAACACCACAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1897 GCGGGACCGCGTGGAAGAATGGGGCAGGAAGCTGTTAAATTGGCAGAACGAACACCACAT 1838
Query 121 TTTGACCTTGTAGGGGCCATAGACCATACATACGATCAGCAAAAATTATCTGATGTGATG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1837 TTTGACCTTGTAGGGGCCATAGACCATACATACGATCAGCAAAAATTATCTGATGTGATG 1778
Query 181 CCTGTTGAGTCAGATGCTTTCATTTACACAGATATCCATGCCTGTTTTACAGAAACACAA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CCTGTTGAGTCAGATGCTTTCATTTACACAGATATCCATGCCTGTTTTACAGAAACACAA 1718
Query 241 CCGGATGTCTTGATTGATTTAACAACGCCCGAAATCGGAAAAGTACATACAAAAATTGCA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1717 CCGGATGTCTTGATTGATTTAACAACGCCCGAAATCGGAAAAGTACATACAAAAATTGCA 1658
Query 301 TTAGAGCACGGAGTCCGTCCAGTTGTCGGAACAACCGGTTTCTCAGAAGCTGATTTAAAA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1657 TTAGAGCACGGAGTCCGTCCAGTTGTCGGAACAACCGGTTTCTCAGAAGCTGATTTAAAA 1598
Query 361 GAGCTCACATCTTTAACAGAAGAAAAAGGGATCGGAGCCATCATCGCGCCAAATTTTGCG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1597 GAGCTCACATCTTTAACAGAAGAAAAAGGGATCGGAGCCATCATCGCGCCAAATTTTGCG 1538
Query 421 CTCGGTGCGATACTGATGATGAAATTTTCAAAAATGGCTGCCAACTATTTTGAGGATGTT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1537 CTCGGTGCGATACTGATGATGAAATTTTCAAAAATGGCTGCCAACTATTTTGAGGATGTT 1478
Query 481 GAGATTATTGAGCTTCATCATGACCAGAAGCTTGACGCACCAAGCGGAACTGCGCTTAAA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 GAGATTATTGAGCTTCATCATGACCAGAAGCTTGACGCACCAAGCGGAACTGCGCTTAAA 1418
Query 541 ACAGCGGAAATGATTTCAGAAGTCCGTAAAGAAAAGCAGCAAGGACATCCGGATGAAAAA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1417 ACAGCGGAAATGATTTCAGAAGTCCGTAAAGAAAAGCAGCAAGGACATCCGGATGAAAAA 1358
Query 601 GAAATTCTCCCAGGAGCAAGAGGAGCGGAGCAAAACGGTATTCGCTTGCACAGCGTCCGT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1357 GAAATTCTCCCAGGAGCAAGAGGAGCGGAGCAAAACGGTATTCGCTTGCACAGCGTCCGT 1298
Query 661 CTTCCGGGACTGATCGCGCATCAGGAGGTCATGTTCGGCATGGATGGCCAAACGCTTCAG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1297 CTTCCGGGACTGATCGCGCATCAGGAGGTCATGTTCGGCATGGATGGCCAAACGCTTCAG 1238
Query 721 ATACGCCATGATTCTTATAACCGTGCTTCTTTCATGTCAGGCGTTAAACTGTCAGTCGAA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 ATACGCCATGATTCTTATAACCGTGCTTCTTTCATGTCAGGCGTTAAACTGTCAGTCGAA 1178
Query 781 CAAGTCATGAAGATTGATCAGCTTGTGTATGGTTTAGAAAATATCATTGATTAGACGGGG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 CAAGTCATGAAGATTGATCAGCTTGTGTATGGTTTAGAAAATATCATTGATTAGACGGGG 1118
Query 841 GGATAAACAATGAAAATTGCTTTGATCGCGCATGACAAGAAAAAACAGGATATGGTTCAA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117 GGATAAACAATGAAAATTGCTTTGATCGCGCATGACAAGAAAAAACAGGATATGGTTCAA 1058
Query 901 TTTACGACTGCCTATCGGGATATTTTAAAGAATCATGATCTATACGCAACCGGAACCACA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 TTTACGACTGCCTATCGGGATATTTTAAAGAATCATGATCTATACGCAACCGGAACCACA 998
Query 961 GGGTTGAAAATTCATGAGGCGACAGGTCTTCAAATTGAACGTTTTCAATCCGGCCCTTTA 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 GGGTTGAAAATTCATGAGGCGACAGGTCTTCAAATTGAACGTTTTCAATCCGGCCCTTTA 938
Query 1021 GGGGGAGACCAGCAAATCGGTGCACTGATCGCTGCCAATGCACTCGATCTTGTCAttttt 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 937 GGGGGAGACCAGCAAATCGGTGCACTGATCGCTGCCAATGCACTCGATCTTGTCATTTTT 878
Query 1081 ttGCGCGACCCGCTGACCGCGCAGCCGCATGAACCGGATGTCTCGGCATTAATCCGTTTA 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 TTGCGCGACCCGCTGACCGCGCAGCCGCATGAACCGGATGTCTCGGCATTAATCCGTTTA 818
Query 1141 TGTGATGTGTATTCCATTCCGCTCGCCACAAATATGGGTACTGCGGAAATTCTTGTGCGC 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 817 TGTGATGTGTATTCCATTCCGCTCGCCACAAATATGGGTACTGCGGAAATTCTTGTGCGC 758
Query 1201 ACACTTGATGAAGGTGTTTTCGAATTCCGTGACCTTCTTCGGGGAGAAGAGCCGAATGTA 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 ACACTTGATGAAGGTGTTTTCGAATTCCGTGACCTTCTTCGGGGAGAAGAGCCGAATGTA 698
Query 1261 TAATGCTGACGTTCTTGCTTTTGGCGCCCACAGTGATGATGTCGAGATCGGAATGGGCGG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 697 TAATGCTGACGTTCTTGCTTTTGGCGCCCACAGTGATGATGTCGAGATCGGAATGGGCGG 638
Query 1321 CACAATAGCGAAGTTTGTCAAACAGGaaaaaaaaGTAATGATATGCGATTTGACAGAAGC 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 CACAATAGCGAAGTTTGTCAAACAGGAAAAAAAAGTAATGATATGCGATTTGACAGAAGC 578
Query 1381 GGAACTCTCTTCTAACGGTACGGTCAGTTTGCGTAAAGAAGAAGCAGCTGAAGCAGCCCG 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 GGAACTCTCTTCTAACGGTACGGTCAGTTTGCGTAAAGAAGAAGCAGCTGAAGCAGCCCG 518
Query 1441 CATATTAGGCGCAGATAAAAGAATTCAGCTAACGCTTCCAGACCGCGGCCTAATAATGAG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 CATATTAGGCGCAGATAAAAGAATTCAGCTAACGCTTCCAGACCGCGGCCTAATAATGAG 458
Query 1501 TGATCAGGCAATTCGGTCAATTGTCACTGTCATCAGAATCTGTCGGCCAAAAGCGGTTTT 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 457 TGATCAGGCAATTCGGTCAATTGTCACTGTCATCAGAATCTGTCGGCCAAAAGCGGTTTT 398
Query 1561 TATGCCGTATAAAAAGGATCGCCATCCGGATCACGGCAATGCGGCTGCACTGGTGGAAGA 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 TATGCCGTATAAAAAGGATCGCCATCCGGATCACGGCAATGCGGCTGCACTGGTGGAAGA 338
Query 1621 AGCGATCTTTTCCGCCGGAATCCATAAATATAAAGACGAAAAAAGCCTTCCGGCGCATAA 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 337 AGCGATCTTTTCCGCCGGAATCCATAAATATAAAGACGAAAAAAGCCTTCCGGCGCATAA 278
Query 1681 AGTCAGCAAGGTTTACTATTATATGATAAATGGTTTTCATCAGCCGGATTTTGTTATTGA 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 AGTCAGCAAGGTTTACTATTATATGATAAATGGTTTTCATCAGCCGGATTTTGTTATTGA 218
Query 1741 TATCTCGGATACAATAGAGGCAAAGAAACAAAGCCTCAACGCCTACAAAAGCCAGTTTAT 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 TATCTCGGATACAATAGAGGCAAAGAAACAAAGCCTCAACGCCTACAAAAGCCAGTTTAT 158
Query 1801 CCCGTCAAAGGATTCCGTTTCTACTCCTCTGACGAATGGGTATATTGAAATCGTTGAAGC 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 CCCGTCAAAGGATTCCGTTTCTACTCCTCTGACGAATGGGTATATTGAAATCGTTGAAGC 98
Query 1861 GAGAGAAAAGCTTTACGGTAAAGAAGCGGGCGTGGAGTATGCCGAAG-TTTCTTTTCCAA 1919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 97 GAGAGAAAAGCTTTACGGTAAAGAAGCGGGCGTGGAGTATGCCGAAGGTTTCTTTTCCAA 38
Query 1920 ACGGATGCTGATGCTTGA 1937
||||||||||| ||||||
Sbjct 37 ACGGATGCTGAAGCTTGA 20
Query= ERCC-00016_genbank |114976930|gb|DQ883664.2| Synthetic construct
clone NISTag23 external RNA control sequence
Length=850
Subject= ERCC-00016
Length=844
Score = 1559 bits (844), Expect = 0.0
Identities = 844/844 (100%), Gaps = 0/844 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGTAACGAATGTTAATTTAGGAGGCAAGAGTTTGTGGGCGCGGACTTGCAGCTCGTAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GTTGTAACGAATGTTAATTTAGGAGGCAAGAGTTTGTGGGCGCGGACTTGCAGCTCGTAA 60
Query 61 CGCTCTAAAAGGGTTATGCCGCTGAGGCGGGACCATAGTCAGGAAGTTTGTCCGATCCGC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CGCTCTAAAAGGGTTATGCCGCTGAGGCGGGACCATAGTCAGGAAGTTTGTCCGATCCGC 120
Query 121 TCCAGTTGTCAAGAGTAGAGGATTTCGTGTTCGCCGATACTGCCGAAAACGTCATACCGA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCCAGTTGTCAAGAGTAGAGGATTTCGTGTTCGCCGATACTGCCGAAAACGTCATACCGA 180
Query 181 AGCAATTCTGTCGTCACTCTGTATGTCCGTGCCCCACCTTCGAGTATGAGTTTTAAAGTT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AGCAATTCTGTCGTCACTCTGTATGTCCGTGCCCCACCTTCGAGTATGAGTTTTAAAGTT 240
Query 241 CGTGCAGAGACATAGCTCGCGCACTCCCTGTGTGATGCCGGTCGGCCGACACATGCTTCA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CGTGCAGAGACATAGCTCGCGCACTCCCTGTGTGATGCCGGTCGGCCGACACATGCTTCA 300
Query 301 ATGTGCCTTGAACTTGCATTCGAAAGAATGTCCTTATCTTGATCGGCCATTGTAATGCAA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATGTGCCTTGAACTTGCATTCGAAAGAATGTCCTTATCTTGATCGGCCATTGTAATGCAA 360
Query 361 CGCTCTCCTTTCATTGACACGAGGTTCGTAGATGGCTGTTACTCGCGGACGTTAAATAAA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CGCTCTCCTTTCATTGACACGAGGTTCGTAGATGGCTGTTACTCGCGGACGTTAAATAAA 420
Query 421 ACTATCAGCGTCAGCGGATTAGGAGGCTTACGGGGGAACCTACAATTGTTCGCCGCATGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ACTATCAGCGTCAGCGGATTAGGAGGCTTACGGGGGAACCTACAATTGTTCGCCGCATGG 480
Query 481 TCCGAAGGCGCCATGTCCCTCAGCGGAGCGACAACAATTACTACTGGAGCTATTGTAAAT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TCCGAAGGCGCCATGTCCCTCAGCGGAGCGACAACAATTACTACTGGAGCTATTGTAAAT 540
Query 541 ACGCAGCAACAAGCGTCCAGACATTTGCCGCTGACCTCCAGTCGCATGGACGGGGGAGAA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 ACGCAGCAACAAGCGTCCAGACATTTGCCGCTGACCTCCAGTCGCATGGACGGGGGAGAA 600
Query 601 CAGCTGGAGCAATGCATCATTCGCTGAGGGACATCCAATCACGGAATCAAGGAAGAATTA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CAGCTGGAGCAATGCATCATTCGCTGAGGGACATCCAATCACGGAATCAAGGAAGAATTA 660
Query 661 CCAATTTTACCTGTAACGAAACCAATTTATTACTGACGCAGAGTGAATCACATCTATAGC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CCAATTTTACCTGTAACGAAACCAATTTATTACTGACGCAGAGTGAATCACATCTATAGC 720
Query 721 GGTTACGACCCTCCAGAGTGATCCGACGGCGATGTGTCTTTGACCCCCGTGTGACTGGTG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GGTTACGACCCTCCAGAGTGATCCGACGGCGATGTGTCTTTGACCCCCGTGTGACTGGTG 780
Query 781 TTCCTGTCGTATCCGCAACATGTTTACTCATCACTACGTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TTCCTGTCGTATCCGCAACATGTTTACTCATCACTACGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 840
Query 841 aaaa 844
||||
Sbjct 841 AAAA 844
Query= ERCC-00017_genbank |92111298|gb|DQ459420.1| Synthetic construct
microarray control MC09 mRNA, complete sequence
Length=1143
Subject= ERCC-00017
Length=1136
Score = 2071 bits (1121), Expect = 0.0
Identities = 1133/1138 (99%), Gaps = 4/1138 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGAACTGAAAGTGAGTCCCAACGAGAGAGGTGCATCTGTCCAGTGAGAGCTGACTGTCT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAGAACTGAAAGTGAGTCCCAACGAGAGAGGTGCATCTGTCCAGTGAGAGCTGACTGTCT 60
Query 61 GCGACAACACTAGTCGGTCCAGGCATGGATTTCGCGACCTCACAACTTAAGGAGGCGGTA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GCGACAACACTAGTCGGTCCAGGCATGGATTTCGCGACCTCACAACTTAAGGAGGCGGTA 120
Query 121 AATCAGATGACAGCGCGACCCTGTAATGGGTGACCTGCTAGTGGAGGTGGCGCGGTGTCC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AATCAGATGACAGCGCGACCCTGTAATGGGTGACCTGCTAGTGGAGGTGGCGCGGTGTCC 180
Query 181 CAGATACAAGGATCTCGATGTAGTACCCTCACATAACTTTGCTCCCTGAAATAACATTCG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CAGATACAAGGATCTCGATGTAGTACCCTCACATAACTTTGCTCCCTGAAATAACATTCG 240
Query 241 ATCACTCTAATGAATCCCTTAAGCCAGGAGCGTTAGTGTCAAACGCAACGCCCCGGGTTC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATCACTCTAATGAATCCCTTAAGCCAGGAGCGTTAGTGTCAAACGCAACGCCCCGGGTTC 300
Query 301 ATGATCCTGGATGGCTGGTCGAACCAGGGAGATGTCACTCTAATAGGTGCCAAATGTACC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATGATCCTGGATGGCTGGTCGAACCAGGGAGATGTCACTCTAATAGGTGCCAAATGTACC 360
Query 361 GCAGAACCTCGTAGGCGTTCGCCCAATTGGACCCGAGGTCATAATGTAGACGGGCACGCT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GCAGAACCTCGTAGGCGTTCGCCCAATTGGACCCGAGGT-ATAATGTAGACGGGCACGCT 419
Query 421 GACTGGGCAAAAGATTACAATCCCAGTTACCATACAGTC-CCC-GTCAGGATCGGGGCAT 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 420 GACTGGGCAAAAGATTACAATCCCAGTTACCATACAGTCGCCCGGTCAGGATCGGGGCAT 479
Query 479 GAAGGCAATATGTTGGCGCATCCCAGTCTTTCCGTAGAAACAGTGGCTAACGACGGAGAT 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 GAAGGCAATATGTTGGCGCATCCCAGTCTTTCCGTAGAAACAGTGGCTAACGACGGAGAT 539
Query 539 ACTGCCGGGCAAGAAACCTTGACCAAGTATGCGCGCCTTGTGAGTCTCCATGGACTTGCT 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 ACTGCCGGGCAAGAAACCTTGACCAAGTATGCGCGCCTTGTGAGTCTCCATGGACTTGCT 599
Query 599 GCACCTACAAATCCGGAAGGGCGCTTATAGTGCTTGCTAGCACTCCCTGGAATATCTTAA 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 GCACCTACAAATCCGGAAGGGCGCTTATAGTGCTTGCTAGCACTCCCTGGAATATCTTAA 659
Query 659 TCCCGCCAGCTCATGGGACGGGAGGAATGTGTTAGACCATAAACAGAGGGCTGGCCAACA 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TCCCGCCAGCTCATGGGACGGGAGGAATGTGTTAGACCATAAACAGAGGGCTGGCCAACA 719
Query 719 ATCAGAGGGAAGTAAGCCCCGCAAAAGGATTCTGCGGGAACCGAATTACACAACGTAAGG 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 ATCAGAGGGAAGTAAGCCCCGCAAAAGGATTCTGCGGGAACCGAATTACACAACGTAAGG 779
Query 779 ACGTACCTGCTCCTACCCCCGAACCACTGTCAATACGATAATGCGCCCAAAACGAGGGAT 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 ACGTACCTGCTCCTACCCCCGAACCACTGTCAATACGATAATGCGCCCAAAACGAGGGAT 839
Query 839 CGAGACGGTCGGAGTGGCAGTCCAGCTTAAACAGGTGCTCGCCGAAACTAGCTGGCCAGG 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 CGAGACGGTCGGAGTGGCAGTCCAGCTTAAACAGGTGCTCGCCGAAACTAGCTGGCCAGG 899
Query 899 GTGAGGCATGGATTCAAAGCCCAACGACCGAAGAAAGTTCCGACATACAATTACTCGGCT 958
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 GTGAGGCATGGATTCAAAGCC-AACGACCGAAGAAAGTTCCGACATACAATTACTCGGCT 958
Query 959 TTTGGCAATACCCAGGCGAGAGGTAAGCCCAAGCCATACCGGGAATGACCTGAGATCCAC 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 TTTGGCAATACCCAGGCGAGAGGTAAGCCCAAGCCATACCGGGAATGACCTGAGATCCAC 1018
Query 1019 TTAGTAAGTCTTACGAGATGATCCCGACCCAGGACTGGAGCTAGGCGGTTGTGCAAGTAA 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1019 TTAGTAAGTCTTACGAGATGATCCCGACCCAGGACTGGAGCTAGGCGGTTGCGCAAGTAA 1078
Query 1079 CTTCATCATGTATCGCTGGGGAATAATGTTCCTGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 CTTCATCATGTATCGCTGGGGAATAATGTTCCTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1136
Query= ERCC-00018_genbank |116733899|gb|EF011065.1| Synthetic construct
spike-in microarray control hypothetical protein (yurP) gene,
complete cds
Length=1013
Subject= ERCC-00018
Length=1032
Score = 1860 bits (1007), Expect = 0.0
Identities = 1009/1010 (99%), Gaps = 0/1010 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 GAGCTCAGTGAAGGATTTGAGTCAGGCCACAGCAAAAGTAAATCGTGAGGTTCAAGCTTT 63
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAGCTCAGTGAAGGATTTGAGTCAGGCCACAGCAAAAGTAAATCGTGAGGTTCAAGCTTT 60
Query 64 CTTGCAGGATTTGAAAGGGAAAACCATTGATCATGTATTCTTTGTCGCATGCGGAGGGTC 123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTTGCAGGATTTGAAAGGGAAAACCATTGATCATGTATTCTTTGTCGCATGCGGAGGGTC 120
Query 124 TTCTGCCATTATGTATCCGAGTAAGTATGTGTTTGACAGAGAGTCAAAATCAATAAACTC 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TTCTGCCATTATGTATCCGAGTAAGTATGTGTTTGACAGAGAGTCAAAATCAATAAACTC 180
Query 184 CGATCTCTACAGCGCCAACGAATTTATTCAGCGCAACCCTGTTCAGCTTGGTGAAAAGTC 243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CGATCTCTACAGCGCCAACGAATTTATTCAGCGCAACCCTGTTCAGCTTGGTGAAAAGTC 240
Query 244 TCTTGTTATTTTGTGCTCGCATTCGGGAAATACCCCGGAGACAGTCAAAGCTGCTGCGTT 303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TCTTGTTATTTTGTGCTCGCATTCGGGAAATACCCCGGAGACAGTCAAAGCTGCTGCGTT 300
Query 304 TGCAAGGGGCAAGGGCGCACTTACGATTGCGATGACGTTTAAACCGGAGTCTCCTTTAGC 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TGCAAGGGGCAAGGGCGCACTTACGATTGCGATGACGTTTAAACCGGAGTCTCCTTTAGC 360
Query 364 GCAGGAAGCGCAATATGTTGCCCAGTACGATTGGGGTGATGAGGCGCTTGCGATCAATAC 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GCAGGAAGCGCAATATGTTGCCCAGTACGATTGGGGTGATGAGGCGCTTGCGATCAATAC 420
Query 424 AAACTATGGCGTTTTGTATCAAATCGTTTTTGGAACCCTGCAAGTATTAGAAAACAATAC 483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AAACTATGGCGTTTTGTATCAAATCGTTTTTGGAACCCTGCAAGTATTAGAAAACAATAC 480
Query 484 GAAATTTGAGCAAGCAATTGAAGGCTTAGATCAATTGCAGGCTGTATATGAAAAAGCCCT 543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GAAATTTGAGCAAGCAATTGAAGGCTTAGATCAATTGCAGGCTGTATATGAAAAAGCCCT 540
Query 544 TAAGCAGGAAGCTGACAACGCCAAGCAATTTGCAAAAGCCCATGAAAAAGAAAGCATTAT 603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TAAGCAGGAAGCTGACAACGCCAAGCAATTTGCAAAAGCCCATGAAAAAGAAAGCATTAT 600
Query 604 TTATACCATGGCAAGCGGTGCAAACTACGGTGTCGCTTACTCCTACAGCATCTGCATTCT 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TTATACCATGGCAAGCGGTGCAAACTACGGTGTCGCTTACTCCTACAGCATCTGCATTCT 660
Query 664 CATGGAAATGCAATGGATTCATTCCCACGCCATTCATGCCGGAGAATATTTTCACGGACC 723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CATGGAAATGCAATGGATTCATTCCCACGCCATTCATGCCGGAGAATATTTTCACGGACC 720
Query 724 GTTTGAAATTATTGATGAATCCGTGCCGTTTATCATCCTGCTCGGTTTAGATGAAACAAG 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GTTTGAAATTATTGATGAATCCGTGCCGTTTATCATCCTGCTCGGTTTAGATGAAACAAG 780
Query 784 ACCTCTTGAAGAGCGGGCGCTTACCTTCTCGAAAAAGTATGGCAAAAAGCTCACTGTGCT 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 ACCTCTTGAAGAGCGGGCGCTTACCTTCTCGAAAAAGTATGGCAAAAAGCTCACTGTGCT 840
Query 844 TGATGCTGCATCTTACGACTTCACTGCAATTGACGATTCAGTTAAAGGCTATCTTGCTCC 903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TGATGCTGCATCTTACGACTTCACTGCAATTGACGATTCAGTTAAAGGCTATCTTGCTCC 900
Query 904 GCTCGTTCTCAATCGTGTGCTGAGAAGCTATGCAGACGAGCTGGCAGAGGAGAGAAATCA 963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GCTCGTTCTCAATCGTGTGCTGAGAAGCTATGCAGACGAGCTGGCAGAGGAGAGAAATCA 960
Query 964 TCCTTTATCTCATATAAGATACATGTGGAAAGTTGAGTATTGAATTCTGG 1013
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TCCTTTATCTCATAGAAGATACATGTGGAAAGTTGAGTATTGAATTCTGG 1010
Query= ERCC-00019_genbank |114975628|gb|DQ883651.2| Synthetic construct
clone NISTag10 external RNA control sequence
Length=650
Subject= ERCC-00019
Length=644
Score = 1190 bits (644), Expect = 0.0
Identities = 644/644 (100%), Gaps = 0/644 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTTAATGGTTGTACATACTTGACGGATTGCAGTGAGTGTATTCCCGTCCCATCGTATGG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTTTAATGGTTGTACATACTTGACGGATTGCAGTGAGTGTATTCCCGTCCCATCGTATGG 60
Query 61 GTAACCCATAGGGGCGTGTCATTCAGCACTTCGGATAGTGTTTGACCGCGTCGCTCCCAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GTAACCCATAGGGGCGTGTCATTCAGCACTTCGGATAGTGTTTGACCGCGTCGCTCCCAT 120
Query 121 GTCGCCTTTCAGGAGAAATAGTACAGGCTGCTGGCTCATGTTTCCTTCTACGCTGCACTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTCGCCTTTCAGGAGAAATAGTACAGGCTGCTGGCTCATGTTTCCTTCTACGCTGCACTT 180
Query 181 GCGGGCATAGAGGTCGGTTGCGATCTATATTCGGAGATAACTATTCACCCAGCGCCACTC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GCGGGCATAGAGGTCGGTTGCGATCTATATTCGGAGATAACTATTCACCCAGCGCCACTC 240
Query 241 GAATATCCCCTCTTCTGAGCAAGAGGCCAATAAATGCTCAAAAACGAGCGATTGTCCAAC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GAATATCCCCTCTTCTGAGCAAGAGGCCAATAAATGCTCAAAAACGAGCGATTGTCCAAC 300
Query 301 GACATAAAGGGAGACTGTAAGGTCCTAGCGCTCTGTCTGTTAGTGAGAGCCCTAGGTAAA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GACATAAAGGGAGACTGTAAGGTCCTAGCGCTCTGTCTGTTAGTGAGAGCCCTAGGTAAA 360
Query 361 CACGGTCGTTATCCCCTAGAGCGTGAAGCGGCTGTAGATATCTCTGAATCTTCGACCTTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CACGGTCGTTATCCCCTAGAGCGTGAAGCGGCTGTAGATATCTCTGAATCTTCGACCTTG 420
Query 421 GTGTAGATGGGGCTAGGTCAAAAAGCGGTAGCGATTAGCACTTGTATACACTCTCCCCCT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GTGTAGATGGGGCTAGGTCAAAAAGCGGTAGCGATTAGCACTTGTATACACTCTCCCCCT 480
Query 481 ACTAAGTATGTAAGGCCTGACCGGAGATTTGTCCATGCTCACCAGGACCGATAGTTGGGC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ACTAAGTATGTAAGGCCTGACCGGAGATTTGTCCATGCTCACCAGGACCGATAGTTGGGC 540
Query 541 CCCGGTAATCTTGCCGCCGTAGGGAGTACGAGCAGTGCACCGTTGAAACAAGCACAGGAG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CCCGGTAATCTTGCCGCCGTAGGGAGTACGAGCAGTGCACCGTTGAAACAAGCACAGGAG 600
Query 601 GTATGAAGCATCAGACCTGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GTATGAAGCATCAGACCTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 644
Query= ERCC-00022_genbank |116662509|gb|DQ855004.2| Synthetic construct
clone AG019.0111 external RNA control sequence
Length=727
Subject= ERCC-00022
Length=751
Score = 1343 bits (727), Expect = 0.0
Identities = 727/727 (100%), Gaps = 0/727 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCGGGCCAATTGCCTCTATAACTAGAGCTGAGCCCACCATTAAAGCGATTTTTTCGCAC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CCCGGGCCAATTGCCTCTATAACTAGAGCTGAGCCCACCATTAAAGCGATTTTTTCGCAC 60
Query 61 TTAGCCGTAATAAATATAATGATCCCGCGGTGTAGTAATTCTACGGAATGCACGGAATGT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTAGCCGTAATAAATATAATGATCCCGCGGTGTAGTAATTCTACGGAATGCACGGAATGT 120
Query 121 CATAAGCAGAAGGACGTGATGTGCAACCTACTCCCCTTTCCCAAGTAAATGTACGGGAAT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CATAAGCAGAAGGACGTGATGTGCAACCTACTCCCCTTTCCCAAGTAAATGTACGGGAAT 180
Query 181 TATCGTTTCGTTACCGACAACCATGGGGCCACGTGGCCAGTTTGCCCCTATTAGGTGGAT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TATCGTTTCGTTACCGACAACCATGGGGCCACGTGGCCAGTTTGCCCCTATTAGGTGGAT 240
Query 241 AGGCACTGAGTACAGAATATATAAAGCGTGACGGATGAAAACGCACCCATTGTCACCGAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AGGCACTGAGTACAGAATATATAAAGCGTGACGGATGAAAACGCACCCATTGTCACCGAT 300
Query 301 TGTGACTAGTTGACCCTATCACCCCTACTGTGTTCAGACGTCGTTCTACTAAAGGCCCGT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TGTGACTAGTTGACCCTATCACCCCTACTGTGTTCAGACGTCGTTCTACTAAAGGCCCGT 360
Query 361 GCCGCCGGAAGCTCATTTAAAAAGAACTCGTAAGTAAGCCGGCGACATATCTAGCAAAAC 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GCCGCCGGAAGCTCATTTAAAAAGAACTCGTAAGTAAGCCGGCGACATATCTAGCAAAAC 420
Query 421 ATAGTCCCCCTTCTGCTCAGAGGTTATCCATAAGTGACTTACCAGATGGAGTGCCAAGGT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ATAGTCCCCCTTCTGCTCAGAGGTTATCCATAAGTGACTTACCAGATGGAGTGCCAAGGT 480
Query 481 ACAGACCTCCCTCCCAACTGGTTCCTGCAGGACGTTGCTATATCACTTCTGGCCGTCCTT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ACAGACCTCCCTCCCAACTGGTTCCTGCAGGACGTTGCTATATCACTTCTGGCCGTCCTT 540
Query 541 ATGGGTTACCCCTCGCGAGTGCCATCGCATCGACTGACACACCTGCATTCTATTTTATGC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 ATGGGTTACCCCTCGCGAGTGCCATCGCATCGACTGACACACCTGCATTCTATTTTATGC 600
Query 601 TCTACTGACGGCGACGAGTTTTTTGTAGCGTCGATCGCGGAGTTAAGGTCATTGGGGAAT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TCTACTGACGGCGACGAGTTTTTTGTAGCGTCGATCGCGGAGTTAAGGTCATTGGGGAAT 660
Query 661 AGAACCATAGCGCTTGGGTTTGTGACTTTCTCCCTAGATACGCGTTTGCTGACTGCGCTA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AGAACCATAGCGCTTGGGTTTGTGACTTTCTCCCTAGATACGCGTTTGCTGACTGCGCTA 720
Query 721 CATGGAT 727
|||||||
Sbjct 721 CATGGAT 727
Query= ERCC-00023_genbank |103488691|gb|DQ516744.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-250-27 genomic sequence
Length=250
Subject= ERCC-00023
Length=273
Score = 462 bits (250), Expect = 3e-135
Identities = 250/250 (100%), Gaps = 0/250 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCTTCAAGTATTACGATGAATTGGCTGAGTTTTGTAAAAGGCATAACATCCCATTTCT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TGCCTTCAAGTATTACGATGAATTGGCTGAGTTTTGTAAAAGGCATAACATCCCATTTCT 60
Query 61 CCCTCTACCAACAATCTCAGAAATTCATCCAGATTTAGAGAAGGATAGGACAGTAGATGA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CCCTCTACCAACAATCTCAGAAATTCATCCAGATTTAGAGAAGGATAGGACAGTAGATGA 120
Query 121 TGACGTAAAGAATAAAGTTGTCAAATATTTGGGATATGAAGGGGTTTATAATTACAAAAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TGACGTAAAGAATAAAGTTGTCAAATATTTGGGATATGAAGGGGTTTATAATTACAAAAA 180
Query 181 TCTTCTTTTATATTTGGCAAATAGGTTTGGAAATTTAAATGTTGAGTATGAAGAACCAAG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCTTCTTTTATATTTGGCAAATAGGTTTGGAAATTTAAATGTTGAGTATGAAGAACCAAG 240
Query 241 ACCAATGCCA 250
||||||||||
Sbjct 241 ACCAATGCCA 250
Query= ERCC-00024_genbank |116662503|gb|DQ854993.2| Synthetic construct
clone AG005.0110 external RNA control sequence
Length=512
Subject= ERCC-00024
Length=536
Score = 946 bits (512), Expect = 0.0
Identities = 512/512 (100%), Gaps = 0/512 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGGAGGAGCTTTGGCATACTAGGCTAGCGAATCTGCAACTAACGCAAGTTACATCCTAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACGGAGGAGCTTTGGCATACTAGGCTAGCGAATCTGCAACTAACGCAAGTTACATCCTAG 60
Query 61 CTAGCGAAGGGCGTCCCAATTTTCGCTAACCCGACGCGACGCATAAAAAGCGAGAATAAC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTAGCGAAGGGCGTCCCAATTTTCGCTAACCCGACGCGACGCATAAAAAGCGAGAATAAC 120
Query 121 GCCTAAGGGATGTACAATGGATGTTGATTATGCCTTCGGGAATGAGGGATGATTTGCGAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GCCTAAGGGATGTACAATGGATGTTGATTATGCCTTCGGGAATGAGGGATGATTTGCGAA 180
Query 181 AAACAAGTCAATACCTAACCAAATCCGCTAATGGACACCCGTAATCGTGCCCAAGTTTAA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AAACAAGTCAATACCTAACCAAATCCGCTAATGGACACCCGTAATCGTGCCCAAGTTTAA 240
Query 241 CTGGTCGGTAGGTGGCAGGCAAAGCGCTAGTATCCCTAGGCGCGACACTATAAGTTTACA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTGGTCGGTAGGTGGCAGGCAAAGCGCTAGTATCCCTAGGCGCGACACTATAAGTTTACA 300
Query 301 ACTGCGAGAATTGACACTATGAGCGCGCATACTGGGGCCAGAATAGGCAATACCATGTGC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ACTGCGAGAATTGACACTATGAGCGCGCATACTGGGGCCAGAATAGGCAATACCATGTGC 360
Query 361 GTCCCTGTGTGAACAGCTCGCGGCCATCAGAAGTTGGGATTGACGCATGATCTTGATCGA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTCCCTGTGTGAACAGCTCGCGGCCATCAGAAGTTGGGATTGACGCATGATCTTGATCGA 420
Query 421 GCATACGGCTTCCACCAACCCATAGTACTTGGTAACTATAGCAATCAAGCACGCGTGAGC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GCATACGGCTTCCACCAACCCATAGTACTTGGTAACTATAGCAATCAAGCACGCGTGAGC 480
Query 481 ACAACGCTATCCAAATTACTACATTAACTGGA 512
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ACAACGCTATCCAAATTACTACATTAACTGGA 512
Query= ERCC-00025_genbank |114977058|gb|DQ883689.2| Synthetic construct
clone NISTag48 external RNA control sequence
Length=2000
Subject= ERCC-00025
Length=1994
Score = 3677 bits (1991), Expect = 0.0
Identities = 1993/1994 (99%), Gaps = 0/1994 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGGTCCATTATAGTGCAGGCGTGGTAAAGTAGCATTAGAACCCTACTACTTAGCCCGCG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGGGTCCATTATAGTGCAGGCGTGGTAAAGTAGCATTAGAACCCTACTACTTAGCCCGCG 60
Query 61 CAACTCGTCCTATTAAAAGTCGGAAGGATTAGGGAAGTTAACCTCCGTTAGGGCCTCATT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CAACTCGTCCTATTAAAAGTCGGAAGGATTAGGGAAGTTAACCTCCGTTAGGGCCTCATT 120
Query 121 GGCGCGCCTCCACGTATCTGTATTCCCGTGTCCCGACTGGCTAATAAGAGATATGGTGCA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GGCGCGCCTCCACGTATCTGTATTCCCGTGTCCCGACTGGCTAATAAGAGATATGGTGCA 180
Query 181 GCGTGAACGCGGACCGAACTCCGGTGTGCGCCGGTTCATGTTACTCGAAAAATAGACCCT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GCGTGAACGCGGACCGAACTCCGGTGTGCGCCGGTTCATGTTACTCGAAAAATAGACCCT 240
Query 241 ACTTGCGCCATGTCATCTTTCACTACGGGGTAGTCTCTCGGCCAGGCTTTGAATCGCCTC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ACTTGCGCCATGTCATCTTTCACTACGGGGTAGTCTCTCGGCCAGGCTTTGAATCGCCTC 300
Query 301 ATCCGCTTCTCAATGGTTCTGTCCTGACCTCTGGAGTTAATCTTCGTCTCATAGAGTAAC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATCCGCTTCTCAATGGTTCTGTCCTGACCTCTGGAGTTAATCTTCGTCTCATAGAGTAAC 360
Query 361 CAGGCGACGCACCACGCCTAGTTGGTACCACCACTAGAAGCCCGGTTCGCTGGCTCAGTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CAGGCGACGCACCACGCCTAGTTGGTACCACCACTAGAAGCCCGGTTCGCTGGCTCAGTG 420
Query 421 CTAATATTCTGGAGGTCAGCCGACAGGTCACATGAGCCTACTCGTCTCGTCAAACACCCG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CTAATATTCTGGAGGTCAGCCGACAGGTCACATGAGCCTACTCGTCTCGTCAAACACCCG 480
Query 481 CCTAGCCATGATTAACAAATACAGTGATTAAGTGTGTTTTGACCCTAGTGTTAGGTCGCT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CCTAGCCATGATTAACAAATACAGTGATTAAGTGTGTTTTGACCCTAGTGTTAGGTCGCT 540
Query 541 GGTACTTAGCAAGGGGAGTTGCATATGTGGTCTCTGTTTCGGGTTATATCTATCATTTAC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GGTACTTAGCAAGGGGAGTTGCATATGTGGTCTCTGTTTCGGGTTATATCTATCATTTAC 600
Query 601 TTGACACCCTATTGGTTTATCACAGTCCTTCCACACGACCATACGCGTTGTAAGAATACC 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TTGACACCCTATTGGTTTATCACAGTCCTTCCACACGACCATACGCGTTGTAAGAATACC 660
Query 661 CTCTAGCGTTGGAGAGAATAAGTTCGATGTTCAATTCACAAAACCGAGCAAAGGCTTGTC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CTCTAGCGTTGGAGAGAATAAGTTCGATGTTCAATTCACAAAACCGAGCAAAGGCTTGTC 720
Query 721 GACAGCTTCTACTAGTATTCACTACCAAAACGCGTACCGACTTTAGGGCGGTAGAGAGAT 780
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GACAGCTTCTACTAGTATTCACTACCAAAACGCGTACCGACTTTAGGGCGGTAGAGAGAA 780
Query 781 TTGCCATTGCCACGAGGTTCCCCAGAATACAGGGTCCAGGCGGCCCCCAGCATCGGAGTG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TTGCCATTGCCACGAGGTTCCCCAGAATACAGGGTCCAGGCGGCCCCCAGCATCGGAGTG 840
Query 841 CCTGAACTGGCGGGGATGCCCAAGATTGTAGAGGGCCTAACGAGTTTGATACGCCCGGGA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CCTGAACTGGCGGGGATGCCCAAGATTGTAGAGGGCCTAACGAGTTTGATACGCCCGGGA 900
Query 901 CTACGGGGCATTGTCTGCCGCGTCTGTTTCAGGTAAACGATCAACCGGAGACCAGGTTAT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CTACGGGGCATTGTCTGCCGCGTCTGTTTCAGGTAAACGATCAACCGGAGACCAGGTTAT 960
Query 961 TCCCATGTCGGTCCCCAGGCTTATACTGCGGAGATAGGCTGATGATGGTAGGTGCCTTGC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TCCCATGTCGGTCCCCAGGCTTATACTGCGGAGATAGGCTGATGATGGTAGGTGCCTTGC 1020
Query 1021 TCTAGCAAAAACGCGCACAGCTTATGAGCATAGCGGCTGGGCGTAGGTCAGAGAGGGTAT 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TCTAGCAAAAACGCGCACAGCTTATGAGCATAGCGGCTGGGCGTAGGTCAGAGAGGGTAT 1080
Query 1081 GTAAGATCTCTCCTCTATCGGTGTGCGTCTACTCTGCCCCCTTCGACACAAATGTACATC 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GTAAGATCTCTCCTCTATCGGTGTGCGTCTACTCTGCCCCCTTCGACACAAATGTACATC 1140
Query 1141 GCGGGAAACGGATACGCCTTACGCCCCAAGGTTTAGCGTATCAAAAAATGCAACGATTCC 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GCGGGAAACGGATACGCCTTACGCCCCAAGGTTTAGCGTATCAAAAAATGCAACGATTCC 1200
Query 1201 GATGTCGAACCTTGGATAGGAGCGACCGATTACGTGTTAATTGGCCCTGTACCTTTCTGG 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 GATGTCGAACCTTGGATAGGAGCGACCGATTACGTGTTAATTGGCCCTGTACCTTTCTGG 1260
Query 1261 TCCGTTGATTATCACTCATCCCCAGGTTGTTATGGTCTACCGTGGAAGCCTCGTCAATGA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 TCCGTTGATTATCACTCATCCCCAGGTTGTTATGGTCTACCGTGGAAGCCTCGTCAATGA 1320
Query 1321 ATACTTTGAGCGCGATTGAAGTGTTCCGCTACATCGCGGCTATCATTAAAAATTCCCCTT 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 ATACTTTGAGCGCGATTGAAGTGTTCCGCTACATCGCGGCTATCATTAAAAATTCCCCTT 1380
Query 1381 TAACAAAGGTTGTGGACGTCAACGGCCCTGCAGTAGCGTTCCTTGGACCCGGTTCGAGTA 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 TAACAAAGGTTGTGGACGTCAACGGCCCTGCAGTAGCGTTCCTTGGACCCGGTTCGAGTA 1440
Query 1441 CCCAGAGCAGACTACGTATATATCCAAGTGGTTATGTCCGACGGCATTTTGCCAGGTTAG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 CCCAGAGCAGACTACGTATATATCCAAGTGGTTATGTCCGACGGCATTTTGCCAGGTTAG 1500
Query 1501 TATCTTCGGCAATGAGTTGCGTCTACGGCTAATCGAGAGCACTTGTCAGTACGCGCAATT 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 TATCTTCGGCAATGAGTTGCGTCTACGGCTAATCGAGAGCACTTGTCAGTACGCGCAATT 1560
Query 1561 ACTACATGGAGTGTATTCGTTTTGAGCGCTGATACAGTTCTCCTATCAAGGTCGCAAAAG 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 ACTACATGGAGTGTATTCGTTTTGAGCGCTGATACAGTTCTCCTATCAAGGTCGCAAAAG 1620
Query 1621 GTTGTCTAGAAAAGGGCCGTGCGCGCAGTCTACTGCTACCGGCGACTTTACGACGAAGTT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 GTTGTCTAGAAAAGGGCCGTGCGCGCAGTCTACTGCTACCGGCGACTTTACGACGAAGTT 1680
Query 1681 AGGCATCAGACGACCACATGACGGAGAATTACGTACGCCACTTCAGACGTTCTGCCTGCG 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 AGGCATCAGACGACCACATGACGGAGAATTACGTACGCCACTTCAGACGTTCTGCCTGCG 1740
Query 1741 TGCTCTGCAATATAGGCGTAGCAACGAAGCTCGGTCGTGAACTGCTATAGGAATAGCCTG 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 TGCTCTGCAATATAGGCGTAGCAACGAAGCTCGGTCGTGAACTGCTATAGGAATAGCCTG 1800
Query 1801 ATACGAGCGCACAACAAGAACGAACCAGCGAAACTACCCAGATAACATCGCTCCCCGGCA 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 ATACGAGCGCACAACAAGAACGAACCAGCGAAACTACCCAGATAACATCGCTCCCCGGCA 1860
Query 1861 TTACTCTGACGGGGGTTGTCACTAGGCTGGTGGGTCCTTTCGCCTCTCATGTCAATTCCC 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 TTACTCTGACGGGGGTTGTCACTAGGCTGGTGGGTCCTTTCGCCTCTCATGTCAATTCCC 1920
Query 1921 TTTGTTGGGCTGCTTGGAAGTACTGATACTAGAGTAGCCTAGTAATACCTaaaaaaaaaa 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 TTTGTTGGGCTGCTTGGAAGTACTGATACTAGAGTAGCCTAGTAATACCTAAAAAAAAAA 1980
Query 1981 aaaaaaaaaaaaaa 1994
||||||||||||||
Sbjct 1981 AAAAAAAAAAAAAA 1994
Query= ERCC-00028_genbank |92111297|gb|DQ459419.1| Synthetic construct
microarray control MC08 mRNA, complete sequence
Length=1147
Subject= ERCC-00028
Length=1130
Score = 2037 bits (1103), Expect = 0.0
Identities = 1126/1135 (99%), Gaps = 9/1135 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 AAGTATTCCATTCCGGCTCATGGTCCCGGCTAGACCTGCAAGATCGAAGGTACTCAATGA 65
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 AAGTATTCCATTCCGGCTCATGGTCCCGGCTAGACCTGCAAGATCGAAGGTACTCAATGA 64
Query 66 CACCAGTGACTGAGCGGTCAGCCCGGAAATAGCCAGAAATGTTACCATCCCCGCATGTTA 125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 CACCAGTGACTGAGCGGTCAGCCCGGAAATAGCCAGAAATGTTACCATCCCCGCATGTTA 124
Query 126 CACAAACGTCGGGCTGACGAAACCCATGAGAACCTATGGTGAATAGACAGTAAACGAGCG 185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 125 CACAAACGTCGGGCTGACGAAACCCATGAGAACCTATGGTGAATAGACAGTAAACGAGCG 184
Query 186 CAAAGGCGTGCTGCCAAGGGCTCCCCACCGAATGTAGAACTGATCTGATCTTCCGTGACA 245
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 185 CAAAGGCGTGCTGCCAAGGGCT-CCCACCGAATGTAGAACTGATCTGAT-TTCCGTGACA 242
Query 246 GGGAAACGCAATGCGAGGTTCCGCAAGTCCACCTATAATCTGTGACCGCTCGTAGAACAT 305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 243 GGGAAACGCAATGCGAGGTTCCGCAAGTCCACCTATAATCTGTGACCGCTCGTAGAACAT 302
Query 306 GGTTAGGGGCCTGATTCAGTTAAATCAAGCCACCTCTGACAGAACGACGAGTCAGTGGAA 365
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 GGTTA-GGGCCTGATTCAGTTAAATCAAGCCACCTCTGACAGAACGACGAGTCAGTGGAA 361
Query 366 TCGACTTCACACACCTCAGAGTCCACTCACGTGCTGTAAGTCAAAACCCAGTGAACTTCT 425
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 TCGACTT--CACACCTCAGAGTCCACTCACGTGCTGTAAGTCAAAACCCAGTGAACTTCT 419
Query 426 CAACCGTGTAGCGCTCCTAGAACATTCAGGCGCCACTGAGGGGCATATGGATGAAGCGTG 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 CAACCGTGTAGCGCTCCTAGAACATTCAGGCGCCACTGAGGGGCATATGGATGAAGCGTG 479
Query 486 ATACGAATTACCTCCAACGAATGCCAGCTGGGAGGAGGATAGGGACTATGTCTTCGTCAA 545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 ATACGAATTACCTCCAACGAATGCCAGCTGGGAGGAGGATAGGGACTATGTCTTCGTCAA 539
Query 546 TGCTCCCGTCAAATGCCTTTCTAAATACCTTTTCGACCTCTCTGTGTGGAATGGGGTCTA 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 TGCTCCCGTCAAATGCCTTTCTAAATACCTTTTCGACCTCTCTGTGTGGAATGGGGTCTA 599
Query 606 GAACCAAGGACTAAAGCGGTGCACGAGGCCCTTTGGATATGTCCTTCTTGGGAGGGCCCA 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 GAACCAAGGACTAAAGCGGTGCACGAGGCCCTTTGGATATGTCCTTCTTGGGAGGGCCCA 659
Query 666 CAGCCAAAGCCACCCATCACAGCTGGAATCTAATCTTGTGACCCAGTATTAACCGTGAGA 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CAGCCAAAGCCACCCATCACAGCTGGAATCTAATCTTGTGACCCAGTATTAACCGTGAGA 719
Query 726 TCTACACAACCGACAAGCGCTAGCTTCCTCCCCGGTCAAGTAGTAATGCCGGGATGACTT 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 TCTACACAACCGACAAGCGCTAGCTTCCTCCCCGGTCAAGTAGTAATGCCGGGATGACTT 779
Query 786 TGCGTGTCCTATAGCGATCGAGCCCTCGAATTCACGTCGTCAAAGTGGAATGATCAGATT 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 TGCGTGTCCTATAGCGATCGAGCCCTCGAATTCACGTCGTCAAAGTGGAATGATCAGATT 839
Query 846 AAAGGGCTGTCGGGAGGGATGTGTAGGCCACTAACACCCCTCTGCACGAACTATAGATAC 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 AAAGGGCTGTCGGGAGGGATGTGTAGGCCACTAACACCCCTCTGCACGAACTATAGATAC 899
Query 906 GTCTTTCATCGGTACGCTCGAAAGCGCAGGTGGCTCCCAAATCGTGGGGAGTTAATCGAG 965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 GTCTTTCATCGGTACGCTCGAAAGCGCAGGTGGCTCCCAAATCGTGGGGAGTTAATCGAG 959
Query 966 CTGCGGATTGGTCCCCACGCCTTACGGCAGCGAACATAATCCCGCTGATGTGAAGTCGAT 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CTGCGGATTGGTCCCCACGCCTTACGGCAGCGAACATAATCCCGCTGATGTGAAGTCGAT 1019
Query 1026 CTACAAGGTAAACAACGGGGAATATAATTCAGTTGAACCGGTGTGGAGCCTGCACTTGGA 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 CTACAAGGTAAACAACGGGGAATATAATTCAGTTGAACCGGTGTGGAGCCTGCACTTGGA 1079
Query 1086 ACGACTGCATAAGGGACCCAACAGCCCCTCATaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1140
||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 ACG-CTGCATAAGGGACCCAACAGCCCC--A-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1130
Query= ERCC-00031_genbank |92111309|gb|DQ459431.1| Synthetic construct
microarray control MC30 mRNA, complete sequence
Length=1140
Subject= ERCC-00031
Length=1138
Score = 2026 bits (1097), Expect = 0.0
Identities = 1128/1141 (98%), Gaps = 9/1141 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGAAAAGCTTCTTGCCTAGTTACAGCACGAAGATTGGGACCCATCGATCAGCGCCTC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGGAGAAAAGCTTCTTGCCTAGTTACAGCACGAAGATTGGGACCCATCGATCAGCGCCTC 60
Query 61 CGTGCAATGGCGCCTTGGTGACACTCTCTAAAATGCAGTCGGTAGCGGGGCATGTAGTTA 120
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CGTGCAATGGCGCCTTGGT-ACACTCTCTAAAATGCAGTCGGTAGCGGGGCATGTAGTTA 119
Query 121 CTGCGGTGATATTAAGCTAGTGAGTAACCTT-TATCGAACTGTCTACCAAATTGATGTAT 179
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 CTGCGGTGATATTAAGCTAGTGAGTAACCTTATATCGAACTGTCTACCAAATTGATGTAT 179
Query 180 CTACATTAGCCGTACGATGAGACAATGAACCGTGTCTACGCTCGGGAGCATTACCCCTAT 239
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CTACATTAGCCGTACGATGAGACAATGAACCGTGTCTACGCTCGGGAGCATTACCCCTA- 238
Query 240 TCATGAGCCTACAAGCACCTGACTAGACCAGGAGACAACTTGAGCGAGACACTAGCGAGA 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 TCATGAGCCTACAAGCACCTGACTAGACCAGGAGACAACTTGAGCGAGACACTAGCGAGA 298
Query 300 GGTGCCGATATAAGGTACA-TGTTGCGGATGCTCAACATCGCATTTTTATCCCCTGGCGG 358
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 GGTGCCGATATAAGGTACATTGTTGCGGATG-TCAACATCGCATTTTTATCCCCTGGCGG 357
Query 359 GATGCAACTAACACCAGTAATGTCGTTCTCCACGACCCCCTACCCGAAAACTTACTCGTA 418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 GATGCAACTAACACCAGTAATGTCGTTCTCCACGACCCCCTACCCGAAAACTTACTCGTA 417
Query 419 TGAGTACTTTCGCGACGACTCGGCTGTGTAGTTTCCAAGCAGGCCCCTGGCTAGACCCAT 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 TGAGTACTTTCGCGACGACTCGGCTGTGTAGTTTCCAAGCAGGCCCCTGGCTAGACCCAT 477
Query 479 TTGTACCACGCGGAGGATCATC-GAATCCATAATCGGCCACAAACTAGCCGGCTGGAAAC 537
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 TTGTACCACGCGGAGGATCATCGGAATCCATAATCGGCCACAAACTAGCCGGCTGGAAAC 537
Query 538 CTTGTGATATCATGAACGAGGAGTAAGAGCTGGTTAGTGAATCACCTTGAGGGCGAGGAA 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 CTTGTGATATCATGAACGAGGAGTAAGAGCTGGTTAGTGAATCACCTTGAGGGCGAGGAA 597
Query 598 CACAACAATTCTGCGGGTTAGCAGGAAGGTTAGGGAACTCGCTCATAGCATATTAGTACC 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 CACAACAATTCTGCGGGTTAGCAGGAAGGTTAGGGAACTCGCTCATAGCATATTAGTACC 657
Query 658 GCTATCTCCTTTCCTTGGCGCGATATCTCCCAAAGTTAGGCT-ATTCTGCCGCCTGTGAT 716
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 658 GCTATCTCCTTTCCTTGGCGCGACATCTCCCAAAGTTAGGCTGATTCTGCCGCCTGTGAT 717
Query 717 CGCTATCCTTATTTGTGGCAGAATATGTCGATGCAAAAAACCTTAATTCGTGCTTCATAC 776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 CGCTATCCTTATTTGTGGCAGAATATGTCGATGCAAAAAACCTTAATTCGTGCTTCATAC 777
Query 777 ATCATCCCCGAGAACTCCACGGCTCCACTACCGCTTATCACGCGTGGGTGCTAAATGATA 836
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 ATCATCCCCGAGAACTCCACGGCTCCACTCCCGCTTATCACGCGTGGGTGCTAAATGATA 837
Query 837 CGAAGTGTGGCAGTCTATGTTAACTTGGAGCATCA-ATTTATTTCTGTTCACGGATTAAG 895
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 838 CGAAGTGTGGCAGTCTATGTTAACTTGGAGCATCATATTTATTTCTGTTCACGGATGAAG 897
Query 896 GCCTATATCAATGATCATTAAAGACATTCCGTCATCGGCTACATGCAAAGAGGCTTTTCC 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 GCCTATATCAATGATCATTAAAGACATTCCGTCATCGGCTACATGCAAAGAGGCTTTTCC 957
Query 956 ACCCTGTTTCGGTGATTCAGGTGTCGAGCGACCATTATCTGTCGGCTCATCATCGAACCG 1015
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 958 ACCCTGTTTCGGTGATTCAGGTGTCGAGCGACCATTATCTGTCGGCTCATCACCGAACCG 1017
Query 1016 GCCGT-ATAGAGTCTTCGCATCAGGTTACACCATGTCGACTGATAGTAACTGTGGTTCGA 1074
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 GCCGTGATAGAGTCTTCGCATCAGGTTACACCATGTCGACTGATAGTAACTGTGGTTCGA 1077
Query 1075 GTTATGCGTGTTGACACACCGTTGAGGCGCCCTATTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 GTTATGCGTGTTGACACACCGTTGAGGCGCCCTATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1137
Query 1135 a 1135
|
Sbjct 1138 A 1138
Query= ERCC-00033_genbank |103488743|gb|DQ516796.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-2000-79 genomic sequence
Length=2000
Subject= ERCC-00033
Length=2022
Score = 3694 bits (2000), Expect = 0.0
Identities = 2000/2000 (100%), Gaps = 0/2000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCACGCCCTATTTAACTGGAAACCTTCCAAGATTCGGAGAGCATATAAGTTGGGCCGAAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCACGCCCTATTTAACTGGAAACCTTCCAAGATTCGGAGAGCATATAAGTTGGGCCGAAA 60
Query 61 GCTCAGCTGTGAGCTTTGCAAACTCTGTCTTAGGAGCTAAGACAAATAGAGAAGGTGGGC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GCTCAGCTGTGAGCTTTGCAAACTCTGTCTTAGGAGCTAAGACAAATAGAGAAGGTGGGC 120
Query 121 CATCAGCATTAGCAGCTGCAATTATTGGAAAAACACCATATTATGGATATCACTTAGATG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CATCAGCATTAGCAGCTGCAATTATTGGAAAAACACCATATTATGGATATCACTTAGATG 180
Query 181 AAAATAGAAAGACAACACATATCATTGAGTTAGATGGACAATTAATCTCTAACTTTAAAT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AAAATAGAAAGACAACACATATCATTGAGTTAGATGGACAATTAATCTCTAACTTTAAAT 240
Query 241 ATGGAGAGAGTTTTTATGGAGCTTTAGGTTACTTAGTTGGGAAGATTGTTAAGAATGGCA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATGGAGAGAGTTTTTATGGAGCTTTAGGTTACTTAGTTGGGAAGATTGTTAAGAATGGCA 300
Query 301 TTCCATATTTTGAAAATCTATATAAATTAAATCCAAATAACGATAATTTAAAATCCTTGG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTCCATATTTTGAAAATCTATATAAATTAAATCCAAATAACGATAATTTAAAATCCTTGG 360
Query 361 GAGCTGCAATGGCTGCAAGTGGTGGTATCGCCTTATATCACGCAAAAAACTTGACAGCTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAGCTGCAATGGCTGCAAGTGGTGGTATCGCCTTATATCACGCAAAAAACTTGACAGCTG 420
Query 421 AATGCAGAGTTAAAGAAGTTGTTAATGATAAAATTGAAAAGATATCTATTGGAGTTGAGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AATGCAGAGTTAAAGAAGTTGTTAATGATAAAATTGAAAAGATATCTATTGGAGTTGAGG 480
Query 481 AGATAAAGGAAGCTTATGAAAAATTAAATACAACAAATGAAGAGCCAGATTTAATTTGTA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AGATAAAGGAAGCTTATGAAAAATTAAATACAACAAATGAAGAGCCAGATTTAATTTGTA 540
Query 541 TTGGTTGCCCTCACTGCAGTTTAATGGaaattaaaaaaattgctgaacttttaaaaaata 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TTGGTTGCCCTCACTGCAGTTTAATGGAAATTAAAAAAATTGCTGAACTTTTAAAAAATA 600
Query 601 aaaaatTGAATGCTGATTTATGGGTTTGCTGCTCTCTTCATATTAAAGCAATAGCAGATA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AAAAATTGAATGCTGATTTATGGGTTTGCTGCTCTCTTCATATTAAAGCAATAGCAGATA 660
Query 661 GAATGGGATATACAAAGATTATTGAAAAAGCTGGTGGAAAGGTAGTTAAAGACACCTGTA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GAATGGGATATACAAAGATTATTGAAAAAGCTGGTGGAAAGGTAGTTAAAGACACCTGTA 720
Query 721 TGGTTGTTTCTCCAATTGAGGATTTAGGTTATAAAAGAGTTGCAACAAACTCTGGAAAAG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TGGTTGTTTCTCCAATTGAGGATTTAGGTTATAAAAGAGTTGCAACAAACTCTGGAAAAG 780
Query 781 CTGCTGTTTATCTACCAAGCTTTTGTAAGAGTGAAGTAATTTTTGGAGATATTGAGGAAT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CTGCTGTTTATCTACCAAGCTTTTGTAAGAGTGAAGTAATTTTTGGAGATATTGAGGAAT 840
Query 841 TGTTAAAAGGGAGATAATGCTGAATCCAATAATCTTATTTTTGGCTATTATTTTTGATAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TGTTAAAAGGGAGATAATGCTGAATCCAATAATCTTATTTTTGGCTATTATTTTTGATAG 900
Query 901 AATCATTGGGGAGTTGCCAGAGAGTATTCATCCAACGGTTTGGATAGGGAAGTTGATAGC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AATCATTGGGGAGTTGCCAGAGAGTATTCATCCAACGGTTTGGATAGGGAAGTTGATAGC 960
Query 961 TTTTTTAGAGAACATATTTAAATCTACAAATTGCAAAAATAAATATAGAGATTTTTTGTT 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TTTTTTAGAGAACATATTTAAATCTACAAATTGCAAAAATAAATATAGAGATTTTTTGTT 1020
Query 1021 TGGCTCACTAACAACATTTATTACTCTATTAGTTGTGGGAGTTATAGCtttttttGTTGA 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TGGCTCACTAACAACATTTATTACTCTATTAGTTGTGGGAGTTATAGCTTTTTTTGTTGA 1080
Query 1081 TAAATGCATAATGCTGTTACCATTTCCTTTAAACTATATTATCTATGGTTTTTTGTTATC 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 TAAATGCATAATGCTGTTACCATTTCCTTTAAACTATATTATCTATGGTTTTTTGTTATC 1140
Query 1141 AACAACTATTGGCTACAAATCATTATTCGAATTCTGCAAAAAGCCGATTGAATATATAAA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 AACAACTATTGGCTACAAATCATTATTCGAATTCTGCAAAAAGCCGATTGAATATATAAA 1200
Query 1201 AAATGGTGATTTAGAGGGAGCAAGGAAAGCTGTTCAGCATATAGTTAGCAGAGATGCCTC 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 AAATGGTGATTTAGAGGGAGCAAGGAAAGCTGTTCAGCATATAGTTAGCAGAGATGCCTC 1260
Query 1261 AAAGTTGGATAAAGAGCATGTATTATCGGCTGCAGTAGAGAGCTTATCCGAGAACATAAC 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 AAAGTTGGATAAAGAGCATGTATTATCGGCTGCAGTAGAGAGCTTATCCGAGAACATAAC 1320
Query 1321 AGACAGTATAATTGGAGCTTTATTCTATGCTATATTTTTTGGTTTGCCTGGAGCCTTTGT 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 AGACAGTATAATTGGAGCTTTATTCTATGCTATATTTTTTGGTTTGCCTGGAGCCTTTGT 1380
Query 1381 TTATAGGGCGATAAATACATTAGATGCAATGATTGGTTATAAAAATGAGAAATATCTATG 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 TTATAGGGCGATAAATACATTAGATGCAATGATTGGTTATAAAAATGAGAAATATCTATG 1440
Query 1441 GTATGGGAAGTTAGCAGCAAGGTTGGATGATATTGCCAATTTTATTCCTTCAAGAATAGC 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 GTATGGGAAGTTAGCAGCAAGGTTGGATGATATTGCCAATTTTATTCCTTCAAGAATAGC 1500
Query 1501 AGGGATTTTGCTAATAATTACTGCCCCATTTTATAAAGGAGATGTTAAAAAGGCAATATA 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 AGGGATTTTGCTAATAATTACTGCCCCATTTTATAAAGGAGATGTTAAAAAGGCAATATA 1560
Query 1561 TGGGTTTTTAAAAGAAGCTAATAAGGTTCCATCACCAAACTCTGGTTATACAATGGCTAC 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 TGGGTTTTTAAAAGAAGCTAATAAGGTTCCATCACCAAACTCTGGTTATACAATGGCTAC 1620
Query 1621 ATTGGCAAATGCATTAAATATAACTTTGGAGAAGATAGGATATTATAAACTTGGTAGTGG 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 ATTGGCAAATGCATTAAATATAACTTTGGAGAAGATAGGATATTATAAACTTGGTAGTGG 1680
Query 1681 GAAAATAGATGTTGAAAAATCTTTAAACGCTTTTAAGGCAGTTGATTATACAGTCGTTGT 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GAAAATAGATGTTGAAAAATCTTTAAACGCTTTTAAGGCAGTTGATTATACAGTCGTTGT 1740
Query 1741 GTTTTTAATTATTTATACTTTAATTTGGTGGATAACATGATAAGTAAAGCTTATTACACT 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GTTTTTAATTATTTATACTTTAATTTGGTGGATAACATGATAAGTAAAGCTTATTACACT 1800
Query 1801 ACAGAGATTCCAGAGGATAGATTTGAAGCTCTGAGTTGTATTAAAGATAGTCAAAAACCT 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 ACAGAGATTCCAGAGGATAGATTTGAAGCTCTGAGTTGTATTAAAGATAGTCAAAAACCT 1860
Query 1861 CTTAAAATTATATTACTTGGAGGAGTTGATAGTGGTAAAACAACATTAGCTACTTTTTTG 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 CTTAAAATTATATTACTTGGAGGAGTTGATAGTGGTAAAACAACATTAGCTACTTTTTTG 1920
Query 1921 GCAAATGAGCTTTTAAACTTAGGATTTAAAGTTGCTATAGTCGATAGTGATGTAGGGCAG 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 GCAAATGAGCTTTTAAACTTAGGATTTAAAGTTGCTATAGTCGATAGTGATGTAGGGCAG 1980
Query 1981 AAGAGCATTTTACCTCCAGC 2000
||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 AAGAGCATTTTACCTCCAGC 2000
Query= ERCC-00034_genbank |110586147|gb|DQ855001.1| Synthetic construct
clone AG012.1111 external RNA control sequence
Length=996
Subject= ERCC-00034
Length=1019
Score = 1805 bits (977), Expect = 0.0
Identities = 990/996 (99%), Gaps = 1/996 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTATTACCCAGCACTCGTATGGCGCCCCATCGTTGTATCAGCAGGAGCATATGTTGCTC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGTATTACCCAGCACTCGTATGGCGCCCCATCGTTGTATCAGCAGGAGCATATGTTGCTC 60
Query 61 TTGATTGTATCACTTCGCGAGAAAGACCCCTTGAATACACGAGCTGCCGTCCGGATAACG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTGATTGTATCACTTCGCGAGAAAGACCCCTTGAATACACGAGCTGCCGTCCGGATAACG 120
Query 121 ATGTAATAGCCTATGGAGGGGAAGTAGTCATGTCTGCGGACTATTGGTAAGAGCACCGCC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATGTAATAGCCTATGGAGGGGAAGTAGTCATGTCTGCGGACTATTGGTAAGAGCACCGCC 180
Query 181 TCGTCGTACGTGGACACGAAGCTGTTCGGCCGCACGCAAGTACCTCCCACTTAGAAAGCG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCGTCGTACGTGGACACGAAGCTGTTCGGCCGCACGCAAGTACCTCCCACTTAGAAAGCG 240
Query 241 AATAACCCAACGACCGTGTTCAACCCTGGCCGTCTCTCAACCAGGTATGCAATCAACGAC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AATAACCCAACGACCGTGTTCAACCCTGGCCGTCTCTCAACCAGGTATGCAATCAACGAC 300
Query 301 ATTGGCCCAGATGTAGGGCCGTCTTGGTGGATTGAAACTCGGATCGATCACGTATGGTCT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATTGGCCCAGATGTAGGGCCGTCTTGGTGGATTGAAACTCGGATCGATCACGTATGGTCT 360
Query 361 AGACCTTATACAACACCTGTGCGTGCGTCTGCGTCTGGCGATGGTGGGTAGCGGTCCGGA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AGACCTTATACAACACCTGTGCGTGCGTCTGCGTCTGGCGATGGTGGGTAGCGGTCCGGA 420
Query 421 CCACGATCGTACTGTAGGCGGCCCAAATGCGGATCTTTAGGTTGACCGATTGTACATCTC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CCACGATCGTACTGTAGGCGGCCCAAATGCGGATCTTTAGGTTGACCGATTGTACATCTC 480
Query 481 GCCATAGCCCTTTTCGTCACAACCTTTATAAAAGGGGTCAGGCCACTGTGTGAATCAGAT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GCCATAGCCCTTTTCGTCACAACCTTTATAAAAGGGGTCAGGCCACTGTGTGAATCAGAT 540
Query 541 GGCAAGCCCGTATCCGTATAGAAACATACGTTTCTCTGGCCACGACCAATAATTATGCAC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GGCAAGCCCGTATCCGTATAGAAACATACGTTTCTCTGGCCACGACCAATAATTATGCAC 600
Query 601 TGTTGGCTccccccccGGGTCTACGGAGAACATTAGATATCGACCTAATATCCTGATAGC 660
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TGTTGGCTCGGAAGC-GGGTCTACGGAGAACATTAGATATCGACCTAATATCCTGATAGC 659
Query 661 TAGCTTTCCCGAGGATAGGCGAGGATGGGCGTGCTAGACACAGGAGCATTGCATCACATG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TAGCTTTCCCGAGGATAGGCGAGGATGGGCGTGCTAGACACAGGAGCATTGCATCACATG 719
Query 721 AATAAAGGGCTACGTACGCAGCGGCGTTAAGACAGACTTAGACTGATCACTATGAAATGA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 AATAAAGGGCTACGTACGCAGCGGCGTTAAGACAGACTTAGACTGATCACTATGAAATGA 779
Query 781 TAGACACCATGTCGCAATTTGCTCCCTCACTCATATCGTTGTATCATAAAGTTGATCCTA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 TAGACACCATGTCGCAATTTGCTCCCTCACTCATATCGTTGTATCATAAAGTTGATCCTA 839
Query 841 ATCACAAACCGAGTAACGAGCCAGACTAATCCGGAACATTCGTAAGCGATAGTGGTTGGC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 ATCACAAACCGAGTAACGAGCCAGACTAATCCGGAACATTCGTAAGCGATAGTGGTTGGC 899
Query 901 TCCTCCCGGTCGCCGAACTGATATCATAGCTAAGTATGCTGGCCTCGGTTAACCGCGAAG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TCCTCCCGGTCGCCGAACTGATATCATAGCTAAGTATGCTGGCCTCGGTTAACCGCGAAG 959
Query 961 GCATATACAATGGATTCGCTGTCCGCGTAGCAATAT 996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 GCATATACAATGGATTCGCTGTCCGCGTAGCAATAT 995
Query= ERCC-00035_genbank |92111291|gb|DQ459413.1| Synthetic construct
microarray control MC02 mRNA, complete sequence
Length=1136
Subject= ERCC-00035
Length=1130
Score = 2065 bits (1118), Expect = 0.0
Identities = 1127/1131 (99%), Gaps = 2/1131 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGAGGTATCGTAAAGGTGAATCCTGTGGCTGTAGGAAGCAGTTCATATGACCAACGG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGGAGAGGTATCGTAAAGGTGAATCCTGTGGCTGTAGGAAGCAGTTCATATGACCAACGG 60
Query 61 GCGCCCTAGGGTATACTCCAGAATCGAATGTTACCAGAAAATAGGGGAACTGGTCGCTCC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GCGCCCTAGGGTATACTCCAGAATCGAATGTTACCAGAAAATAGGGGAACTGGTCGCTCC 120
Query 121 TAGGTAAGGTTGCCTGTCCCCGCACTGTACGAAGGTCCGGTCAACGGAAGCAGGCACACG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TAGGTAAGGTTGCCTGTCCCCGCACTGTACGAAGGTCCGGTCAACGGAAGCAGGCACACG 180
Query 181 CGCTATCTGAGTCCAAATACTTGATCCGGCCGGAAAATTAGAGGTGACGGCTTCCCACTA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CGCTATCTGAGTCCAAATACTTGATCCGGCCGGAAAATTAGAGGTGACGGCTTCCCACTA 240
Query 241 CTGATCTCACTGACGTGCAATCATCCTGTGTCCGGAGCAATGACAGTGTCCAGTCTGTTA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTGATCTCACTGACGTGCAATCATCCTGTGTCCGGAGCAATGACAGTGTCCAGTCTGTTA 300
Query 301 TGGACGAGCTGGACGATTCACAGATAAGGACAGTCGCCCGGATACCGCAAACTAAATCTT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TGGACGAGCTGGACGATTCACAGATAAGGACAGTCGCCCGGATACCGCAAACTAAATCTT 360
Query 361 GCCTGCCTCCGAGGGTGTGTGAAGGATAACTGTCGCCCTTAAGTAAAGATCTACCATTCG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GCCTGCCTCCGAGGGTGTGTGAAGGATAACTGTCGCCCTTAAGTAAAGATCTACCATTCG 420
Query 421 CCGGGGCAACGCGGCTCTCTGATGCTACGACCAAAGTGGTTGACATTACGCCAGTAATGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CCGGGGCAACGCGGCTCTCTGATGCTACGACCAAAGTGGTTGACATTACGCCAGTAATGG 480
Query 481 ACTAAGGTTGAATTTGAGCGGATGGGCTCAACTGCGTCGTAACCGGTAGATACAGGGCAT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ACTAAGGTTGAATTTGAGCGGATGGGCTCAACTGCGTCGTAACCGGTAGATACAGGGCAT 540
Query 541 ACGAGCCTCCCTATTTAACGGCATCATCCCGCGTAGTGCTGGTCAACCCGACTGTCTATT 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 541 ACGAGCCTCCCTATTTAACGGCATCATCCCGCGTAGTGCTGGTCAACC-GACTGTCTATT 599
Query 601 GAAGTCAGGTTTCGGCTACATCAGCTGGAACGTTCCCGTAGCTACTATAATCAGGCAATC 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 GAAGTCAGGTTTCGGCTACATCAGCTGGAACGTTCCCGTAGCTACTATAATCAGGCAATC 659
Query 661 TGTCCCGAAGAGCCCACACCCTGACTTGGCCGTAAGGGAGCCCTAAATCAGTTAAATACG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TGTCCCGAAGAGCCCACACCCTGACTTGGCCGTAAGGGAGCCCTAAATCAGTTAAATACG 719
Query 721 GGGAAGGAGTCTCGCCCTCCGGGTGATCCATCTTATTTACCAAAGAACATGTC-ACGCCT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 720 GGGAAGGAGTCTCGCCCTCCGGGTGATCCATCTTATTTACCAAAGAACATGTCCACGCCT 779
Query 780 GTGGGCTCTGAAGATGGGCGACACATGTCTACCCTGGCATAACGCCCAGCTTGATAAGAG 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GTGGGCTCTGAAGATGGGCGACACATGTCTACCCTGGCATAACGCCCAGCTTGATAAGAG 839
Query 840 TGAAACGACCCATCTGACACAGGCCGGCATAGAAGACCAGCGCAATGCGAGGGCCACACA 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TGAAACGACCCATCTGACACAGGCCGGCATAGAAGACCAGCGCAATGCGAGGGCCACACA 899
Query 900 TAGGAGTGTGAAAATCTACATCAACATACTTCGGCCGTGGCTGAACCAGGGAGTGCTTGT 959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 900 TAGGAGTGTGAAAATCTACATCAACATACTTCGGCCGTGGCTGAACGAGGGAGTGCTTGT 959
Query 960 ACAATCCCGTTGTTTGGTGTGGCAGATTCCGGGAAATGAGCAAACGCTTCTCCCATGAAC 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 ACAATCCCGTTGTTTGGTGTGGCAGATTCCGGGAAATGAGCAAACGCTTCTCCCATGAAC 1019
Query 1020 ACACTCACAGCCATAAGTCCTACCTTGCTAACATCGCCCCGAATGCAGAGCCACCTACTG 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 ACACTCACAGCCATAAGTCCTACCTTGCTAACATCGCCCCGAATGCAGAGCCACCTACTG 1079
Query 1080 GGGTTGTCTGAGAATACTCCATGGGTCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1130
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 GGGTTGTCTGAGAACACTCCATGGGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1130
Query= ERCC-00039_genbank |114975660|gb|DQ883656.2| Synthetic construct
clone NISTag15 external RNA control sequence
Length=750
Subject= ERCC-00039
Length=740
Score = 1367 bits (740), Expect = 0.0
Identities = 740/740 (100%), Gaps = 0/740 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGCATGGCCTAACTGAATGCGCCTGCAGTATCTTTCTTAGTATATCAAGATCCGTAATA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAGCATGGCCTAACTGAATGCGCCTGCAGTATCTTTCTTAGTATATCAAGATCCGTAATA 60
Query 61 TAACGGTTTGCGCGACTACGGTTACCGTCTTTATAAGTGAACAAAACCGGCTACCAGCAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TAACGGTTTGCGCGACTACGGTTACCGTCTTTATAAGTGAACAAAACCGGCTACCAGCAT 120
Query 121 GTCGTATTTCGCCACCCATATAAACCCCACTTCGTCCTCAAGGAATCCAAAAGTCGGACG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTCGTATTTCGCCACCCATATAAACCCCACTTCGTCCTCAAGGAATCCAAAAGTCGGACG 180
Query 181 GCGTGGCTTGTCATCTTCGTCAGAAGGTTCGAAACCAGTAAAAAGACGCGATAGATAGGC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GCGTGGCTTGTCATCTTCGTCAGAAGGTTCGAAACCAGTAAAAAGACGCGATAGATAGGC 240
Query 241 CTAAGTGGGCCTCCCCTTTGCCAAAATCACGACGAAGTGACTAGTGCAGGCGTCGTATAC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTAAGTGGGCCTCCCCTTTGCCAAAATCACGACGAAGTGACTAGTGCAGGCGTCGTATAC 300
Query 301 TTACTCCTCATGTTCAGCCCACGCTGCATTGGTAGGCTGTTAGAAGCCGTGACCGAACAG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTACTCCTCATGTTCAGCCCACGCTGCATTGGTAGGCTGTTAGAAGCCGTGACCGAACAG 360
Query 361 GGTATGATGACCTCGCCATGGGCACCCTTGTATTCTCGGGGGCGGATGTAGAAATCAAAG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGTATGATGACCTCGCCATGGGCACCCTTGTATTCTCGGGGGCGGATGTAGAAATCAAAG 420
Query 421 CTGTTTACTAACCATGTACTGTCCTAAGAGATTGGCTGTGACCGGTCCCGGACACTGCGT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CTGTTTACTAACCATGTACTGTCCTAAGAGATTGGCTGTGACCGGTCCCGGACACTGCGT 480
Query 481 CAACGCAGGTCGCTCACGATCGGCGTGCGCATTTTCGTGAATCATGTATAGTGGTTCTCG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CAACGCAGGTCGCTCACGATCGGCGTGCGCATTTTCGTGAATCATGTATAGTGGTTCTCG 540
Query 541 TTAGATACACATGTAAGCTGAATGGGGCCCTACCCAACCGGTTGGGTCTATAAGGCAGAT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TTAGATACACATGTAAGCTGAATGGGGCCCTACCCAACCGGTTGGGTCTATAAGGCAGAT 600
Query 601 GTGCGACGCACCTATTGGTAGGCCAATCTTATGGTTTGCCTCTTGTACTGAGGGTACCGC 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GTGCGACGCACCTATTGGTAGGCCAATCTTATGGTTTGCCTCTTGTACTGAGGGTACCGC 660
Query 661 AGAGGTCCACTGGTTAGCTCACACTATGATCTAGGAGCAGTTGGGCGGTAAACGGCaaaa 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AGAGGTCCACTGGTTAGCTCACACTATGATCTAGGAGCAGTTGGGCGGTAAACGGCAAAA 720
Query 721 aaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 740
||||||||||||||||||||
Sbjct 721 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 740
Query= ERCC-00040_genbank |114976678|gb|DQ883661.2| Synthetic construct
clone NISTag20 external RNA control sequence
Length=750
Subject= ERCC-00040
Length=744
Score = 1369 bits (741), Expect = 0.0
Identities = 743/744 (99%), Gaps = 0/744 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AACTACGATCCCATGAGAACACCTGTAGATACTCAGGTCTCCGCGGACCTACGCCGCGGA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AACTACGATCCCATGAGAACACCTGTAGATACTCAGGTCTCCGCGGACCTACGCCGCGGA 60
Query 61 CGATGATAAAGTCCGAGAAACCACCGGATTGCCCCAACAGACGGCCTAGCCCATCGAACT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CGATGATAAAGTCCGAGAAACCACCGGATTGCCCCAACAGACGGCCTAGCCCATCGAACT 120
Query 121 AGGGAAATGAACTATATCGTAACCAAGCCGGGTAGCTGCGGTGGTGCTAGACTAGATGTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AGGGAAATGAACTATATCGTAACCAAGCCGGGTAGCTGCGGTGGTGCTAGACTAGATGTT 180
Query 181 AGCGTTCAGTCGAGCTGTTACGTGTAACGCCATTGAGACCCTTACCCTTTACCGGTCGGC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AGCGTTCAGTCGAGCTGTTACGTGTAACGCCATTGAGACCCTTACCCTTTACCGGTCGGC 240
Query 241 GGATACGTCCAGCTTCGTCACTGCGTTCGAGCCTTCTACACGATCCAAGTTACCAGCGCA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GGATACGTCCAGCTTCGTCACTGCGTTCGAGCCTTCTACACGATCCAAGTTACCAGCGCA 300
Query 301 GTTTAAGGTACGTCGCTTCGACCAGAACGAGAGTTCGCAGCAAGGGGGAGGAGTTGGATT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GTTTAAGGTACGTCGCTTCGACCAGAACGAGAGTTCGCAGCAAGGGGGAGGAGTTGGATT 360
Query 361 CTTAGGGAATGAGGCTGAACCTAACTCCTCGCTACATTCCTATTGTTTTCCCGATCGGCT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTTAGGGAATGAGGCTGAACCTAACTCCTCGCTACATTCCTATTGTTTTCCCGATCGGCT 420
Query 421 TCATCGGGACGCCGGAGACCGCACCTTTGCCCGTTTAAGCTCGGACGGGATGCCACGGTT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TCATCGGGACGCCGGAGACCGCACCTTTGCCCGTTTAAGCTCGGACGGGATGCCACGGTT 480
Query 481 CTGTTCCACAACCCGGTCGGAGCACACCCTCACTATGCTGCGTCTATGCCTTCCGGGTGG 540
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CTGTTCCACAACCCGGTCGGAGCACACCCTCTCTATGCTGCGTCTATGCCTTCCGGGTGG 540
Query 541 TTGAGGTGAGCCATGTGGTCTTAGAATCCGGTTGTATTAGACAGTATTGTGCTTGACGTC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TTGAGGTGAGCCATGTGGTCTTAGAATCCGGTTGTATTAGACAGTATTGTGCTTGACGTC 600
Query 601 GTGGTATCGGGTGGTTGTGAAGGATACAGATATTCTATGGGCAGCGATGGGGCTTCCTCA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GTGGTATCGGGTGGTTGTGAAGGATACAGATATTCTATGGGCAGCGATGGGGCTTCCTCA 660
Query 661 GTCCGTCTACGGCCCACCAGACAAACAACTCGGGATACAAATTGAGCACCCGCGGACCGG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GTCCGTCTACGGCCCACCAGACAAACAACTCGGGATACAAATTGAGCACCCGCGGACCGG 720
Query 721 aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 744
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 744
Query= ERCC-00041_genbank |116733906|gb|EF011069.1| Synthetic construct
spike-in microarray control O-sialoglycoprotein endopeptidase (gcp)
gene, complete cds
Length=1101
Subject= ERCC-00041
Length=1122
Score = 2032 bits (1100), Expect = 0.0
Identities = 1100/1100 (100%), Gaps = 0/1100 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 CCGAGCTCAAGATGCGTTAATTATGTGGGTGACGATAAATGAGTGAGCAAAAAGACATGT 61
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CCGAGCTCAAGATGCGTTAATTATGTGGGTGACGATAAATGAGTGAGCAAAAAGACATGT 60
Query 62 ACGTATTAGGAATTGAAACAAGCTGTGATGAGACTGCTGCAGCTATTGTGAAAAACGGGA 121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACGTATTAGGAATTGAAACAAGCTGTGATGAGACTGCTGCAGCTATTGTGAAAAACGGGA 120
Query 122 AAGAGATCATTTCAAACGTAGTAGCCTCTCAAATTGAAAGCCATAAGCGCTTCGGAGGCG 181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAGAGATCATTTCAAACGTAGTAGCCTCTCAAATTGAAAGCCATAAGCGCTTCGGAGGCG 180
Query 182 TTGTTCCGGAAATTGCTTCAAGACATCATGTTGAACAAATCACTTTGGTTATAGAAGAGG 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTGTTCCGGAAATTGCTTCAAGACATCATGTTGAACAAATCACTTTGGTTATAGAAGAGG 240
Query 242 CGTTTCGCAAAGCTGGCATGACGTATAGTGATATTGATGCGATTGCAGTAACAGAAGGTC 301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CGTTTCGCAAAGCTGGCATGACGTATAGTGATATTGATGCGATTGCAGTAACAGAAGGTC 300
Query 302 CGGGACTGGTGGGAGCGCTTCTTATCGGAGTGAATGCCGCTAAAGCATTGAGCTTTGCAT 361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CGGGACTGGTGGGAGCGCTTCTTATCGGAGTGAATGCCGCTAAAGCATTGAGCTTTGCAT 360
Query 362 ATAACATTCCGTTAGTAGGCGTTCATCATATAGCCGGTCATATATACGCGAACCGTCTTG 421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ATAACATTCCGTTAGTAGGCGTTCATCATATAGCCGGTCATATATACGCGAACCGTCTTG 420
Query 422 TAGAAGACATCGTGTTCCCGGCACTGGCATTGGTCGTTTCAGGAGGCCATACAGAACTGG 481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TAGAAGACATCGTGTTCCCGGCACTGGCATTGGTCGTTTCAGGAGGCCATACAGAACTGG 480
Query 482 TTTATATGAAGGAACATGGATCATTTGAAGTCATTGGGGAAACCCTTGATGATGCGGCAG 541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TTTATATGAAGGAACATGGATCATTTGAAGTCATTGGGGAAACCCTTGATGATGCGGCAG 540
Query 542 GAGAAGCCTACGACAAAGTGGCGCGGACGATGGGATTGCCATATCCGGGTGGACCGCAAA 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GAGAAGCCTACGACAAAGTGGCGCGGACGATGGGATTGCCATATCCGGGTGGACCGCAAA 600
Query 602 TTGACAAGCTAGCTGAAAAAGGGAATGACAATATTCCGCTTCCTCGCGCATGGCTTGAAG 661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TTGACAAGCTAGCTGAAAAAGGGAATGACAATATTCCGCTTCCTCGCGCATGGCTTGAAG 660
Query 662 AAGGCTCTTACAACTTCAGCTTTAGCGGATTGAAGTCTGCGGTGATCAATACGCTTCATA 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AAGGCTCTTACAACTTCAGCTTTAGCGGATTGAAGTCTGCGGTGATCAATACGCTTCATA 720
Query 722 ATGCATCCCAAAAAGGGCAAGAGATTGCTCCGGAAGATTTGTCTGCCAGTTTCCAAAATA 781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 ATGCATCCCAAAAAGGGCAAGAGATTGCTCCGGAAGATTTGTCTGCCAGTTTCCAAAATA 780
Query 782 GTGTGATCGATGTCTTGGTAACCAAAACGGCGCGCGCGGCAAAGGAATATGATGTCAAAC 841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GTGTGATCGATGTCTTGGTAACCAAAACGGCGCGCGCGGCAAAGGAATATGATGTCAAAC 840
Query 842 AGGTCCTTTTAGCCGGAGGAGTAGCTGCAAACAGAGGCCTCAGAGCTGCATTAGAAAAGG 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AGGTCCTTTTAGCCGGAGGAGTAGCTGCAAACAGAGGCCTCAGAGCTGCATTAGAAAAGG 900
Query 902 AATTTGCCCAGCATGAAGGGATTACGCTTGTCATTCCTCCATTAGCTTTATGCACGGATA 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AATTTGCCCAGCATGAAGGGATTACGCTTGTCATTCCTCCATTAGCTTTATGCACGGATA 960
Query 962 ATGCTGCGATGATTGCTGCTGCTGGTACAATTGCTTTTGAAAAAGGAATTCGCGGTGCAT 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATGCTGCGATGATTGCTGCTGCTGGTACAATTGCTTTTGAAAAAGGAATTCGCGGTGCAT 1020
Query 1022 ATGATATGAATGGCCAGCCCGGCCTTGAATTGACTTCTTATCAAAGTCTCACGAGATAAT 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 ATGATATGAATGGCCAGCCCGGCCTTGAATTGACTTCTTATCAAAGTCTCACGAGATAAT 1080
Query 1082 AGCGTGAGACTCCCGGGTAC 1101
||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 AGCGTGAGACTCCCGGGTAC 1100
Query= ERCC-00042_genbank |103488730|gb|DQ516783.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-66 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00042
Length=1023
Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCAACTCTGGCCTTTGTGTTGCTATTCCCCAAGCACACAATCCAGTATAACATCTTCCA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACCAACTCTGGCCTTTGTGTTGCTATTCCCCAAGCACACAATCCAGTATAACATCTTCCA 60
Query 61 CAAACTCTACAGCCAAGAGCAACCATTGCAGCAGTTCCAATATAGACAGCATCTGCTCCT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CAAACTCTACAGCCAAGAGCAACCATTGCAGCAGTTCCAATATAGACAGCATCTGCTCCT 120
Query 121 AAAGCTATAGCCTTAAATACATCTGCTGAACATCTGATTCCTCCACTTGCTATGATGCTA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAAGCTATAGCCTTAAATACATCTGCTGAACATCTGATTCCTCCACTTGCTATGATGCTA 180
Query 181 ATTTCATTTCTCAAACCTTCCTCTCTCAATCTTTGATCTACTGCGGCAATAGCCATTTCT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ATTTCATTTCTCAAACCTTCCTCTCTCAATCTTTGATCTACTGCGGCAATAGCCATTTCT 240
Query 241 ATTGGGATTCCAACATGGTCTCTGAATACCTTTGGTGCTGCCCCTGTCCCTCCTTTATAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATTGGGATTCCAACATGGTCTCTGAATACCTTTGGTGCTGCCCCTGTCCCTCCTTTATAT 300
Query 301 CCATCTATAACAACTGCGTCAGCATCACTTGTTGCTATTCCAACAGCAATAGCTGGAGCA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CCATCTATAACAACTGCGTCAGCATCACTTGTTGCTATTCCAACAGCAATAGCTGGAGCA 360
Query 361 TTATGGACAGCTGCAATTTTAACAAACACTGGCTTTTTCCATCTTGTTGCTTCTTTCAAA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTATGGACAGCTGCAATTTTAACAAACACTGGCTTTTTCCATCTTGTTGCTTCTTTCAAA 420
Query 421 CTTCTAACTAATTGAGCTAAATCCTCAATTGAGTAAATGTCATGGTGAGGAGCTGGTGAG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CTTCTAACTAATTGAGCTAAATCCTCAATTGAGTAAATGTCATGGTGAGGAGCTGGTGAG 480
Query 481 ATAGCATCACTTCCCTCAGGAATCATTCTTGTTGCTGAAATTTCTGCTGTAACCTTCTCT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ATAGCATCACTTCCCTCAGGAATCATTCTTGTTGCTGAAATTTCTGCTGTAACCTTCTCT 540
Query 541 CCAGGTAAGTGCCCTCCAATTCCAGGCTTAGCTCCCTGCCCTATTTTAATCTCTATTGCA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CCAGGTAAGTGCCCTCCAATTCCAGGCTTAGCTCCCTGCCCTATTTTAATCTCTATTGCA 600
Query 601 GAACCTTTCATAAGATACTCTTCATTAACTCCAAATCTTCCACTTGCAACTTGGGTAATT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GAACCTTTCATAAGATACTCTTCATTAACTCCAAATCTTCCACTTGCAACTTGGGTAATT 660
Query 661 ATGTGGTCTGCATAAGGGTAGAGAGCTTTTGGCAATCCTCCTTCACCAGTTCCCATGAAT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ATGTGGTCTGCATAAGGGTAGAGAGCTTTTGGCAATCCTCCTTCACCAGTTCCCATGAAT 720
Query 721 GTTCCACATTCTTTAACTGCCTTAGCAAATGATAGGTGAGCGTTTAAAGACAAAGCTCCA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GTTCCACATTCTTTAACTGCCTTAGCAAATGATAGGTGAGCGTTTAAAGACAAAGCTCCA 780
Query 781 TAAGACATATGGGCAATCATTATTGGGGTATCTAACTTTAAGTTTGGAGCTAtttttgtt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TAAGACATATGGGCAATCATTATTGGGGTATCTAACTTTAAGTTTGGAGCTATTTTTGTT 840
Query 841 tttaacttagcttttttAATCTTCTTGCCATCAATCTCTTCTTCAACAAATTCAAACTCT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TTTAACTTAGCTTTTTTAATCTTCTTGCCATCAATCTCTTCTTCAACAAATTCAAACTCT 900
Query 901 AACTGCTTTGGTTTTTTACCAATGTAAGTTCTTAATTCCATTGGCTCTCTCAATGGGTCG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AACTGCTTTGGTTTTTTACCAATGTAAGTTCTTAATTCCATTGGCTCTCTCAATGGGTCG 960
Query 961 ATGGATGGGTTTGTAACTTGGCATGCATCTAAAACAATCT 1000
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATGGATGGGTTTGTAACTTGG-ATGCATCTAAAACAATCT 999
Query= ERCC-00043_genbank |103488734|gb|DQ516787.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-70 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00043
Length=1023
Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATACCTTTACAAATGCTTTAACAAGAGGAAATTGTGTTTTTGCCAATTTAAGACCTAAT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AATACCTTTACAAATGCTTTAACAAGAGGAAATTGTGTTTTTGCCAATTTAAGACCTAAT 60
Query 61 TTAATAGTTAAACCATTAACCTTAGTTGTTCCAAGGCATAATATAGAGAGTGAGATACAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTAATAGTTAAACCATTAACCTTAGTTGTTCCAAGGCATAATATAGAGAGTGAGATACAG 120
Query 121 GATGAGCTATTTCAGGGAGTTATTCAGTATGCAGTTGCCAAGGCAGTTGCTGATTTAGAT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GATGAGCTATTTCAGGGAGTTATTCAGTATGCAGTTGCCAAGGCAGTTGCTGATTTAGAT 180
Query 181 TTAGATGAAGATTTAAAGGTTGTTGTCTCTGTTAATGTCCCAGAGGTTCCAATAACCAAT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTAGATGAAGATTTAAAGGTTGTTGTCTCTGTTAATGTCCCAGAGGTTCCAATAACCAAT 240
Query 241 TTAAATAAAAGAAAACTCTTCCAATACTTCTATGCCTCAGCAAAGTTAGCTATAAACAGA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TTAAATAAAAGAAAACTCTTCCAATACTTCTATGCCTCAGCAAAGTTAGCTATAAACAGA 300
Query 301 GCTTTAAATGAATATCCTTCAAAAGAGAAGGTAAAGAAAGAGAAATATAGAGCTTTGCAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GCTTTAAATGAATATCCTTCAAAAGAGAAGGTAAAGAAAGAGAAATATAGAGCTTTGCAT 360
Query 361 CCATTAGTTGGATTTAGGGATGTTAGATTGGAGTATCCTCCATATCTACAAATTGCTTTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CCATTAGTTGGATTTAGGGATGTTAGATTGGAGTATCCTCCATATCTACAAATTGCTTTG 420
Query 421 GATGTCCCAACTATGGAGAATTTGGAATTTTTGTTACAAACAATTCCAAATAGCGACCAC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GATGTCCCAACTATGGAGAATTTGGAATTTTTGTTACAAACAATTCCAAATAGCGACCAC 480
Query 481 ATCATCTTAGAGGCTGGAACACCACTAATTAAAAAGTTTGGTTTAGAGGTTATTGAAATA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ATCATCTTAGAGGCTGGAACACCACTAATTAAAAAGTTTGGTTTAGAGGTTATTGAAATA 540
Query 541 ATGAGAGAATATTTTGATGGCTTTATTGTTGCTGATTTAAAAACCTTAGACACTGGAAGG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 ATGAGAGAATATTTTGATGGCTTTATTGTTGCTGATTTAAAAACCTTAGACACTGGAAGG 600
Query 601 GTTGAGGTAAGATTGGCATTTGAAGCAACAGCTAATGCAGTGGCAATAAGTGGAGTAGCA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GTTGAGGTAAGATTGGCATTTGAAGCAACAGCTAATGCAGTGGCAATAAGTGGAGTAGCA 660
Query 661 CCAAAATCAACAATAATTAAAGCTATCCACGAATGTCAAAAATGTGGTTTAATCAGCTAT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CCAAAATCAACAATAATTAAAGCTATCCACGAATGTCAAAAATGTGGTTTAATCAGCTAT 720
Query 721 TTGGATATGATGAACGTCTCTGAACCTCAAAAATTATATGATTCATTAAAATTAAAGCCA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TTGGATATGATGAACGTCTCTGAACCTCAAAAATTATATGATTCATTAAAATTAAAGCCA 780
Query 781 GATGTTGTTATCTTGCATAGAGGGATTGATGAGGAGACATTTGGAATTAAAAAGGAATGG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GATGTTGTTATCTTGCATAGAGGGATTGATGAGGAGACATTTGGAATTAAAAAGGAATGG 840
Query 841 AAATTTAAGGAAAACTGCTTATTAGCAATTGCTGGAGGAGTTGGTGTGGAGAATGTTGAA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AAATTTAAGGAAAACTGCTTATTAGCAATTGCTGGAGGAGTTGGTGTGGAGAATGTTGAA 900
Query 901 GAGCTTTTAAAAGAATATCAAATATTAATCGTTGGTAGAGCAATTACAAAATCAAAAGAC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GAGCTTTTAAAAGAATATCAAATATTAATCGTTGGTAGAGCAATTACAAAATCAAAAGAC 960
Query 961 CCAGGAAGAGTAATTAGGATGTTTATAAACAAGATGGGTT 1000
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 961 CCAGGAAGAGTAATTAGGAT-TTTATAAACAAGATGGGTT 999
Query= ERCC-00044_genbank |92111302|gb|DQ459424.1| Synthetic construct
microarray control MC19 mRNA, complete sequence
Length=1140
Subject= ERCC-00044
Length=1156
Score = 2008 bits (1087), Expect = 0.0
Identities = 1106/1114 (99%), Gaps = 6/1114 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 AGATAGTGACTAGGGTAAATGCCAAGCCGTCTTATAAAAGCGGTAGCGAGAGATCTTAGA 63
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGATAGTGACTAGGGTAAATGCCAAGCCGTCTTATAAAAGCGGTAGCGAGAGATCTTAGA 60
Query 64 ACTCCCGGGCGAACGCCCCAACTTATGCGATGTCCAGCCCCAAACGGTTGATTAGATCGG 123
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACTCCCGG-CGAACGCCCCAACTTATGCGATGTCCAGCCCCAAACGGTTGATTAGATCGG 119
Query 124 TAGCTCCCGAACTAAGAGACCCTAAACGCTATCCGTGGACTGTGTAGGTAGGCCGTCGTC 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TAGCTCCCGAACTAAGAGACCCTAAACGCTATCCGTGGACTGTGTAGGTAGGCCGTCGTC 179
Query 184 CTAAGTGGCCTCGTGAACTAACGCCTGCTGCTATGTCCCAATGAAGGGTACATGCCCTCT 243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CTAAGTGGCCTCGTGAACTAACGCCTGCTGCTATGTCCCAATGAAGGGTACATGCCCTCT 239
Query 244 TCCCGTACTACGCCGATACAAAGTCCCGAACGAGCTTACGAAATATAGCGCTTAACCATG 303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TCCCGTACTACGCCGATACAAAGTCCCGAACGAGCTTACGAAATATAGCGCTTAACCATG 299
Query 304 GG-CCACCATAGGTGCCTGGTACAGACGTGTCAGACGAGCCCTCGGCTAGCTCATAATTG 362
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GGGCCACCATAGGTGCCTGGTACAGACGTGTCAGACGAGCCCTCGGCTAGCTCATAATTG 359
Query 363 CGGCCGTTCATATAAACCTCAGCGTCTGGTCATGTCTGTTACCACAACGCTCCCGGTTCT 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 360 CGGCCGTTCATATAAACCTCAGCGTCTGGTCATGTCTGT-ACCACAACGCTCCCGGTTCT 418
Query 423 TCGACGCTCAGTTCGGTACCCAAGATAGCGGACTCTCAAAGAACGATTCAGTAGTCGC-G 481
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 419 TCGACGCTCAGTTCGGTACCCAAGATAGCGGACTCTCAAAGAACGATTCAGTAGTCGCCG 478
Query 482 TACCCATGTAGGCCTTAAGAGGTCTAATTAGCTCTAGGAAACACAACGCCGGGATTTGGG 541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 479 TACCCATGTAGGCCTTAAGAGGTCTAATTAGCTCTAGGAAACACAACCCCGGGATTTGGG 538
Query 542 ATACGCCACCAACACGATATCCAGCCGCATCGCACGCGTCGAAGTCCTCCGTGCTTGTGT 601
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 ATACGCCACCAACACGA-ATCCAGCCGCATCGCACGCGTCGAAGTCCTCCGTGCTTGTGT 597
Query 602 GAGTCGACACATAGGATCGGGCACGGAGAGATCGGCGGTTGAAGTATGGAGCGTAGGTCT 661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 GAGTCGACACATAGGATCGGGCACGGAGAGATCGGCGGTTGAAGTATGGAGCGTAGGTCT 657
Query 662 CGATCTCGTACAAAACGACTATGACCATTGGGCGTTGTACTCATTATCGTTACGATTTTA 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 CGATCTCGTACAAAACGACTATGACCATTGGGCGTTGTACTCATTATCGTTACGATTTTA 717
Query 722 CGGTGGCAAACGAAGCTACCAAGTAGATGCCGACGTCGAGTGGATCCACGCAGTCCGAGA 781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 CGGTGGCAAACGAAGCTACCAAGTAGATGCCGACGTCGAGTGGATCCACGCAGTCCGAGA 777
Query 782 CAGCGCCACACTCGCTGTAGAGGGTTTCAATCCGACTAAGACGGCGGGATCTACTACTTC 841
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 CAGCGC-ACACTCGCTGTAGAGGGTTTCAATCCGACTAAGACGGCGGGATCTACTACTTC 836
Query 842 TGCGAGTTTAGATTAACTGTATCTCCCGAATGCGCGTTCTAAAACCCTGACGTGATGGGA 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 TGCGAGTTTAGATTAACTGTATCTCCCGAATGCGCGTTCTAAAACCCTGACGTGATGGGA 896
Query 902 CGGGTGAAGCACCAGGTTTTCGCCGGTTAGGTAAGGTAAAAATATGACCTTACCCTACGT 961
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 CGGGTGAAGCACCGGGTTTTCGCCGGTTAGGTAAGGTAAAAATATGACCTTACCCTACGT 956
Query 962 TGATTGTGGTCATTACAGCAAGAGGTGGGTTATAACGCAATCTATGTTCGCATGCTATGT 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 TGATTGTGGTCATTACAGCAAGAGGTGGGTTATAACGCAATCTATGTTCGCATGCTATGT 1016
Query 1022 TATTTGACCCCTGCGGTAAGATTATTCACTCGTCATGGATAACCGGATAATCCCGTATAA 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 TATTTGACCCCTGCGGTAAGATTATTCACTCGTCATGGATAACCGGATAATCCCGTATAA 1076
Query 1082 CCTGTGGGTATTATAGGCGACAATTCGaaaaaaa 1115
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 CCTGTGGGTATTATAGGCGACAATTCGAAAAAAA 1110
Query= ERCC-00046_genbank |103488695|gb|DQ516748.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-31 genomic sequence
Length=500
Subject= ERCC-00046
Length=522
Score = 911 bits (493), Expect = 0.0
Identities = 498/500 (99%), Gaps = 2/500 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCTCCTCTAACTTTGGAGAGGTAGGAATGGGAGTATTTGCACTTGTGGTAACGGTATTT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATCTCCTCTAACTTTGGAGAGGTAGGAATGGGAGTATTTGCACTTGTGGTAACGGTATTT 60
Query 61 GCATTATTGATGGTTTTTACTATGTTGGGTATGCTGTTCGATTTCTTAAAGGACTGAATA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GCATTATTGATGGTTTTTACTATGTTGGGTATGCTGTTCGATTTCTTAAAGGACTGAATA 120
Query 121 TTCGGTGGCAGTATGGGATTTCTAAAAATAATGTTAAGAATTTTTTGCTGGTTTTTTGCG 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 121 TTCGGTGGCAGTATGGGATTTCTAAAAATAATGTTAAGAA-TTTTTGCTGGTTTTTTGCG 179
Query 181 ACGTTGGTGTTGTATTCTATAGCTCCATTATGGCCGTTATATGGAATCATTGGAGTGCCA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 ACGTTGGTGTTGTATTCTATAGCTCCATTATGGCCGTTATATGGAATCATTGGAGTGCCA 239
Query 241 GTAATTCTACCACGCCTTATATTTAAAGACAAAAAGAAGTGTCTAACAACAACATCCACA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GTAATTCTACCACGCCTTATATTTAAAGACAAAAAGAAGTGTCTAACAACAACATCCACA 299
Query 301 CTACTACTCCTTGTCATATTTCTTCCTGAATTGCTGATTCTTATTGGATTTCTGATATTT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CTACTACTCCTTGTCATATTTCTTCCTGAATTGCTGATTCTTATTGGATTTCTGATATTT 359
Query 361 CCTATTGTTATGGGCTATTACATCTCTAAGGAATTGGTGAAGTAAAATGGTGAAGCTTAT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 CCTATTGTTATGGGCTATTACATCTCTAAGGAATTGGTGAAGTAAAATGGTGAAGCTTAT 419
Query 421 GAATTTGTGGAGTGAGAGGATTAAAGATAGGGAAGTTGTTGAAGTTATTGGCTGTGAGAG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GAATTTGTGGAGTGAGAGGATTAAAGATAGGGAAGTTGTTGAAGTTATTGGCTGTGAGAG 479
Query 481 AGTGCCATTGAATGAAACGT 500
||||||||||||| ||||||
Sbjct 480 AGTGCCATTGAAT-AAACGT 498
Query= ERCC-00048_genbank |114976955|gb|DQ883671.2| Synthetic construct
clone NISTag30 external RNA control sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00048
Length=992
Score = 1832 bits (992), Expect = 0.0
Identities = 992/992 (100%), Gaps = 0/992 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCTGTAAATCCCGTAAACGAGTAGTACGAATCCGGACTTGAATACACGCGTCAATCCCTT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCTGTAAATCCCGTAAACGAGTAGTACGAATCCGGACTTGAATACACGCGTCAATCCCTT 60
Query 61 TTATATCCTAGAATGGACCGTGTGGACGGCAACTCAGAGATAACGCATATCTATGTGCTC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTATATCCTAGAATGGACCGTGTGGACGGCAACTCAGAGATAACGCATATCTATGTGCTC 120
Query 121 GCTTGCCCATCAAAGAAGAGACGGCGACCAAACGGACGACATATAGTGACATGGTCAACC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GCTTGCCCATCAAAGAAGAGACGGCGACCAAACGGACGACATATAGTGACATGGTCAACC 180
Query 181 CGTACGCCTGCTTCGTAAGCCGACGGTCCTTTGAAGAGGCTGGCGAATCATGTCGTTTGT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CGTACGCCTGCTTCGTAAGCCGACGGTCCTTTGAAGAGGCTGGCGAATCATGTCGTTTGT 240
Query 241 GCTTACTATTACATGCTAGCTTGGTTGGGGCATCTCGGGACAACGTCTATGTACAATAAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GCTTACTATTACATGCTAGCTTGGTTGGGGCATCTCGGGACAACGTCTATGTACAATAAA 300
Query 301 CACAAAGCCGCGTAGTTATCTTCCGCGAGTTCCGCCCAATACATTGGCGGTGACTTGAGA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CACAAAGCCGCGTAGTTATCTTCCGCGAGTTCCGCCCAATACATTGGCGGTGACTTGAGA 360
Query 361 CCGCTAAAATGCACATAGAAGCCTCAAACATGGTAAGACTATAGATAAGCGGCGCGAAAA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CCGCTAAAATGCACATAGAAGCCTCAAACATGGTAAGACTATAGATAAGCGGCGCGAAAA 420
Query 421 CACGGCATTTGGAATGATGTGTACTGGGAATAAGACGACGTCGCTATGGCCTCTCCGGAA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CACGGCATTTGGAATGATGTGTACTGGGAATAAGACGACGTCGCTATGGCCTCTCCGGAA 480
Query 481 GGCGGTGTATGTGCCAAGCGATGTTTCATTAATGTAACGGACAGGTCGCTGAGGTGGCTT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GGCGGTGTATGTGCCAAGCGATGTTTCATTAATGTAACGGACAGGTCGCTGAGGTGGCTT 540
Query 541 TCGTTGGGGGCGCCGTCTTTGGGGGAGATTGCGTCAATTTTGACTGTCAGATCAGCGACT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TCGTTGGGGGCGCCGTCTTTGGGGGAGATTGCGTCAATTTTGACTGTCAGATCAGCGACT 600
Query 601 AGATTTTAGGCAGATTAGTGTGCCACCTGAATCAATAGAACAATATCAGTTATGGCGGTG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AGATTTTAGGCAGATTAGTGTGCCACCTGAATCAATAGAACAATATCAGTTATGGCGGTG 660
Query 661 CAGTATACTATACAATGGGTTGGGCGCATCTGCATGTCTCATGCTGTCATGGCAATCGAC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CAGTATACTATACAATGGGTTGGGCGCATCTGCATGTCTCATGCTGTCATGGCAATCGAC 720
Query 721 CTCTAGTCTGGGGTGATCCGAGGCGCTTCTCTTATTAGGAATAGTGCAGGACCCGAAACC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CTCTAGTCTGGGGTGATCCGAGGCGCTTCTCTTATTAGGAATAGTGCAGGACCCGAAACC 780
Query 781 GCCATAGGGAAAGGGTGAGCGAGGTAGCAGCGTAATAATTCGCGGTGGGCAGGAAATGCT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GCCATAGGGAAAGGGTGAGCGAGGTAGCAGCGTAATAATTCGCGGTGGGCAGGAAATGCT 840
Query 841 TAGTGTTCTGTCTCAAGACCTAAGCGACAGCGTGACCTTGTTTCACTTACCTCTGAAGCT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TAGTGTTCTGTCTCAAGACCTAAGCGACAGCGTGACCTTGTTTCACTTACCTCTGAAGCT 900
Query 901 CTTCGACGTTATAGATATTGGCATCCCTAAACAACGAGTACCTTGTGCTACGACAGAAAA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CTTCGACGTTATAGATATTGGCATCCCTAAACAACGAGTACCTTGTGCTACGACAGAAAA 960
Query 961 GTGACCTGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 992
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GTGACCTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 992
Query= ERCC-00051_genbank |103488687|gb|DQ516740.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-250-23 genomic sequence
Length=250
Subject= ERCC-00051
Length=274
Score = 462 bits (250), Expect = 3e-135
Identities = 250/250 (100%), Gaps = 0/250 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTACAATAGATGCGTTTAGAGTAGCTGGGGGAATTTTGCTCTTTAAAATAGCTTGGGACA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTACAATAGATGCGTTTAGAGTAGCTGGGGGAATTTTGCTCTTTAAAATAGCTTGGGACA 60
Query 61 TGCTTCACGCAGAAATTCCAAAAACAAAGCACAAACCAGATGAAAGATTAGACCTTGAAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TGCTTCACGCAGAAATTCCAAAAACAAAGCACAAACCAGATGAAAGATTAGACCTTGAAG 120
Query 121 ATATTGATAGTATAGTTTATGTCCCATTGGCTATTCCTTTAATCTCTGGCCCTGGAGCTA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATATTGATAGTATAGTTTATGTCCCATTGGCTATTCCTTTAATCTCTGGCCCTGGAGCTA 180
Query 181 TAACAACAACCATGATTTTGATTAGCAAAACCCAGAGTATCTTAGAGAAAGGGGTTGTTG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TAACAACAACCATGATTTTGATTAGCAAAACCCAGAGTATCTTAGAGAAAGGGGTTGTTG 240
Query 241 TTCTCTCTAT 250
||||||||||
Sbjct 241 TTCTCTCTAT 250
Query= ERCC-00053_genbank |103488732|gb|DQ516785.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-68 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00053
Length=1023
Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACATCTGTATAAAAAACACTACAGGGTGGTAACATGGTTCTATATAAAATTAGAAGATCA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACATCTGTATAAAAAACACTACAGGGTGGTAACATGGTTCTATATAAAATTAGAAGATCA 60
Query 61 AAAAACGATCCCTGTCCATCAATACCTTCAGCGGTAATTATAGGATATTCTGTTGGATTA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAAAACGATCCCTGTCCATCAATACCTTCAGCGGTAATTATAGGATATTCTGTTGGATTA 120
Query 121 AAATTAATTACTGGACATGGAGCTCAGAGCTTAAGCAATATGGCTGGTTCTTATGCTGGA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAATTAATTACTGGACATGGAGCTCAGAGCTTAAGCAATATGGCTGGTTCTTATGCTGGA 180
Query 181 AAGGAATTGGGAATTTACGCAATGAATAATGGTTATGAATTTAAGGATATTAAAGATATT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AAGGAATTGGGAATTTACGCAATGAATAATGGTTATGAATTTAAGGATATTAAAGATATT 240
Query 241 GAAAGATTTCTTAACCAGTTAGATTTTGCAAAGATAGAGATGAATGAGGAAGAGGATGAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GAAAGATTTCTTAACCAGTTAGATTTTGCAAAGATAGAGATGAATGAGGAAGAGGATGAA 300
Query 301 ATTATAGTAAAGATATCAAAATGCAATCTCTGCCCAAAGAGAATTTGTGGCTATGAATTT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATTATAGTAAAGATATCAAAATGCAATCTCTGCCCAAAGAGAATTTGTGGCTATGAATTT 360
Query 361 GAAGGAACAGCATGCCCTTGGGGAGGATTGTTAATTGGATTTATAAGTGAAACTTTAAAG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAAGGAACAGCATGCCCTTGGGGAGGATTGTTAATTGGATTTATAAGTGAAACTTTAAAG 420
Query 421 TATAATTTAGGCTACCAAATGAATTTAAAGCCAGCTGAAACATGTATTATTAAATTAAAG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TATAATTTAGGCTACCAAATGAATTTAAAGCCAGCTGAAACATGTATTATTAAATTAAAG 480
Query 481 AAGAAATAAAACTTATCTAATATTAAAAAACTCCAAAATCTCATAAGGATGCTTTAATAC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AAGAAATAAAACTTATCTAATATTAAAAAACTCCAAAATCTCATAAGGATGCTTTAATAC 540
Query 541 AATAACATCCTCCAACTCCATCAATTTTCTTGTATTTTCAGCATCTATCTTTCTAACCCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AATAACATCCTCCAACTCCATCAATTTTCTTGTATTTTCAGCATCTATCTTTCTAACCCT 600
Query 601 CATCTTAATCTCTTTTCCCTCAATTATTGCATTATAAGGGCAAACTTTTTTACAATTTCC 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CATCTTAATCTCTTTTCCCTCAATTATTGCATTATAAGGGCAAACTTTTTTACAATTTCC 660
Query 661 ACATCCTAAGCATTTAGATAATAATATCTCAACAAAATTATCCCTCTTAACTATAGCTCC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ACATCCTAAGCATTTAGATAATAATATCTCAACAAAATTATCCCTCTTAACTATAGCTCC 720
Query 721 ATTTGGACAGACGTTTATACATTTTAAACAGAGTTTGCATTTCTTTTTATCAATTGCATA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 ATTTGGACAGACGTTTATACATTTTAAACAGAGTTTGCATTTCTTTTTATCAATTGCATA 780
Query 781 AGGAAGTTTTGTTGTTACAATCCCAGCTTTATAATCAACTGGAACTATTAAAGATTTAAC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AGGAAGTTTTGTTGTTACAATCCCAGCTTTATAATCAACTGGAACTATTAAAGATTTAAC 840
Query 841 AAATCCTTTCCCTGCCTGAGCTATAGCATTTGTTACTAAGCTATCTGCAATGCCATTAAC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AAATCCTTTCCCTGCCTGAGCTATAGCATTTGTTACTAAGCTATCTGCAATGCCATTAAC 900
Query 901 AACCTTAGCAACGGTATTTCCAGTAGCTGGTGAGCAAATTAAATAATCATACTTTCCTAA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AACCTTAGCAACGGTATTTCCAGTAGCTGGTGAGCAAATTAAATAATCATACTTTCCTAA 960
Query 961 GCTCAATCTTCCAGTGATTGGTGATGAGTAAGGATGTTCT 1000
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 961 GCTCAATCTTCCAGTGATTG-TGATGAGTAAGGATGTTCT 999
Query= ERCC-00054_genbank |103488678|gb|DQ516731.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-250-14 genomic sequence
Length=250
Subject= ERCC-00054
Length=274
Score = 462 bits (250), Expect = 3e-135
Identities = 250/250 (100%), Gaps = 0/250 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAAATTGGTTTTGTCTTTCAGCAATTCAACTTAATTCCTTTATTAACTGCCTTAGAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GATAAAATTGGTTTTGTCTTTCAGCAATTCAACTTAATTCCTTTATTAACTGCCTTAGAA 60
Query 61 AATGTTGAACTTCCACTGATTTTTAAATATAGGGGAGCAATgagcggagaagagaggagg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AATGTTGAACTTCCACTGATTTTTAAATATAGGGGAGCAATGAGCGGAGAAGAGAGGAGG 120
Query 121 aagagagctttagaatgcttaaagatggcagagttggaggagagaTTTGCCAATCACAAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAGAGAGCTTTAGAATGCTTAAAGATGGCAGAGTTGGAGGAGAGATTTGCCAATCACAAA 180
Query 181 CCAAATCAGTTGAGTGGAGGGCAACAACAGAGAGTTGCTATAGCGAGGGCTTTGGCAAAC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CCAAATCAGTTGAGTGGAGGGCAACAACAGAGAGTTGCTATAGCGAGGGCTTTGGCAAAC 240
Query 241 AACCCACCAA 250
||||||||||
Sbjct 241 AACCCACCAA 250
Query= ERCC-00057_genbank |110339339|gb|DQ668366.1| Synthetic construct
clone TagQ microarray control
Length=1000
Subject= ERCC-00057
Length=1021
Score = 1847 bits (1000), Expect = 0.0
Identities = 1000/1000 (100%), Gaps = 0/1000 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTAGTGCATCCTCGTGGCATCATGCGTCTCCTCAGTAGGTCTGCGACTGATCCTAGTGCA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 CTAGTGCATCCTCGTGGCATCATGCGTCTCCTCAGTAGGTCTGCGACTGATCCTAGTGCA 962
Query 61 ATGCGTCTGAGCCTGAGCTACAGCGATATAGCCTGGATTGTGAGCGTATTTGCTGTCAGA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATGCGTCTGAGCCTGAGCTACAGCGATATAGCCTGGATTGTGAGCGTATTTGCTGTCAGA 902
Query 121 ACCTCAGCTCATCATGTATGATGCTGTACCATCCTGCGATACTGAAGATGCACCGCTATA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 ACCTCAGCTCATCATGTATGATGCTGTACCATCCTGCGATACTGAAGATGCACCGCTATA 842
Query 181 ATGCGAGGCTCTCCGCTAAAGTGGAAGCTGCTCGTTCTCAATGCGAGCGAGTCGAATCCA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 ATGCGAGGCTCTCCGCTAAAGTGGAAGCTGCTCGTTCTCAATGCGAGCGAGTCGAATCCA 782
Query 241 ATGCCGTAGCTGCGATAACGATGCCGCTGACTCTACGGTAATGCACGATCCTCTACATTG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 ATGCCGTAGCTGCGATAACGATGCCGCTGACTCTACGGTAATGCACGATCCTCTACATTG 722
Query 301 ATAGCAGATAGTCTAACGGGATAGCATAGGTGCAAGGCTCCTAGCATGTAGTCACAGGTG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 ATAGCAGATAGTCTAACGGGATAGCATAGGTGCAAGGCTCCTAGCATGTAGTCACAGGTG 662
Query 361 CTCAGATATAGTCATCGCTGCAATCAGCTAGTCATCTTGTCAGGATGCTACTCACTGCGT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CTCAGATATAGTCATCGCTGCAATCAGCTAGTCATCTTGTCAGGATGCTACTCACTGCGT 602
Query 421 GCAGAAGATTCGCACGACTTCAGAGGATGGCACTCGTCATTAGAGTGATGTTCTCGGATC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GCAGAAGATTCGCACGACTTCAGAGGATGGCACTCGTCATTAGAGTGATGTTCTCGGATC 542
Query 481 GACACTGCTGGTCTGCGAATGACTCGCATTCACTAACATGGAGCATCGTTATCTAAAGGG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GACACTGCTGGTCTGCGAATGACTCGCATTCACTAACATGGAGCATCGTTATCTAAAGGG 482
Query 541 GATGCACGTTATCGTCGAGTGGCCGTCATGTCTATGCAGTGCGGCCTATGTCTCATTAGC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GATGCACGTTATCGTCGAGTGGCCGTCATGTCTATGCAGTGCGGCCTATGTCTCATTAGC 422
Query 601 GAGTCGTATGTATCATGTCGGGCTCGAATGTTGCACACGTCTGCGTAATGGTGACCGCTA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GAGTCGTATGTATCATGTCGGGCTCGAATGTTGCACACGTCTGCGTAATGGTGACCGCTA 362
Query 661 GTCCCACATGGTGCTTCGTAGCCACAAATGTCGTTAGGTAGACCGACGTTATCGCGCTAT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTCCCACATGGTGCTTCGTAGCCACAAATGTCGTTAGGTAGACCGACGTTATCGCGCTAT 302
Query 721 ACCCGATGTCAACGCGAGTTAGACCGTATCGTCCCCAGTGCCCTAAGATGGTCAAGCGTG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ACCCGATGTCAACGCGAGTTAGACCGTATCGTCCCCAGTGCCCTAAGATGGTCAAGCGTG 242
Query 781 CTCCTACGTTAGTATCAGTTTCCCTATTGGTACGTCTGGCGTACTTCTGAAACGTGATGG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTCCTACGTTAGTATCAGTTTCCCTATTGGTACGTCTGGCGTACTTCTGAAACGTGATGG 182
Query 841 GCGGCTGGTTACCCGTATATGGGCTCGGTTGACCTCTATTGGGCGTTGTTGACCCGAATT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GCGGCTGGTTACCCGTATATGGGCTCGGTTGACCTCTATTGGGCGTTGTTGACCCGAATT 122
Query 901 CGGTATCCTCGTCGTTAAATGGCGAACGTCGTCTGCTATAGGCAAACGTCTGTCGGTCAT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CGGTATCCTCGTCGTTAAATGGCGAACGTCGTCTGCTATAGGCAAACGTCTGTCGGTCAT 62
Query 961 GGCAAATGTTACTCGTGTGTGCAAGAAATTACTCGCTGTC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGCAAATGTTACTCGTGTGTGCAAGAAATTACTCGCTGTC 22
Query= ERCC-00058_genbank |92111296|gb|DQ459418.1| Synthetic construct
microarray control MC07 mRNA, complete sequence
Length=1140
Subject= ERCC-00058
Length=1136
Score = 2041 bits (1105), Expect = 0.0
Identities = 1130/1140 (99%), Gaps = 9/1140 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGAGTAGGGCCCACTTGTCGATTCGTTTGACTAAACATGGAGAAAGCATCCGAGGGT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGGAGAGTAGGGCCCACTTGTCGATTCGTTTGACTAAACATGGAGAAAGCATCCGAGGGT 60
Query 61 GGGCAGATCCGCCTAAGCAAGGTACCATTTAATCCCGGTCCCACGAAAGAGTTAACCTAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGGCAGATCCGCCTAAGCAAGGTACCATTTAATCCCGGTCCCACGAAAGAGTTAACCTAT 120
Query 121 ACGCTCAGATGGCGCCATGGTGCGTTCGGAGCCAC-TTCTGCGAATTGTCCACCACTGCC 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ACGCTCAGATGGCGCCATGGTGCGTTCGGAGCCACTTTCTGCGAATTGTCCACCACTGCC 180
Query 180 CTCTCGTGTGATGATCAACATACTATCTTCTGCGGATGACCACCACTCACG-GTGTAGGT 238
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 181 CTCTCGTGTGATGATCAACATACTATCTTCTGCGGA-GACCACCACTCACGTGTGTAGGT 239
Query 239 GAGCCATGTTGAATCCATCAGGCACCCGTCCCGGCGTATGAGCGTCTGGAGGCTCACCAA 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GAGCCATGTTGAATCCATCAGGCACCCGTCCCGGCGTATGAGCGTCTGGAGGCTCACCAA 299
Query 299 CAAAACTTACATAAGACCGGAACTCGAGAGTCTGGCATCATCGTGAACAGGGGCACGAGA 358
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 300 CAAAACTTACATAAGACCGGAACTCGAGAGTCTGGCATCATCGTGAACAGAGGCACGAGA 359
Query 359 GTGAGTCTGTGAGTCCTGACTGAGCATGTCTCGAAAACTGTGATAGATTAAGCCATGGAC 418
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GTGAG-CTGTGAGTCCTGACTGAGCATGTCTCGAAAACTGTGATAGATTAAGCCATGGAC 418
Query 419 CAAGGACCAAGAGATCGACGGGCTTGGATATTGCCGCAAGGCTGAAGGTAACACCTTCAG 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 CAAGGACCAAGAGATCGACGGGCTTGGATATTGCCGCAAGGCTGAAGGTAACACCTTCAG 478
Query 479 CTTCAAAATGCTTGAATACTCAGCCGTCCATCACTTCGACCGGGGTTAAGCTAAGATCTG 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 CTTCAAAATGCTTGAATACTCAGCCGTCCATCACTTCGACCGGGGTTAAGCTAAGATCTG 538
Query 539 GTGAGCGGTAGCCCGTCAAACGAATTGGCATCGGACAAGACAAATCAACCAAAGAATCTA 598
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 GTG-GCGGTAGCCCGTCAAACGAATTGGCATCGGACAAGACAAATCAACCAAAGAATCTA 597
Query 599 CGGTTGCCATGCCATGGTCTGCGTAACGACACCCGAGGTCCTTTTTATGGCGCCAGGCAT 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 CGGTTGCCATGCCATGGTCTGCGTAACGACACCCGAGGTCCTTTTTATGGCGCCAGGCAT 657
Query 659 CGACGCTGTAAAACCCTTCCGTTGTCCTGAGCAGGTTATAACGACATCAAGCGACAGCGA 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 CGACGCTGTAAAACCCTTCCGTTGTCCTGAGCAGGTTATAACGACATCAAGCGACAGCGA 717
Query 719 CAAAGAAGGCGGGAAAACTGTGGACTCCCGGCTATGTCAAATACGCTGAGTCACCCAACA 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 CAAAGAAGGCGGGAAAACTGTGGACTCCCGGCTATGTCAAATACGCTGAGTCACCCAACA 777
Query 779 GAAACGTTATCCGCTTGG-AAACGAATACATGGAAAGTGGGGCCGGTCGGATCACCAAGA 837
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 GAAACGTTATCCGCTTGGCAAACGAATACATGGAAAGTGGGGCCGGTCGGATCACCAAGA 837
Query 838 TAAGTGGTGTCACGAATAGCCCTCGCTTGCTCTAATCATGGGATGGTACATCGTCATTGC 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 TAAGTGGTGTCACGAATAGCCCTCGCTTGCTCTAATCATGGGATGGTACATCGTCATTGC 897
Query 898 TATTGGATGCAAGACGAATCCTG-CAACAGCCCTCCGGACTCAGTAGGTCCATGGATTTA 956
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 TATTGGATGCAAGACGAATCCTGGCAACAGCCCTCCGGACTCAGTAGGTCCATGGATTTA 957
Query 957 ACTACAACAGGAAGCCGGTCAACTGTGGAAGACTACCAGTATTCGAGCTGGAATAAAGAG 1016
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 958 ACTACAACAGGAAGCCGGTCAACTGTGGAAGACTACCAGTATTCGAGCTGGA-TAAAGAG 1016
Query 1017 GCTCGGCACCATGGTATAGATGTAATAGGAACCATGAAACTCCC-TGTCGCAAGCACTAA 1075
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1017 GCTCGGCACCATGGTATAGATGTAATAGGAACCATGAAACTCCCATGTCGCAAGCACTAA 1076
Query 1076 CAGAGCTGTAACCTCCCTCCATTAGCGGTAATCGGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 CAGAGCTGTAACCTCCCTCCATTAGCGGTAATCGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1136
Query= ERCC-00059_genbank |110339329|gb|DQ668356.1| Synthetic construct
clone TagA microarray control
Length=501
Subject= ERCC-00059
Length=525
Score = 926 bits (501), Expect = 0.0
Identities = 501/501 (100%), Gaps = 0/501 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTGATCGTAACTCGGGTGACCAATGACCATATACGGCGTATTAAGGTTGTACCCTCGG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 525 ATTTGATCGTAACTCGGGTGACCAATGACCATATACGGCGTATTAAGGTTGTACCCTCGG 466
Query 61 TCTCAACTTGTCGTATGGGACTTTCAAGTACCTTAGCTCGTCGGACGCTTTAGATGACTT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 465 TCTCAACTTGTCGTATGGGACTTTCAAGTACCTTAGCTCGTCGGACGCTTTAGATGACTT 406
Query 121 ATCCATAGTCCTAAGTCCGGCGCCGGTTAAGCCGCTATTAGCGTGTGTGGACTCTCTCTA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405 ATCCATAGTCCTAAGTCCGGCGCCGGTTAAGCCGCTATTAGCGTGTGTGGACTCTCTCTA 346
Query 181 GGAGCGGCTTCGCACAAATTACTGCTCAATCCTAGATACGTTGCGCTCTTTGGTAAACGG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345 GGAGCGGCTTCGCACAAATTACTGCTCAATCCTAGATACGTTGCGCTCTTTGGTAAACGG 286
Query 241 CTCAGATCTTAGCACTCGTGCAGTTCTACGATGGCAAGTCGTGCCTCGTTCTCGTGTAGA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 CTCAGATCTTAGCACTCGTGCAGTTCTACGATGGCAAGTCGTGCCTCGTTCTCGTGTAGA 226
Query 301 ATATCAGCTAATAGGGTCGGCTCAACAGTGTATCCGGTGGACAAGCACTGACACGCGATG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 225 ATATCAGCTAATAGGGTCGGCTCAACAGTGTATCCGGTGGACAAGCACTGACACGCGATG 166
Query 361 ACGTTCGTCAAGAGTCGCATAATCTCAGAATCCGTACAGCCGCATCGGGTTCACGGCTAT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165 ACGTTCGTCAAGAGTCGCATAATCTCAGAATCCGTACAGCCGCATCGGGTTCACGGCTAT 106
Query 421 AAAACAGCGTCATCAGCGTAGGGTATCGCTTCGCGTGTCATGACTTGGGCCACGTCTCTC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 AAAACAGCGTCATCAGCGTAGGGTATCGCTTCGCGTGTCATGACTTGGGCCACGTCTCTC 46
Query 481 TCTCGCACATTAGGCTAGATT 501
|||||||||||||||||||||
Sbjct 45 TCTCGCACATTAGGCTAGATT 25
Query= ERCC-00060_genbank |103488710|gb|DQ516763.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-46 genomic sequence
Length=500
Subject= ERCC-00060
Length=523
Score = 917 bits (496), Expect = 0.0
Identities = 499/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCGACAATAAACAAAGAAATAGAACTTTTAACACCAGAAGGAAAAATATTTTTGAAGAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATCGACAATAAACAAAGAAATAGAACTTTTAACACCAGAAGGAAAAATATTTTTGAAGAA 60
Query 61 AATTGGTTATGTTGATTACTATGAGGCAGGTAGTTTAAAATTAGCTGAAGAAACAGCAAA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AATTGGTTATGTTGATTACTATGAGGCAGGTAGTTTAAAATTAGCTGAAGAAACAGCAAA 120
Query 121 AAGAGATGAGGACGTTATTATATTAAAAAATCATGGAGTAGTTTGTTTAGGTAAAGATTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAGAGATGAGGACGTTATTATATTAAAAAATCATGGAGTAGTTTGTTTAGGTAAAGATTT 180
Query 181 GATAGATGCATATATAAAAGTGGAGGTTTTAGAAGAACAAGCTAAACTTACACTTTTAAA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GATAGATGCATATATAAAAGTGGAGGTTTTAGAAGAACAAGCTAAACTTACACTTTTAAA 240
Query 241 CCTTCTTGTAAAGAAATAGTGGGGATTTTTAAATTTATTTAACTCTTTCTAATTCACTAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CCTTCTTGTAAAGAAATAGTGGGGATTTTTAAATTTATTTAACTCTTTCTAATTCACTAA 300
Query 301 CAATACTCCAAATTTGTGTTCTTGTGTGAAGTGGCATGTTTGGGTCGTTGCTAATCTCAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CAATACTCCAAATTTGTGTTCTTGTGTGAAGTGGCATGTTTGGGTCGTTGCTAATCTCAT 360
Query 361 CTAAGATGTGGATTGCTGTTGCACTTCTAACGATTGGCTCCTCCCCCTCTTTTAAAACAG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTAAGATGTGGATTGCTGTTGCACTTCTAACGATTGGCTCCTCCCCCTCTTTTAAAACAG 420
Query 421 CTTCTTTAGCCTTTTCAGCAGCAGCTCTAATGTTTCTTGGAACGGTTGTATCGTTAATTA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CTTCTTTAGCCTTTTCAGCAGCAGCTCTAATGTTTCTTGGAACGGTTGTATCGTTAATTA 480
Query 481 TCTCATCCAACATCAAAGCA 500
|||||||||| |||||||||
Sbjct 481 TCTCATCCAA-ATCAAAGCA 499
Query= ERCC-00061_genbank |92111304|gb|DQ459426.1| Synthetic construct
microarray control MC22 mRNA, complete sequence
Length=1147
Subject= ERCC-00061
Length=1136
Score = 2034 bits (1101), Expect = 0.0
Identities = 1131/1143 (98%), Gaps = 12/1143 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAG-AGCTTGGCAAACACTACCGGGCATAGAT--A-A-GCGGGGCCAAGCATGCCGACA 55
|||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGAGAAGCTTGGCAAACACTACCGGGCATAGATAAAGACGCGGGGCCAAGCATGCCGACA 60
Query 56 TTGGGATACTTCCATGTTACGAGGGGGCATGGAGGCGCAGCTATCCCACCCTCGTGCGCA 115
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTGGGATACTTCCATGTTAC---GGGGCATGGAGGCGCAGCTATCCCACCCTCGTGCGCA 117
Query 116 AGATGGACAACCGAGCGCGGTAGTAATCGCGAACTGCCAGGCACTTATTGTAGAGGTGAA 175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 AGATGGACAACCGAGCGCGGTAGTAATCGCGAACTGCCAGGCACTTATTGTAGAGGTGAA 177
Query 176 TCGCTAACTAACTCGGTGTAAGTTTCCGTCGATGAACAGGCATCGGAGAGGGCTCTACGG 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 TCGCTAACTAACTCGGTGTAAGTTTCCGTCGATGAACAGGCATCGGAGAGGGCTCTACGG 237
Query 236 GCCACCCAGTAGTGACGTCAGGAGTGCATAAGGAAGCAGATTGACCGTGGCGCAGACTCG 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 GCCACCCAGTAGTGACGTCAGGAGTGCATAAGGAAGCAGATTGACCGTGGCGCAGACTCG 297
Query 296 CGATATGAATAAGACTCTAGGGGGTGTACAATTGATCGTTGCGTACTGGAATCGTGCGAC 355
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 298 CGATATGAATAAGACTCTAGGGGGTGTACAATTGATCGTTGCGTAC-GGAATCGTGCGAC 356
Query 356 CTCAAAAGTTAAGCGCGAGGGTCACCTTGCTCCGCGCGAGCAGCCTTTGTCCAGGCCTAG 415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 CTCAAAAGTTAAGCGCGAGGGTCACCTTGCTCCGCGCGAGCAGCCTTTGTCCAGGCCTAG 416
Query 416 TCCTTGCATTCGACCTATCGCACCGAGCGTCTCACCCAGCTAGTACGAAATTAACTGATA 475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 TCCTTGCATTCGACCTATCGCACCGAGCGTCTCACCCAGCTAGTACGAAATTAACTGATA 476
Query 476 GAGATGGTTAACCCCCTCAGAGCGACTGGTTTAAGTCTAGGACCGGACAAACGGTACGAT 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 GAGATGGTTAACCCCCTCAGAGCGACTGGTTTAAGTCTAGGACCGGACAAACGGTACGAT 536
Query 536 TACGTCTTAGCATCAAGTGGTGCCTGATCTCGTGATAGACAACGTGAGAGTATTTGGATG 595
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537 TACGTCTTAGCATCAAGTGGTGCCTGATCTCGTGATAGACAACGTGAGAGTATTTGGATG 596
Query 596 TATGGCTAGTTACGCAGAGCATGTGGCATTATTCTCATGTTTTGCGGCGGAGCGACTCAA 655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 TATGGCTAGTTACGCAGAGCATGTGGCATTATTCTCATGTTTTGCGGCGGAGCGACTCAA 656
Query 656 TTTATCCGAACCATGGGAGATCGTCATTCTTGTGGTGCaaaaaaaTCACGGGCCCTGATA 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 TTTATCCGAACCATGGGAGATCGTCATTCTTGTGGTGCAAAAAAATCACGGGCCCTGATA 716
Query 716 CTGGTCGAAGTTGCGCCCTATGCTTACACGGCGCACGCCGCGGTGGAGCGATCGAGACCT 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 CTGGTCGAAGTTGCGCCCTATGCTTACACGGCGCACGCCGCGGTGGAGCGATCGAGACCT 776
Query 776 CTCGGATCTGAAATAAACCCGCAACGTGAGGTAGTGTTACGCATACATTCGCCCACGCTA 835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 CTCGGATCTGAAATAAACCCGCAACGTGAGGTAGTGTTACGCATACATTCGCCCACGCTA 836
Query 836 GTCACTGATGCGTTGTATTTCTCGGAGTCTTTACCATGAGAATTGGCATATGGAAATCCT 895
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 ---ACTGATGCGTTGTATTTCTCGGAGTCTTTACCATGAGAATTGGCATATGGAAATCCT 893
Query 896 GTCATACCACGGGTCGATACTTGTTCTCCGTCTGAAGCGAACAACGAAGCATGTTGACCG 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 894 GTCATACCACGGGTCGATACTTGTTCTCCGTCTGAAGCGAACAACGAAGCATGTTGACCG 953
Query 956 TCTAAGATGATTTTTCCGACAGAGTGACGCATATAACACCTCTGGTCTTACAATGATTCG 1015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 TCTAAGATGATTTTTCCGACAGAGTGACGCATATAACACCTCTGGTCTTACAATGATTCG 1013
Query 1016 AAGACACGTGAGACGCACTAGAGGCTTAACCTGGCAGATTGTGATCTCCGATGGTAATGA 1075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 AAGACACGTGAGACGCACTAGAGGCTTAACCTGGCAGATTGTGATCTCCGATGGTAATGA 1073
Query 1076 AGTCGCCGTACTATCTCTTACTTGCATGACGCGACTACCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074 AGTCGCCGTACTATCTCTTACTTGCATGACGCGACTACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1133
Query 1136 aaa 1138
|||
Sbjct 1134 AAA 1136
Query= ERCC-00062_genbank |103488733|gb|DQ516786.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-69 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00062
Length=1023
Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTATTGGAGAGAAAGATATCAGCCAGACCTATTTAGTAGCTCCACAGGCGCTAATAAAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACTATTGGAGAGAAAGATATCAGCCAGACCTATTTAGTAGCTCCACAGGCGCTAATAAAA 60
Query 61 GAGGCAGTATCATTAATTGGAAAGAGTGCTGTTGAGGGGATGATTAGAAGAAGTTCAAAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GAGGCAGTATCATTAATTGGAAAGAGTGCTGTTGAGGGGATGATTAGAAGAAGTTCAAAT 120
Query 121 AAATTATTCAAATAATCATAATAAAGTAATACTTATACTGAATATTCGAAATTATTATTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAATTATTCAAATAATCATAATAAAGTAATACTTATACTGAATATTCGAAATTATTATTT 180
Query 181 TGGAATTTTACAATATAGGTGATATTATGGCATTAAAATTCACCATTGAAGAGTTATCAA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TGGAATTTTACAATATAGGTGATATTATGGCATTAAAATTCACCATTGAAGAGTTATCAA 240
Query 241 ATCAAAAAAGAGATACATTAGGAAGAAATATTGACGTAACTGTTTTTAGATTAATAAGAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATCAAAAAAGAGATACATTAGGAAGAAATATTGACGTAACTGTTTTTAGATTAATAAGAT 300
Query 301 TTATGGATTTGGAAAGATATTTAGGAAGAGGGGCTCATGGAGTTATTTACGAATGTGGAA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTATGGATTTGGAAAGATATTTAGGAAGAGGGGCTCATGGAGTTATTTACGAATGTGGAA 360
Query 361 GAGAGCTTGGACTGGCATTAAATCCAAAAACTGTTGAAGATGTAGTTAAGTTTTGTGAGG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAGAGCTTGGACTGGCATTAAATCCAAAAACTGTTGAAGATGTAGTTAAGTTTTGTGAGG 420
Query 421 AATATAAAATTGGAAAGGTGGAGATAGTTAATAAAGAGCCATTGTAAATTAGGGTTTATG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AATATAAAATTGGAAAGGTGGAGATAGTTAATAAAGAGCCATTGTAAATTAGGGTTTATG 480
Query 481 AATGTATCTCTTGTTCTGGACTTCCTGAGGTTGGAGAGACATTATGTTGGTTTGAAGGAG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AATGTATCTCTTGTTCTGGACTTCCTGAGGTTGGAGAGACATTATGTTGGTTTGAAGGAG 540
Query 541 GCTTTATTGCTGGATGCTTAGAAAAAATATTAAACAAGAGAGTTAGAGTGAAAGAAACTC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GCTTTATTGCTGGATGCTTAGAAAAAATATTAAACAAGAGAGTTAGAGTGAAAGAAACTC 600
Query 601 ACTGTGCAGGTTTGGGGCATGATTTCTGTCAGTTTGAGGTAAAAGTCCTTTAATGATATT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ACTGTGCAGGTTTGGGGCATGATTTCTGTCAGTTTGAGGTAAAAGTCCTTTAATGATATT 660
Query 661 TTTTCATCTCATTTATTATATATTCTAAAGCTTCAAAACCCTCTTTTCTATGTCTTGCAA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TTTTCATCTCATTTATTATATATTCTAAAGCTTCAAAACCCTCTTTTCTATGTCTTGCAA 720
Query 721 AAACGGCTATTGAAGCAATCCTCTCCCCAATACTTAAAAATCCAGTGTTGTGGTAAAATA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 AAACGGCTATTGAAGCAATCCTCTCCCCAATACTTAAAAATCCAGTGTTGTGGTAAAATA 780
Query 781 AGATATCAATAACATCAAACTTATTTTTTGCCTCCTCAATAACTAACTTCAACTTTTCTA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AGATATCAATAACATCAAACTTATTTTTTGCCTCCTCAATAACTAACTTCAACTTTTCTA 840
Query 841 AGATGTCTTCATCTATCTTCATTCCTTTTGATGGAACTTTTTCTCCATCTTTTAAATCAT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AGATGTCTTCATCTATCTTCATTCCTTTTGATGGAACTTTTTCTCCATCTTTTAAATCAT 900
Query 901 ACTCCCTAACAAATCCATTGAAAGTTACAATACATCCAAATTTCCCTTTGTATTTTTCAA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 ACTCCCTAACAAATCCATTGAAAGTTACAATACATCCAAATTTCCCTTTGTATTTTTCAA 960
Query 961 TACATTCATCCATCTTTTTGCAAAACTCTTCATACTCGTT 1000
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 961 TACATTCATCCATCTTTTTG-AAAACTCTTCATACTCGTT 999
Query= ERCC-00067_genbank |114975645|gb|DQ883653.2| Synthetic construct
clone NISTag12 external RNA control sequence
Length=650
Subject= ERCC-00067
Length=644
Score = 1190 bits (644), Expect = 0.0
Identities = 644/644 (100%), Gaps = 0/644 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCGTACTTACACCCTACGTTGCTGATCTCGGCGCTCGTACATTTACACTTGTAGTTGAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCCGTACTTACACCCTACGTTGCTGATCTCGGCGCTCGTACATTTACACTTGTAGTTGAA 60
Query 61 GGTCGGGCGATGAGGCGTTCGTTTGGCCAACCTCGTTACATTGCACAAATGCCGGATTTG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGTCGGGCGATGAGGCGTTCGTTTGGCCAACCTCGTTACATTGCACAAATGCCGGATTTG 120
Query 121 GCTACTATATATACTCCCTGATCAAGGGTCGAGTTGTCTGTGCATTAGCTCGGAGCTAAT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GCTACTATATATACTCCCTGATCAAGGGTCGAGTTGTCTGTGCATTAGCTCGGAGCTAAT 180
Query 181 GAGCACGTCGGTCACGGACACTGCGAAGCACGACGAAATGGCTCTCATTGCGATTGTGGC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GAGCACGTCGGTCACGGACACTGCGAAGCACGACGAAATGGCTCTCATTGCGATTGTGGC 240
Query 241 CCTTGTTGCAGACAATTGTCAGGCGGGACGGGCCAGGAATGACAATAGAACATTAATCTA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CCTTGTTGCAGACAATTGTCAGGCGGGACGGGCCAGGAATGACAATAGAACATTAATCTA 300
Query 301 ATTTACAATTTGACGCCATGACGTATTAAACATTCGGGCATGCAAATCACCGATTTTAAG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATTTACAATTTGACGCCATGACGTATTAAACATTCGGGCATGCAAATCACCGATTTTAAG 360
Query 361 ATCCCCTGTACGGCTGCGTCCACACTAGCATGATGTAAATCGATTTGGCGGTGACCGCTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ATCCCCTGTACGGCTGCGTCCACACTAGCATGATGTAAATCGATTTGGCGGTGACCGCTG 420
Query 421 ATCCTTAACAAAAGGGGGTGGTTCAAATGTAAAACAAGTAGGTGCGAGCAAACGTCTGGT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ATCCTTAACAAAAGGGGGTGGTTCAAATGTAAAACAAGTAGGTGCGAGCAAACGTCTGGT 480
Query 481 GCTCTAATGGCAAACATCTGCAATCAGCGAACCTCGCGGTATGGCAACTCACTAATTGTC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GCTCTAATGGCAAACATCTGCAATCAGCGAACCTCGCGGTATGGCAACTCACTAATTGTC 540
Query 541 CGTGCGACGACAAATTACCGAGGGAGGCACTTATGAGTTATCTTCGCTGTGATATCTCCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CGTGCGACGACAAATTACCGAGGGAGGCACTTATGAGTTATCTTCGCTGTGATATCTCCT 600
Query 601 TCGACTAGCGCGGTCAGTCCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TCGACTAGCGCGGTCAGTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 644
Query= ERCC-00069_genbank |92111299|gb|DQ459421.1| Synthetic construct
microarray control MC10 mRNA, complete sequence
Length=1139
Subject= ERCC-00069
Length=1137
Score = 2002 bits (1084), Expect = 0.0
Identities = 1125/1142 (98%), Gaps = 14/1142 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGAAGTACCAAGATCAGACTCCCGAGACATAAGGGGTGTGCACGGCATGGATGTGTC 60
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGGAGAAGTACCAATATCAGACTCCCGAGACATAAGGGGTGTGCACGGCATGGATGTGTC 60
Query 61 GCTAACCTCCTGGTCCTATAAAGGCAACACTCATGGCACCGTGTGCTGAAGGCTCCAAAC 120
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GCTAACCTCCTGGTCCTATAAA-GCAACACTCATGGCACCGTGTGCTGAAGGCTCCAAAC 119
Query 121 GGGTCGATACCAGAAGGGTCGATTC-TTCTTCCAATACATTGTCGGTGTCAATGCTGGAG 179
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 GGGTCGATACCAGAAGGGTCGATTCTTTCTTCCAATACATTGTCGGTGTCAATGCTGGAG 179
Query 180 GCCCAGGAGGACGAAATCCTCGGTCAGGTTGTTACTTGAAGGGTTCAACACGAGCTCAAA 239
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 GCCCAGGA-GACGAAATCCTCGGTCAGGTTGTTACTTGAAGGGTTCAACACGAGCTCAAA 238
Query 240 TTTGTCCAGGGGTGGTCACCAGCGGGTCTCGAACAGAGGTGAAACGGGATAAATACCCGA 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 TTTGTCCAGGGGTGGTCACCAGCGGGTCTCGAACAGAGGTGAAACGGGATAAATACCCGA 298
Query 300 AACATTCATAACCCTGCCAGTCATTATAAGCAAGCCGCTGACTTGGACACCACAACGTGT 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 AACATTCATAACCCTGCCAGTCATTATAAGCAAGCCGCTGACTTGGACACCACAACGTGT 358
Query 360 GGAACCTCAGGTAAGCTGGTCCGGGAATCTTGGTCGCGAAGCGACCCCATTGAGTAGGCA 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 GGAACCTCAGGTAAGCTGGTCCGGGAATCTTGGTCGCGAAGCGACCCCATTGAGTAGGCA 418
Query 420 ATCCAAACCCTGCAAACAATAGGTGGCCATCCGGTCAAATAATGTGGGAGATGCGCACAT 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 ATCCAAACCCTGCAAACAATAGGTGGCCATCCGGTCAAATAATGTGGGAGATGCGCACAT 478
Query 480 CATGAGAGCGACGTATTGAACTCAAGGGACGGTGGTCCCCAGGAGAGGGATTACCACATG 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 479 CATGAGAGCGACGTATTGAACTCAAGGGACGGTGGTCCC-AGGAGAGGGATTACCACATG 537
Query 540 TTGAAGCTCTTTCAAATCGATTATCCCAATCGGCGCACTGTAAGGTAACCAACCGCAACT 599
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 538 TTGAAGCTCTTTCAAATCGATTATCCCAATCTGCGCACTGTAAGGTAACCAACCGCAA-T 596
Query 600 AATCCCCAGAACACTGCCCTGGTATCCATCGATTTGGAAGTC-AGACTCTAGTGATGCCG 658
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 597 AATCCCCAGAACACTGCCCTGGTATCCATCGATTTGGAAGTCCAGACTCTAGTGATGCCG 656
Query 659 GCTGGTCGCGACAAGAAAACATAATTCGCAAAGGGCCCCTGTCTCATTTGGCGTCTTGTA 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 GCTGGTCGCGACAAGAAAACATAATTCGCAAAGGGCCCCTGTCTCATTTGGCGTCTTGTA 716
Query 719 CCCAAACATCATACTTGGGAGGGTGTTGCGGCCGCATATCAACGACTAGAGGCCGTCAGA 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 CCCAAACATCATACTTGGGAGGGTGTTGCGGCCGCATATCAACGACTAGAGGCCGTCAGA 776
Query 779 ATGAGTCTTCAACACATATCGCTGAAGAAATGTCACTCCCCTGGTGGCTGATATAGAAAC 838
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 777 ATGAGTCTTCAACACATATCGCTGAAGAAATGTCACTCCCATGGTGGCTGATATAGAAAC 836
Query 839 ATATCCTCGCGGACTTCATCGCCGGGCACAAGGCTACAAGATGGACCTGGAACGCCGTGT 898
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 837 ATATCCTCGCGGACTTCATCGCCGGGCACAAGGCTACAAGATGGAC-TGGAACGCCGTGT 895
Query 899 CAACCTCGTAACAACTCCCCATGCAATTCACTCACCGAGTAGCCTATAATGGGGAATGTA 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 896 CAACCTCGTAACAACTCCCCATGCAATTCACTCACCGAGTAGCCTATAATGGGGAATGTA 955
Query 959 GACGGGGCCCTATCTCAAATGTGTGCACCTCTATCCCCACCAAGTATAGTCGACTTAAGG 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 GACGGGGCCCTATCTCAAATGTGTGCACCTCTATCCCCACCAAGTATAGTCGACTTAAGG 1015
Query 1019 GCGGATCAAATGGCGCGCTGCCATACAAATCCGGTTCCAA---TGACTCAT----AGTAC 1071
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1016 GCGGATCAAATGGCGCGCTGCCATACAAATCCGGTTCCAAGCATGACTCATGGGCAGTAC 1075
Query 1072 GCCGGTTAGTGGGAAATACGGCTGTCAAACGCTGGTCCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 GCCGGTTAGTGGGAAATACGGCTGTCAAACGCTGGTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1135
Query 1132 aa 1133
||
Sbjct 1136 AA 1137
Query= ERCC-00071_genbank |114975649|gb|DQ883654.2| Synthetic construct
clone NISTag13 external RNA control sequence
Length=650
Subject= ERCC-00071
Length=642
Score = 1186 bits (642), Expect = 0.0
Identities = 642/642 (100%), Gaps = 0/642 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATGCGAGAGGCCTTGAGCCGTTGGCCGATCGCATACAGAGACTATTGCATCAAGGTAAC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CATGCGAGAGGCCTTGAGCCGTTGGCCGATCGCATACAGAGACTATTGCATCAAGGTAAC 60
Query 61 ACTTATTAATCCCCATCGTCATAATCGCTAGATTCTAGGTATTTCGGATCTTCCTAGTTA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACTTATTAATCCCCATCGTCATAATCGCTAGATTCTAGGTATTTCGGATCTTCCTAGTTA 120
Query 121 TCAGAAACATGTTAATTGGGCTCGGGCGTCTGCGCCAGGCCTTCGTAGTCCATACCACGA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCAGAAACATGTTAATTGGGCTCGGGCGTCTGCGCCAGGCCTTCGTAGTCCATACCACGA 180
Query 181 TCTGTATTTTGCACCTTTCGCTATGCTGAGGTTGTTGACATAAGGATTAACTGCTGTGGT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCTGTATTTTGCACCTTTCGCTATGCTGAGGTTGTTGACATAAGGATTAACTGCTGTGGT 240
Query 241 GTGTCATACTCGGCTACCTCCTGGTTTGGCGTCAAACAACTTCCAAGATTATCTCATACT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GTGTCATACTCGGCTACCTCCTGGTTTGGCGTCAAACAACTTCCAAGATTATCTCATACT 300
Query 301 ATAAAAAGACGACATGCACCGCCGTCCTTAAGTGCTTACGACAGAGGGTCGTTATCTCTC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATAAAAAGACGACATGCACCGCCGTCCTTAAGTGCTTACGACAGAGGGTCGTTATCTCTC 360
Query 361 TCGGTCTCGGTGCGCCTCTTCACGGAGCAGCATGACCTGCTAACCTGCATCAGCCAATGT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TCGGTCTCGGTGCGCCTCTTCACGGAGCAGCATGACCTGCTAACCTGCATCAGCCAATGT 420
Query 421 CCCGTCTCGAGCTGGCCTACGGATGCGTGAGCAAAGGTGCTAACTCTTTTCATAACCCGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CCCGTCTCGAGCTGGCCTACGGATGCGTGAGCAAAGGTGCTAACTCTTTTCATAACCCGG 480
Query 481 AGATGAACTACCACGCTTCCTGCGTGGGTCCCGCGAAAACGAAGCAAGGAGATTCTTCGC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AGATGAACTACCACGCTTCCTGCGTGGGTCCCGCGAAAACGAAGCAAGGAGATTCTTCGC 540
Query 541 GACCTGGCCCATTCACTACATAACAGAGTTAAGACTTAGATCAGCGAGCAGGTGTACGCC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GACCTGGCCCATTCACTACATAACAGAGTTAAGACTTAGATCAGCGAGCAGGTGTACGCC 600
Query 601 CCGGACCTTGGGCTACTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CCGGACCTTGGGCTACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 642
Query= ERCC-00073_genbank |110339331|gb|DQ668358.1| Synthetic construct
clone TagC microarray control
Length=579
Subject= ERCC-00073
Length=603
Score = 1070 bits (579), Expect = 0.0
Identities = 579/579 (100%), Gaps = 0/579 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTGATAATTTCGACGAGGCGTTACATATTCTGAGAGGGGTGATTAAGTCTGCTTCGGCC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TGTGATAATTTCGACGAGGCGTTACATATTCTGAGAGGGGTGATTAAGTCTGCTTCGGCC 60
Query 61 TGGGATGGTCTGTCTACGTGTGCGTAGTTCTGTCATAGCGTCGAGGATTCTGAACCTGTC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TGGGATGGTCTGTCTACGTGTGCGTAGTTCTGTCATAGCGTCGAGGATTCTGAACCTGTC 120
Query 121 CATAGTATCCTGTAAGCGTCCAATGTACCTATATCGTGGACCCAAAGTCGATACGTCCGA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CATAGTATCCTGTAAGCGTCCAATGTACCTATATCGTGGACCCAAAGTCGATACGTCCGA 180
Query 181 TTAAGCGACGTTGGTCTAGGTAACGAATTATACCCTCGGGTTACGAATTATGGCTGTGCC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTAAGCGACGTTGGTCTAGGTAACGAATTATACCCTCGGGTTACGAATTATGGCTGTGCC 240
Query 241 TAACGAATCTGGGACGTGCCTAAGTAATCTGGTCCGCGACTAAGATGTACGGTGATCGTG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TAACGAATCTGGGACGTGCCTAAGTAATCTGGTCCGCGACTAAGATGTACGGTGATCGTG 300
Query 301 GACGCTTGACCGGACTTATGCGTCGCCTTCCGAGTTATTGGATGGCGTTCCGTCCTATTG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GACGCTTGACCGGACTTATGCGTCGCCTTCCGAGTTATTGGATGGCGTTCCGTCCTATTG 360
Query 361 GATACTATTCCGTGCGTGTGCGACACGTTCCGAGCATATGCTAACAGTTCCGTCACTATG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GATACTATTCCGTGCGTGTGCGACACGTTCCGAGCATATGCTAACAGTTCCGTCACTATG 420
Query 421 TAACGCTTGACGTAGATTGCTATCAGGTTACGATGACTGCTAAGCCATTACGCGACATTC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TAACGCTTGACGTAGATTGCTATCAGGTTACGATGACTGCTAAGCCATTACGCGACATTC 480
Query 481 TGCAAAGTTACGTCGCATTCTCTCACGTTACGGCTGATTCTCTAGGCTTACGCGCATGAG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TGCAAAGTTACGTCGCATTCTCTCACGTTACGGCTGATTCTCTAGGCTTACGCGCATGAG 540
Query 541 CTCTAGGTTCCGGGTACTATCGAACGTGTCATTGGTACT 579
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CTCTAGGTTCCGGGTACTATCGAACGTGTCATTGGTACT 579
Query= ERCC-00074_genbank |103488701|gb|DQ516754.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-37 genomic sequence
Length=500
Subject= ERCC-00074
Length=522
Score = 917 bits (496), Expect = 0.0
Identities = 499/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGACATTAATTAGGGCTGAAAGCCCTAACTTAATGGACGGGAGGTATCCCAATAGGAGG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TGGACATTAATTAGGGCTGAAAGCCCTAACTTAATGGACGGGAGGTATCCCAATAGGAGG 60
Query 61 TTTCCTCCTATGGTTTTCAAAACAATCACCATCATGCTATTAATGATATTAAAATCCCAA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTTCCTCCTATGGTTTTCAAAACAATCACCATCATGCTATTAATGATATTAAAATCCCAA 120
Query 121 CTATACCAAAGAATATCCCAATTATCCATAAAACTGTAACTAAGTGAGGCTCTCTCATTG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CTATACCAAAGAATATCCCAATTATCCATAAAACTGTAACTAAGTGAGGCTCTCTCATTG 180
Query 181 GTTTATACTTCAATATAAGCCTTGGTAGGGATAGATAGCCACCTATATAGTATAGCTTCC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTTTATACTTCAATATAAGCCTTGGTAGGGATAGATAGCCACCTATATAGTATAGCTTCC 240
Query 241 CATCTTCTTTGAGAGTTGTTGGTTTATGCTCATCCCTACTCATAACCCCAGCACTTAGAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CATCTTCTTTGAGAGTTGTTGGTTTATGCTCATCCCTACTCATAACCCCAGCACTTAGAT 300
Query 301 ATTTTAAAGAGGCATCTATCACATAAGGCATCATTATAACTAAAAATGGGATATATTCCT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATTTTAAAGAGGCATCTATCACATAAGGCATCATTATAACTAAAAATGGGATATATTCCT 360
Query 361 TATAAACTACTGCTAAGACAGCTAAGAAAGCTCCAATTGGTAGAGTTCCAACATCTCCTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TATAAACTACTGCTAAGACAGCTAAGAAAGCTCCAATTGGTAGAGTTCCAACATCTCCTG 420
Query 421 GAAAAACCTTTGCTGGATATTTGTTAAATATCAATAGCCCTAAATAGGATGCAGAGAATA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GAAAAACCTTTGCTGGATATTTGTTAAATATCAATAGCCCTAAATAGGATGCAGAGAATA 480
Query 481 TCAAAGCGGATAAAAATCCA 500
|||||||||| |||||||||
Sbjct 481 TCAAAGCGGA-AAAAATCCA 499
Query= ERCC-00075_genbank |103488725|gb|DQ516778.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-61 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00075
Length=1023
Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCTACACGTTCCCTCATCTGAAACCATACAACTACCAACTGGATTTAATGGAGTGCAAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCCTACACGTTCCCTCATCTGAAACCATACAACTACCAACTGGATTTAATGGAGTGCAAA 60
Query 61 CCGTTCCAAACAATGGGCAGTCAGTTGGCAGTTTCTCTCCTCTCAAAATCTTATCACATA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CCGTTCCAAACAATGGGCAGTCAGTTGGCAGTTTCTCTCCTCTCAAAATCTTATCACATA 120
Query 121 TACAACCTTTAGGAATTTTCTCTTTAATCTCTGGAATATCCTCATGCTCATAGATGTCAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TACAACCTTTAGGAATTTTCTCTTTAATCTCTGGAATATCCTCATGCTCATAGATGTCAA 180
Query 181 ATTTCTTATACTTCTCCCTCAATCCAAAACCACCATTTTTAACAACTGGGAAACCTCTCC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ATTTCTTATACTTCTCCCTCAATCCAAAACCACCATTTTTAACAACTGGGAAACCTCTCC 240
Query 241 AAGGAACATCTATGCTTTCAAAAACTTCATTTATTATTTTTTGAGCTAAAACATTACCTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAGGAACATCTATGCTTTCAAAAACTTCATTTATTATTTTTTGAGCTAAAACATTACCTT 300
Query 301 CTGGCTTAACTGCTCTAATATATTCATTTTCAACCTTTGCCTCTCCACTGATGACTTGCT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CTGGCTTAACTGCTCTAATATATTCATTTTCAACCTTTGCCTCTCCACTGATGACTTGCT 360
Query 361 TTAAAATCATTATTATAGCCATTAACACATCTATTGGCTCAAAGCCAGCAACAACCATTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTAAAATCATTATTATAGCCATTAACACATCTATTGGCTCAAAGCCAGCAACAACCATTG 420
Query 421 GAGCTTTGTATTTTTCACACAACCCATAATAAGGCTTTAATCCGGTGATTGTTGAAACAT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GAGCTTTGTATTTTTCACACAACCCATAATAAGGCTTTAATCCGGTGATTGTTGAAACAT 480
Query 481 GTCCTGGGCATATAAATGCATCTAAATAAACTCCCTCATTTAACAAGAACTCCATAACTG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GTCCTGGGCATATAAATGCATCTAAATAAACTCCCTCATTTAACAAGAACTCCATAACTG 540
Query 541 GAGGAGTCTGCCTGTGGCAATTTAGGATAAAGAAGTTATTAACATCTTTATTTTTTAAAC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GAGGAGTCTGCCTGTGGCAATTTAGGATAAAGAAGTTATTAACATCTTTATTTTTTAAAC 600
Query 601 TTATTAGTTCAGCCCCAGTAGTTGGAGCAGTGGTTTCAAAACCTATTGCCACAAAAACAA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TTATTAGTTCAGCCCCAGTAGTTGGAGCAGTGGTTTCAAAACCTATTGCCACAAAAACAA 660
Query 661 ACTTCTTATCTCTCTCCTTCTTAGCCATCTTTACTGCTTCACTTATACTATAGACAATTC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ACTTCTTATCTCTCTCCTTCTTAGCCATCTTTACTGCTTCACTTATACTATAGACAATTC 720
Query 721 TAACATCACAACCCTCAGATTGCTTTTCCATCAAAGATTTTTCACTTCCCGGCACTCTAT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TAACATCACAACCCTCAGATTGCTTTTCCATCAAAGATTTTTCACTTCCCGGCACTCTAT 780
Query 781 ACATATCTCCAAGAGTGGTTATTACATATCCATTGTCAGCTAAATATATGGCTGTATCTA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 ACATATCTCCAAGAGTGGTTATTACATATCCATTGTCAGCTAAATATATGGCTGTATCTA 840
Query 841 TCTCTTTTTGAGTTGTTACACAAACTGGACAACCCGGCCCTGGAACAACGGTTATATTCT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TCTCTTTTTGAGTTGTTACACAAACTGGACAACCCGGCCCTGGAACAACGGTTATATTCT 900
Query 901 CTGGCAGAACATCCCTAATCCCATACTTACAGATTGTGTGCTCATGACTTCCACAGACGT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CTGGCAGAACATCCCTAATCCCATACTTACAGATTGTGTGCTCATGACTTCCACAGACGT 960
Query 961 GCATAATCTTTAATTTATCTATCTTCTCAGCAAGTTTGTT 1000
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 961 GCATAATCTTTAATTTATCT-TCTTCTCAGCAAGTTTGTT 999
Query= ERCC-00076_genbank |114975623|gb|DQ883650.2| Synthetic construct
clone NISTag9 external RNA control sequence
Length=650
Subject= ERCC-00076
Length=642
Score = 1181 bits (639), Expect = 0.0
Identities = 642/643 (99%), Gaps = 1/643 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCTCATGTGAGCGGATCACTATCTACAGCTGGTAATACTCTCAGAATTTCTAACTACC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCCTCATGTGAGCGGATCACTATCTACAGCTGGTAATACTCTCAGAATTTCTAACTACC 60
Query 61 AGTCGTAAAGTAGGCGAGCGTTGGTTGGTTCCTCTTGAAGCGAGAGAACCAAGGTGCTGG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AGTCGTAAAGTAGGCGAGCGTTGGTTGGTTCCTCTTGAAGCGAGAGAACCAAGGTGCTGG 120
Query 121 CTATTGTCCGCCCCGTCTACGGCTAACGCGGGGTTCTGCCATCCCGGTTTAGCGCAGAAT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CTATTGTCCGCCCCGTCTACGGCTAACGCGGGGTTCTGCCATCCCGGTTTAGCGCAGAAT 180
Query 181 AGTATTAGTCGGTCAGTGGACCCCCTCCTGAATATCTATACTTAGCGGCGGATTACCCGG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AGTATTAGTCGGTCAGTGGACCCCCTCCTGAATATCTATACTTAGCGGCGGATTACCCGG 240
Query 241 CCCTCTTCATTGTCGAAAGATTGGGAACCGCCCTCTGGCTGTCACGCCCCCAGGCCCTAG 300
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CCCTCTTCATTGTCGAAAGATTGGGAACCG-CCTCTGGCTGTCACGCCCCCAGGCCCTAG 299
Query 301 GTGAGGTACTATGTGAGGTATTTTTTCAATGTTAGATCATCTATGTAGTGGATCTGAGAG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GTGAGGTACTATGTGAGGTATTTTTTCAATGTTAGATCATCTATGTAGTGGATCTGAGAG 359
Query 361 ATCACGTGGACCAAAGCTGATTGATTACGGGACTGGCCGTAAGTGCTGCCCGCGAGTAGA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 ATCACGTGGACCAAAGCTGATTGATTACGGGACTGGCCGTAAGTGCTGCCCGCGAGTAGA 419
Query 421 TCGTCTAGATCCGGCTAAAATTCCCTGCGGTGCCTTAGCCACCACTCCTACGACGGGCCG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TCGTCTAGATCCGGCTAAAATTCCCTGCGGTGCCTTAGCCACCACTCCTACGACGGGCCG 479
Query 481 CATCTTGGTTATTCTCGCTAGACACGGTTCGGGAAGTGGAGCATCGTTAGCTGCCAAGAT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CATCTTGGTTATTCTCGCTAGACACGGTTCGGGAAGTGGAGCATCGTTAGCTGCCAAGAT 539
Query 541 GTGTATGTTGTCGCCACTCTCGCACCGTTTTTATAGTCGTTCTATTAGAGATGGTTGCAC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 GTGTATGTTGTCGCCACTCTCGCACCGTTTTTATAGTCGTTCTATTAGAGATGGTTGCAC 599
Query 601 ATGGGCGTTTCTCATCGGTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 643
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 ATGGGCGTTTCTCATCGGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 642
Query= ERCC-00077_genbank |103488689|gb|DQ516742.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-250-25 genomic sequence
Length=250
Subject= ERCC-00077
Length=273
Score = 462 bits (250), Expect = 3e-135
Identities = 250/250 (100%), Gaps = 0/250 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTTTTTTCACCTTATGACTTCTCATTCCATACGAAAGACAGATGGTTTGCTCCCAATGA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGTTTTTTCACCTTATGACTTCTCATTCCATACGAAAGACAGATGGTTTGCTCCCAATGA 60
Query 61 ACCCAGAGGGAGTTAAGGTTGATGATTCCCAAGTCCAACATGGAGTTATGCCTATAACGT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACCCAGAGGGAGTTAAGGTTGATGATTCCCAAGTCCAACATGGAGTTATGCCTATAACGT 120
Query 121 CATGTTGGACAGACCCCTGTATTGAGCAGACTTAACTTATACTGATATACAGCTAAAATT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CATGTTGGACAGACCCCTGTATTGAGCAGACTTAACTTATACTGATATACAGCTAAAATT 180
Query 181 TGAACAACAAATCTCTTAAATTTATTGTTGAGAATAAAAAGGATACTATCTTATCCAATA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TGAACAACAAATCTCTTAAATTTATTGTTGAGAATAAAAAGGATACTATCTTATCCAATA 240
Query 241 TTGTATTTCC 250
||||||||||
Sbjct 241 TTGTATTTCC 250
Query= ERCC-00078_genbank |114976964|gb|DQ883673.2| Synthetic construct
clone NISTag32 external RNA control sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00078
Length=993
Score = 1834 bits (993), Expect = 0.0
Identities = 993/993 (100%), Gaps = 0/993 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGGAATTGGATTTGCAGAGCATATTAGCAAGTTAACGCCGATCACTCTCCGGCAGTTGC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGGGAATTGGATTTGCAGAGCATATTAGCAAGTTAACGCCGATCACTCTCCGGCAGTTGC 60
Query 61 TCCATTAAATACGGGCCTTCGCAATCGCGTGTTGTTACACATAATGCCGGTATCCATCTA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCCATTAAATACGGGCCTTCGCAATCGCGTGTTGTTACACATAATGCCGGTATCCATCTA 120
Query 121 CTATCGCCGCCAGGTGCAAGAAATGCATATCCCGGCCTACCCCCTTAGCAATCGACATTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CTATCGCCGCCAGGTGCAAGAAATGCATATCCCGGCCTACCCCCTTAGCAATCGACATTT 180
Query 181 GTCTTTGCTGGACGCGCATGATTGAGTTATACGGAACTTCGCAAAAGTATTCCCTTTGTG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTCTTTGCTGGACGCGCATGATTGAGTTATACGGAACTTCGCAAAAGTATTCCCTTTGTG 240
Query 241 GTCCGTGCGCCATGCTCCTCTGGGCGTAGCTTACAAGGACTAGGCCGTAGCCTGTAATTA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GTCCGTGCGCCATGCTCCTCTGGGCGTAGCTTACAAGGACTAGGCCGTAGCCTGTAATTA 300
Query 301 GGGAACCGAGCACCAGAGAATCAGGGTCACAGTGTGTGGTAGACGAAATGATCGTGGGCT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GGGAACCGAGCACCAGAGAATCAGGGTCACAGTGTGTGGTAGACGAAATGATCGTGGGCT 360
Query 361 GAGGGAATTAGGAGGCGCCGGTCCAATAGTCGATAACACCTGACGGAAGTACGGCTGCAG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAGGGAATTAGGAGGCGCCGGTCCAATAGTCGATAACACCTGACGGAAGTACGGCTGCAG 420
Query 421 GATCTAATCATATAGTTCAGAATTGCACGCGCGTCTAAGAACGGACCAGTGTAGACACAA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GATCTAATCATATAGTTCAGAATTGCACGCGCGTCTAAGAACGGACCAGTGTAGACACAA 480
Query 481 TACAACTTAAGCGCAGATCTGAGAGAGGGGTGCACAATCCAGGCAAAGTCCGTTAGAAGG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TACAACTTAAGCGCAGATCTGAGAGAGGGGTGCACAATCCAGGCAAAGTCCGTTAGAAGG 540
Query 541 TCAACCTTGTGGGTGCAGCGCTTTGCTCCTAAAGATTCGCTCCTCGGGAGCGACGCGACT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TCAACCTTGTGGGTGCAGCGCTTTGCTCCTAAAGATTCGCTCCTCGGGAGCGACGCGACT 600
Query 601 GCTAGGGACTGGTAAAACGTTGGGCGCTGTCCAAGGTACCCTCAGTCTGTATTTCATGCC 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GCTAGGGACTGGTAAAACGTTGGGCGCTGTCCAAGGTACCCTCAGTCTGTATTTCATGCC 660
Query 661 CTCAAATATGCAATCCCGACCCGGAGCCGGCTTTAGATTTATAGCAGAGGGTCTCCGAGG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CTCAAATATGCAATCCCGACCCGGAGCCGGCTTTAGATTTATAGCAGAGGGTCTCCGAGG 720
Query 721 ACTGTAATGTCTTTTGCGAGACAGGAAAGGTTGGGCGGTGTACGTCACCTCTACGGTCGA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 ACTGTAATGTCTTTTGCGAGACAGGAAAGGTTGGGCGGTGTACGTCACCTCTACGGTCGA 780
Query 781 GGCTTGGGTGTATCATGGAGTAATCTATATTCCTTACACGCTTGCTTGCTCCTACCATAC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GGCTTGGGTGTATCATGGAGTAATCTATATTCCTTACACGCTTGCTTGCTCCTACCATAC 840
Query 841 AACCACGCAGTCATTACGCGTACATATACCAGCAATTCTTCTACGGACCGTTAGGAAGAA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AACCACGCAGTCATTACGCGTACATATACCAGCAATTCTTCTACGGACCGTTAGGAAGAA 900
Query 901 AATGAACGGAGTGGCTGGCCCATAATTTCGCACCCGAAGCTACTGGTCGGACCCATCAGC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AATGAACGGAGTGGCTGGCCCATAATTTCGCACCCGAAGCTACTGGTCGGACCCATCAGC 960
Query 961 GCGTGTCGTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 993
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GCGTGTCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 993
Query= ERCC-00079_genbank |114975640|gb|DQ883652.2| Synthetic construct
clone NISTag11 external RNA control sequence
Length=650
Subject= ERCC-00079
Length=644
Score = 1190 bits (644), Expect = 0.0
Identities = 644/644 (100%), Gaps = 0/644 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATGTTGGAGTTAACGGAGACCCGCCATCGTTTACGAAACAGGTCGCAGATAAATGTGGA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GATGTTGGAGTTAACGGAGACCCGCCATCGTTTACGAAACAGGTCGCAGATAAATGTGGA 60
Query 61 GCAGATTTACGTTGAGGGCCTTCTGGGGACCCAAAGGATGAACGGGGTGTTGTTTCAGAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GCAGATTTACGTTGAGGGCCTTCTGGGGACCCAAAGGATGAACGGGGTGTTGTTTCAGAG 120
Query 121 CGAATAGAGCGATCACCAACGCGCACGTCTCTTTTTAAGATTGAGCGGCTAGGTGTTTCC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CGAATAGAGCGATCACCAACGCGCACGTCTCTTTTTAAGATTGAGCGGCTAGGTGTTTCC 180
Query 181 TACAGTAACTCAATTAGCGTGAGCCAAAGGGCGGAGCCACGGGCCAGTAAGCTATTTAGG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TACAGTAACTCAATTAGCGTGAGCCAAAGGGCGGAGCCACGGGCCAGTAAGCTATTTAGG 240
Query 241 GTTTACATGGCTCGATACCGAAACGTGACCGGTACGACGTTCATTTCCTCTGCTTTGGAG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GTTTACATGGCTCGATACCGAAACGTGACCGGTACGACGTTCATTTCCTCTGCTTTGGAG 300
Query 301 TTATCAATTCGTGACCCCGATCATCCAGTCCAGAAGTCGCGGCCCGAAGATCAAAGACGC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTATCAATTCGTGACCCCGATCATCCAGTCCAGAAGTCGCGGCCCGAAGATCAAAGACGC 360
Query 361 TACTGACTTGGACTGGTACGAGAGCCCGAGAGTTTAGTGTGCGCACCCCACGTATTTTTT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TACTGACTTGGACTGGTACGAGAGCCCGAGAGTTTAGTGTGCGCACCCCACGTATTTTTT 420
Query 421 CGCGTCGATCATGCTTAGATTTTAACAACCCGCGGGCCGAAGTTTGATAAGCGTGTTCTA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CGCGTCGATCATGCTTAGATTTTAACAACCCGCGGGCCGAAGTTTGATAAGCGTGTTCTA 480
Query 481 GATTGGAACTTACCACTGTTAAATACACGACGCCCATCTCCAAATCGCACGCAACAGGGG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GATTGGAACTTACCACTGTTAAATACACGACGCCCATCTCCAAATCGCACGCAACAGGGG 540
Query 541 GCTTCCACCAGATACTCCCCAGGACAGGTGGAGATACCAACCACGAAGGAGGTCTCGTGC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GCTTCCACCAGATACTCCCCAGGACAGGTGGAGATACCAACCACGAAGGAGGTCTCGTGC 600
Query 601 TGAGCCTTCGTCGATATACCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TGAGCCTTCGTCGATATACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 644
Query= ERCC-00081_genbank |110586078|gb|DQ854991.1| Synthetic construct
clone AG002.0011 external RNA control sequence
Length=509
Subject= ERCC-00081
Length=534
Score = 929 bits (503), Expect = 0.0
Identities = 508/510 (99%), Gaps = 1/510 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTATGCGGGGTGTTGTTGATAAGACTTCCTAGGCACGCGGACCAAGCACGTTAAAGGGA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTTATGCGGGGTGTTGTTGATAAGACTTCCTAGGCACGCGGACCAAGCACGTTAAAGGGA 60
Query 61 GGTTCGCTCGATCAAGAGATCCATACAGCAGGCTCCTATCAGTCTATCTGACGCCAGTTG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGTTCGCTCGATCAAGAGATCCATACAGCAGGCTCCTATCAGTCTATCTGACGCCAGTTG 120
Query 121 CCATTGGACGGGATGTCGAGGGTTTGCGGTGGGGAACGACCATACTTACTGTCATTACGA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CCATTGGACGGGATGTCGAGGGTTTGCGGTGGGGAACGACCATACTTACTGTCATTACGA 180
Query 181 CGTGCGGGGAAATTGAGGTTAAGTTGTTTGCCACCCTACAATAACGAAGAATTTAGCCAC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CGTGCGGGGAAATTGAGGTTAAGTTGTTTGCCACCCTACAATAACGAAGAATTTAGCCAC 240
Query 241 CGGTTGGCG-TAGAGTTGTCAAGACGTTGGCGTGATGGGATGAACGTCGCTTAAACGTTG 299
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CAGTTGGCGTTAGAGTTGTCAAGACGTTGGCGTGATGGGATGAACGTCGCTTAAACGTTG 300
Query 300 GTTCAGGGCTCCATATATACATCTGCCGTGCCCCCCTTAATCTCCATACAGACCCCCCAG 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GTTCAGGGCTCCATATATACATCTGCCGTGCCCCCCTTAATCTCCATACAGACCCCCCAG 360
Query 360 GCGGAATGATAAGTCGATACCAGGACAATGACGGCTTCAACGTTTTCACTTTCCGCAGGT 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GCGGAATGATAAGTCGATACCAGGACAATGACGGCTTCAACGTTTTCACTTTCCGCAGGT 420
Query 420 GGCGACCCTCTAGTTGCACGCTGGTACATCAGACACGTACACACGCGCAGTGGGGTGTAA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GGCGACCCTCTAGTTGCACGCTGGTACATCAGACACGTACACACGCGCAGTGGGGTGTAA 480
Query 480 TCAAGCAGGACCATAACTGATAGTTCACCA 509
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TCAAGCAGGACCATAACTGATAGTTCACCA 510
Query= ERCC-00083_genbank |103488727|gb|DQ516780.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-63 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00083
Length=1022
Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGTTTATAGTCtttttttGATTGCCTCAACTAATGCCTCCTTTGTAGGAGCTCCAATAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAGTTTATAGTCTTTTTTTGATTGCCTCAACTAATGCCTCCTTTGTAGGAGCTCCAATAA 60
Query 61 ACTCAACATCCCCATTTATTACAATTGTTGGAACTGCCATTATCCCATATTCCATTGCCT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACTCAACATCCCCATTTATTACAATTGTTGGAACTGCCATTATCCCATATTCCATTGCCT 120
Query 121 TTTGAGGATTCTCCATAACGTTTATGTATTCTACTTCAACAGCATCCGGCATTTCATTTG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TTTGAGGATTCTCCATAACGTTTATGTATTCTACTTCAACAGCATCCGGCATTTCATTTG 180
Query 181 CTACCTCTTCAACAACTCTTTTAGCTGCAGGACAGTGAGGACACATTGGTGATGTAAAAA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTACCTCTTCAACAACTCTTTTAGCTGCAGGACAGTGAGGACACATTGGTGATGTAAAAA 240
Query 241 GCTCTATCTTTACCTTTGACATACTAACACCttaaaaacctcttaagtttataataaaaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GCTCTATCTTTACCTTTGACATACTAACACCTTAAAAACCTCTTAAGTTTATAATAAAAA 300
Query 301 ttttatccaaatttttataaatagttttccaaaaatagaatattaaattataGGCTAAAA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTTTATCCAAATTTTTATAAATAGTTTTCCAAAAATAGAATATTAAATTATAGGCTAAAA 360
Query 361 ATTAATGACCACATGTCCAAACTTGTCTGAAGTGTTCAATTGCTTCAACAATATCCTTCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ATTAATGACCACATGTCCAAACTTGTCTGAAGTGTTCAATTGCTTCAACAATATCCTTCA 420
Query 421 ATTTCTCTGGTGGGAAAGCTACAACAACTTCTTCTGGCTTAATTCCAGCGTATTTTCTTG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ATTTCTCTGGTGGGAAAGCTACAACAACTTCTTCTGGCTTAATTCCAGCGTATTTTCTTG 480
Query 481 AACCGTTACAACCTAAAGTCATGTTAGGAGCTTTTCTTGTATAAACTGCCGCTACAGCAT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AACCGTTACAACCTAAAGTCATGTTAGGAGCTTTTCTTGTATAAACTGCCGCTACAGCAT 540
Query 541 CAGCACACAATGACTGAATTCCTGAGAAATCTGCCTGGAATCTTCCACCTTTATGGTAGA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CAGCACACAATGACTGAATTCCTGAGAAATCTGCCTGGAATCTTCCACCTTTATGGTAGA 600
Query 601 GTATTGCTTGAACTAACCTCAACGCATATAATGGCTCTCCAATAAATACAATTGAGTCTG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GTATTGCTTGAACTAACCTCAACGCATATAATGGCTCTCCAATAAATACAATTGAGTCTG 660
Query 661 GAATGAAGTCGGTTTCATCTAATGGAGCATAGACTGTTGCATAAATTTCCTCTTCAACTT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GAATGAAGTCGGTTTCATCTAATGGAGCATAGACTGTTGCATAAATTTCCTCTTCAACTT 720
Query 721 TTGGTATTGCATCAACTGtttttttAGCTGCCTCTTCATCTTTAAAGTTTCCTAATTTGA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TTGGTATTGCATCAACTGTTTTTTTAGCTGCCTCTTCATCTTTAAAGTTTCCTAATTTGA 780
Query 781 CATATAATTTTCCTGTTGCTAATGGTTCTGGTGGGTTTCTAAAGACCCCCATTGCATAAG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CATATAATTTTCCTGTTGCTAATGGTTCTGGTGGGTTTCTAAAGACCCCCATTGCATAAG 840
Query 841 CTCCTCCCTTACAGAGGTGTTTATCAACTGTTGCATATAAtttttttCTTTCTAATCTTG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CTCCTCCCTTACAGAGGTGTTTATCAACTGTTGCATATAATTTTTTTCTTTCTAATCTTG 900
Query 901 CCATTTGAATCATTTCACAGTGTCTTTTTTCTTCGTCTAATGTTTCATAGCCTTCTGGAA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CCATTTGAATCATTTCACAGTGTCTTTTTTCTTCGTCTAATGTTTCATAGCCTTCTGGAA 960
Query 961 TTTCTTCCTTTGATTTTGCCAATTTTACAGCGACAAATGG 1000
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 961 TTTCTTCCTTTGATTTTGCCA-TTTTACAGCGACAAATGG 999
Query= ERCC-00084_genbank |114976998|gb|DQ883682.2| Synthetic construct
clone NISTag41 external RNA control sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00084
Length=994
Score = 1836 bits (994), Expect = 0.0
Identities = 994/994 (100%), Gaps = 0/994 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGAATTGTCTGGGGCCTCGTTGTGACTATCCTATTACGGGGATCTCAGGTGTGGTATCC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCGAATTGTCTGGGGCCTCGTTGTGACTATCCTATTACGGGGATCTCAGGTGTGGTATCC 60
Query 61 CTGGTTGAGACATTGGACTAGTGTAATTGACAGTCATCGTATGCGGGATACCTCAAGTTG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTGGTTGAGACATTGGACTAGTGTAATTGACAGTCATCGTATGCGGGATACCTCAAGTTG 120
Query 121 TATTCGAGGGCTTATCGGTGATACTGTGTAATCCCTTCGGCGAAAGATGTATGCGTGAGC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TATTCGAGGGCTTATCGGTGATACTGTGTAATCCCTTCGGCGAAAGATGTATGCGTGAGC 180
Query 181 ATTAAATTTACGTGTTTCCTATATCGGACGCCTAATCTTTACCCGAGAAAGATATCTCTG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ATTAAATTTACGTGTTTCCTATATCGGACGCCTAATCTTTACCCGAGAAAGATATCTCTG 240
Query 241 TAAGTTTTCAAGCAACCGCGTCCTAATGTATATAACTTGGATCATCAGATAGGCCCATTA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TAAGTTTTCAAGCAACCGCGTCCTAATGTATATAACTTGGATCATCAGATAGGCCCATTA 300
Query 301 CACTCTTCGGTGCTGCCGATATCCGACGAGCGGGCTTTTCGACTTGATCAGCGCTGTGGG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CACTCTTCGGTGCTGCCGATATCCGACGAGCGGGCTTTTCGACTTGATCAGCGCTGTGGG 360
Query 361 TAGAGCTTGGATAAGCGAGGTCAGTCAAGCGATTCGTTGCCTCCGGGTCCCACGTAGATC 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TAGAGCTTGGATAAGCGAGGTCAGTCAAGCGATTCGTTGCCTCCGGGTCCCACGTAGATC 420
Query 421 GTTTGCCTGCATTTTATAGGTAGTGGCCTGCGTTCGCACTCCGAGGCACTGGGAACGATC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GTTTGCCTGCATTTTATAGGTAGTGGCCTGCGTTCGCACTCCGAGGCACTGGGAACGATC 480
Query 481 CTACCAACATAACGGTCGAACTCGGTGTCGGATGACCCGGACGGGACGCCCGCGCTCACA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CTACCAACATAACGGTCGAACTCGGTGTCGGATGACCCGGACGGGACGCCCGCGCTCACA 540
Query 541 CAGGTATCTGGCGTGTACACCCGAATCGGCGGGGCTCGGCGACACAAAATGCTTCTAACT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CAGGTATCTGGCGTGTACACCCGAATCGGCGGGGCTCGGCGACACAAAATGCTTCTAACT 600
Query 601 CGCTGTGAATCTACTGCAGAACTATGGGTTTGCTAGCGCGCCGGTATCTACCAGCAAAAC 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CGCTGTGAATCTACTGCAGAACTATGGGTTTGCTAGCGCGCCGGTATCTACCAGCAAAAC 660
Query 661 ATAGGAGCGTGGCCGAAACTGGGTCACTGAGTGGAATATATCCGAGTGCAGCTGCCATTA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ATAGGAGCGTGGCCGAAACTGGGTCACTGAGTGGAATATATCCGAGTGCAGCTGCCATTA 720
Query 721 GTGGGGCGGTATCGGGCGTGATTGAAGGTAGGCTAACATTAGTCATCTGGTAGGGCATAT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GTGGGGCGGTATCGGGCGTGATTGAAGGTAGGCTAACATTAGTCATCTGGTAGGGCATAT 780
Query 781 TTTACAAACGGTCTAGGCTGCGGTTCAGATAGGGACTGATATACTTGATGTGCCCCCGTT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TTTACAAACGGTCTAGGCTGCGGTTCAGATAGGGACTGATATACTTGATGTGCCCCCGTT 840
Query 841 CTTCAGCGTGCAGCTATGCAGCGACAGACGTTTGGAGCCTTAATCAAGTACGCATCGGAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CTTCAGCGTGCAGCTATGCAGCGACAGACGTTTGGAGCCTTAATCAAGTACGCATCGGAG 900
Query 901 CATACGGTCACTGGGGCATTTGCAGTGAAATTAACCATCCCCGTTCCCGCTTCTCAGTTG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CATACGGTCACTGGGGCATTTGCAGTGAAATTAACCATCCCCGTTCCCGCTTCTCAGTTG 960
Query 961 CAGGGTGGGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 994
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CAGGGTGGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 994
Query= ERCC-00085_genbank |114976949|gb|DQ883669.2| Synthetic construct
clone NISTag28 external RNA control sequence
Length=850
Subject= ERCC-00085
Length=844
Score = 1559 bits (844), Expect = 0.0
Identities = 844/844 (100%), Gaps = 0/844 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATTCAGCCTGACGTACATAGACGAGATAGGGTAAGCCTATTGCAAACCTCCGCTTTGCT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GATTCAGCCTGACGTACATAGACGAGATAGGGTAAGCCTATTGCAAACCTCCGCTTTGCT 60
Query 61 ACTACAAGGACCTCGGAAGTGTGGAGAATCGAACCTACAATTTTGCCAGGATCACGCCGG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACTACAAGGACCTCGGAAGTGTGGAGAATCGAACCTACAATTTTGCCAGGATCACGCCGG 120
Query 121 TTATCTCTTGCAATTCCTAAGATGGAGGATAGTTTTGGAACCCAATATCCCCAGCCTACG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TTATCTCTTGCAATTCCTAAGATGGAGGATAGTTTTGGAACCCAATATCCCCAGCCTACG 180
Query 181 GTTTAGGTGCAAGAATAGAGCGTACCAGGCGTCGCCCGCGGCCTTATGTAGTCTGTATTG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTTTAGGTGCAAGAATAGAGCGTACCAGGCGTCGCCCGCGGCCTTATGTAGTCTGTATTG 240
Query 241 TTGAATTAGCCTTCTTCAGAGGGCCTAACGCCAGCACAACATGCTTACCTGGCTAATTGA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TTGAATTAGCCTTCTTCAGAGGGCCTAACGCCAGCACAACATGCTTACCTGGCTAATTGA 300
Query 301 CTAAGTGCTACGGTACACAACGACTACGTACGTAGCACACAGTTGAGGTTATCTCTGAGC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CTAAGTGCTACGGTACACAACGACTACGTACGTAGCACACAGTTGAGGTTATCTCTGAGC 360
Query 361 GCCCCGTTAGAACTGAGGGCTCAATTATAGTACCTTAACTGCGTTGCGCTGTCATGGGAA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GCCCCGTTAGAACTGAGGGCTCAATTATAGTACCTTAACTGCGTTGCGCTGTCATGGGAA 420
Query 421 GGTATTTTAATACGGATTCATTACCGCTCCACCGGCAGCGTTCCGTTACATCCAACTAGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GGTATTTTAATACGGATTCATTACCGCTCCACCGGCAGCGTTCCGTTACATCCAACTAGG 480
Query 481 TGGACAAACCTGCTCATTCAAGGGCGCCTCCATCGCAGGGTTGCAATTTATTTTCTAGCT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TGGACAAACCTGCTCATTCAAGGGCGCCTCCATCGCAGGGTTGCAATTTATTTTCTAGCT 540
Query 541 AGAGGTGTAACCATGCCGGCAGCGAACGTCCGCACTAGCAGGTACACAATCAGGCATCGA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AGAGGTGTAACCATGCCGGCAGCGAACGTCCGCACTAGCAGGTACACAATCAGGCATCGA 600
Query 601 ACATGTACTCATTAGTTCCGAATTATAAGTCGGATACTTGCCTTAAGTCGCATCTGAATC 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ACATGTACTCATTAGTTCCGAATTATAAGTCGGATACTTGCCTTAAGTCGCATCTGAATC 660
Query 661 ATAGCCGCTCCATTGCCGAGTAGACGGGATCTGCTGTAGAATGGTAATCAGTCTTACCCG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ATAGCCGCTCCATTGCCGAGTAGACGGGATCTGCTGTAGAATGGTAATCAGTCTTACCCG 720
Query 721 TGGGGTCGTTCTGCCCGAGTGCTGCATTCCGCCTACGCGCGGTATTCAACAAGGGTAATC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TGGGGTCGTTCTGCCCGAGTGCTGCATTCCGCCTACGCGCGGTATTCAACAAGGGTAATC 780
Query 781 CCTCCGACAACCCTCAGTGTTATCATCCGCGTCAAGGGGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CCTCCGACAACCCTCAGTGTTATCATCCGCGTCAAGGGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 840
Query 841 aaaa 844
||||
Sbjct 841 AAAA 844
Query= ERCC-00086_genbank |103488738|gb|DQ516791.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-74 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00086
Length=1020
Score = 1825 bits (988), Expect = 0.0
Identities = 996/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTCTTGACTTTTTCCATAACTTCCCTAATTGTTCTATAATTCYCTTTCAAAGAGTCC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1 TTTCTCTTGACTTTTTCCATAACTTCCCTAATTGTTCTATAATTCTCTTTCAAAGAGTCC 60
Query 61 TTATCATAACCAAATACATAAACTCTAACTCTATTTCCTTTTGATTCTATTGTGCAATCA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTATCATAACCAAATACATAAACTCTAACTCTATTTCCTTTTGATTCTATTGTGCAATCA 120
Query 121 ATGTCCATCCTTGATAATCTCTCACAAAGCTCCAAAAGCTCTTCATCACAACTCACTTTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATGTCCATCCTTGATAATCTCTCACAAAGCTCCAAAAGCTCTTCATCACAACTCACTTTT 180
Query 181 GATGAAATAATCTTTCTCATAGTATCACCAAAATAATAAAGTAAATTTATAAATTACCAT 240
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 181 GATGAAATAATCTTTCTCATAGTATCGCCAAAATAATAAAGTAAATTTACAAATTACCAT 240
Query 241 AGCTTATATAATAAAGTTTTGCATGAACAAAAATGTTGTGGTGATATATCATGGACGAAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AGCTTATATAATAAAGTTTTGCATGAACAAAAATGTTGTGGTGATATATCATGGACGAAT 300
Query 301 TTGAAATGATAAAGAGAAACACATCTGAAATTATCAGCGAGGAAGAGTTAAGAGAGGTTT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTGAAATGATAAAGAGAAACACATCTGAAATTATCAGCGAGGAAGAGTTAAGAGAGGTTT 360
Query 361 TaaaaaaaGATGAAAAATCTGCTTACATAGGTTTTGAACCAAGTGGTAAAATACATTTAG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TAAAAAAAGATGAAAAATCTGCTTACATAGGTTTTGAACCAAGTGGTAAAATACATTTAG 420
Query 421 GGCATTATCTCCAAATAAAAAAGATGATTGATTTACAAAATGCTGGATTTGATATAATTA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GGCATTATCTCCAAATAAAAAAGATGATTGATTTACAAAATGCTGGATTTGATATAATTA 480
Query 481 TATTGTTGGCTGATTTACACGCCTATTTAAACCAGAAAGGAGAGTTGGATGAGATTAGAA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TATTGTTGGCTGATTTACACGCCTATTTAAACCAGAAAGGAGAGTTGGATGAGATTAGAA 540
Query 541 AAATAGGAGATTATAACAAAAAAGTTTTTGAAGCAATGGGGTTAAAGGCAAAATATGTTT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AAATAGGAGATTATAACAAAAAAGTTTTTGAAGCAATGGGGTTAAAGGCAAAATATGTTT 600
Query 601 ATGGAAGTGAATTCCAGCTTGATAAGGATTATACACTGAATGTCTATAGATTGGCTTTAA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ATGGAAGTGAATTCCAGCTTGATAAGGATTATACACTGAATGTCTATAGATTGGCTTTAA 660
Query 661 AAACTACCTTAAAAAGAGCAAGAAGGAGTATGGAACTTATAGCAAGAGAGGATGAAAATC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AAACTACCTTAAAAAGAGCAAGAAGGAGTATGGAACTTATAGCAAGAGAGGATGAAAATC 720
Query 721 CAAAGGTTGCTGAAGTTATCTATCCAATAATGCAGGTTAATGATATTCATTATTTAGGCG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CAAAGGTTGCTGAAGTTATCTATCCAATAATGCAGGTTAATGATATTCATTATTTAGGCG 780
Query 781 TTGATGTTGCAGTTGGAGGGATGGAGCAGAGAAAAATACACATGTTAGCAAGGGAGCTTT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TTGATGTTGCAGTTGGAGGGATGGAGCAGAGAAAAATACACATGTTAGCAAGGGAGCTTT 840
Query 841 TACCAAAAAAGGTTGTTTGTATTCACAACCCTGTCTTAACGGGTTTGGATGGAGAAGGAA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TACCAAAAAAGGTTGTTTGTATTCACAACCCTGTCTTAACGGGTTTGGATGGAGAAGGAA 900
Query 901 AGATGAGTTCTTCAAAAGGGAATTTTATAGCTGTTGATGACTCTCCAGAAGAGATTAGGG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AGATGAGTTCTTCAAAAGGGAATTTTATAGCTGTTGATGACTCTCCAGAAGAGATTAGGG 960
Query 961 CTAAGATAAAGAAAGCATACTGCCCAGCTGGAGTTGTTGA 1000
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 961 CTAAGATAAAGAAAGCATAC-GCCCAGCTGGAGTTGTTGA 999
Query= ERCC-00092_genbank |92111303|gb|DQ459425.1| Synthetic construct
microarray control MC20 mRNA, complete sequence
Length=1131
Subject= ERCC-00092
Length=1124
Score = 2023 bits (1095), Expect = 0.0
Identities = 1117/1126 (99%), Gaps = 7/1126 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 AGATGTATATATGATGTCCTTGGACGGGGTGGCGCAGTCTTACTGCAAGAGAGCGGACAG 63
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGATGTATATATGATGTCCTTGGACGGGGTGGCGCAGTATTACTGCAAGAGAGCGGACAG 60
Query 64 ATTAGTGTGTTGG-GCCGACACATCAAAGGTTCGTCCGGGGACCGATCTGCAGCCTACGG 122
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ATTAGTGTGTTGGAGCCGACACATCAAAGGTTCGTCCGGGGACCGATCTGCAGCCTACGG 120
Query 123 GACATTTATCCGTAAAAGCATGGCGCTGTTTCGTACTTATCGGAGGCCAGGTATCGTCGC 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GACATTTATCCGTAAAAGCATGGCGCTGTTTCGTACTTATCGGAGGCCAGGTATCGTCGC 180
Query 183 GGCGAGTCTCCCCGACGACGGAGATGGGCGTTACTATCTGGGCCGTCTCGTACTCTGTTA 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GGCGAGTCTCCCCGACGACGGAGATGGGCGTTACTATCTGGGCCGTCTCGTACTCTGTTA 240
Query 243 CTTGGCACAGATGCGAGCCCTCGTAATGTGCATCAGCTAAGGGCGATATTATAATGCGAC 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTTGGCACAGATGCGAGCCCTCGTAATGTGCATCAGCTAAGGGCGATATTATAATGCGAC 300
Query 303 GTTTGTACGGACTCGTTACTAACGTGTTGGACGCTAGTGGAATATGTGTCGTTGGTTAGC 362
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GTTTGTACGGATTCGTTACTAACGTGTTGGACGCTAGTGGAATATGTGTCGTTGGTTAGC 360
Query 363 CTACCCATGGCTTTCGCGGCGAC-CATGCTTAGACTCTTTCAAAACTTCGGTGAAGTTCA 421
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTACCCATGGCTTTCGCGGCGACACATGCTTAGACTCTTTCAAAACTTCGGTGAAGTTCA 420
Query 422 CTCAAGCCGCGGAGCGCCGTCGTAATTCACTAGGGATGGCGG-ACCCG-GCCCGTCCGAT 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 421 CTCAAGCCGCGGAGCGCCGTCGTAATTCACTAGGGATGGCGGTACCCGTGCCCGTCCGAT 480
Query 480 TCGTAGCAACCTGCATCACGATTTTGTCTTCGGGCGACTTATCAGATACGGTAATGTAAA 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TCGTAGCAACCTGCATCACGATTTTGTCTTCGGGCGACTTATCAGATACGGTAATGTAAA 540
Query 540 TACCTGGCATTTGGGCACTTCTGTGC-TTTAAGCGGGAAAGATCGCGAGGGCCCGCTATT 598
|||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TACCTGGCATTTGGGCACTTCT-TGCGTTTAAGCGGGAAAGATCGCGAGGGCCCGCTATT 599
Query 599 TGCGATACTTCCCATGTCGGTGCCGTCGCCTCTATGTACTCGGAGACGTTAATGCAGAGG 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TGCGATACTTCCCATGTCGGTGCCGTCGCCTCTATGTACTCGGAGACGTTAATGCAGAGG 659
Query 659 CTAAGGACAATTTACCATGACTCGGTAATCCGTTCGTCAAGCAGGTAGCTCGAGTCTCCC 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CTAAGGACAATTTACCATGACTCGGTAATCCGTTCGTCAAGCAGGTAGCTCGAGTCTCCC 719
Query 719 CACGGACACGTAGTGGGTTTGTAACGATCGATACCGAGTCTTTTTGTCTAGTAGAACCAA 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 CACGGACACGTAGTGGGTTTGTAACGATCGATACCGAGTCTTTTTGTCTAGTAGAACCAA 779
Query 779 CCAACGCATTAAGGAGTTCACTAGCACATCTTTGCGACCCGATCGTCCGTGTGTCGCGTA 838
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 CCAAC-CATTAAGGAGTTCACTAGCACATCTTTGCGACCCGATCGTCCGTGTGTCGCGTA 838
Query 839 ATACTTTTGTTATGACGAGACATACGCTCAAGCCCTGGGTAGCTAGTCGCGGAGGCACGT 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 ATACTTTTGTTATGACGAGACATACGCTCAAGCCCTGGGTAGCTAGTCGCGGAGGCACGT 898
Query 899 TACCGCGCACAACCCCTATTCGTTTACATGTACATCGCATCTGAGGTAGTACACTTCCGG 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 TACCGCGCACAACCCCTATTCGTTTACATGTACATCGCATCTGAGGTAGTACACTTCCGG 958
Query 959 CGTACGTGAGTATTTGCGCGTAATAAGCGCGTGTTTAGCTGATCCCCTCTCGTATCGAGG 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 CGTACGTGAGTATTTGCGCGTAATAAGCGCGTGTTTAGCTGATCCCCTCTCGTATCGAGG 1018
Query 1019 TTAAGGCAGATTAGTGCCCAGTAATTGCGtttttttGTCGTTGTCGCAGAACGCGATTTG 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 TTAAGGCAGATTAGTGCCCAGTAATTGCGTTTTTTTGTCGTTGTCGCAGAACGCGATTTG 1078
Query 1079 CTCCGAAAGCTTTAAGCCGTGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 CTCCGAAAGCTTTAAGCCGTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1124
Query= ERCC-00095_genbank |103488706|gb|DQ516759.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-42 genomic sequence
Length=500
Subject= ERCC-00095
Length=521
Score = 911 bits (493), Expect = 0.0
Identities = 498/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGATGATGATACTTAACCAAACCTACCACTAATGTAGTCATCTGTCTCCTTCTTCTGTG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTGATGATGATACTTAACCAAACCTACCACTAATGTAGTCATCTGTCTCCTTCTTCTGTG 60
Query 61 GATTTAGGAATATCTGCTCTGTCTCTCCAAACTCAATTAATTTCCCCATTAAGAAAAAGG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GATTTAGGAATATCTGCTCTGTCTCTCCAAACTCAATTAATTTCCCCATTAAGAAAAAGG 120
Query 121 CAGTGTAATCAGAAACCCTACTTGCCTGCTGCATGTTGTGGGTAACAACAACAATCGTAT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CAGTGTAATCAGAAACCCTACTTGCCTGCTGCATGTTGTGGGTAACAACAACAATCGTAT 180
Query 181 AATCTTTAGCTAACTCAACCATTAACTCCTCTATCTTTAATGTGGAGATAGGGTCTAAGG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AATCTTTAGCTAACTCAACCATTAACTCCTCTATCTTTAATGTGGAGATAGGGTCTAAGG 240
Query 241 CAGATGTTGGTTCATCCATCAATAAAACCTCTGGCTTAACTGCTATCGCTCTCGCTATAC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CAGATGTTGGTTCATCCATCAATAAAACCTCTGGCTTAACTGCTATCGCTCTCGCTATAC 300
Query 301 ATAACCTCTGCTGTTGTCCTCCAGAGAGAGATAAAGCGTTTTTATGCAGTTCATCTTTAA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATAACCTCTGCTGTTGTCCTCCAGAGAGAGATAGAGCGTTTTTATGCAGTTCATCTTTAA 360
Query 361 CCTCATCCCACAAAGCCGCTTTCTTTAAAGCCCACTCAACAATCTTATCCAATTCTTTTT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CCTCATCCCACAAAGCCGCTTTCTTTAAAGCCCACTCAACAATCTTATCCAATTCTTTTT 420
Query 421 TATCCTTAATTCCATGAATTCTTGGGCCAAATGCAACATTATCATAGATGCTCATAGCAA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TATCCTTAATTCCATGAATTCTTGGGCCAAATGCAACATTATCATAGATGCTCATAGCAA 480
Query 481 AAGGATTTGGCTTTTGAAAT 500
|||||||||| |||||||||
Sbjct 481 AAGGATTTGG-TTTTGAAAT 499
Query= ERCC-00096_genbank |92111307|gb|DQ459429.1| Synthetic construct
microarray control MC27 mRNA, complete sequence
Length=1119
Subject= ERCC-00096
Length=1107
Score = 2036 bits (1102), Expect = 0.0
Identities = 1107/1109 (99%), Gaps = 2/1109 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 AGATAAAACGAATAGCTCGTAACCAAACATGCACAGCGGTCAAACAGTATGTCCCAAGGG 63
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGATAAAACGAATAGCTCGTAACCAAACATGCACAGCGGTCAAACAGTATGTCCCAAGGG 60
Query 64 GACTTAAGCGCGGTGGCCTCCCCTATCCCCTACGAGGCTACCCGGATCGATGACGCGCAA 123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 61 GACTTAAGCGCGGTGGCCTCCCCTATCCCCTACGAGGCTACCCGGATCGATGACGCG-AA 119
Query 124 TTGGGGACATTCAAATGAGCATCCTAGTCACCGCGTTTAAAATGAACCTGCCGGCTGATC 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TTGGGGACATTCAAATGAGCATCCTAGTCACCGCGTTTAAAATGAACCTGCCGGCTGATC 179
Query 184 GTTTTTAGGATATTGTGAGTAATATAGATTGGCGCTAGTAGATCACAGAACAACCGCCGC 243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 GTTTTTAGGATATTGTGAGTAATATAGATTGGCGCTAGTAGATCACAGAACAACCGCCGC 239
Query 244 ATACGGCCGATTGTCGCAGCCCGGGTCGATTATAACAACGGTGCAATCTCAGCTAAACCG 303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 ATACGGCCGATTGTCGCAGCCCGGGTCGATTATAACAACGGTGCAATCTCAGCTAAACCG 299
Query 304 ACGCAGTTTTGCTCCTTGGATTCTGAGCCCGGGCATCGCCCCTCGTTTATGAACTAGCCT 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 ACGCAGTTTTGCTCCTTGGATTCTGAGCCCGGGCATCGCCCCTCGTTTATGAACTAGCCT 359
Query 364 ATCGCAGACGGTATCAACAGGAACATCCTCGTGTTAGATATTGAGGCTGCTTCGTGTCGG 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 ATCGCAGACGGTATCAACAGGAACATCCTCGTGTTAGATATTGAGGCTGCTTCGTGTCGG 419
Query 424 CACGAAGTGTCTTCCGATGCAGTGTCCAGTCATGACCTCGATCCATCGCGTATAGGGACG 483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 CACGAAGTGTCTTCCGATGCAGTGTCCAGTCATGACCTCGATCCATCGCGTATAGGGACG 479
Query 484 CCCCCTGCTCGCGTTACTGCCAAGCGAGCGTGGTGTGGTGCCCCCGACCTACAACTTGCG 543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CCCCCTGCTCGCGTTACTGCCAAGCGAGCGTGGTGTGGTGCCCCCGACCTACAACTTGCG 539
Query 544 CCAATTATCCGAGCTGGTAGACGACCAGCGCTGACGAGCTGGCGCAATGATGACCTAATT 603
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 CCAATTAT-CGAGCTGGTAGACGACCAGCGCTGACGAGCTGGCGCAATGATGACCTAATT 598
Query 604 GGCGCACAGTACTAGGCATCGTCATCCAATGCGACGAGTCCTACACTATCTTGGATATGA 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 GGCGCACAGTACTAGGCATCGTCATCCAATGCGACGAGTCCTACACTATCTTGGATATGA 658
Query 664 TATGGCGCACTACACATGCTAGCCGCTGGGGAGATTAGCTCGAGTTGCCCCTTTGCCCGA 723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 TATGGCGCACTACACATGCTAGCCGCTGGGGAGATTAGCTCGAGTTGCCCCTTTGCCCGA 718
Query 724 TCCCGGAAGATACGCTCTAAGCTCGGCAATCGCTCTTGCCGTGCGAGATGCTAGCAAAAA 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 TCCCGGAAGATACGCTCTAAGCTCGGCAATCGCTCTTGCCGTGCGAGATGCTAGCAAAAA 778
Query 784 GGTGTACTTCTCAGCGGAGCAGAAAGATCATGTTTATTGGAAGCATCAACCTGTGCCGTC 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 GGTGTACTTCTCAGCGGAGCAGAAAGATCATGTTTATTGGAAGCATCAACCTGTGCCGTC 838
Query 844 TTGTTAACTTGTCATATCGCGCACGTAGTAGCCTAGAGCGCCAGGGGCGGAAATTCGCCT 903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 TTGTTAACTTGTCATATCGCGCACGTAGTAGCCTAGAGCGCCAGGGGCGGAAATTCGCCT 898
Query 904 GAAAAGTTTTGCCGGCGCACAAGCACGATCGGCTCCTAATAGGAGGTGAATTAGATAGGG 963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 GAAAAGTTTTGCCGGCGCACAAGCACGATCGGCTCCTAATAGGAGGTGAATTAGATAGGG 958
Query 964 AAAAGATCGGGATGCTACTAGTTTACTGCGTCACGCTGAGGGACTCATCCTGGGCTACAA 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 AAAAGATCGGGATGCTACTAGTTTACTGCGTCACGCTGAGGGACTCATCCTGGGCTACAA 1018
Query 1024 TCCTATTGCCGAGATAGTATTTCTTAGCTTCCTGAGGGAGGTCAATTTGAATGTGGTTAT 1083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 TCCTATTGCCGAGATAGTATTTCTTAGCTTCCTGAGGGAGGTCAATTTGAATGTGGTTAT 1078
Query 1084 ATGCGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1112
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 ATGCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1107
Query= ERCC-00097_genbank |103488705|gb|DQ516758.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-41 genomic sequence
Length=500
Subject= ERCC-00097
Length=523
Score = 911 bits (493), Expect = 0.0
Identities = 498/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTCATAATACCACCAAAATACCAATTCGAAAGTTTTAGCATATTCAAACAATATAAAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CCTTCATAATACCACCAAAATACCAATTCGAAAGTTTTAGCATATTCAAACAATATAAAA 60
Query 61 TCTTCAGATTGGACATTAATTGGGACTGAAAGTCCCAACTTAATGGACGTGTGGTATCCA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCTTCAGATTGGACATTAATTGGGACTGAAAGTCCCAACTTAATGGACGTGTGGTATCCA 120
Query 121 CACCATAAAGGGGCTACGCCCCTCTTGGGATACTCCCCTAATATTGCTAATTTACACCTC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CACCATAAAGGGGCTACGCCCCTCTTGGGATACTCCCCTAATATTGCTAATTTACACCTC 180
Query 181 CGAGCATAAGCGAGGAGGTGTTAGGTTTTGATGAACCTTTTACTAAAAGGTTCATACCAA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CGAGCATAAGCGAGGAGGTGTTAGGTTTTGATGAACCTTTTACTAAAAGGTTCATACCAA 240
Query 241 TAGGAGGTTTCCTCCTATGGTAGTTAAATGTACATTGGATATTCCTTTCTACTCTTTGAC 300
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TAGGAGGTTTCCCCCTATGGTAGTTAAATGTACATTGGATATTCCTTTCTACTCTTTGAC 300
Query 301 ATCATCTTTAAATGTTGCTCTGCCAGTTCTTTAAGTTTGTTTTCAATAGCTTCAGCCTCT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATCATCTTTAAATGTTGCTCTGCCAGTTCTTTAAGTTTGTTTTCAATAGCTTCAGCCTCT 360
Query 361 TTGATGAGATTTTCAATATTTACATTTAGATTGAACATTTTATTCAAAACCTCTAATAGA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTGATGAGATTTTCAATATTTACATTTAGATTGAACATTTTATTCAAAACCTCTAATAGA 420
Query 421 TTAGcccccccTCTTGGGTCTGGTCTAATTCCAACAGTTTCAGCCAACAAACCAATAGCA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TTAGCCCCCCCTCTTGGGTCTGGTCTAATTCCAACAGTTTCAGCCAACAAACCAATAGCA 480
Query 481 TCAAACCCATTGTCATGGCA 500
|||||||||| |||||||||
Sbjct 481 TCAAACCCAT-GTCATGGCA 499
Query= ERCC-00098_genbank |92111293|gb|DQ459415.1| Synthetic construct
microarray control MC04 mRNA, complete sequence
Length=1146
Subject= ERCC-00098
Length=1143
Score = 2065 bits (1118), Expect = 0.0
Identities = 1137/1145 (99%), Gaps = 6/1145 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAGTCGCAATTACATCGGTTCCTGTCCCGTAGAGGCTGGAAGGGGCATAAGAAGCAG 60
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGAG-GTCGCAATTACATCGGTTCCTGTCCCGTAGAGGCTGGAAGGGGCATAAGAAGCAG 59
Query 61 TGATACCAACGCTCTCCCCCGCGCGTCTCGTGAGAGCAGACCATGAACATCGCAGAGGAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 TGATACCAACGCTCTCCCCCGCGCGTCTCGTGAGAGCAGACCATGAACATCGCAGAGGAG 119
Query 121 AATCCTGCATGACTGAATGCGCAGAGCAACTGTCACCACGTGGTTAATGAGAAGGCAGAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 AATCCTGCATGACTGAATGCGCAGAGCAACTGTCACCACGTGGTTAATGAGAAGGCAGAA 179
Query 181 CTCAACAGACAGCTCTGGATCTGCTGCATCCCAGGGCAAGAATCAGGAAAGCAGATGCAG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CTCAACAGACAGCTCTGGATCTGCTGCATCCCAGGGCAAGAATCAGGAAAGCAGATGCAG 239
Query 241 TAACCATAGGCACGTGAAAATGCTCCCGGCCACACTTTGGAGCTATTACCATGGTCGGGC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TAACCATAGGCACGTGAAAATGCTCCCGGCCACACTTTGGAGCTATTACCATGGTCGGGC 299
Query 301 CCAAACATAAGTGGACAGCTAGAACGATTTCTCAAGCCTGGCAACGTGGGTTAGAACTCC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CCAAACATAAGTGGACAGCTAGAACGATTTCTCAAGCCTGGCAACGTGGGTTAGAACTCC 359
Query 361 AACCCCTCGCACGTAGTATGGCGCTGGAGTAAAGAGCGCTCTGTTAGCAAGCGACCAGTC 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 AACCCCTCGCACGTAGTATGGCGCTGGAGTAAAGAGCGCTCTGTTAGCAAGCGACCAGTC 419
Query 421 TCCCGAAAGTACAGGATGTGCATGTTCTAACCAAAGGGTCGCAGGGACGATGATT-CTAG 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 420 TCCCGAAAGTACAGGATGTGCATGTTCTAACCAAAGGGTCGCAGGGACGATGATTGCTAG 479
Query 480 TAGCTTGACAAGGCTATCCTAGTCATCCTGAATCCGGCCTATCAAAGGAATGCGTGGCAG 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TAGCTTGACAAGGCTATCCTAGTCATCCTGAATCCGGCCTATCAAAGGAATGCGTGGCAG 539
Query 540 GTCAAGTGACGAGAGTGGAAGAGCTTCCCGTTGACAAGCGGCAAGTAGACTGTGCCTACC 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 GTCAAGTGACGAGAGTGGAAGAGCTTCCCGTTGACAAGCGGCAAGTAGACTGTGCCTACC 599
Query 600 CGGGCTTTCCAGACCTAAGATATCTGCACTCAGCAGAGTGTTGTGTTCGGGGCAGCAGTG 659
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 CGGGCTTTCCAGACCTAAGATATCTGCATTCAGCAGAGTGTTGTGTTCGGGGCAGCAGTG 659
Query 660 TGCCTTCATTCGTCAACTGGAGCCTAAGGCCCCAAACTCGATCATTGATGACTACTCGAC 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TGCCTTCATTCGTCAACTGGAGCCTAAGGCCCCAAACTCGATCATTGATGACTACTCGAC 719
Query 720 AAAAGAGGGTGGTATACAGAAAGAGGCTTGTGTCGCCGGAAACGCTTATCCGCACAGTAA 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 AAAAGAGGGTGGTATACAGAAAGAGGCTTGTGTCGCCGGAAACGCTTATCCGCACAGTAA 779
Query 780 AACCTCCCCAGATGACCTTCTCCCTCATAATCACTTAATCTG-GC--AGGAGGCAGGCTG 836
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 780 AACCTCCCCAGATGACCTTCTCCCTCATAATCACTTAATCTGAGCGCAGGAGGCAGGCTG 839
Query 837 TATTAATTCCGGCCTCCAACCGGACCGTGGAACGACGCGACCAAGTGGTCGACGGGACAT 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TATTAATTCCGGCCTCCAACCGGACCGTGGAACGACGCGACCAAGTGGTCGACGGGACAT 899
Query 897 GCCCCAGTATTTGGCCGTTCTGCCGATTCTCAGCTAGCAAACCAAGATCGTACTACGTAC 956
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 GCCC-AGTATTTGGCCGTTCTGCCGATTCTCAGCTAGCAAACCAAGATCGTACTACGTAC 958
Query 957 GCGCCTGGATAGATCGACGGCTGTTTAATAAGAGTCACTCCAGGCCTGTGCTAGGATCAG 1016
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 GCGCCTGGATAGATCGACGGCTGTTTAATAAGAGTCACTCCAGGCCTGTGCTAGGATCAG 1018
Query 1017 GGCGACCATGCCAAATATCAACTCAAGGACAAGTTGACGCCTGCCTTCTGGGGTATGGAT 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 GGCGACCATGCCAAATATCAACTCAAGGACAAGTTGACGCCTGCCTTCTGGGGTATGGAT 1078
Query 1077 CAAAAGCCCACGTTACCATGTAAGACCGTGTGGATCTTCGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 CAAAAGCCCACGTTACCATGTAAGACCGTGTGGATTTTCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1138
Query 1137 aaaaa 1141
|||||
Sbjct 1139 AAAAA 1143
Query= ERCC-00099_genbank |112819962|gb|DQ875387.1| Synthetic construct
microarray control PHE gene, complete sequence
Length=1330
Subject= ERCC-00099
Length=1350
Score = 2444 bits (1323), Expect = 0.0
Identities = 1328/1330 (99%), Gaps = 2/1330 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGATGCAAATGAAAGAGGAGACATTTTATCTTGTCCGTGAAGATGTATTGCCCGATGC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350 GGGGATGCAAATGAAAGAGGAGACATTTTATCTTGTCCGTGAAGATGTATTGCCCGATGC 1291
Query 61 AATGAGAAAAACATTAGAAGTCAAAAAGCTGCTTGATCGaaaaaaaGCAGATTCAGTAGC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290 AATGAGAAAAACATTAGAAGTCAAAAAGCTGCTTGATCGAAAAAAAGCAGATTCAGTAGC 1231
Query 121 AGATGCCGTTCAAAAGGTCGATTTAAGTAGAAGTGCGTTTTATAAATACAGGGATGCTGT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1230 AGATGCCGTTCAAAAGGTCGATTTAAGTAGAAGTGCGTTTTATAAATACAGGGATGCTGT 1171
Query 181 TTTTCCATTCTACACCATGGTAAAAGAACAAATTATCACACTTTTCTTTCATTTGGAGGA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170 TTTTCCATTCTACACCATGGTAAAAGAACAAATTATCACACTTTTCTTTCATTTGGAGGA 1111
Query 241 TAGGTCAGGTGCGTTATCTCAGCTTCTTCAGGCGGTAGCTGATTCTGGAAGCAACGTTCT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TAGGTCAGGTGCGTTATCTCAGCTTCTTCAGGCGGTAGCTGATTCTGGAAGCAACGTTCT 1051
Query 301 TTCCATTCACCAGACCATTCCGCTTCAAGGCAGAGCAAATGTGACACTGTCTATCAGTAC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050 TTCCATTCACCAGACCATTCCGCTTCAAGGCAGAGCAAATGTGACACTGTCTATCAGTAC 991
Query 361 GTCGGCAATGGAAGAAGACATTCATACATTAATGAATAAGCTCAGGAAGTTTGATTTTGT 420
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 990 GTCGGC-ATGGAAGAAGACATTCATACATTAATGAATAAGCTCAGGAAGTTTGATTTTGT 932
Query 421 AGAAAAGGTTGAAATATTAGGTTCAGGTGCATAAGGGAGAGAAAATCGTCATGAAAGTCG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 931 AGAAAAGGTTGAAATATTAGGTTCAGGTGCATAAGGGAGAGAAAATCGTCATGAAAGTCG 872
Query 481 GTTATTTAGGTCCAGCAGCTACATTTACACATCTAGCAGTCAGTTCTTGTTTTCAAAACG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 871 GTTATTTAGGTCCAGCAGCTACATTTACACATCTAGCAGTCAGTTCTTGTTTTCAAAACG 812
Query 541 GCGCCGAACATGTTGCTTACCGCACCATTCCGGAGTGTATAGATGCAGCCGTTGCAGGCG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 811 GCGCCGAACATGTTGCTTACCGCACCATTCCGGAGTGTATAGATGCAGCCGTTGCAGGCG 752
Query 601 AAGTTGATTTTGCTTTTGTTCCTTTGGAAAATGCTTTAGAAGGATCTGTTAATCTAACAA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 751 AAGTTGATTTTGCTTTTGTTCCTTTGGAAAATGCTTTAGAAGGATCTGTTAATCTAACAA 692
Query 661 TAGACTATTTAATACATGAACAGCCTTTGCCAATCGTGGGTGAAATGACGTTGCCGATTC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 TAGACTATTTAATACATGAACAGCCTTTGCCAATCGTGGGTGAAATGACGTTGCCGATTC 632
Query 721 ACCAGCACTTGCTCGTCCATCCCTCAAGAGAGAATGCATGGAAAGAGCTCGACAAAATTT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 ACCAGCACTTGCTCGTCCATCCCTCAAGAGAGAATGCATGGAAAGAGCTCGACAAAATTT 572
Query 781 ACTCACATTCACACGCGATTGCGCAATGCCATAAATTTCTTCATCGACACTTTCCTTCCG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 ACTCACATTCACACGCGATTGCGCAATGCCATAAATTTCTTCATCGACACTTTCCTTCCG 512
Query 841 TTCCATATGAATACGCCAATTCTACCGGGGCGGCAGCAAAGTTTGTCAGTGACCATCCCG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 TTCCATATGAATACGCCAATTCTACCGGGGCGGCAGCAAAGTTTGTCAGTGACCATCCCG 452
Query 901 AGCTGAATATCGGGGTCATTGCCAATGATATGGCAGCTTCTACATACGAATTAAAAATCG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 451 AGCTGAATATCGGGGTCATTGCCAATGATATGGCAGCTTCTACATACGAATTAAAAATCG 392
Query 961 TGAAACGGGATATACAGGATTATAGGGACAATCATACAAGATTTGTTATCCTGTCTCCCG 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 391 TGAAACGGGATATACAGGATTATAGGGACAATCATACAAGATTTGTTATCCTGTCTCCCG 332
Query 1021 ATGAAAACATATCTTTTGAAGTGAATTCAAAATTGAGCTCTAGGCCCAAAACGACCTTAA 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331 ATGAAAACATATCTTTTGAAGTGAATTCAAAATTGAGCTCTAGGCCCAAAACGACCTTAA 272
Query 1081 TGGTCATGCTGCCGCAGGATGATCAGTCCGGGGCGCTGCATAGAGTGCTGTCTGCATTTT 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 271 TGGTCATGCTGCCGCAGGATGATCAGTCCGGGGCGCTGCATAGAGTGCTGTCTGCATTTT 212
Query 1141 CTTGGAGAAATTTAAACCTGTCAAAAATTGAGTCACGTCCGACTAAAACCGGATTAGGCC 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 CTTGGAGAAATTTAAACCTGTCAAAAATTGAGTCACGTCCGACTAAAACCGGATTAGGCC 152
Query 1201 ATTATTTCTTTATTATTGATATTGAGAAAGCGTTTGATGATGTATTGATTCCAGGGGCCA 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 151 ATTATTTCTTTATTATTGATATTGAGAAAGCGTTTGATGATGTATTGATTCCAGGGGCCA 92
Query 1261 TGCAGGAGCTTGAAGCACTCGGCTGCAAAGTGAGGCTTCTGGGTGCATACCAGTCTTACC 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 91 TGCAGGAGCTTGAAGCACTCGGCTGCAAAGTGAGGCTTCTGGGTGCATAC-AGTCTTACC 33
Query 1321 AATTATAAAA 1330
||||||||||
Sbjct 32 AATTATAAAA 23
Query= ERCC-00104_genbank |103488762|gb|DQ516815.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-2000-98 genomic sequence
Length=2000
Subject= ERCC-00104
Length=2022
Score = 3677 bits (1991), Expect = 0.0
Identities = 1997/2000 (99%), Gaps = 0/2000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCAATCTCTTCAACAGCCTCTGCTAAGTATTCTGCAGCTGCTCTGCTAACTCTCTCAGC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TGCAATCTCTTCAACAGCCTCTGCTAAGTATTCTGCAGCTGCTCTGCTAACTCTCTCAGC 60
Query 61 ACCAGCCTTTTTCAATATTCTCTCAAATGGTGCAACTGGAAGCTCAGCCATAATACCACC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACCAGCCTTTTTCAATATTCTCTCAAATGGTGCAACTGGAAGCTCAGCCATAATACCACC 120
Query 121 TCACAATAGATTTCCAATAAATACTGTTATAAAATCCTTTATTTAAACTTTTCGGTCATT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCACAATAGATTTCCAATAAATACTGTTATAAAATCCTTTATTTAAACTTTTCGGTCATT 180
Query 181 TTCATTTTTTGTGAAAGTCTTTGGAAAATTTTCCCACACATAAAGAAGGTATTAAAAAGT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTCATTTTTTGTGAAAGTCTTTGGAAAATTTTCCCACACATAAAGAAGGTATTAAAAAGT 240
Query 241 GTGACACTAAAATTATAAAAAACACTATTTATAATGTATGTCACAAATTTAAAATATAAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GTGACACTAAAATTATAAAAAACACTATTTATAATGTATGTCACAAATTTAAAATATAAT 300
Query 301 TTTATGAAAGATAGATAAACATAAATTAATAGAGTTTAATTGTGATATTTATGATAATTA 360
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTTATGAAAGATAGATAAACATAAATTGGTAGAGTTTAATTGTGATATTTATGATAATTA 360
Query 361 CTATAGCTTCGGGTAAAGGAGGGGTTGGAAAAACTACAACATCAGCATCTTTAGCAGTAG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTATAGCTTCGGGTAAAGGAGGGGTTGGAAAAACTACAACATCAGCATCTTTAGCAGTAG 420
Query 421 CACTTGCTAAATTGGGAAAAAAGGTTTTAGCTATTGATGGAGACATATCAATGGCTAATT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CACTTGCTAAATTGGGAAAAAAGGTTTTAGCTATTGATGGAGACATATCAATGGCTAATT 480
Query 481 TAGGGATTCTATTCAATATGGAAAAGAAAAAACCCTCTTTACATGAAGTTTTGAGTGAAG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TAGGGATTCTATTCAATATGGAAAAGAAAAAACCCTCTTTACATGAAGTTTTGAGTGAAG 540
Query 541 AGGCAGATGTTAGGGATGCAATTTACAAACATAAAACTGGAGTTTATGTATTGCCAACGA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AGGCAGATGTTAGGGATGCAATTTACAAACATAAAACTGGAGTTTATGTATTGCCAACGA 600
Query 601 GTTTGTCTTTAGAAGGTTATAAGAAATCAGATATTGATTTACTTCCAGATGTGGTTAATG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GTTTGTCTTTAGAAGGTTATAAGAAATCAGATATTGATTTACTTCCAGATGTGGTTAATG 660
Query 661 AGGTAGCTGATGATTTTGATTATGTAATTATAGATGCTCCAGCTGGGTTAAATAGAGAAA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AGGTAGCTGATGATTTTGATTATGTAATTATAGATGCTCCAGCTGGGTTAAATAGAGAAA 720
Query 721 TGGCTACTCATTTAGCTATTGCTGATAAACTTTTACTTGTTGTCACCCCAGAGATGTTCT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TGGCTACTCATTTAGCTATTGCTGATAAACTTTTACTTGTTGTCACCCCAGAGATGTTCT 780
Query 781 CAATTATTGACGCTGTTAGATTAAAAGAAAGTGCTGAAATGGCTGGAACACCTTTAATGG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CAATTATTGACGCTGTTAGATTAAAAGAAAGTGCTGAAATGGCTGGAACACCTTTAATGG 840
Query 841 GTGTTGTGTTAAATAGGGTTGGTAGAGATTTTGGTGAAATGGGTAGAGATGAGATTGAAA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GTGTTGTGTTAAATAGGGTTGGTAGAGATTTTGGTGAAATGGGTAGAGATGAGATTGAAA 900
Query 901 TGTTAATAAAAGGTAAAGTTTTAGTTGAAGTCCCTGAAGATGAAAATGTTAGGTCAGCAG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TGTTAATAAAAGGTAAAGTTTTAGTTGAAGTCCCTGAAGATGAAAATGTTAGGTCAGCAG 960
Query 961 CTTTAAAAAAGATGAGTGTTATTGAATATAGAAAGAATTCTCCAGCTTCTCAAGCTTATA 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CTTTAAAAAAGATGAGTGTTATTGAATATAGAAAGAATTCTCCAGCTTCTCAAGCTTATA 1020
Query 1021 TGAAGTTAGCTTCAATAATAGCAGGAGTTCCTATTTACATTGAAGATGAAATTAAAATAA 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TGAAGTTAGCTTCAATAATAGCAGGAGTTCCTATTTACATTGAAGATGAAATTAAAATAA 1080
Query 1081 TAAGGAAAGAAAGCTTTATAGATAAAATTAAGAGATTATTTAGGATGTATTAATTATCTT 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 TAAGGAAAGAAAGCTTTATAGATAAAATTAAGAGATTATTTAGGATGTATTAATTATCTT 1140
Query 1141 GATTTAAAAATTTTAATTATCATCCTTTTCCAAATAAACCGTATATGTTGGGAACGCCCT 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GATTTAAAAATTTTAATTATCATCCTTTTCCAAATAAACCGTATATGTTGGGAACGCCCT 1200
Query 1201 CTCAATGAACCTTTCAGTAAAAGCTTCACCAAAAATGGATGCATCATCTCGCTTTGCTCG 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 CTCAATGAACCTTTCAGTAAAAGCTTCACCAAAAATGGATGCATCATCTCGCTTTGCTCG 1260
Query 1261 ATGATGCCTCTTAGTTATCTTTCTCCAAATAAACAGTATATGTTGGGAATGCCATCTCTA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 ATGATGCCTCTTAGTTATCTTTCTCCAAATAAACAGTATATGTTGGGAATGCCATCTCTA 1320
Query 1321 TCCCTTCTTTTTCAAATTCCTCTTTTATCTTCAAATTTATTTCATCAACGGCATTTAAAT 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 TCCCTTCTTTTTCAAATTCCTCTTTTATCTTCAAATTTATTTCATCAACGGCATTTAAAT 1380
Query 1381 AGTAATCAAATCCCATGTTTCTAACAAAGTATTCTACCCTCAAATTTAAACTCCAATCTC 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 AGTAATCAAATCCCATGTTTCTAACAAAGTATTCTACCCTCAAATTTAAACTCCAATCTC 1440
Query 1441 CATATTCCCTAAAATGCACTCTATATGGAGGGAGAGTAGCTGGATGATTTTCAACAATCT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 CATATTCCCTAAAATGCACTCTATATGGAGGGAGAGTAGCTGGATGATTTTCAACAATCT 1500
Query 1501 CTTTTATTATCTCCTTAGCCCTCTTAATTTTCTCTACCGGTGTGTTATAAGTTAAACCGA 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 CTTTTATTATCTCCTTAGCCCTCTTAATTTTCTCTACCGGTGTGTTATAAGTTAAACCGA 1560
Query 1561 TAGTCATTAAAACCCTTCTTCTATCTCTAACTGTTAAGTTTTCAATGGCTGAATCCAACA 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 TAGTCATTAAAACCCTTCTTCTATCTCTAACTGTTAAGTTTTCAATGGCTGAATCCAACA 1620
Query 1621 ATTCTGAGTTTGGGATAGTTATTAAAGTGTAATCAAAAGTTCTAATTCGTGTGCTTCTTA 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 ATTCTGAGTTTGGGATAGTTATTAAAGTGTAATCAAAAGTTCTAATTCGTGTGCTTCTTA 1680
Query 1681 TTCCAATCTCCTCTACAATCCCTTCAGCCCCTTTAACTTTAACCCAATGGCCTAAACTAA 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 TTCCAATCTCCTCTACAATCCCTTCAGCCCCTTTAACTTTAACCCAATGGCCTAAACTAA 1740
Query 1741 AGGGTTTGTCAATCAATATTAAAATCCCAGCAATGAAGTTTTTTATGGTGTCTTGCATAG 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 AGGGTTTGTCAATCAATATTAAAATCCCAGCAATGAAGTTTTTTATGGTGTCTTGCATAG 1800
Query 1801 CCAAAGCTAAAGCTAAACCCCCTACTCCTAAACCAGCCAATAAAGCAGTGATATCATAAC 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 CCAAAGCTAAAGCTAAACCCCCTACTCCTAAACCAGCCAATAAAGCAGTGATATCATAAC 1860
Query 1861 CAACAGAGCTTAAAGCCGTTAATATACCAAGAAGTATTGTTAATATCTTTACAACTTTTT 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 CAACAGAGCTTAAAGCCGTTAATATACCAAGAAGTATTGTTAATATCTTTACAACTTTTT 1920
Query 1921 TCAATGGCTTTATTATGTGTTCGTCCAACTCTGTTTCTGTCTTTTCGGTTAATGGAATTA 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1921 TCAATGGCTTTATTATGTGTTCGTCCAACTCTGTTTCTGTCTTTTCGGTCAATGGAATTA 1980
Query 1981 GGTAGTGTTCAAATATCCCA 2000
||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 GGTAGTGTTCAAATATCCCA 2000
Query= ERCC-00108_genbank |110339338|gb|DQ668365.1| Synthetic construct
clone TagO microarray control
Length=998
Subject= ERCC-00108
Length=1022
Score = 1844 bits (998), Expect = 0.0
Identities = 998/998 (100%), Gaps = 0/998 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGTGTCATGATCGTGAGTTGTCGCAGTGTCTGTACCAATACTCTGGTGGAGCTATAT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCTGTGTCATGATCGTGAGTTGTCGCAGTGTCTGTACCAATACTCTGGTGGAGCTATAT 60
Query 61 AAGCCGCTGTTGCGTAAATCAACGGCATGATCCCTATGACCGCGTCATGCTAACTGATAC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAGCCGCTGTTGCGTAAATCAACGGCATGATCCCTATGACCGCGTCATGCTAACTGATAC 120
Query 121 ACGCTGCTCGAACAGTGATACGCACACTGATAACTATGCGCAGACGCTTGAAACGATGTG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ACGCTGCTCGAACAGTGATACGCACACTGATAACTATGCGCAGACGCTTGAAACGATGTG 180
Query 181 ACATCGCTTCTAGAGTATGAGCCGCAATGCACGACTGATACTCGATATGAGCAGCAGTCG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ACATCGCTTCTAGAGTATGAGCCGCAATGCACGACTGATACTCGATATGAGCAGCAGTCG 240
Query 241 GCTATGATTTGCAATGCTTGCAGTATGTATCCTGATCGTGCGTGCGATGTCTGATAATAC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GCTATGATTTGCAATGCTTGCAGTATGTATCCTGATCGTGCGTGCGATGTCTGATAATAC 300
Query 301 GCTCGCATGATATGTATTGCGCTCAGATGCTGGAGATATGCCATGCGTGCTGTCAGTATG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GCTCGCATGATATGTATTGCGCTCAGATGCTGGAGATATGCCATGCGTGCTGTCAGTATG 360
Query 361 CCATGTATGCTGATATGTCGCGATCTATGTGGTGACTATGAGATCCATGTGATGACGTTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CCATGTATGCTGATATGTCGCGATCTATGTGGTGACTATGAGATCCATGTGATGACGTTG 420
Query 421 CAGTCTCTGTGACCTTATCGACGCGCATGTGAGCCTATAGACAGCGATGTGAGCACTCTC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CAGTCTCTGTGACCTTATCGACGCGCATGTGAGCCTATAGACAGCGATGTGAGCACTCTC 480
Query 481 ATCTGCGGATCAGTCTATCCTCGCTGATGCTCAGTGATACACGCTGATGCACGTAGTGAG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ATCTGCGGATCAGTCTATCCTCGCTGATGCTCAGTGATACACGCTGATGCACGTAGTGAG 540
Query 541 CATCCTGTGCTCGCATATACCGCTGCTGCACTGATATGAGCCAGTGCTGCTGCTCTCTAC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CATCCTGTGCTCGCATATACCGCTGCTGCACTGATATGAGCCAGTGCTGCTGCTCTCTAC 600
Query 601 GGAGTGTGCTCGGCTATAACAGCGAGTGCTACGCCTAAACTGGCTGTCTAGCACTGTAGC 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GGAGTGTGCTCGGCTATAACAGCGAGTGCTACGCCTAAACTGGCTGTCTAGCACTGTAGC 660
Query 661 TGGTGCATGTACTCGACTGCCGCTGCATCTACTATAAGACTCTGACATTAGCGTATAGGC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TGGTGCATGTACTCGACTGCCGCTGCATCTACTATAAGACTCTGACATTAGCGTATAGGC 720
Query 721 TGATACATTAGCTCGGATGCTATCAGCTTGCGCCTATTATATGCCTGACGCGGGATCTAT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TGATACATTAGCTCGGATGCTATCAGCTTGCGCCTATTATATGCCTGACGCGGGATCTAT 780
Query 781 CAGAACGACTCGGTAGCTCATATACTGGATCACGGTGCCACAACATGCTACACGAGGTCT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CAGAACGACTCGGTAGCTCATATACTGGATCACGGTGCCACAACATGCTACACGAGGTCT 840
Query 841 CAGACTCTATCCCGTGGACTCAACGTGCATCTGCTATGCTGAGCGCGTATCTGTGTACCT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CAGACTCTATCCCGTGGACTCAACGTGCATCTGCTATGCTGAGCGCGTATCTGTGTACCT 900
Query 901 GTCCGATGCTCTGATCTACACTGCCGTGATCGTTATATGACGAGACTGTGCGCTCATAGC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GTCCGATGCTCTGATCTACACTGCCGTGATCGTTATATGACGAGACTGTGCGCTCATAGC 960
Query 961 CGACACTGTGCTCGATAAGACCACGCTGTGCGGATATA 998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CGACACTGTGCTCGATAAGACCACGCTGTGCGGATATA 998
Query= ERCC-00109_genbank |110586144|gb|DQ854998.1| Synthetic construct
clone AG009.1100 external RNA control sequence
Length=511
Subject= ERCC-00109
Length=536
Score = 939 bits (508), Expect = 0.0
Identities = 511/512 (99%), Gaps = 1/512 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAGCGGAGTGTCAAATTTCGGAAGGGGGCCATAATGTTTCTTTACAATCGCACCAGTTAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TAGCGGAGTGTCAAATTTCGGAAGGGGGCCATAATGTTTCTTTACAATCGCACCAGTTAG 60
Query 61 CGTGGCGTATACCATGTTGTTAACAGCGCCATAAGTGCCTGATCCGCGGGCAAAACTACG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CGTGGCGTATACCATGTTGTTAACAGCGCCATAAGTGCCTGATCCGCGGGCAAAACTACG 120
Query 121 CAACACTGTGACTGGGTGCTAGGTCGACGAACAACTGACGCAACTAGATCATGGGAGTGC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CAACACTGTGACTGGGTGCTAGGTCGACGAACAACTGACGCAACTAGATCATGGGAGTGC 180
Query 181 CCCAAGTAAAAATTGTGTGTCAGGGCAACAAGTGACGATAGCGCGCGTAAATGGTATCAT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CCCAAGTAAAAATTGTGTGTCAGGGCAACAAGTGACGATAGCGCGCGTAAATGGTATCAT 240
Query 241 GATTGTGACCTCGGTATCTCTTGTACAGTTTACGTCGACGCGAAGTCTGATCACGTTTAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GATTGTGACCTCGGTATCTCTTGTACAGTTTACGTCGACGCGAAGTCTGATCACGTTTAA 300
Query 301 CTAGCTCAGGGGTATTAAATAACCGAAAGGTTCATGTGGATGTGTGAACTTGCAGACAGA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CTAGCTCAGGGGTATTAAATAACCGAAAGGTTCATGTGGATGTGTGAACTTGCAGACAGA 360
Query 361 ATGACCCATAGTCCTTTACCCAGGTAGCTGAGGGCGACGCACTTGACCATCCGAATCAAA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ATGACCCATAGTCCTTTACCCAGGTAGCTGAGGGCGACGCACTTGACCATCCGAATCAAA 420
Query 421 CTGAGAGATCGAAATAGCCTCACCCTTGAACCTACAAAGCTCACTTTAGCCCGTTAAGTT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CTGAGAGATCGAAATAGCCTCACCCTTGAACCTACAAAGCTCACTTTAGCCCGTTAAGTT 480
Query 481 GTCGAAATCACTAGATCAGAAGTCTCC-ACTC 511
||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 481 GTCGAAATCACTAGATCAGAAGTCTCCCACTC 512
Query= ERCC-00111_genbank |114977037|gb|DQ883685.2| Synthetic construct
clone NISTag44 external RNA control sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00111
Length=994
Score = 1836 bits (994), Expect = 0.0
Identities = 994/994 (100%), Gaps = 0/994 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCCTAAGTTCCGGTCCGCAATTTCGTTTCGTTGGGACGCTTGAAGCGCAAGTAGAAAAC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCCCTAAGTTCCGGTCCGCAATTTCGTTTCGTTGGGACGCTTGAAGCGCAAGTAGAAAAC 60
Query 61 GAGATAGGGTGTCCCATCTAAACCGCCGTGCCAATAGCTTTAAAGGCCAGGAAACATTTA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GAGATAGGGTGTCCCATCTAAACCGCCGTGCCAATAGCTTTAAAGGCCAGGAAACATTTA 120
Query 121 ATATCCCTAACAAGCACGGTCCACCAACGGCATTACGACTTTACGAGTTCGCAGAACAAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATATCCCTAACAAGCACGGTCCACCAACGGCATTACGACTTTACGAGTTCGCAGAACAAA 180
Query 181 GACTTTGCAACTGCAGGGGAGCCCTTCGATGCATCCGAATGAGGGCGAGCGTCGCAGATT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GACTTTGCAACTGCAGGGGAGCCCTTCGATGCATCCGAATGAGGGCGAGCGTCGCAGATT 240
Query 241 AACTTCGAGCAGTTAACCAGGCAAGGATATTTCCGGCATCAAGCGTTTCTCCCTACTAAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AACTTCGAGCAGTTAACCAGGCAAGGATATTTCCGGCATCAAGCGTTTCTCCCTACTAAT 300
Query 301 ATCCTTCCTTATGTCCCGCATTAAACAGCACTCAGCATCTCAAACAATCACAAAACAACC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATCCTTCCTTATGTCCCGCATTAAACAGCACTCAGCATCTCAAACAATCACAAAACAACC 360
Query 361 CACCTCATCGTTGACCAGATGATAACGTGGGACATTATCTTTGGGCAATACCACCAAAAT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CACCTCATCGTTGACCAGATGATAACGTGGGACATTATCTTTGGGCAATACCACCAAAAT 420
Query 421 CGTTCTTTATGGGGTATCGCTCTTAAGCAGCGCACTTCTGCATAACTATGCCATACAGTT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CGTTCTTTATGGGGTATCGCTCTTAAGCAGCGCACTTCTGCATAACTATGCCATACAGTT 480
Query 481 AGGTGCTACCATGAACATCCCGAGCTGCGTTGCATGTATCGGGTATGCCCAAGACCATAC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AGGTGCTACCATGAACATCCCGAGCTGCGTTGCATGTATCGGGTATGCCCAAGACCATAC 540
Query 541 CTCCAATGCTGCAGGGGTTAAATTCTCCGTTCTCGTCTAATCTAAGAGAATTGTATAGCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CTCCAATGCTGCAGGGGTTAAATTCTCCGTTCTCGTCTAATCTAAGAGAATTGTATAGCT 600
Query 601 TGCAGGCTAACATCCTGGGTCCAACCCCACATTGTAACTTCGCTGATTCCCACCACTAAT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TGCAGGCTAACATCCTGGGTCCAACCCCACATTGTAACTTCGCTGATTCCCACCACTAAT 660
Query 661 TTCTAGGGTTAGTGAAGGTTCGATACATCGCGCATTGGGGGTCTCGGTCAAGAGGAGCGC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TTCTAGGGTTAGTGAAGGTTCGATACATCGCGCATTGGGGGTCTCGGTCAAGAGGAGCGC 720
Query 721 GTAAGTAAAGACGCCTATCTTCCAGTTTGATCGGGAAACTACCCGAGGGGGATGGTGCTC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GTAAGTAAAGACGCCTATCTTCCAGTTTGATCGGGAAACTACCCGAGGGGGATGGTGCTC 780
Query 781 AATTGGGCCTCGTCTGAACACAAGAGAGATCGCACGCGGAAACCGTTAACGCAAGAATAT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AATTGGGCCTCGTCTGAACACAAGAGAGATCGCACGCGGAAACCGTTAACGCAAGAATAT 840
Query 841 ACAGCATATGGCATGTAAGCGAAATAACATCCTCCCACTGGGTGCACAGCGAATTAGTAT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 ACAGCATATGGCATGTAAGCGAAATAACATCCTCCCACTGGGTGCACAGCGAATTAGTAT 900
Query 901 CATAGTAGAATTAAGCGAGATCCATGACGTCACCGCTACTCAATCATCATCCACGTCTCG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CATAGTAGAATTAAGCGAGATCCATGACGTCACCGCTACTCAATCATCATCCACGTCTCG 960
Query 961 CGTCATACCCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 994
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CGTCATACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 994
Query= ERCC-00112_genbank |92111300|gb|DQ459422.1| Synthetic construct
microarray control MC14 mRNA, complete sequence
Length=1137
Subject= ERCC-00112
Length=1136
Score = 2002 bits (1084), Expect = 0.0
Identities = 1123/1139 (98%), Gaps = 14/1139 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 AGATGCCTGGATAGGTTCAAGTTACGTTTACACCGTTCCCACCCCACTAACCACGACCTT 63
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGATGCCTGGATAGGTTCAAGTTACGTTTACACCGTTCCCACCCCACTAACCACGACCTT 60
Query 64 TCTCGCCTTTGTTTTACCAACGCCGGCTAACAGCGTCGGGCCCAGCTAATATTGTTAAGG 123
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCTCGCCTTTGTTTTACCAACGCCGGCTAACAG-GTCGGGCCCAGCTAATATTGTTAAGG 119
Query 124 CAGGCGTTCTGTACTTACTCGATCGTTCATAGCCCC-CGACATAGTTTTTAGTCATTACG 182
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 CAGGCGTTCTGTACTTACTCGATCGTTCATAGCCCCACGACATAGTTTTTAGTCATTACG 179
Query 183 TAGCCGTTATAGAAACTCACCTGTTGTAGGAGGTTACAACCAGATCGTCTTAGCTTATGG 242
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 180 TAGCCGTTATAGAAACTCACCTGTTGTAGAAGGTTACAACCAGATCGTCTTA-CTTATGG 238
Query 243 CATGCTGGCGTAGACAGGT-CCAATTTGCGGCCAGTACTCGGATGTTCGTGGACTGATCT 301
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 CATGCTGGCGTAGACAGGTGCCAATTTGCGGCCAGTACTCGGATGTTCGTGGACTGATCT 298
Query 302 GGTCCTCTGTTCCCCTGGTGAAAACGTCGCTTCACTCCGGTAAGGGCGAATGTAATGACC 361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 GGTCCTCTGTTCCCCTGGTGAAAACGTCGCTTCACTCCGGTAAGGGCGAATGTAATGACC 358
Query 362 GTATTCTAAGGTACAGATCTACACTATGTGCGGGCGAATAGA-TCGGGCCCGTAGCGGGG 420
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 359 GTATTCTAAGGTACGGATCTACACTATGTGCGGGCGAATAGACTCGGGCCCGTAGCGGGG 418
Query 421 AGCAAATACTTGATCGCAATCTCTGACGTCAACTGATGTCGC-GAGA---CTG-GCACCC 475
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||
Sbjct 419 AGCAAATACTTGATCGCAATCTCTGACGTCAACTGATGTCGCGGAGACTGCTGCGCACCC 478
Query 476 AATAGGTACCACTAACGTCCGTGTGATTTT-ACCGGTAGGAATAAACACCGTCTTATACA 534
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 AATAGGTACCACTAACGTCCGTGTGATTTTAACCGGTAGGAATAAACACCGTCTTATACA 538
Query 535 GCTACGTTTTTCGATTTACTACCGAGCCGTTTGCGAGAACATATGGATTGGGAAATAGGC 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 GCTACGTTTTTCGATTTACTACCGAGCCGTTTGCGAGAACATATGGATTGGGAAATAGGC 598
Query 595 TCGAGTCCACATACAGCCTACGGTAAGTTGCT-GGCTCGCAATTCTATCCGGGTTTGTGA 653
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 TCGAGTCCACATACAGCCTACGGTAAGTTGCTAGGCTCGCAATTCTATCCGGGTTTGTGA 658
Query 654 GTCTTAGTTGTGCTCCGGCTTTTGAATGAGCATACTCATGAAAGCGCTGCTTACTATGAT 713
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 659 GTCTTAGTTGTGCTCCGGCTTTTGAATGAGCATACTCATGAAAGCGCTGC-TACTATGAT 717
Query 714 AAGAGTACACGTACAGGTCTCGCCCGATTGGATTATGGCGAGCTGCCGCATTGACGGACA 773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 AAGAGTACACGTACAGGTCTCGCCCGATTGGATTATGGCGAGCTGCCGCATTGACGGACA 777
Query 774 TACCTTTGAACGTAATCGCGCACGAGTGCGGATTAAGATTCTCCGCTTCAATCATGCAAT 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 TACCTTTGAACGTAATCGCGCACGAGTGCGGATTAAGATTCTCCGCTTCAATCATGCAAT 837
Query 834 GTGGTACAGCTGACTATCATTGACACCAAGCCGCTTGCAGGTATCGCCTGTCGGATAAGT 893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 GTGGTACAGCTGACTATCATTGACACCAAGCCGCTTGCAGGTATCGCCTGTCGGATAAGT 897
Query 894 TAAGAGTGAGACGAAGAGTATTCATCGAGCGCCAGGTAAGATAGTGCCACTCTAAGCATC 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 TAAGAGTGAGACGAAGAGTATTCATCGAGCGCCAGGTAAGATAGTGCCACTCTAAGCATC 957
Query 954 GGTATCTAGCTTTAGTAACCTTCTCGATGGGGAATACACCTCTGCTTAACGGTCTTAATA 1013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 GGTATCTAGCTTTAGTAACCTTCTCGATGGGGAATACACCTCTGCTTAACGGTCTTAATA 1017
Query 1014 ATTGACGCG-CTTGGACGTAGTACTCTGCAGTGCCTAAACTCATAGTAAACGATCTGGTA 1072
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 ATTGACGCGTCTTGGACGTAGTACTCTGCAGTGCCTAAACTCATAGTAAACGATCTGGTA 1077
Query 1073 GGTCCTTTTACACACGGTTTTTATCGCTTAGTGCTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1131
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 GGTCCTTTTACACACGGTTTTTATCGCTTAGTGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1136
Query= ERCC-00113_genbank |114976925|gb|DQ883663.2| Synthetic construct
clone NISTag22 external RNA control sequence
Length=850
Subject= ERCC-00113
Length=840
Score = 1537 bits (832), Expect = 0.0
Identities = 840/843 (99%), Gaps = 3/843 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACACCGGCGCACGCCACAGGCGTCATACTTCCCAAGAAGCGGCCATAGCCCAGATGCGAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACACCGGCGCACGCCACAGGCGTCATACTTCCCAAGAAGCGGCCATAGCCCAGATGCGAG 60
Query 61 GTGGAAAAGTCACACTAGAGCGACACCAACATCGTTACGCTTACACACCGGACGCTTGGA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GTGGAAAAGTCACACTAGAGCGACACCAACATCGTTACGCTTACACACCGGACGCTTGGA 120
Query 121 TCAGTGGGAAGTGCTCACGCGCGGAGCCCACTGGGCGAACAGCAACGTTATAACGGCCAC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCAGTGGGAAGTGCTCACGCGCGGAGCCCACTGGGCGAACAGCAACGTTATAACGGCCAC 180
Query 181 TCAGTGGTTCGTCACGCGCAGCCCCGGGTTCGTCCCCTATAAGGGCCTAGTACCTTTCGA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCAGTGGTTCGTCACGCGCAGCCCCGGGTTCGTCCCCTATAAGGGCCTAGTACCTTTCGA 240
Query 241 GCCCCGCGCGTACTAGGCAGATAAGAACCCTCCAGCTCGGGGCCTCAAACCGATATTCCA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GCCCCGCGCGTACTAGGCAGATAAGAACCCTCCAGCTCGGGGCCTCAAACCGATATTCCA 300
Query 301 TGTGGGCCAACTGCCATGTTGTGTCCAGTCGCTATCGGAGTAGCCGCGCTGGTGCCACAC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TGTGGGCCAACTGCCATGTTGTGTCCAGTCGCTATCGGAGTAGCCGCGCTGGTGCCACAC 360
Query 361 GACTACAACCCTCGTAATAGGGCTGCGTGCGTCCTAAATACACTCGCTGTTGAGATACTA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GACTACAACCCTCGTAATAGGGCTGCGTGCGTCCTAAATACACTCGCTGTTGAGATACTA 420
Query 421 AAATTATCTGTGGATTGCCGGCATTGAGCCCACGGTAAACCCCAAATACATAAGTGTATA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AAATTATCTGTGGATTGCCGGCATTGAGCCCACGGTAAACCCCAAATACATAAGTGTATA 480
Query 481 ATGTCTCGGACCCGTCGCAACGGTTGTTAATATGACAGGCCGCTAAAGACGTTCTACTCC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ATGTCTCGGACCCGTCGCAACGGTTGTTAATATGACAGGCCGCTAAAGACGTTCTACTCC 540
Query 541 GCCATATGAGATAATATCCTTATCTTGAGACGCATAGCAAATGTAGGAGAGAGAGGTTAA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GCCATATGAGATAATATCCTTATCTTGAGACGCATAGCAAATGTAGGAGAGAGAGGTTAA 600
Query 601 TAAGGCCTAGCCTAAAGGTTCTTGCAGAGCAACATCATATACCCTGTAGAACCCGACTTT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TAAGGCCTAGCCTAAAGGTTCTTGCAGAGCAACATCATATACCCTGTAGAACCCGACTTT 660
Query 661 TGGGTTTAGGGGCCTGCCGTCAGCTACAATTCATGCTTGAAGGTTTCACTAGATCGTGTT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TGGGTTTAGGGGCCTGCCGTCAGCTACAATTCATGCTTGAAGGTTTCACTAGATCGTGTT 720
Query 721 ATGGACGATGACTATAGTGTAACAGGTGCAGAGCTTAACTTTGGACACATGACACTCAGT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 ATGGACGATGACTATAGTGTAACAGGTGCAGAGCTTAACTTTGGACACATGACACTCAGT 780
Query 781 TCTGTACCAACTAGGAAGAGCGCCGGGGTAGAAGAATGGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TCTGTACCAACTAGGAAGAGCGCCGGGGTAGAAGAAT---AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 837
Query 841 aaa 843
|||
Sbjct 838 AAA 840
Query= ERCC-00116_genbank |110339340|gb|DQ668367.1| Synthetic construct
clone TagIN microarray control
Length=1969
Subject= ERCC-00116
Length=1991
Score = 3637 bits (1969), Expect = 0.0
Identities = 1969/1969 (100%), Gaps = 0/1969 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGCGTTCACAGCTCGGCAATACCTGTGACGAGCTGCTCGCAAGATTTACGCAGTGTGGC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1991 AAGCGTTCACAGCTCGGCAATACCTGTGACGAGCTGCTCGCAAGATTTACGCAGTGTGGC 1932
Query 61 TATACTTGACAGTGATGGCGCTTACTTCAGATGTATGGGTGATACTTCGCTATATGGGTG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1931 TATACTTGACAGTGATGGCGCTTACTTCAGATGTATGGGTGATACTTCGCTATATGGGTG 1872
Query 121 GTCACTTCTCTATGGCGCGTGACAATGTACTATGGAGCGGTCAATGTCAGTACGGATCGC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1871 GTCACTTCTCTATGGCGCGTGACAATGTACTATGGAGCGGTCAATGTCAGTACGGATCGC 1812
Query 181 GTCGATCTAGGTGACTACGCACGCCTCTGGAGTAAATCGAGTGCTCCGTGCGAAATACGC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1811 GTCGATCTAGGTGACTACGCACGCCTCTGGAGTAAATCGAGTGCTCCGTGCGAAATACGC 1752
Query 241 GGTCATCGTGCGAATAACCGAGTCATCGTGAGTAGTATGAACGTGTCGTGTTATGCAGCG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1751 GGTCATCGTGCGAATAACCGAGTCATCGTGAGTAGTATGAACGTGTCGTGTTATGCAGCG 1692
Query 301 GTATGTCGTGCTATAATGGCGTCTGTCGTGCTCATAAGGTTCCTCTGATGTGCTAGACGT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 GTATGTCGTGCTATAATGGCGTCTGTCGTGCTCATAAGGTTCCTCTGATGTGCTAGACGT 1632
Query 361 GTCCATCGAGCTGCATAGCTATACTTCGAGTCACTTGGGATACTTCGATAGCGTTGTGAA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1631 GTCCATCGAGCTGCATAGCTATACTTCGAGTCACTTGGGATACTTCGATAGCGTTGTGAA 1572
Query 421 TAGTGTCGTAGGCTCTCGGGCACGTTGTTAAACTGTTGCCGCCAATTCAAGATTAGTCCA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571 TAGTGTCGTAGGCTCTCGGGCACGTTGTTAAACTGTTGCCGCCAATTCAAGATTAGTCCA 1512
Query 481 GCTCGTACTATCGAATACACCATCGTCGTATCGAATAATCGCACCTCGTAGGAGTCAGTT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1511 GCTCGTACTATCGAATACACCATCGTCGTATCGAATAATCGCACCTCGTAGGAGTCAGTT 1452
Query 541 GCCACTCGTTGATAGTCAACCAAGCTCGTTAGATAGTAGCCCAGATCCTACGAGATGAGC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451 GCCACTCGTTGATAGTCAACCAAGCTCGTTAGATAGTAGCCCAGATCCTACGAGATGAGC 1392
Query 601 TACGTAACTACAGTGATAGCATATAGGGTACGCTAGAATGCCAGGTCGTAGTCGAATTAG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 TACGTAACTACAGTGATAGCATATAGGGTACGCTAGAATGCCAGGTCGTAGTCGAATTAG 1332
Query 661 TCAGGTTGGATGTCTACTAGTTGACTTGGAGTATGCCATGAAGACTCGTCCCTCGATATC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331 TCAGGTTGGATGTCTACTAGTTGACTTGGAGTATGCCATGAAGACTCGTCCCTCGATATC 1272
Query 721 AATACTCGTCCGCAGGTGAACACTGTAGTCGGTGCTAGTGCCCACTTCTCGGTATGTGTC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1271 AATACTCGTCCGCAGGTGAACACTGTAGTCGGTGCTAGTGCCCACTTCTCGGTATGTGTC 1212
Query 781 CTCAATTATCGAGTAGGATTCTAATCAATCGTCGCGGCTCACTAATTGTCTGCGGTGGCT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211 CTCAATTATCGAGTAGGATTCTAATCAATCGTCGCGGCTCACTAATTGTCTGCGGTGGCT 1152
Query 841 ACTAATGGTTACGGTGCCTGACTAATCGTGTAGGTGTCTAATACATCGTGATACGGGCGA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151 ACTAATGGTTACGGTGCCTGACTAATCGTGTAGGTGTCTAATACATCGTGATACGGGCGA 1092
Query 901 TATAATGCTCGATACGGCAAATATAGCTCCGTCCGGTGGATCCAGATCGCAGGGTATCGC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 TATAATGCTCGATACGGCAAATATAGCTCCGTCCGGTGGATCCAGATCGCAGGGTATCGC 1032
Query 961 ATCGACAGACCTGGTATCGTCGTGACGAACGTGCTACTCGCTTATCGGGCCTGCTACATC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031 ATCGACAGACCTGGTATCGTCGTGACGAACGTGCTACTCGCTTATCGGGCCTGCTACATC 972
Query 1021 AGTGGCGATGTTCGTAACCCTTAGCCGATCTTCTTACTTACGAGGCTACTATTCGATCAA 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 971 AGTGGCGATGTTCGTAACCCTTAGCCGATCTTCTTACTTACGAGGCTACTATTCGATCAA 912
Query 1081 ACTCGCCTATCTGGTAATAACTGCGGTGATCTGGTAGCCACTACGTGCGCCTGGTAGCAA 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 911 ACTCGCCTATCTGGTAATAACTGCGGTGATCTGGTAGCCACTACGTGCGCCTGGTAGCAA 852
Query 1141 ATACGGCGAGCTGGTATCACTATCGGCTCAGTGGTCCGACATAGTGCCCAGTGGTTCGCA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 851 ATACGGCGAGCTGGTATCACTATCGGCTCAGTGGTCCGACATAGTGCCCAGTGGTTCGCA 792
Query 1201 TAACTGCCGCTGGGTCCAATATAACACGCAGTCGTCAATCATACGAGCCGATGGTCAGCA 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 791 TAACTGCCGCTGGGTCCAATATAACACGCAGTCGTCAATCATACGAGCCGATGGTCAGCA 732
Query 1261 ATAGCGCCTGTGGTGACACTATGCCACCTCTGGTCTAATATAGCGCCCTGTGGTCGTATA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 731 ATAGCGCCTGTGGTGACACTATGCCACCTCTGGTCTAATATAGCGCCCTGTGGTCGTATA 672
Query 1321 ATCGAGCGCGTAATCGTATATCCGACTGTAGGTGCGTAACTCGCGACTAGGTGGCTCTAA 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 ATCGAGCGCGTAATCGTATATCCGACTGTAGGTGCGTAACTCGCGACTAGGTGGCTCTAA 612
Query 1381 TCTGCGTTGGTTGTCGCTCACAGTGTCTGGTGTTCGATACCCGGATCGGGTTCCGTAATC 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 611 TCTGCGTTGGTTGTCGCTCACAGTGTCTGGTGTTCGATACCCGGATCGGGTTCCGTAATC 552
Query 1441 TTGGCATCGAGGTTTCGTACATGTCACGCGGTCTCGTTCATTCTCGGTGGTGCTCAGTAC 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551 TTGGCATCGAGGTTTCGTACATGTCACGCGGTCTCGTTCATTCTCGGTGGTGCTCAGTAC 492
Query 1501 ATCCAGTGGTGAGTCGCTACATCACACGGTGATCCGGCTAAACCTCTGGGCATCCGTATT 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 ATCCAGTGGTGAGTCGCTACATCACACGGTGATCCGGCTAAACCTCTGGGCATCCGTATT 432
Query 1561 AAGCGACATTCCTACGACTTATCAGCACGTCCTACGGTATAACAAGGCGTGCTACGGTCT 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 431 AAGCGACATTCCTACGACTTATCAGCACGTCCTACGGTATAACAAGGCGTGCTACGGTCT 372
Query 1621 AACGACGCTGGTAGCAGTCTATCAGATCGCTAGTACGAGTTAGAGATGCTTAGTACGCCT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AACGACGCTGGTAGCAGTCTATCAGATCGCTAGTACGAGTTAGAGATGCTTAGTACGCCT 312
Query 1681 TCGAATCTATGATGCTCGTGCTCACGCGATGCACTCGGATTATGGCACATGCACTCGCGT 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311 TCGAATCTATGATGCTCGTGCTCACGCGATGCACTCGGATTATGGCACATGCACTCGCGT 252
Query 1741 AATGACGCTGCATCGCTCAGTATGATCCATGAGCGCCGTGAATGACGCATGAGCCTCGTA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 251 AATGACGCTGCATCGCTCAGTATGATCCATGAGCGCCGTGAATGACGCATGAGCCTCGTA 192
Query 1801 TCGAGTGCATGAGCTGTCTTTCACATGATACATCGCTCTAAATCATCATGCGACAGTCTC 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 191 TCGAGTGCATGAGCTGTCTTTCACATGATACATCGCTCTAAATCATCATGCGACAGTCTC 132
Query 1861 GACAGCAGCTCAGCATCTATGCATCATGTGCCTCACTAGGACATCATGCTCGACTCTGAG 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 131 GACAGCAGCTCAGCATCTATGCATCATGTGCCTCACTAGGACATCATGCTCGACTCTGAG 72
Query 1921 ACACTGATCGAGCATTAAGACTCTAGAGCGGCCGCCGACTAGTGAGCTC 1969
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 71 ACACTGATCGAGCATTAAGACTCTAGAGCGGCCGCCGACTAGTGAGCTC 23
Query= ERCC-00117_genbank |92111290|gb|DQ459412.1| Synthetic construct
microarray control MC01 mRNA, complete sequence
Length=1143
Subject= ERCC-00117
Length=1136
Score = 2036 bits (1102), Expect = 0.0
Identities = 1129/1140 (99%), Gaps = 10/1140 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 AGATACTATCAGGCGCCTATGGGCAAATCTGGCCTCCAAACTCCGAGTGTCACCGAACCG 63
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGATACTATCAGGCGCCTATGGGCAAATCTGGCCTCCAAACTCCGAGTGTCACCGAACCG 60
Query 64 TAGGAAATTCCTT-CCCAAGCGTGTGCAATACTCGTAGCACACCGGGATAAATAGGAAGG 122
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TAGGAAATTCCTTCCCCAAGCGTGTGCAATACTCGTAGCACACCGGGATAAATAGGAAGG 120
Query 123 AAACATCCGCGGGTCTTACGGTGAAGCTGTGGGACCGCTTCTGTACACGGCGTCCAATCA 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAACATCCGCGGGTCTTACGGTGAAGCTGTGGGACCGCTTCTGTACACGGCGTCCAATCA 180
Query 183 AGGGGCTTGGCATTTGGCCCCAGATC-AAAGTGTTGAACCACAAACGACTCTATCGGTGA 241
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AGGGGCTTGGCATTTGG-CCCAGATCGAAAGTGTTGAACCACAAACGACTCTATCGGTGA 239
Query 242 CGCCTCCAAGCGCGAAACTCCAGGCATTGGGGAACCGCAGAAAGATGTTCCGCTAGACCG 301
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 CGCCTCCAAGCGCGAAACTCCAGGCAATGGGGAACCGCAGAAAGATGTTCCGCTAGACCG 299
Query 302 CATTAATACCACATCTGGGCTTAGAAGCCCCTCGGTGCTCCAGGGAGGACGGATCGGAAT 361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CATTAATACCACATCTGGGCTTAGAAGCCCCTCGGTGCTCCAGGGAGGACGGATCGGAAT 359
Query 362 TAAACGTGATATGGAACTTTAACTGAT-AGGCCTTGCCCTTACTAATGGCGCGTTGTAAC 420
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TAAACGTGATATGGAACTTTAACTGATCAGGCCTTGCCCTTACTAATGGCGCGTTGTAAC 419
Query 421 GGGCCTTGAGGGCAATGTCACTATTGAGGCACCCGTTCGACCCTCAGAGATATACCATTC 480
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GGGCCTTGAGGG-AATGTCACTATTGAGGCACCCGTTCGACCCTCAGAGATATACCATTC 478
Query 481 CGCCTATTGTAGCTCTCCTCGTACCACAGTCTTGCAAATACTGTCATAGCTATGGAACCG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 CGCCTATTGTAGCTCTCCTCGTACCACAGTCTTGCAAATACTGTCATAGCTATGGAACCG 538
Query 541 CCCCGACGCCGGGATTATGGCCTCTCATGGACTCAGTGTGATCAGAACCTGCTCG-GTGG 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 539 CCCCGACGCCGGGATTATGGCCTCTCATGGACTCAGTGTGATCAGAACCTGCTCGAGTGG 598
Query 600 GGACTGGATGCAGAGCTGATCTCTGTAGTGTGTTGTGTCGCGGGAGCACCACCGG-TGAC 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 599 GGACTGGATGCAGAGCTGATCTCTGTAGTGTGTTGTGTCGCGGGAGCACCACCGGATGAC 658
Query 659 AACCGCCATATTCCAGTGCCCAAATACTCACTGGTAACGGCTTGAACTCATGCTAATTCC 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 AACCGCCATATTCCAGTGCCCAAATACTCACTGGTAACGGCTTGAACTCATGCTAATTCC 718
Query 719 ATTATAGTTCTTTAAACATAAGCTTTGCCCTCGGGGCCCATCCCCTGAACCATGCGGTGA 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 ATTATAGTTCTTTAAACATAAGCTTTGCCCTCGGGGCCCATCCCCTGAACCATGCGGTGA 778
Query 779 GTCACGTACGCAGACCTGAAAATTAAAGATCCGGACAGGCCCGACCTTAGCCAAGGGTAA 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 GTCACGTACGCAGACCTGAAAATTAAAGATCCGGACAGGCCCGACCTTAGCCAAGGGTAA 838
Query 839 GAACCGCTGTCACTTAGTGAACATCCTATCCAGTGCCGTGCAGCATCGTCTACGGTCCGG 898
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 GAACCGCT-TCACTTAGTGAACATCCTATCCAGT-CCGTGCAGCATCGTCTACGGTCCGG 896
Query 899 GCTTCTGCCGAAAGGTCCATTAAACAGACAGAAGGATAAATGGCTCCAGCGGATACGCGC 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 GCTTCTGCCGAAAGGTCCATTAAACAGACAGAAGGATAAATGGCTCCAGCGGATACGCGC 956
Query 959 ATATTCGGTTATCGCAGTTACCGTGCAAAACTGCATCCCCGCTGGGATAAGCACATGAGA 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 ATATTCGGTTATCGCAGTTACCGTGCAAAACTGCATCCCCGCTGGGATAAGCACATGAGA 1016
Query 1019 TGGACAAGGCTTCCTATGA-TGATTCCAAAGAACATTGCCCGACGACCGAGCCTTCAGGT 1077
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 TGGACAAGGCTTCCTATGAGTGATTCCAAAGAACATTGCCCGACGACCGAGCCTTCAGGT 1076
Query 1078 AATCCACGAGACATATGCTAACCAGTGGTGCCATGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 AATCCACGAGACATATGCTAACCAGTGGTGCCATGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1136
Query= ERCC-00120_genbank |110586090|gb|DQ854992.1| Synthetic construct
clone AG003.0011 external RNA control sequence
Length=512
Subject= ERCC-00120
Length=536
Score = 941 bits (509), Expect = 0.0
Identities = 511/512 (99%), Gaps = 0/512 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGCGTCTCACCTGGCTTGATTCAGTTAATGGAGCACTTGTGGGAGTGCCGCGACACAACA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGCGTCTCACCTGGCTTGATTCAGTTAATGGAGCACTTGTGGGAGTGCCGCGACACAACA 60
Query 61 TCCGCTAGCCTCAGTCGAATGACAAGTTAGAACAAGAGTGGGGCCGATCTCTGCAAACTC 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCCGCTAGCCTCAGTCGAATGACAAGTTAGAACAGGAGTGGGGCCGATCTCTGCAAACTC 120
Query 121 CTATTGTCAGGGGTGGTGGACGGTATAGGGTTTTGCGCCTACCTGAATGCAAGGGCTTAC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CTATTGTCAGGGGTGGTGGACGGTATAGGGTTTTGCGCCTACCTGAATGCAAGGGCTTAC 180
Query 181 CTCCAACGGCTTAGATGTGCCTAGAAGGTACGCCCTTCAGTCAAGACCGGCCCGGCGTTA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTCCAACGGCTTAGATGTGCCTAGAAGGTACGCCCTTCAGTCAAGACCGGCCCGGCGTTA 240
Query 241 GTTAAAGCAGGCTTGTCACACATCACGTAGTTCCTGCTGCGTTTTAAGTCATTAGCTCCC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GTTAAAGCAGGCTTGTCACACATCACGTAGTTCCTGCTGCGTTTTAAGTCATTAGCTCCC 300
Query 301 AGTAACCCATCAACCATTACCGTATAGACTTATCCGAGTGTGATCAAATAACGCTGAGCC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AGTAACCCATCAACCATTACCGTATAGACTTATCCGAGTGTGATCAAATAACGCTGAGCC 360
Query 361 TTATGATCCTCGTCGACCCAACAACCGCCGGATATACGTTGGGATATAAACGAAACACGT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTATGATCCTCGTCGACCCAACAACCGCCGGATATACGTTGGGATATAAACGAAACACGT 420
Query 421 ACCGCGCGAGTGACACGCGTTGACGTTACATGGTAAACTCGTAGCCAACCTTAACATTCC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ACCGCGCGAGTGACACGCGTTGACGTTACATGGTAAACTCGTAGCCAACCTTAACATTCC 480
Query 481 CTGCACTATGTTAGTGCGTACAACATTAAGGG 512
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CTGCACTATGTTAGTGCGTACAACATTAAGGG 512
Query= ERCC-00123_genbank |103488729|gb|DQ516782.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-65 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00123
Length=1022
Score = 1807 bits (978), Expect = 0.0
Identities = 993/1000 (99%), Gaps = 2/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTAAGAGAGGAATAATTActtttttcatcttacccaccaagttttagttttcttattctt 60
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTAAGAGAGGAATAATTAC-TTTTTCATCTTACCCACCAAGTTTTAGTTTTCTTATTCTT 59
Query 61 tcatttaatttttcGACCTCCTCCTTTGTTAATCTTGTAGCTTTTTTAACCTCCTCCAAT 120
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 TCACTTAATTTTTCGACCTCCTCCTTTGTTAATCTTGTAGCTTTTTTAACCTCCTCCAAT 119
Query 121 TCTTTTTGTAACATTATTACTTTAATCCCCAGTATTATGTTGAGGAGTATGCTAATAGCC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TCTTTTTGTAACATTATTACTTTAATCCCCAGTATTATGTTGAGGAGTATGCTAATAGCC 179
Query 181 ACAATTATATACAAAATCATCCTTATCTCCTCCCGAACAATCCTTTAATAAACTTAGATA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 ACAATTATATACAAAATCATCCTTATCTCCTCCCGAACAATCCTTTAATAAACTTAGATA 239
Query 241 TGAATGATTCTTTCTTCTTCTTAAGTTGTGCTTCATATTTAGCTCCAATTAACTTAGCTG 300
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TGAATGATTCTTTCTTCTTCTCAAGTTGTGCTTCATATTTAGCTCCAATTAACTTAGCTG 299
Query 301 CTATCTCCATGATTGCTTGAGCGGCTGGAGAATCTGGATACATAATAACGAGAGGTGTTC 360
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CTATCTCCATGACTGCTTGAGCGGCTGGAGAATCTGGATACATAATAACGAGAGGTGTTC 359
Query 361 CAAATGCAGCTGCCTTCCTAACATGAGGGTCCTCTGGAACAACACCTATAACAGGAACTT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 CAAATGCAGCTGCCTTCCTAACATGAGGGTCCTCTGGAACAACACCTATAACAGGAACTT 419
Query 421 CTAAAATTGTCTCTATAGCTTTAACCCCCAACTCTGTACTCTCATTTGAAACCCTATTAA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 CTAAAATTGTCTCTATAGCTTTAACCCCCAACTCTGTACTCTCATTTGAAACCCTATTAA 479
Query 481 CAATAGCCCCAATGATGTCAGTTCCCAATCTTTTTGTTATAGCGATAATTTTTAATGCAT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CAATAGCCCCAATGATGTCAGTTCCCAATCTTTTTGTTATAGCGATAATTTTTAATGCAT 539
Query 541 CTGATATTGAGGATATCTCTGGATTTACAACGACAATTAAACCATCTGCTGATGATATTG 600
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 CTGATATTGGGGATATCTCTGGATTTACAACGACAATTAAACCATCTGCTGATGATATTG 599
Query 601 CTATTAAAGTCTCTTTTCCAATACCTGCTGGACAGTCAATAATTAAAATCTCAACTAAAT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 CTATTAAAGTCTCTTTTCCAATACCTGCTGGACAGTCAATAATTAAAATCTCAACTAAAT 659
Query 661 CATGTATTGCCTTTAAAACTTCCTCAAGTTTTTCTGGTTTAGCTCTTCTGAACTTTTCTA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CATGTATTGCCTTTAAAACTTCCTCAAGTTTTTCTGGTTTAGCTCTTCTGAACTTTTCTA 719
Query 721 ATGAAACACCTGCTGGAATAACTAAAACTCCTTCAGGACCTTCATAAATTGCGTCCTTTA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 ATGAAACACCTGCTGGAATAACTAAAACTCCTTCAGGACCTTCATAAATTGCGTCCTTTA 779
Query 781 TATCTGCTTTACCAGCCAACACATCGTTTAAGGTTACTGGCTTTCCTTCTAACCCCATGA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 TATCTGCTTTACCAGCCAACACATCGTTTAAGGTTACTGGCTTTCCTTCTAACCCCATGA 839
Query 841 TAAGCTCTAAGTTTGCCATTGCTATATCAGCGTCCAAAACAGCCACtttttttCCAAATT 900
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TAGGCTCTAAGTTTGCCATTGCTATATCAGCGTCCAAAACAGCCACTTTTTTTCCAAATT 899
Query 901 TTGCAAGAGCCACAGCAAGATTTGCAGATATCGTTGTCTTTCCAGTACCTCCTTTTCCAG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TTGCAAGAGCCACAGCAAGATTTGCAGATATCGTTGTCTTTCCAGTACCTCCTTTTCCAG 959
Query 961 ATGCTATCGCGATAGCTATTGCCATTAATGTCACCATTCT 1000
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 960 ATGCTATCGCGATAGCTATT-CCATTAATGTCACCATTCT 998
Query= ERCC-00126_genbank |92111305|gb|DQ459427.1| Synthetic construct
microarray control MC25 mRNA, complete sequence
Length=1124
Subject= ERCC-00126
Length=1118
Score = 1962 bits (1062), Expect = 0.0
Identities = 1107/1125 (98%), Gaps = 17/1125 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGA-CGACCGCGCATTAGTCAATCATATAGTTCGATAAATGAGACGTCACGGATTTGA 59
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGAGACCGACCGCGCATTAGTCAATCATATAGTTCGATAAATGAGACGTCACGGATTTGA 60
Query 60 GTATCATTTGCTAGAACTGCTTACCTATCTAAACGCTCAGGTATGCCTGCGCTGAGACTC 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GTATCATTTGCTAGAACTGCTTACCTATCTAAACGCTCAGGTATGCCTGCGCTGAGACTC 120
Query 120 AGCATCTCAATGTGACCGAGCTTGTGACTCCGCA---TCC--C--TATACCCATCGGCCC 172
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||
Sbjct 121 AGCATCTCAATGTGACCGAGCTTGTGACTCCGCATCCTCCTGCAATATACCCATCGGCCC 180
Query 173 TCACGGGGTAACGTAGCTCTTCTGCGTACACCTGGCTAGAGGGTCCTTACCGGCTGTAAG 232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCACGGGGTAACGTAGCTCTTCTGCGTACACCTGGCTAGAGGGTCCTTACCGGCTGTAAG 240
Query 233 CTCACTACAATCCAGGTACAGAGTGCGTTAACCGGCCATTAGAGGGCCGCTACACCCGTC 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTCACTACAATCCAGGTACAGAGTGCGTTAACCGGCCATTAGAGGGCCGCTACACCCGTC 300
Query 293 AGAATTTAAACGTATGGGCGGCGAAGCGCGATAATGGTTAGACGCTTCTTGCAGGGGTCA 352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 301 AGAATTTAAACGTATGGGCGGCGAAGCGCGATAATGGTTAGAC-CTTCTTGCAGGGG-CA 358
Query 353 AATAACGATTTTGCGACTGCCCCTTTAAGATGGAGAATGGACAAACGCTCATTCCTAGTG 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 AATAACGATTTTGCGACTGCCCCTTTAAGATGGAGAATGGACAAACGCTCATTCCTAGTG 418
Query 413 AGGACATCGACATCGTTACGATGCAACGTCGAGTGGCGGCATAACACTTGGCTCGGTCCT 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 AGGACATCGACATCGTTACGATGCAACGTCGAGTGGCGGCATAACACTTGGCTCGGTCCT 478
Query 473 ACCCGCGACAGTGCAACAAAAACAGTTGCTCTACATTCGCTATGCATTTTAACGGATATG 532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 ACCCGCGACAGTGCAACAAAAACAGTTGCTCTACATTCGCTATGCATTTTAACGGATATG 538
Query 533 CCTTTGCCCCCCGTCCGTCATG-ACGAAAAGTTTGGCTATGCGCGGAACATTATGCCGGA 591
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 CCTTTGCCCCCCGTCCGTCATGGACGAAAAGTTTGGCTATGCGCGGAACATTATGCCGGA 598
Query 592 TTACTCGTTATCGCTGGGTAATCGTCCGTTGGGCCCGCTCTTACGCGATCAGTGCCGTTA 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 TTACTCGTTATCGCTGGGTAATCGTCCGTTGGGCCCGCTCTTACGCGATCAGTGCCGTTA 658
Query 652 GCACATGCGCGAATAGGGCGGATTCCGAAAGCATGTGCCAAATTCCCCATGACCCTGTTC 711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 GCACATGCGCGAATAGGGCGGATTCCGAAAGCATGTGCCAAATTCCCCATGACCCTGTTC 718
Query 712 CAGGTGAG-TGACACTATCAGTCGAAGTTGTTTGCTTAACCAGGAAAAACGCTGTTTCTC 770
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 CAGGTGAGCTGACACTATCAGTCGAAGTTGTTTCCTTAACCAGGAAAAACGCTGTTTCTC 778
Query 771 CGTTTGCTTGTACCATGGGGGCAGGGAATTCTTCGAGCGCGCGAATGTATACACTATTAT 830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 CGTTTGCTTGTACCATGGGGGCAGGGAATTCTTCGAGCGCGCGAATGTATACACTATTAT 838
Query 831 CTCATGTGCATGTCCAGAGCGGGCTAACCTAATATACCTGGTCGCATCCGTCCGAGATCA 890
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 839 CTCATGTGCATGTCCAGAGCGGGCTAACCTAATATACCTGGTCGCATC-GTCCGAGATCA 897
Query 891 GTTGGGAATAGCGGAGCGGATACGCCTGGAACGCTGGGGCGTGCCAGTAAACTTACTGTT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 GTTGGGAATAGCGGAGCGGATACGCCTGGAACGCTGGGGCGTGCCAGTAAACTTACTGTT 957
Query 951 CTCCAGTTCCTCCATCATGTTCCGTCTAATCCGGAGATGTGTAGCTGCATTGTGCTCCGT 1010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 CTCCAGTTCCTCCATCATGTTCCGTCTAATCCGGAGATGTGTAGCTGCATTGTGCTCCGT 1017
Query 1011 TGCGGTACTCCTCGACTTGCCAGGTGCCATATGGGCTACTGGCGAGAGGAAATTTGCTTT 1070
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 TGCGGTACTCCTCGACT-G---GGTGCCATATGGGCTACTGGCGAGAGGAAATTTGCTTT 1073
Query 1071 TGTGTATTTAGGCCCGTGGCACCTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1115
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074 TGTGTATTTAGGCCCGTGGCACCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1118
Query= ERCC-00128_genbank |92111306|gb|DQ459428.1| Synthetic construct
microarray control MC26 mRNA, complete sequence
Length=1134
Subject= ERCC-00128
Length=1133
Score = 2021 bits (1094), Expect = 0.0
Identities = 1123/1135 (98%), Gaps = 10/1135 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGAACCTAAAAGCCATGAATCAAGCGCTTATGGATTCGTTTGCAGCGAAGTGAGGCC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGGAGAACCTAAAAGCCATGAATCAAGCGCTTATGGATTCGTTTGCAGCGAAGTGAGGCC 60
Query 61 ATTCCCGCTTACATTAAAGACGTCCTATGAGGTTCGGAGGTGCCTGGCACCCTTGGCCGC 120
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ATTCCCGCTTACATTAAAGACGTCCTATGA-GTTCGGAGGTGCCTGGCACCCTTGGCCGC 119
Query 121 GGTTGTATACTAACTGCTGACGCAAGCATAAGGAGTCAGGTTGATGGTACATCTTCACTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 GGTTGTATACTAACTGCTGACGCAAGCATAAGGAGTCAGGTTGATGGTACATCTTCACTT 179
Query 181 GCACACCCATAGCGCCAAGAAGAACCACTGTTAGCTTGACAGGGGATAAGTCCATGGTTC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 GCACACCCATAGCGCCAAGAAGAACCACTGTTAGCTTGACAGGGGATAAGTCCATGGTTC 239
Query 241 GTCCGGGTTAGATTAGATGTTGCCTAGGCGACTTTAAGTGAACCAGATTATGTATGGACG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GTCCGGGTTAGATTAGATGTTGCCTAGGCGACTTTAAGTGAACCAGATTATGTATGGACG 299
Query 301 CGCAATAGATATGACACTTATTAATACCCGTACTGGTTTGGACACGGTATGGATCATAAC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CGCAATAGATATGACACTTATTAATACCCGTACTGGTTTGGACACGGTATGGATCATAAC 359
Query 361 TAGTCTTGCCTACATCAAGAGACCTGCACTCTCCTGTTGCGACGGTAGCAGACTCTACAT 420
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TAGTATTGCCTACATCAAGAGACCTGCACTCTCCTGTTGCGACGGTAGCAGACTCTACAT 419
Query 421 TGGCCAATCATGTCCTCTGTTAATCCAGCCAGAATATGCCAATTGAGGCGAGGGAACTGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TGGCCAATCATGTCCTCTGTTAATCCAGCCAGAATATGCCAATTGAGGCGAGGGAACTGG 479
Query 481 GATTGTCCCGTAGAACCTATACCATGTAATGGTTGTTAAGCTTCGATTCATCGGGAGTTG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 GATTGTCCCGTAGAACCTATACCATGTAATGGTTGTTAAGCTTCGATTCATCGGGAGTTG 539
Query 541 CGCGTGCTGATGTCTCAGATATAGCACGCAGCTGCGCACGTCTCTATCGTAAGTCCGAGT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 CGCGTGCTGATGTCTCAGATATAGCACGCAGCTGCGCACGTCTCTATCGTAAGTCCGAGT 599
Query 601 ATGCTTGCACTTGGTCAATTACAAGTTCGAACAGAGAGCGGGTGGAGGGCTATAGCTTTG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 ATGCTTGCACTTGGTCAATTACAAGTTCGAACAGAGAGCGGGTGGAGGGCTATAGCTTTG 659
Query 661 CTGTAGCGATCCAATCGAGGCCAGTCTCTGCGGCCAAGTTACGCCTGAAAATTCCGATAG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CTGTAGCGATCCAATCGAGGCCAGTCTCTGCGGCCAAGTTACGCCTGAAAATTCCGATAG 719
Query 721 GTGGCTCTCGTACCGCGATGCGGGTACCCCGCCGGCTTTTCTATCACTATGCTTCGCAGA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GTGGCTCTCGTACCGCGATGCGGGTACCCCGCCGGCTTTTCTATCACTATGCTTCGCAGA 779
Query 781 TCAAACTTCTCCTGCGCGCCACGAGTGCAGGTAATCGCACTTAGAAGTAACTATGCCTAT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 TCAAACTTCTCCTGCGCGCCACGAGTGCAGGTAATCGCACTTAGAAGTAACTATGCCTAT 839
Query 841 CATAACCCTGTACGCGGAGTAATTCCATGAACCGGCTTTGAAACGGATTACCGATCCTAT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 CATAACCCTGTACGCGGAGTAATTCCATGAACCGGCTTTGAAACGGATTACCGATCCTAT 899
Query 901 CTGTTTGCTGTTTGGAGTGTGTATCCATGGTGATTGCAGGCACACTAAAATTGGCCTGAG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 CTGTTTGCTGTTTGGAGTGTGTATCCATGGTGATTGCAGGCACACTAAAATTGGCCTGAG 959
Query 961 GA--TC-T-----GGCATGGACCGCGTCCGTTGAATAATGCATAATATCGCATTGAGCGA 1012
|| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 GAACTCCTTTTCTGGCATGGACCGCGTCCGTTGAATAATGCATAATATCGCATTGAGCGA 1019
Query 1013 TCACTGCGTCTTCTGTACGGTCGGACCCCTTGTTGATCAACGAACTAACTACGCGTTTAA 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 TCACTGCGTCTTCTGTACGGTCGGACCCCTTGTTGATCAACGAACTAACTACGCGTTTAA 1079
Query 1073 GATAGCGGACAGCCTATTCAATTCTCACTCTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1127
| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 GGTAGCGGACAGCCTATTCAATTCTCACTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1133
Query= ERCC-00130_genbank |116733912|gb|EF011072.1| Synthetic construct
spike-in microarray control hypothetical protein (ynbA) gene,
partial cds
Length=1046
Subject= ERCC-00130
Length=1059
Score = 1916 bits (1037), Expect = 0.0
Identities = 1037/1037 (100%), Gaps = 0/1037 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 GCATTTTGAAAATTCTATGGAAGAGCTAGCATCTCTGACGAAAACAGCAGACGGAAAAGT 69
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCATTTTGAAAATTCTATGGAAGAGCTAGCATCTCTGACGAAAACAGCAGACGGAAAAGT 60
Query 70 ACTGACCAGCGTCACACAAAAACGGAACAGGGCTGACGCCGCTACATATATAGGAAAAGG 129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACTGACCAGCGTCACACAAAAACGGAACAGGGCTGACGCCGCTACATATATAGGAAAAGG 120
Query 130 GAAGGTAGAAGAGCTGAAGGCACTCGTGGAAGAGCTTGAAGCTGATCTCCTCATCTTTAA 189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GAAGGTAGAAGAGCTGAAGGCACTCGTGGAAGAGCTTGAAGCTGATCTCCTCATCTTTAA 180
Query 190 TGATGAACTGTCGCCAAGTCAGCTGAAGTCATTGGCAACAGCAATTGAAGTGAAGATGAT 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TGATGAACTGTCGCCAAGTCAGCTGAAGTCATTGGCAACAGCAATTGAAGTGAAGATGAT 240
Query 250 TGACCGCACGCAATTGATATTAGATATTTTTGCAAAGCGGGCGAGAACGAGAGAAGGCAA 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TGACCGCACGCAATTGATATTAGATATTTTTGCAAAGCGGGCGAGAACGAGAGAAGGCAA 300
Query 310 ACTTCAAATTGAGCTGGCTCAGCTGCAATATGCACTGCCGCGTCTGACGGGACAAGGGAT 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ACTTCAAATTGAGCTGGCTCAGCTGCAATATGCACTGCCGCGTCTGACGGGACAAGGGAT 360
Query 370 CAACCTTTCCCGGCAAGGCGGAGGAATTGGGGCAAGAGGTCCCGGGGAAACGAAACTGGA 429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CAACCTTTCCCGGCAAGGCGGAGGAATTGGGGCAAGAGGTCCCGGGGAAACGAAACTGGA 420
Query 430 AACCGACCGCCGCCATATCAGAAATCGCATTCATGAAATCAACACACAGCTTTCCACTGT 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AACCGACCGCCGCCATATCAGAAATCGCATTCATGAAATCAACACACAGCTTTCCACTGT 480
Query 490 CATTCGCCATAGAAGCCGATACCGTGAAAGAAGAAAGAAAAACGGTGTGCTTCAAATTGC 549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CATTCGCCATAGAAGCCGATACCGTGAAAGAAGAAAGAAAAACGGTGTGCTTCAAATTGC 540
Query 550 GCTTGTCGGCTATACAAACGCAGGGAAATCAACATGGTTCAACCGCCTGACGAGTGCTGA 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GCTTGTCGGCTATACAAACGCAGGGAAATCAACATGGTTCAACCGCCTGACGAGTGCTGA 600
Query 610 CAGCTATGAAGAAGACCTCCTGTTTGCCACGCTGGACCCGATGACCAGAAAAATGGTCCT 669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CAGCTATGAAGAAGACCTCCTGTTTGCCACGCTGGACCCGATGACCAGAAAAATGGTCCT 660
Query 670 GCCAAGCGGCTACAGTGTTCTTCTTTCAGATACAGTAGGATTTATTCAGGATCTTCCGAC 729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GCCAAGCGGCTACAGTGTTCTTCTTTCAGATACAGTAGGATTTATTCAGGATCTTCCGAC 720
Query 730 GACATTGATTGCTGCATTCCGCTCAACGCTTGAGGAAGTAAAAGAAGCGGATTTAATTCT 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GACATTGATTGCTGCATTCCGCTCAACGCTTGAGGAAGTAAAAGAAGCGGATTTAATTCT 780
Query 790 GCATTTAATTGATTCTTCAAATGAGGATTATGCGGGACATGAAAAAACAGTGCTTCGGCT 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GCATTTAATTGATTCTTCAAATGAGGATTATGCGGGACATGAAAAAACAGTGCTTCGGCT 840
Query 850 GCTTGAGGAGCTTGAAGCAGATGATATCCCGATGCTGACGGCTTACAATAAACGTGATCA 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GCTTGAGGAGCTTGAAGCAGATGATATCCCGATGCTGACGGCTTACAATAAACGTGATCA 900
Query 910 AAAACTGCCTGATTTTATACCGACCGCCGGAAGGGATCACATTATGGTCAGTGCGAAATT 969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AAAACTGCCTGATTTTATACCGACCGCCGGAAGGGATCACATTATGGTCAGTGCGAAATT 960
Query 970 TGAGGACGACGCTGCAGCCTTTAAAGAAGCGATTCAGCGCTATTTGCGCCAAGAACTGTT 1029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TGAGGACGACGCTGCAGCCTTTAAAGAAGCGATTCAGCGCTATTTGCGCCAAGAACTGTT 1020
Query 1030 AACGTCTTGAATTCTGG 1046
|||||||||||||||||
Sbjct 1021 AACGTCTTGAATTCTGG 1037
Query= ERCC-00131_genbank |116662508|gb|DQ855003.2| Synthetic construct
clone AG016.1110 external RNA control sequence
Length=747
Subject= ERCC-00131
Length=771
Score = 1369 bits (741), Expect = 0.0
Identities = 745/747 (99%), Gaps = 0/747 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCCGGATAAAGGCTTCTTCGGTACTATACAAGTTGTCTACGCACATTTGCCTTGGGTAT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CGCCGGATAAAGGCTTCTTCGGTACTATACAAGTTGTCTACGCACATTTGCCTTGGGTAT 60
Query 61 TAAACTCTAGTAGGAGCGAAACTTGACATATCAAACCTCTCTGGAGAGGCATCTCCCAGA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TAAACTCTAGTAGGAGCGAAACTTGACATATCAAACCTCTCTGGAGAGGCATCTCCCAGA 120
Query 121 CATTACGGATGATCAGGTCTCAGCGAATCTTAGCTGTGCGGATAATTTGTGGCCCGCACA 180
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CATTACGGATGATCAGGTCTCAGCGAATCCTAGCTGTGCGGATAATTTGTGGCCCGCACA 180
Query 181 ACCGCAAGACACCGCCGTGTCTATTCCACAAACTTCGACATATCAATAACGCAGTAACAA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ACCGCAAGACACCGCCGTGTCTATTCCACAAACTTCGACATATCAATAACGCAGTAACAA 240
Query 241 CGTTAAGTAGGGGGACAGGCAGTGCGTCCTAAGGGGCTTGAGGTCGCCCGATTCGCGATC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CGTTAAGTAGGGGGACAGGCAGTGCGTCCTAAGGGGCTTGAGGTCGCCCGATTCGCGATC 300
Query 301 TAATCTTAACAGACGAGGTGGCGTAAGATGTACCTCGTTCAATCTAAGTATGAATTTGTC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TAATCTTAACAGACGAGGTGGCGTAAGATGTACCTCGTTCAATCTAAGTATGAATTTGTC 360
Query 361 CGCTGGGTAATGGTGGAATTAAAGAACATGCGTAAAACGACCTCGTTGTAATTTGGGTCG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CGCTGGGTAATGGTGGAATTAAAGAACATGCGTAAAACGACCTCGTTGTAATTTGGGTCG 420
Query 421 GCCCGTCTCGGCAAATTTGCCCTTGCAGTGAAGCTCGGATTGGATGTCTCGTAAGGAATA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GCCCGTCTCGGCAAATTTGCCCTTGCAGTGAAGCTCGGATTGGATGTCTCGTAAGGAATA 480
Query 481 CTTATTGCGGGTGGTACGCAAATTCGCAACCATGTGAAGTAATGTGAGCGTACTTCACCT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CTTATTGCGGGTGGTACGCAAATTCGCAACCATGTGAAGTAATGTGAGCGTACTTCACCT 540
Query 541 GCTCCGGTACAAGCCGCCATGTGCTCATGTTGGGAACCTCCTGCGTAACAACCGGACGCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GCTCCGGTACAAGCCGCCATGTGCTCATGTTGGGAACCTCCTGCGTAACAACCGGACGCT 600
Query 601 TGCGAAAGTCATTCCCCTATCGGTACACTATTGGAAAACATGACAAACGTATAATGCGTG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TGCGAAAGTCATTCCCCTATCGGTACACTATTGGAAAACATGACAAACGTATAATGCGTG 660
Query 661 ATGACCGCAACAGATGTAAGTGCACCAACTAGTATTGGCTCCTGTCCACATGGTCGGGTT 720
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ATGACCGCAACAGGTGTAAGTGCACCAACTAGTATTGGCTCCTGTCCACATGGTCGGGTT 720
Query 721 TTCCGCCCCCAAACATGCAAACATCCG 747
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TTCCGCCCCCAAACATGCAAACATCCG 747
Query= ERCC-00134_genbank |103488686|gb|DQ516739.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-250-22 genomic sequence
Length=250
Subject= ERCC-00134
Length=274
Score = 457 bits (247), Expect = 1e-133
Identities = 249/250 (99%), Gaps = 0/250 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGCTTTGTTATTGGTATTGACTTACAACCAGTTAAGCCATTTGAATATGATAATGTAGT 60
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGGCTTTGTTATTGGTATTGACTTACAAACAGTTAAGCCATTTGAATATGATAATGTAGT 60
Query 61 TGCAATAAAAGGAGATTTCACCTTAGAAGAAAATTTGAACAAAATTAGAGAGCTAATTCC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TGCAATAAAAGGAGATTTCACCTTAGAAGAAAATTTGAACAAAATTAGAGAGCTAATTCC 120
Query 121 AAATGATGaaaaaaaGGTGGATGTGGTTATAAGTGACGCCTCCCCTAATATAAGCGGTTA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAATGATGAAAAAAAGGTGGATGTGGTTATAAGTGACGCCTCCCCTAATATAAGCGGTTA 180
Query 181 TTGGGATATAGACCACGCTCGTTCAATAGATTTAGTAACTACTGCCTTACAAATAGCTAC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTGGGATATAGACCACGCTCGTTCAATAGATTTAGTAACTACTGCCTTACAAATAGCTAC 240
Query 241 TGAGATGCTA 250
||||||||||
Sbjct 241 TGAGATGCTA 250
Query= ERCC-00136_genbank |116733895|gb|EF011063.1| Synthetic construct
spike-in microarray control DNA-directed RNA polymerase alpha
subunit (rpoA) gene, complete cds
Length=1020
Subject= ERCC-00136
Length=1033
Score = 1834 bits (993), Expect = 0.0
Identities = 1005/1011 (99%), Gaps = 0/1011 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 TTTCGACGTTTTGAAGGAGGGTTTTAAGTAATGATCGAGATTGAAAAACCAAAAATCGAA 69
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTTCGACGTTTTGAAGGAGGGTTTTAAGTAATGATCGAGATTGAAAAACCAAAAATCGAA 60
Query 70 ACGGTTGAAATCAGCGACGATGCCAAATTTGGTAAGTTTGTCGTAGAGCCACTTGAGCGT 129
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACGGTTGAAATCAGCGACGATGCCGAATTTGGTAAGTTTGTCGTAGAGCCACTTGAGCGT 120
Query 130 GGATATGGTACAACTCTGGGTAACTCCTTACGTCGTATCCTCTTATCCTCACTCCCTGGT 189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GGATATGGTACAACTCTGGGTAACTCCTTACGTCGTATCCTCTTATCCTCACTCCCTGGT 180
Query 190 GCCGCTGTAACATCAATCCAGATAGATGGTGTACTGCACGAATTCTCGACAATTGAAGGC 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GCCGCTGTAACATCAATCCAGATAGATGGTGTACTGCACGAATTCTCGACAATTGAAGGC 240
Query 250 GTTGTGGAAGATGTTACAACGATTATCTTACACATTAAAAAGCTTGCATTGAAAATCTAC 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GTTGTGGAAGATGTTACAACGATTATCTTACACATTAAAAAGCTTGCATTGAAAATCTAC 300
Query 310 TCTGATGAAGAGAAGACGCTAGAAATTGATGTACAGGGTGAAGGAACTGTAACGGCAGCT 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TCTGATGAAGAGAAGACGCTAGAAATTGATGTACAGGGTGAAGGAACTGTAACGGCAGCT 360
Query 370 GATATTACACACGATAGTGATGTAGAGATCTTAAATCCTGATCTTCATATCGCGACTCTT 429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GATATTACACACGATAGTGATGTAGAGATCTTAAATCCTGATCTTCATATCGCGACTCTT 420
Query 430 GGTGAGAATGCGAGTTTCCGAGTTCGCCTTACTGCTCAAAGAGGACGTGGGTATACGCCT 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GGTGAGAATGCGAGTTTCCGAGTTCGCCTTACTGCTCAAAGAGGACGTGGGTATACGCCT 480
Query 490 GCTGACGCAAACAAGAGAGACGATCAGCCAATCGGCGTGATTCCGATCGATTCTATCTAT 549
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GCTGACGCAAACAAGAGAGGCGATCAGCCAATCGGCGTGATTCCGATCGATTCTATCTAT 540
Query 550 ACGCCAGTTTCTCGTGTATCTTATCAGGTAGAGAACACTCGTGTAGGCCAAGTTGCAAAC 609
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 ACGCCAGTTTCCCGTGTATCTTATCAGGTAGAGAACACTCGTGTAGGCCAAGTTGCAAAC 600
Query 610 TATGATAAACTTACACTTGATGTTTGGACTGATGGAAGCACTGGACCGAAAGAAGCAATT 669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TATGATAAACTTACACTTGATGTTTGGACTGATGGAAGCACTGGACCGAAAGAAGCAATT 660
Query 670 GCGCTTGGTTCAAAGATTTTAACTGAACACCTTAATATATTCGTTGGTTTAACTGACGAA 729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 661 GCGCTTGGTTCAAAGATTTTAACTGAACACCTTAATATATTCGCTGGTTTAACTGACGAA 720
Query 730 GCTCAACATGCTGAAATCATGGTTGAAAAAGAAGAAGATCAAAAAGAGAAAGTTCTTGAA 789
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GCTCAACATGCTGAAATCATGGTTGAAGAAGAAGAAGATCAAAAAGAGAAAGTTCTTGAA 780
Query 790 ATGACAATTGAAGAATTGGATCTTTCTGTTCGTTCTTACAACTGCTTAAAGCGTGCGGGT 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 ATGACAATTGAAGAATTGGATCTTTCTGTTCGTTCTTACAACTGCTTAAAGCGTGCGGGT 840
Query 850 ATTAACACGGTTCAAGAGCTTGCGAACAAGACGGAAGAAGATATGATGAAAGTTCGAAAT 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 ATTAACACGGTTCAAGAGCTTGCGAACAAGACGGAAGAAGATATGATGAAAGTTCGAAAT 900
Query 910 CTAGGACGCAAATCACTTGAAGAAGTGAAAGCGAAACTAGAAGAACTTGGACTCGGACTT 969
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CTAGGACGCAAATCACTTGAAGAAGTGAAAGCGAGACTAGAAGAACTTGGACTCGGACTT 960
Query 970 CGCAAAGACGATTGACTAGTTTCCCTTGTGAACTAGGATTTTCCCGGGTAC 1020
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CGCAAAGACGATTGACTAGTTTCCCTTGTGAACTAGGATTTTCCCGGGTAC 1011
Query= ERCC-00137_genbank |116662507|gb|DQ855000.2| Synthetic construct
clone AG011.0011 external RNA control sequence
Length=513
Subject= ERCC-00137
Length=537
Score = 942 bits (510), Expect = 0.0
Identities = 512/513 (99%), Gaps = 0/513 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAAGCAAACCTAATGAAGCCAGACACGAGATCACAGAAAATCGCTGACTATCCCGAGTG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CAAAGCAAACCTAATGAAGCCAGACACGAGATCACAGAAAATCGCTGACTATCCCGAGTG 60
Query 61 CGCGGCGAGCTACAATCCAAGATGATTATTTTTTCACGACCGGGCGCTGGTCAGGTATAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CGCGGCGAGCTACAATCCAAGATGATTATTTTTTCACGACCGGGCGCTGGTCAGGTATAT 120
Query 121 CGCTGGTACAGATGGCGGCAAGCATCGTTGTCACCACTTCCTTCACGATTTCCGTTAGAG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CGCTGGTACAGATGGCGGCAAGCATCGTTGTCACCACTTCCTTCACGATTTCCGTTAGAG 180
Query 181 CCGAGTGGTACAGCACGTACGTTATATATGGGAGTACGGACATGCTTCCCACCTCGTCAG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CCGAGTGGTACAGCACGTACGTTATATATGGGAGTACGGACATGCTTCCCACCTCGTCAG 240
Query 241 CCAAGATGATAGATACCCGTAGCGTGATGGTCTTATAGCTGCTCTGATGGACTTCGAAAG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CCAAGATGATAGATACCCGTAGCGTGATGGTCTTATAGCTGCTCTGATGGACTTCGAAAG 300
Query 301 ATCACCGTGCAGCTATTCAAAAAAGCAGCCGGGGAAAAGGTGGTCTCGCCCGAAAGCCAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATCACCGTGCAGCTATTCAAAAAAGCAGCCGGGGAAAAGGTGGTCTCGCCCGAAAGCCAT 360
Query 361 GACCTCCGATCACTCCTGGCCGGTAGTCGGTTTATTGCATATTGTACAATTGCGCGCGCG 420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 361 GACCTCCGATCACTCCTGGCCGGTAGTCGGTTTATTGCATATTGTACAGTTGCGCGCGCG 420
Query 421 GCAGGTCACATCCCCCTGGTTAAATAGAGGCACGAGCGCTCGTTTTTGGGTGATCAATAT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GCAGGTCACATCCCCCTGGTTAAATAGAGGCACGAGCGCTCGTTTTTGGGTGATCAATAT 480
Query 481 GGCTTACCCCCGAGAGAGTTGTGAGCTTGCACG 513
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GGCTTACCCCCGAGAGAGTTGTGAGCTTGCACG 513
Query= ERCC-00138_genbank |103488724|gb|DQ516777.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-60 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00138
Length=1024
Score = 1836 bits (994), Expect = 0.0
Identities = 998/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTGCTAAAAGAGGTTGGTTGTATAAGATTTGGAGAATTTATCTTAGCCTCTGGTaaaaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 CCTGCTAAAAGAGGTTGGTTGTATAAGATTTGGAGAATTTATCTTAGCCTCTGGTAAAAA 61
Query 61 aaGTAACTACTACATAGACATaaaaaaaGCCACCACAAACCCAGAAATTTTAAAGTTAGT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62 AAGTAACTACTACATAGACATAAAAAAAGCCACCACAAACCCAGAAATTTTAAAGTTAGT 121
Query 121 TGGAGAAATTATTGCTGAGCAAATAAAGGATGAAGATGTAAAAGTTGCTGGAGTAGAGCT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122 TGGAGAAATTATTGCTGAGCAAATAAAGGATGAAGATGTAAAAGTTGCTGGAGTAGAGCT 181
Query 181 TGGTTCTGTCCCTATAGCTACAGCTGTCTCAATTATTGCTCAAAAACCACTATTAATTGT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 TGGTTCTGTCCCTATAGCTACAGCTGTCTCAATTATTGCTCAAAAACCACTATTAATTGT 241
Query 241 TAGAAAGAAACCTAAGGATTACGGAACTAAAAATAAGATAGAAGGAGAGCTAAAAGAAGG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 242 TAGAAAGAAACCTAAGGATTACGGAACTAAAAATAAGATAGAAGGAGAGCTAAAAGAAGG 301
Query 301 AGATAAGGTTGTTATTGTGGAGGATGTTACTACAACTGGAGGAAGTGTGCTAAAGGCAGT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302 AGATAAGGTTGTTATTGTGGAGGATGTTACTACAACTGGAGGAAGTGTGCTAAAGGCAGT 361
Query 361 TAAAGAGATTAGGGAAAATGGTGGAATTGTTGATAAAGTTTTTGTTGTTGTTGATAGGTT 420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 362 TAAAGAGATTAGGGAAAATGGTGGAATTGTTGATAAAGTTTTYGTTGTTGTTGATAGGTT 421
Query 421 AGAAGGAGCTAAAGAAAACCTACAAAAAGAGAATGTTGAATTAATCCCATTAGTTACTGT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 AGAAGGAGCTAAAGAAAACCTACAAAAAGAGAATGTTGAATTAATCCCATTAGTTACTGT 481
Query 481 TAAGGAGCTACAATCCACTCAATAAATCTAAAAACCTCTTAGTCCATAGGGGAAACCCCT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482 TAAGGAGCTACAATCCACTCAATAAATCTAAAAACCTCTTAGTCCATAGGGGAAACCCCT 541
Query 541 ATTGGGATACTCCCCGTCCATTAAGTTGCTCCTTTCAGGAGCAATTAATGTCCATTTTAA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 ATTGGGATACTCCCCGTCCATTAAGTTGCTCCTTTCAGGAGCAATTAATGTCCATTTTAA 601
Query 601 GCTTATAATCCACTCAATAAATCTAAAAACTTCTTAGTTTTCTCTTTTTTAACCTTACCA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 602 GCTTATAATCCACTCAATAAATCTAAAAACTTCTTAGTTTTCTCTTTTTTAACCTTACCA 661
Query 661 AATTTCTCTAATTTGCTAACATCTACATTTTTATCCTTTAAAATTTCTTTTATTGGTTCT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 AATTTCTCTAATTTGCTAACATCTACATTTTTATCCTTTAAAATTTCTTTTATTGGTTCT 721
Query 721 ATGAGTGCAAtttttttAAGTAAGTCTTCAATATCCTTCTTTTTGAAGTTAAATCTTTCC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 ATGAGTGCAATTTTTTTAAGTAAGTCTTCAATATCCTTCTTTTTGAAGTTAAATCTTTCC 781
Query 781 ACAGCATCCCAGTCGTGAATTAAGTATAAAGCAACTCCACCAATGTTCTTTAAAGGAATC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 ACAGCATCCCAGTCGTGAATTAAGTATAAAGCAACTCCACCAATGTTCTTTAAAGGAATC 841
Query 841 TGATATTTTGGCAACTCCTCCTCCAATTTAAATTTTAAATCTAAAACATCCACACAATTA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 TGATATTTTGGCAACTCCTCCTCCAATTTAAATTTTAAATCTAAAACATCCACACAATTA 901
Query 901 ATCCCATCAACACTCATCCAAGATAAAAATCCTCTCTGTGGAGTAATCATAATAGATGGG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 902 ATCCCATCAACACTCATCCAAGATAAAAATCCTCTCTGTGGAGTAATCATAATAGATGGG 961
Query 961 AACAAATTACTCCTTGCCCTCTCATCTGGTGTTTTGTAGA 1000
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 962 AACAAATTACTCCTTGCCCT-TCATCTGGTGTTTTGTAGA 1000
Query= ERCC-00142_genbank |114975604|gb|DQ883646.2| Synthetic construct
clone NISTag5 external RNA control sequence
Length=500
Subject= ERCC-00142
Length=493
Score = 905 bits (490), Expect = 0.0
Identities = 492/493 (99%), Gaps = 0/493 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CACCTGTCACATTTCCAATCGGCTCCAGGAAGAGAGAAGTGACGGCTTGATCCTGTAGTA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CACCTGTCACATTTCCAATCGGCTCCAGGAAGAGAGAAGTGACGGCTTGATCCTGTAGTA 60
Query 61 ATCCGGGATCGACTTAAGGGGTGCAGCGACCACGGCGGATCGGGCGTCGCAATAGTCCTC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ATCCGGGATCGACTTAAGGGGTGCAGCGACCACGGCGGATCGGGCGTCGCAATAGTCCTC 120
Query 121 CTGTTAGGAGGGTCCTTCTAATGTTAACGCCCGAATATTAGTCATATTTTGCTAGCGCCT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CTGTTAGGAGGGTCCTTCTAATGTTAACGCCCGAATATTAGTCATATTTTGCTAGCGCCT 180
Query 181 ATCAGCGTAAGATATGATTTAAGTTACACCAGGAGAGTAGCGAGATAGAACCACTCGTTG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ATCAGCGTAAGATATGATTTAAGTTACACCAGGAGAGTAGCGAGATAGAACCACTCGTTG 240
Query 241 GATCGGTCTTTCTTAATTGACTACTATCAGATCCGGCGCATGGCGCTGAGGTCAAACTAC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GATCGGTCTTTCTTAATTGACTACTATCAGATCCGGCGCATGGCGCTGAGGTCAAACTAC 300
Query 301 ATTACAGGCCCTGGTTTCCGTGGGTCAGCGCAAGTACAGGCGAGCAGATACAACCTTCCG 360
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATTACAGGCCCTGGTTTCCATGGGTCAGCGCAAGTACAGGCGAGCAGATACAACCTTCCG 360
Query 361 GAGACTTCGCCTCCACACACCGGAGACCCTAACCGTACCCAAATGTAACTAGCGCCTCTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAGACTTCGCCTCCACACACCGGAGACCCTAACCGTACCCAAATGTAACTAGCGCCTCTG 420
Query 421 GTGTGAGCTTACTAGAAAGTAGGCCGGGCCGGTCGACAGGAGGTTGCGCCaaaaaaaaaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GTGTGAGCTTACTAGAAAGTAGGCCGGGCCGGTCGACAGGAGGTTGCGCCAAAAAAAAAA 480
Query 481 aaaaaaaaaaaaa 493
|||||||||||||
Sbjct 481 AAAAAAAAAAAAA 493
Query= ERCC-00143_genbank |110339335|gb|DQ668362.1| Synthetic construct
clone TagG microarray control
Length=760
Subject= ERCC-00143
Length=784
Score = 1404 bits (760), Expect = 0.0
Identities = 760/760 (100%), Gaps = 0/760 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCAGCGTAGGTATCGACTCTCACTGTGGAGTCGTCTATGATGTCGTGGAGTCCTCTCA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAGCGTAGGTATCGACTCTCACTGTGGAGTCGTCTATGATGTCGTGGAGTCCTCTCA 60
Query 61 GAGTGCTGTAGGTCCTCATAGGTCGTGCTGTCTCTCTACACGCGTGCGTGAGTCTACATT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GAGTGCTGTAGGTCCTCATAGGTCGTGCTGTCTCTCTACACGCGTGCGTGAGTCTACATT 120
Query 121 TCTGCGAGTTGGTGCTCTCACTGCGGTGTCAGTGATCTCTCCGCGTGTGACATGAGTCTA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCTGCGAGTTGGTGCTCTCACTGCGGTGTCAGTGATCTCTCCGCGTGTGACATGAGTCTA 180
Query 181 GCTTCGCGGTCATGGTCTATCCCAGCGATGGATGAGACTACTCTGTACTAGATGGTCATG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GCTTCGCGGTCATGGTCTATCCCAGCGATGGATGAGACTACTCTGTACTAGATGGTCATG 240
Query 241 CCTGCGAATGAGTCGTCAGTGCCCACAATGTCTCGATAGTGCGCCGAATGTGTCTGTAAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CCTGCGAATGAGTCGTCAGTGCCCACAATGTCTCGATAGTGCGCCGAATGTGTCTGTAAT 300
Query 301 GCCTCGAATGTGTAATCGTCAACTCGTATGTGAAGTGCTAGGCTAGTATTGACATCTACG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GCCTCGAATGTGTAATCGTCAACTCGTATGTGAAGTGCTAGGCTAGTATTGACATCTACG 360
Query 361 GGCGGCTATTGACGAACTCTCCGGTATATGCTCTACATCTGCAGGGAATTGCCGACCATA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGCGGCTATTGACGAACTCTCCGGTATATGCTCTACATCTGCAGGGAATTGCCGACCATA 420
Query 421 TATGGGTCTTGCTGATACGCTAGGGTGCTTGCTACTTAGATAGGCGTCTTGGCCGCTATT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TATGGGTCTTGCTGATACGCTAGGGTGCTTGCTACTTAGATAGGCGTCTTGGCCGCTATT 480
Query 481 CGCGGCGTGTCTCAGAATATGCGCGACGTGTCTGGTATATGGCGACTGTGTCCGTCTATA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CGCGGCGTGTCTCAGAATATGCGCGACGTGTCTGGTATATGGCGACTGTGTCCGTCTATA 540
Query 541 CGCATACTGGTCCACATATAGACATACTTCCACGACATGACAAAGCGTGCTCCTACATAG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CGCATACTGGTCCACATATAGACATACTTCCACGACATGACAAAGCGTGCTCCTACATAG 600
Query 601 CACGAGCGTCTCCTAAATAGATCCGGTCTTATCGCTGAATGTCTAGGATTCTCGTCAATG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CACGAGCGTCTCCTAAATAGATCCGGTCTTATCGCTGAATGTCTAGGATTCTCGTCAATG 660
Query 661 ATCTACGATCCTCGCTAAGTATTCAGCCACCTCGTATAGTATTCGCGCACCTGAGGATTT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ATCTACGATCCTCGCTAAGTATTCAGCCACCTCGTATAGTATTCGCGCACCTGAGGATTT 720
Query 721 ATTCACCTGACTCGCGTATAATATGCCGTCACCTAGTCTA 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 ATTCACCTGACTCGCGTATAATATGCCGTCACCTAGTCTA 760
Query= ERCC-00144_genbank |116662504|gb|DQ854995.2| Synthetic construct
clone AG006.1100 external RNA control sequence
Length=514
Subject= ERCC-00144
Length=538
Score = 950 bits (514), Expect = 0.0
Identities = 514/514 (100%), Gaps = 0/514 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTAGGATAAATTGACCCGTATGAACTGTTGCCGGCTCGGAAATGTTAAGGCTCTGCGC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGCTAGGATAAATTGACCCGTATGAACTGTTGCCGGCTCGGAAATGTTAAGGCTCTGCGC 60
Query 61 ACGCACTTTATCATTCGCAGCCTGTTCTGTCAGCGGGTCAGCCTAGGTTACGGTGGAACC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACGCACTTTATCATTCGCAGCCTGTTCTGTCAGCGGGTCAGCCTAGGTTACGGTGGAACC 120
Query 121 ACTCGGTATCGTGCAGACAGGGATCGTAAGGCGATCCAGCCGGTATACCTTAGTCACATA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ACTCGGTATCGTGCAGACAGGGATCGTAAGGCGATCCAGCCGGTATACCTTAGTCACATA 180
Query 181 TACTATCGTAATATTGGCGGTTGCTGACAAGTAAATACGGCTAAACCGGTCGTTGACCAA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TACTATCGTAATATTGGCGGTTGCTGACAAGTAAATACGGCTAAACCGGTCGTTGACCAA 240
Query 241 CCACTCTCGCGGGGGTCATAAATATCACTGAGCCCGGGAAGTACCCCGTGACAGACATAC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CCACTCTCGCGGGGGTCATAAATATCACTGAGCCCGGGAAGTACCCCGTGACAGACATAC 300
Query 301 GAAAAGCGTGATAACGTATTCGTAGGTATTATTTCCGTTAGCTGGAGGTAAAGGGGTTCT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GAAAAGCGTGATAACGTATTCGTAGGTATTATTTCCGTTAGCTGGAGGTAAAGGGGTTCT 360
Query 361 GGTCCTAGCCGTGTTATGTCTATTTATGAGATGGTAAGCTCGTCACCAACTCGTCACGCG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGTCCTAGCCGTGTTATGTCTATTTATGAGATGGTAAGCTCGTCACCAACTCGTCACGCG 420
Query 421 ATCGAAATAGCTTGGACTAATGTCCGGCACATAATCAAGTCTACATCAATCATGAATGGT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ATCGAAATAGCTTGGACTAATGTCCGGCACATAATCAAGTCTACATCAATCATGAATGGT 480
Query 481 TTCTGATTTGCTACCATCAGATATCATGTGAGCA 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TTCTGATTTGCTACCATCAGATATCATGTGAGCA 514
Query= ERCC-00145_genbank |112819961|gb|DQ875386.1| Synthetic construct
microarray control LYS gene, complete sequence
Length=1018
Subject= ERCC-00145
Length=1042
Score = 1881 bits (1018), Expect = 0.0
Identities = 1018/1018 (100%), Gaps = 0/1018 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTGTCCTTTCATCCATAAGCGGAGAAAGAGGGAATGACATTGTTCTTACACGGCACAAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACTGTCCTTTCATCCATAAGCGGAGAAAGAGGGAATGACATTGTTCTTACACGGCACAAG 60
Query 61 CAGACAAAATCAACATGGTCATTTAGAAATCGGAGGTGTGGATGCTCTCTATTTAGCGGA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CAGACAAAATCAACATGGTCATTTAGAAATCGGAGGTGTGGATGCTCTCTATTTAGCGGA 120
Query 121 GAAATATGGTACACCTCTTTACGTATATGATGTGGCTTTAATACGTGAGCGTGCTAAAAG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GAAATATGGTACACCTCTTTACGTATATGATGTGGCTTTAATACGTGAGCGTGCTAAAAG 180
Query 181 CTTTAAGCAGGCGTTTATTTCTGCAGGGCTGAAAGCACAGGTGGCATATGCGAGCAAAGC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTTTAAGCAGGCGTTTATTTCTGCAGGGCTGAAAGCACAGGTGGCATATGCGAGCAAAGC 240
Query 241 ATTCTCATCAGTCGCAATGATTCAGCTCGCTGAGGAAGAGGGACTTTCTTTAGATGTCGT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATTCTCATCAGTCGCAATGATTCAGCTCGCTGAGGAAGAGGGACTTTCTTTAGATGTCGT 300
Query 301 ATCCGGAGGAGAGCTATATACGGCTGTTGCAGCAGGCTTTCCGGCAGAACGCATCCACTT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATCCGGAGGAGAGCTATATACGGCTGTTGCAGCAGGCTTTCCGGCAGAACGCATCCACTT 360
Query 361 TCATGGAAACAATAAGAGCAGGGAAGAACTGCGGATGGCGCTTGAGCACCGCATCGGCTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TCATGGAAACAATAAGAGCAGGGAAGAACTGCGGATGGCGCTTGAGCACCGCATCGGCTG 420
Query 421 CATTGTGGTGGATAATTTCTATGAAATCGCGCTTCTTGAAGACCTATGTAAAGAAACGGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CATTGTGGTGGATAATTTCTATGAAATCGCGCTTCTTGAAGACCTATGTAAAGAAACGGG 480
Query 481 TCACTCCATCGATGTTCTTCTTCGGATCACGCCCGGAGTAGAAGCGCATACGCATGACTA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TCACTCCATCGATGTTCTTCTTCGGATCACGCCCGGAGTAGAAGCGCATACGCATGACTA 540
Query 541 CATTACAACGGGCCAGGAAGATTCAAAGTTTGGTTTCGATCTTCATAACGGACAAACTGA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CATTACAACGGGCCAGGAAGATTCAAAGTTTGGTTTCGATCTTCATAACGGACAAACTGA 600
Query 601 ACGGGCCATTGAACAAGTATTACAATCGGAACACATTCAGCTGCTGGGTGTCCATTGCCA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ACGGGCCATTGAACAAGTATTACAATCGGAACACATTCAGCTGCTGGGTGTCCATTGCCA 660
Query 661 TATCGGCTCGCAAATCTTTGATACGGCCGGTTTTGTGTTAGCAGCGGAAAAAATCTTCAA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TATCGGCTCGCAAATCTTTGATACGGCCGGTTTTGTGTTAGCAGCGGAAAAAATCTTCAA 720
Query 721 AAAACTAGACGAATGGAGAGATTCATATTCATTTGTATCCAAGGTGCTGAATCTTGGAGG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 AAAACTAGACGAATGGAGAGATTCATATTCATTTGTATCCAAGGTGCTGAATCTTGGAGG 780
Query 781 AGGTTTCGGCATTCGTTATACGGAAGATGATGAACCGCTTCATGCCACTGAATACGTTGA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AGGTTTCGGCATTCGTTATACGGAAGATGATGAACCGCTTCATGCCACTGAATACGTTGA 840
Query 841 AAAAATTATCGAAGCTGTGAAAGAAAATGCTTCCCGTTACGGTTTTGACATTCCGGAAAT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AAAAATTATCGAAGCTGTGAAAGAAAATGCTTCCCGTTACGGTTTTGACATTCCGGAAAT 900
Query 901 TTGGATCGAACCGGGCCGTTCTCTCGTGGGAGACGCAGGCACAACTCTTTATACGGTTGG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TTGGATCGAACCGGGCCGTTCTCTCGTGGGAGACGCAGGCACAACTCTTTATACGGTTGG 960
Query 961 CTCTCAAAAAGAAGTGGATAAGCTGTACAATCGTTTCATCATTCGGCGTGCGAATTAA 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CTCTCAAAAAGAAGTGGATAAGCTGTACAATCGTTTCATCATTCGGCGTGCGAATTAA 1018
Query= ERCC-00147_genbank |103488737|gb|DQ516790.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-73 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00147
Length=1023
Score = 1834 bits (993), Expect = 0.0
Identities = 998/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTGCTTAACCTTAATCTTGCCTTATTACAATATTTTTAGaaaaataaaaagtaaaaat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CCTTGCTTAACCTTAATCTTGCCTTATTACAATATTTTTAGAAAAATAAAAAGTAAAAAT 60
Query 61 aaaaGCAAATCCTTAATCTTTGGTGATATTGATGGAGAGGTATGAAATCCCTAAAGAGAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAAAGCAAATCCTTAATCTTTGGTGATATTGATGGAGAGGTATGAAATCCCTAAAGAGAT 120
Query 121 TGGAGAAATAATGTTTGGCTTGTTGTCTCCAGATTACATAAGACAGATGTCAGTTGCTAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TGGAGAAATAATGTTTGGCTTGTTGTCTCCAGATTACATAAGACAGATGTCAGTTGCTAA 180
Query 181 GATAGTTACACCAGACACTTATGATGAAGATGGTTATCCAATAGATGGAGGTTTAATGGA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GATAGTTACACCAGACACTTATGATGAAGATGGTTATCCAATAGATGGAGGTTTAATGGA 240
Query 241 CACAAGATTGGGAGTTATAGACCCAGGTTTAGTTTGCAAAACATGTGGAGGAAGGATTGG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CACAAGATTGGGAGTTATAGACCCAGGTTTAGTTTGCAAAACATGTGGAGGAAGGATTGG 300
Query 301 AGAGTGTCCAGGGCATTTTGGGCATATAGAGTTGGCTAAACCAGTAATTCATATAGGATT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AGAGTGTCCAGGGCATTTTGGGCATATAGAGTTGGCTAAACCAGTAATTCATATAGGATT 360
Query 361 TGCCAAAACAATATACAAGATATTGAAGGCAGTTTGCCCACACTGTGGAAGAGTAGCAAT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TGCCAAAACAATATACAAGATATTGAAGGCAGTTTGCCCACACTGTGGAAGAGTAGCAAT 420
Query 421 AAGTGAAACTAAGAGGAAAGAAATTTTGGAAAAGATGGAAAAATTAGAGAGAGATGGAGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AAGTGAAACTAAGAGGAAAGAAATTTTGGAAAAGATGGAAAAATTAGAGAGAGATGGAGG 480
Query 481 AAACAAGTGGGAGGTTTGTGAAGAGGTTTATAAAGAAGCTTCAAAAGTTACAATCTGCCC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AAACAAGTGGGAGGTTTGTGAAGAGGTTTATAAAGAAGCTTCAAAAGTTACAATCTGCCC 540
Query 541 ACACTGTGGAGAGATAAAGTATGATATAAAGTTTGAGAAACCAACAACCTACTACAGAAT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 ACACTGTGGAGAGATAAAGTATGATATAAAGTTTGAGAAACCAACAACCTACTACAGAAT 600
Query 601 TGATGGAAATGAGGAAAAAACATTAACTCCATCAGATGTTAGAGAGATTTTAGAGAAGAT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TGATGGAAATGAGGAAAAAACATTAACTCCATCAGATGTTAGAGAGATTTTAGAGAAGAT 660
Query 661 TCCAGATGAAGATTGTATCTTACTCGGCTTAAACCCAGAGGTTGCAAGGCCAGAGTGGAT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TCCAGATGAAGATTGTATCTTACTCGGCTTAAACCCAGAGGTTGCAAGGCCAGAGTGGAT 720
Query 721 GGTTCTCACCGTTTTGCCAGTTCCACCAGTAACTGTAAGGCCATCAATTACCTTGGAAAC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GGTTCTCACCGTTTTGCCAGTTCCACCAGTAACTGTAAGGCCATCAATTACCTTGGAAAC 780
Query 781 TGGAGAGAGAAGTGAAGACGATTTAACTCACAAGTTAGTTGATATCATCAGAATCAACAA 840
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TGGAGAGAGAAGTGAAGACGATTTAACCCACAAGTTAGTTGATATCATCAGAATCAACAA 840
Query 841 TAGATTAGAGGAGAATATAGAAGGAGGAGCACCAAACTTAATTATTGAGGATTTATGGAA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TAGATTAGAGGAGAATATAGAAGGAGGAGCACCAAACTTAATTATTGAGGATTTATGGAA 900
Query 901 TCTGTTGCAGTATCACGTAAATACCTACTTCGATAACGAAGCTCCAGGTATTCCACCAGC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TCTGTTGCAGTATCACGTAAATACCTACTTCGATAACGAAGCTCCAGGTATTCCACCAGC 960
Query 961 TAAGCACAGAAGTGGAAGACCATTAAAAACCTTAGCTCAG 1000
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 961 TAAGCACAGAAGTGGAAGAC-ATTAAAAACCTTAGCTCAG 999
Query= ERCC-00148_genbank |114975574|gb|DQ883642.2| Synthetic construct
clone NISTag1 external RNA control sequence
Length=500
Subject= ERCC-00148
Length=494
Score = 913 bits (494), Expect = 0.0
Identities = 494/494 (100%), Gaps = 0/494 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCTCCATTTGGTCACGTTTACAACCGGAGTAGACGGCCATAGCAGGAGGGGTGTGCGA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CATCTCCATTTGGTCACGTTTACAACCGGAGTAGACGGCCATAGCAGGAGGGGTGTGCGA 60
Query 61 CAGGCAGGAAGCTCTCGCGGGGTCCAAGCATTGCTGCAATGGGCGTCCTTGCTCGATGTT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CAGGCAGGAAGCTCTCGCGGGGTCCAAGCATTGCTGCAATGGGCGTCCTTGCTCGATGTT 120
Query 121 GACCCGAAGCTCTAACTGCATTTCAAGTCCGAATCTCTAGATATCTCGAGAGCCAATGGT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GACCCGAAGCTCTAACTGCATTTCAAGTCCGAATCTCTAGATATCTCGAGAGCCAATGGT 180
Query 181 TAAGGAAGGGGCGTCAATTTTGCGCGGACACGCTGCAGGATGTAATGATTAAGCCGTAGT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TAAGGAAGGGGCGTCAATTTTGCGCGGACACGCTGCAGGATGTAATGATTAAGCCGTAGT 240
Query 241 TGAATTTATGGAGCGGTGCCCCGGGAAAGGTATAAATCGGAGGCAGGGGTTTACGGCGTC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TGAATTTATGGAGCGGTGCCCCGGGAAAGGTATAAATCGGAGGCAGGGGTTTACGGCGTC 300
Query 301 AGGATAGTTCATAGCGTACGCAGAACGAGAACAAGTGAGACGTGTATAGTTGCCATGCTG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AGGATAGTTCATAGCGTACGCAGAACGAGAACAAGTGAGACGTGTATAGTTGCCATGCTG 360
Query 361 AGTAGACCTGGCGTCTACCCCTCCAAACGCATTCTTATTGGCAAATGGAAGTAGCTTCCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AGTAGACCTGGCGTCTACCCCTCCAAACGCATTCTTATTGGCAAATGGAAGTAGCTTCCA 420
Query 421 CAGTTTGTAACAAGCCGTGCCTGCGCATGTTATTTACCAATGGAGAATCGaaaaaaaaaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CAGTTTGTAACAAGCCGTGCCTGCGCATGTTATTTACCAATGGAGAATCGAAAAAAAAAA 480
Query 481 aaaaaaaaaaaaaa 494
||||||||||||||
Sbjct 481 AAAAAAAAAAAAAA 494
Query= ERCC-00150_genbank |114976669|gb|DQ883659.2| Synthetic construct
clone NISTag18 external RNA control sequence
Length=750
Subject= ERCC-00150
Length=743
Score = 1373 bits (743), Expect = 0.0
Identities = 743/743 (100%), Gaps = 0/743 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGATGTGACATCACGTCCCAATCAATTTGGTTTTACTCCCCTCGATTATGCGGAGT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGCTTGATGTGACATCACGTCCCAATCAATTTGGTTTTACTCCCCTCGATTATGCGGAGT 60
Query 61 TATCAGTAAGAGCGGGTACCGTTCTGCTGAATGCACTATGAGGGCGACCCTTGATCTTCA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TATCAGTAAGAGCGGGTACCGTTCTGCTGAATGCACTATGAGGGCGACCCTTGATCTTCA 120
Query 121 TTCGTTCCATAGATGCAAATACCCGGGTACTAGTTGGCGAAGTTTGGCTAAAGATTGCCC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TTCGTTCCATAGATGCAAATACCCGGGTACTAGTTGGCGAAGTTTGGCTAAAGATTGCCC 180
Query 181 ACTTACTAGGTGACTGTTAACTAGAAAGTTGCATGAGGCTGGTAAGTGAGGGGCTCAGTG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ACTTACTAGGTGACTGTTAACTAGAAAGTTGCATGAGGCTGGTAAGTGAGGGGCTCAGTG 240
Query 241 AAACAGGATACACCGTACCGTGACGATTCCCGTGTGGGCTTGACATTCAGCCAGCCTCCC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAACAGGATACACCGTACCGTGACGATTCCCGTGTGGGCTTGACATTCAGCCAGCCTCCC 300
Query 301 GCTTGTACAGAGGCAGACTGTCCGATGCCTAGTATGTTCACTATACGATTTCTTGGGCTA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GCTTGTACAGAGGCAGACTGTCCGATGCCTAGTATGTTCACTATACGATTTCTTGGGCTA 360
Query 361 GCTAGGTGTCTTGACCCCATATTCCAAAGATCCGAACCTGCTTGTACTTATCAGTACGAG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GCTAGGTGTCTTGACCCCATATTCCAAAGATCCGAACCTGCTTGTACTTATCAGTACGAG 420
Query 421 TTGATGCTCTTGGGGTACCTATTTTTTGATCCGATAGTATTGGTTCTGGCGTGTTCTCGT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TTGATGCTCTTGGGGTACCTATTTTTTGATCCGATAGTATTGGTTCTGGCGTGTTCTCGT 480
Query 481 AACCCCGGGCACTAGATTATGGTGAATGGTGTGTACACACTACTTGACGGGGCGTTACCA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AACCCCGGGCACTAGATTATGGTGAATGGTGTGTACACACTACTTGACGGGGCGTTACCA 540
Query 541 TTTTCAGGTGGGCACAAATAGCTAAAGCCTCGTCCGCATTACGCCCCATGGCTCACGTCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TTTTCAGGTGGGCACAAATAGCTAAAGCCTCGTCCGCATTACGCCCCATGGCTCACGTCT 600
Query 601 CAGAGGAGGCTAGCTCGAGGTCACCCATAAGGGATTACGGAGTTACACCCATAGTAACAG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CAGAGGAGGCTAGCTCGAGGTCACCCATAAGGGATTACGGAGTTACACCCATAGTAACAG 660
Query 661 ACGGAAATTGTTGATAACAGATAGTTAATACGCCTTGGCTGAGGAGACCAACGGACTTCa 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ACGGAAATTGTTGATAACAGATAGTTAATACGCCTTGGCTGAGGAGACCAACGGACTTCA 720
Query 721 aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 743
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 743
Query= ERCC-00154_genbank |110586143|gb|DQ854997.1| Synthetic construct
clone AG009.0011 external RNA control sequence
Length=512
Subject= ERCC-00154
Length=537
Score = 931 bits (504), Expect = 0.0
Identities = 508/510 (99%), Gaps = 0/510 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CTAGATCAGAAGTCTCCCACTCGAGACTAATCTTGGACTATCTATGAGCACCTATTGCGC 62
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4 CTAGATCAGAAGTCTCCCACTCGAGACTAATCTTGGACTATCTATGAGCACCTATTGCGC 63
Query 63 TGTGGAAGATTGCCCCTAGGTCTCTGGCGGCTCCGATTGCGGGATGAACTGGTTGGTCCG 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 TGTGGAAGATTGCCCCTAGGTCTCTGGCGGCTCCGATTGCGGGATGAACTGGTTGGTCCG 123
Query 123 AGGAGGCATATAGGAAACGATGGGCACGCGCTATTCAGACGTTATTTGGTATGGAGTAAG 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 124 AGGAGGCATATAGGAAACGATGGGCACGCGCTATTCAGACGTTATTTGGTATGGAGTAAG 183
Query 183 AGGCCGGAAACTGGGCTCGATTGATGGATACTGATCAGTCAACTCAAGCGAGGATATCCA 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 AGGCCGGAAACTGGGCTCGATTGATGGATACTGATCAGTCAACTCAAGCGAGGATATCCA 243
Query 243 TACCCACCGACGGTATGGTCATTAATACCCAGTATTGACTAGTCGGAGGTCTAATTTGGA 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 TACCCACCGACGGTATGGTCATTAATACCCAGTATTGACTAGTCGGAGGTCTAATTTGGA 303
Query 303 ACGTATTCCGCCGCACACACGAGATTCACTTACATGGACGTGAAGATTGATCGCCGGGCG 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304 ACGTATTCCGCCGCACACACGAGATTCACTTACATGGACGTGAAGATTGATCGCCGGGCG 363
Query 363 ACTATTATTGCACGACCTTCGCCTGCCCTCAGCTGCGCCCTTTTTGTCCACGGCGCGGGC 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 364 ACTATTATTGCACGACCTTCGCCTGCCCTCAGCTGCGCCCTTTTTGTCCACGACGCAGGC 423
Query 423 TGGACCAAGCAGCCGAGGCTGCGCTCCGGCATCAAAGTCCACGAGTTACAGCCAGCGGGT 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 TGGACCAAGCAGCCGAGGCTGCGCTCCGGCATCAAAGTCCACGAGTTACAGCCAGCGGGT 483
Query 483 TTTAAGGGGGTATTAGCATCTCGAGTGAGT 512
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 TTTAAGGGGGTATTAGCATCTCGAGTGAGT 513
Query= ERCC-00156_genbank |114975588|gb|DQ883643.2| Synthetic construct
clone NISTag2 external RNA control sequence
Length=500
Subject= ERCC-00156
Length=494
Score = 913 bits (494), Expect = 0.0
Identities = 494/494 (100%), Gaps = 0/494 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CACAAGAATCCCTGCTAGCTGAAGGAGGGTCAAACTATAACACCTTTAGCATTCGTACAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CACAAGAATCCCTGCTAGCTGAAGGAGGGTCAAACTATAACACCTTTAGCATTCGTACAG 60
Query 61 GCAGGCTAAGTGAATACTAACCCACCGGCAGCCCGTTGTAGTAACGTTGACCCCTGGCTC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GCAGGCTAAGTGAATACTAACCCACCGGCAGCCCGTTGTAGTAACGTTGACCCCTGGCTC 120
Query 121 GGAGACATTTGGTGTTGCCTAGTACTAGGTGACTGGTACCGATTCATAGGTTCGCCATTC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GGAGACATTTGGTGTTGCCTAGTACTAGGTGACTGGTACCGATTCATAGGTTCGCCATTC 180
Query 181 TCTTATCGAGAGCCCGAGGTAGACTATCTTCCAGATGATGCCATACGTTCACTCAATCGC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCTTATCGAGAGCCCGAGGTAGACTATCTTCCAGATGATGCCATACGTTCACTCAATCGC 240
Query 241 GCGGCATGCACGGTGGGGCTACGAACTTGCTATCCATAGGCTCTAGATGTGGTAGAAATA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GCGGCATGCACGGTGGGGCTACGAACTTGCTATCCATAGGCTCTAGATGTGGTAGAAATA 300
Query 301 TGCTGCAGGGGTTCTGTCGAATTTGCTCGGCAACCGTGGCCGTGTATGCTTTCATATCCC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TGCTGCAGGGGTTCTGTCGAATTTGCTCGGCAACCGTGGCCGTGTATGCTTTCATATCCC 360
Query 361 GGCGGTGTGATCTAGCCTTCTCGCCATATGAGGGCGCTGAGCATAGACCCAAACCCGACT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGCGGTGTGATCTAGCCTTCTCGCCATATGAGGGCGCTGAGCATAGACCCAAACCCGACT 420
Query 421 AGTCGAATCTTAGGGTTGTATGCTAGAACGGCATGGTATAAGCCGTGCTCaaaaaaaaaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AGTCGAATCTTAGGGTTGTATGCTAGAACGGCATGGTATAAGCCGTGCTCAAAAAAAAAA 480
Query 481 aaaaaaaaaaaaaa 494
||||||||||||||
Sbjct 481 AAAAAAAAAAAAAA 494
Query= ERCC-00157_genbank |110586151|gb|DQ839618.1| Synthetic construct
clone AG090.1111 external RNA control sequence
Length=995
Subject= ERCC-00157
Length=1019
Score = 1821 bits (986), Expect = 0.0
Identities = 992/995 (99%), Gaps = 0/995 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCTTTGTCACCTCCGTCAATTTGTATTAGAACCCGTGAAGGCCCAAGTAACAGGCCCA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGTCTTTGTCACCTCCGTCAATTTGTATTAGAACCCGTGAAGGCCCAAGTAACAGGCCCA 60
Query 61 GGGTTAACATGTACGGAACATACTCCTTCCACGGAAGATTGGGGATGAAAGTTGATACCC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGGTTAACATGTACGGAACATACTCCTTCCACGGAAGATTGGGGATGAAAGTTGATACCC 120
Query 121 AAACTTCATTAACACAAAGGCGATGTGGGCCGAGTACTGTGCTTACACCAACAGGGCGGC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAACTTCATTAACACAAAGGCGATGTGGGCCGAGTACTGTGCTTACACCAACAGGGCGGC 180
Query 181 TCAACTGGGTTGGTAGCCAGCACTAGCTTATTCACAATTAAGGCCGTATGCATTCTACTG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCAACTGGGTTGGTAGCCAGCACTAGCTTATTCACAATTAAGGCCGTATGCATTCTACTG 240
Query 241 CTTATCCGGTGGTGATTGCAGCCAGGGCGGAAGTGAACACGCTTGTACGATGTGTTTGCA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTTATCCGGTGGTGATTGCAGCCAGGGCGGAAGTGAACACGCTTGTACGATGTGTTTGCA 300
Query 301 TAAGCGGTTACCACAGGCGCTACTCTCGTCGATAGCCGACTACTAATATTCAGCCGGCGC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TAAGCGGTTACCACAGGCGCTACTCTCGTCGATAGCCGACTACTAATATTCAGCCGGCGC 360
Query 361 CGGTAGATAGCGAGGCTTTGGGGGTAGCTTTAAGTGCGGTCTAGGCTCAGTTGACGATAC 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CGGTAGATAGCGAGGCTTTGGGGGTAGCTTTAAGTGCGGTCTAGGCTCAGTTGACGATAC 420
Query 421 TTACTTAGGCAGGGTTACAACCCTTATGATGGGGTATGAGGCACGTGGCCATTCATCCGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TTACTTAGGCAGGGTTACAACCCTTATGATGGGGTATGAGGCACGTGGCCATTCATCCGG 480
Query 481 ACCCGATGCTGTCGTGCTTCTCGTTGGCAATAGCGCGGATTAGTACAGGTGACTAGTTCA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ACCCGATGCTGTCGTGCTTCTCGTTGGCAATAGCGCGGATTAGTACAGGTGACTAGTTCA 540
Query 541 GCTGTTGTTCGGATTCCAAGTAAGCTCGCATAGAGCTGGACTTCTCGGAACGGTCCTGAC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GCTGTTGTTCGGATTCCAAGTAAGCTCGCATAGAGCTGGACTTCTCGGAACGGTCCTGAC 600
Query 601 GCATTCCTGCATCAATACGCGGCACCGGGGGTCCGATAGCATCTCGCCTTAGATCCGGCG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GCATTCCTGCATCAATACGCGGCACCGGGGGTCCGATAGCATCTCGCCTTAGATCCGGCG 660
Query 661 GGGGATACTTGGTCAAAGCTCACTACGGGACTAGAGTGGCTAGTGCAGATGCGCAGCGCA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GGGGATACTTGGTCAAAGCTCACTACGGGACTAGAGTGGCTAGTGCAGATGCGCAGCGCA 720
Query 721 GATATGCTATACGAGATGAGCTTCAAATTCATGGAGTTATGACGATATAACGCTAGGATC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GATATGCTATACGAGATGAGCTTCAAATTCATGGAGTTATGACGATATAACGCTAGGATC 780
Query 781 TGACGCGGTGACACCGGTCGTGTGACAACTGGGCTTTAAGTGAGGCATCAGAAGTATACT 840
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TGACGCAGTGACACCGGTCGTGTGACAACTGGGCTTTAAGTGAGGCATCAGAAGTATACT 840
Query 841 TTTAATGGTGCCGCTCCCAAATCCCCGATCTTGCCACGATTGCCTAAGCCGTCATGTTAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TTTAATGGTGCCGCTCCCAAATCCCCGATCTTGCCACGATTGCCTAAGCCGTCATGTTAG 900
Query 901 AGGCGGTCACAGCAAACCCCCACTTTACCGGTTCGATGATTATACGATGCCGGAGCGAAC 960
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AGGCGGTCACAGCAAACCCTCAGTTTACCGGTTCGATGATTATACGATGCCGGAGCGAAC 960
Query 961 GACTACGCTCGAAGTTTGGTTATCTAGAGCACGTC 995
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GACTACGCTCGAAGTTTGGTTATCTAGAGCACGTC 995
Query= ERCC-00158_genbank |103488742|gb|DQ516795.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-78 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00158
Length=1027
Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCAACAGATCATGGAACTACGGGAGAAATAAACATTTGGATAGAAAATGTAACATTTA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7 TTTCAACAGATCATGGAACTACGGGAGAAATAAACATTTGGATAGAAAATGTAACATTTA 66
Query 61 AAAATGATGCAAAATCATATTCCTTTAATTTAACGAATCTTAATATATGGGCAGTAAATA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 67 AAAATGATGCAAAATCATATTCCTTTAATTTAACGAATCTTAATATATGGGCAGTAAATA 126
Query 121 AATCTGCTTATGAGTTGTATTGGAATCCATTTAACAAATCTATCTGGATAGATGGGAGTA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 AATCTGCTTATGAGTTGTATTGGAATCCATTTAACAAATCTATCTGGATAGATGGGAGTA 186
Query 181 ATTACACTATAACTCCAAATATTGACATACCTCCAGGAGAAGTATGGAACTCTAAAACCT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187 ATTACACTATAACTCCAAATATTGACATACCTCCAGGAGAAGTATGGAACTCTAAAACCT 246
Query 241 ACAACTTCACATTTAGTGGAGTTCCAATCGTTTGGGCAAACTGCTCATTTACACTGTCaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 247 ACAACTTCACATTTAGTGGAGTTCCAATCGTTTGGGCAAACTGCTCATTTACACTGTCAA 306
Query 301 aaaaaGATTATATCCTTTTAAATGAAGTAAGTCAAATAGGAAGTTCCTATGTTGTTGTTG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307 AAAAAGATTATATCCTTTTAAATGAAGTAAGTCAAATAGGAAGTTCCTATGTTGTTGTTG 366
Query 361 AGGAGATTTATGTTGTGGGTAGTTATTTGATTAAGGTGACTAAGCATATTGTTCCGGATG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 AGGAGATTTATGTTGTGGGTAGTTATTTGATTAAGGTGACTAAGCATATTGTTCCGGATG 426
Query 421 CGGATGGGACTTATGATATTTATATAGTTGTGGAGAATATTGGTAGTGTGAAGACTCCTG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 427 CGGATGGGACTTATGATATTTATATAGTTGTGGAGAATATTGGTAGTGTGAAGACTCCTG 486
Query 481 AGTATGTGTATGTTTATGATTTGATTCCTAAGAACTTCACCGTCTCAGATGAGTGGGTTA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 487 AGTATGTGTATGTTTATGATTTGATTCCTAAGAACTTCACCGTCTCAGATGAGTGGGTTA 546
Query 541 ATCAATCAAGTATGTTGATTGCTGAAGGAAATCACACCATTACAACAAATCCAAGGTATA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 547 ATCAATCAAGTATGTTGATTGCTGAAGGAAATCACACCATTACAACAAATCCAAGGTATA 606
Query 601 ATTTAAGCATGTGGTGGGCGTTACATGCAATATATCCAGGAGCAGATGGGGACGGTAACT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 607 ATTTAAGCATGTGGTGGGCGTTACATGCAATATATCCAGGAGCAGATGGGGACGGTAACT 666
Query 661 GGAACGACACTGCTGAAATACTTGCAAATAAAACAGTAGTCATACACTACAAACTAAACG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAACGACACTGCTGAAATACTTGCAAATAAAACAGTAGTCATACACTACAAACTAAACG 726
Query 721 GAACTGGCGAATTCTACCCAAGCGACGCATTTATCGTTGGTATCGACCCTACAAACTCAC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 727 GAACTGGCGAATTCTACCCAAGCGACGCATTTATCGTTGGTATCGACCCTACAAACTCAC 786
Query 781 TACTACCAACAACCTCACCAAAAATAACAACAGTAGCCGGAACAGTAGAAAACAACTTTG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 787 TACTACCAACAACCTCACCAAAAATAACAACAGTAGCCGGAACAGTAGAAAACAACTTTG 846
Query 841 AGATATTTTTAATACTGATAAACGTTATCTTTGGATTAGGTATATTAACAAAGAGGAATA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 847 AGATATTTTTAATACTGATAAACGTTATCTTTGGATTAGGTATATTAACAAAGAGGAATA 906
Query 901 TAAGGAATAATAAATAAAGTTGGGGGATGATGATGAAGAGATTTGCATTACTCTTTATTT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 907 TAAGGAATAATAAATAAAGTTGGGGGATGATGATGAAGAGATTTGCATTACTCTTTATTT 966
Query 961 TCCTTGCATTTATAACACCAACTTTTGCAGATGTTGAGGA 1000
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 967 TCCTTGCATTTATAACACCA-CTTTTGCAGATGTTGAGGA 1005
Query= ERCC-00160_genbank |114976664|gb|DQ883658.2| Synthetic construct
clone NISTag17 external RNA control sequence
Length=750
Subject= ERCC-00160
Length=743
Score = 1367 bits (740), Expect = 0.0
Identities = 743/744 (99%), Gaps = 1/744 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCTTGGTTTGAAATCAAATTACTATAGATTGCATGCAGAAGTAGGGCTTTACAAGTTTG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCCTTGGTTTGAAATCAAATTACTATAGATTGCATGCAGAAGTAGGGCTTTACAAGTTTG 60
Query 61 TTCCTAATTCCGTTGAACAATAGCGAATGTATGATGGTCGGTCATTGCCGCAACCCTGAA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTCCTAATTCCGTTGAACAATAGCGAATGTATGATGGTCGGTCATTGCCGCAACCCTGAA 120
Query 121 GCAGTGAGCGTGGTTGAGTAACCACGTACTAGAAGTCCAAGGATGGTTGCAGTAGCTAGC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GCAGTGAGCGTGGTTGAGTAACCACGTACTAGAAGTCCAAGGATGGTTGCAGTAGCTAGC 180
Query 181 TCAATTGCCATTGCTGGAATAGTGTCGGTAAACCACGCACCGGGGAGCCGCGTTTCGTTG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCAATTGCCATTGCTGGAATAGTGTCGGTAAACCACGCACCGGGGAGCCGCGTTTCGTTG 240
Query 241 CGATAACCTCATATAGTCCCAGTCTCGGACGCGAGCACCTGCAGCGTAATTAATAAGGTC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CGATAACCTCATATAGTCCCAGTCTCGGACGCGAGCACCTGCAGCGTAATTAATAAGGTC 300
Query 301 AGGCTATGATTCACCACCGTGTAGGAGTTATGCGCCTTATCGCGAAGGTAGTTACTCTTG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AGGCTATGATTCACCACCGTGTAGGAGTTATGCGCCTTATCGCGAAGGTAGTTACTCTTG 360
Query 361 CCAGTGGGCATGAAATTGCGAGCTTGCCCTAGTAGCGTTAGTACCGTCATAAGCCACTCT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CCAGTGGGCATGAAATTGCGAGCTTGCCCTAGTAGCGTTAGTACCGTCATAAGCCACTCT 420
Query 421 AAGAGATCGAAATTTTATACAGTAGTACTAACCAGCAGACCTGCAATATCAAAGTTATAA 480
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AAGAGATCGAAATTTTATACAGTAGTACTAAC-AGCAGACCTGCAATATCAAAGTTATAA 479
Query 481 GCGCGTCGACACGCCTCGTCTAAGAAAAACTACTTCCATTAAAGTTCGAGGACAAATGCG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 GCGCGTCGACACGCCTCGTCTAAGAAAAACTACTTCCATTAAAGTTCGAGGACAAATGCG 539
Query 541 GTCTGATTCAGTCCTATAGCGAGGCCATTGCAGTGTGGTCTGCCGTGGTCGGCTCGATAA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 GTCTGATTCAGTCCTATAGCGAGGCCATTGCAGTGTGGTCTGCCGTGGTCGGCTCGATAA 599
Query 601 TACCATGATAACTACTGACTGCGCAGTTGTAGCGACCGCAATGGGGAGTGTGTGTTCTTT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TACCATGATAACTACTGACTGCGCAGTTGTAGCGACCGCAATGGGGAGTGTGTGTTCTTT 659
Query 661 ATTTCAACTGCGTGGCTTATCCTACTTAGGAGTTGTGGATACCAGATTATCTCGCGGTGG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 ATTTCAACTGCGTGGCTTATCCTACTTAGGAGTTGTGGATACCAGATTATCTCGCGGTGG 719
Query 721 aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 744
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 743
Query= ERCC-00162_genbank |103488697|gb|DQ516750.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-500-33 genomic sequence
Length=500
Subject= ERCC-00162
Length=523
Score = 917 bits (496), Expect = 0.0
Identities = 499/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCACAGATTCCCATGTGTCCAATTCTGAATATCTTTCCAGCTAAGTGCTTCTGCCCAC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCCACAGATTCCCATGTGTCCAATTCTGAATATCTTTCCAGCTAAGTGCTTCTGCCCAC 60
Query 61 CAGCAACAACTATGTTGTATTTGTTGCTTAATATACCTCTAAATTTGCTATCTTCAATGC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CAGCAACAACTATGTTGTATTTGTTGCTTAATATACCTCTAAATTTGCTATCTTCAATGC 120
Query 121 CTTCTGGATATTTTGCTGATGTAACTGTTACTGACCTTGCCCTCTCCTTGGCAAACAACT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CTTCTGGATATTTTGCTGATGTAACTGTTACTGACCTTGCCCTCTCCTTGGCAAACAACT 180
Query 181 CTATTCCCATTGCCTCCAAACCAGCCCTTGTTGCTTTTGCTAATCTCTCATGTCTTTTAA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTATTCCCATTGCCTCCAAACCAGCCCTTGTTGCTTTTGCTAATCTCTCATGTCTTTTAA 240
Query 241 CCCTATTCTCGATTCCTTCCTCTAAAACTAAATCTAATGCAACATTTAAGGCATAGGTTA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CCCTATTCTCGATTCCTTCCTCTAAAACTAAATCTAATGCAACATTTAAGGCATAGGTTA 300
Query 301 AATTAACTGATGGTGTGTATGGGGTTTGTTTTTTCTCTTCATAGTATTTTTTATAAGCCA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AATTAACTGATGGTGTGTATGGGGTTTGTTTTTTCTCTTCATAGTATTTTTTATAAGCCA 360
Query 361 ATAAATCTAAGTAGAAACCAACTTTGTCATCATTCTTCTTAATAACTTCCCATGCCTTTT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ATAAATCTAAGTAGAAACCAACTTTGTCATCATTCTTCTTAATAACTTCCCATGCCTTTT 420
Query 421 CACTGACTGTTATTGCAGCCAATCCTGGTGGAGCTGCCAAACATTTTTGAGAACCAGTAA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CACTGACTGTTATTGCAGCCAATCCTGGTGGAGCTGCCAAACATTTTTGAGAACCAGTAA 480
Query 481 CACAGATATCTATGTGGAAT 500
|||||||||| |||||||||
Sbjct 481 CACAGATATC-ATGTGGAAT 499
Query= ERCC-00163_genbank |110339332|gb|DQ668359.1| Synthetic construct
clone TagD microarray control
Length=519
Subject= ERCC-00163
Length=543
Score = 942 bits (510), Expect = 0.0
Identities = 516/519 (99%), Gaps = 0/519 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATAGACTAGCCTGCCGGTCAATAACTGATGACGCGGAGTCAACCTGATAACCCATAGCGG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATAGACTAGCCTGCCGGTCAATAACTGATGACGCGGAGTCAACCTGATAACCCATAGCGG 60
Query 61 AACAGTCTAACCTACGCGAGATACGTCTTACCGCACATAGGTAACCTATTCGTGACTAGC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AACAGTCTAACCTACGCGAGATACGTCTTACCGCACATAGGTAACCTATTCGTGACTAGC 120
Query 121 AGGCCTTATTCCGGTGCTATGAGTATCTTACCTGGTCTAGGTATCTAATTCGTGAGTCGG 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 121 AGGCCTTATTCCGGTGCTATGAGTATCTTACCTGGTCTAGGTATCTAATTCGTGGGTCGG 180
Query 181 GTACTACATTCGTGCGATGGGTCCTCGCTTCGTCTATGAGGTCTCGTCTTCGTGAGTGCA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTACTACATTCGTGCGATGGGTCCTCGCTTCGTCTATGAGGTCTCGTCTTCGTGAGTGCA 240
Query 241 ATGTATCCGAAGTCGTAGTGATAATATGGAACTAGGCGCGATTTGACGAACGTATGCCGC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATGTATCCGAAGTCGTAGTGATAATATGGAACTAGGCGCGATTTGACGAACGTATGCCGC 300
Query 301 ATATTCGGAACGTCGCCTGGAAATTCGCCACCTAGATCGAAATTATCGGAACTCGTCGCT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATATTCGGAACGTCGCCTGGAAATTCGCCACCTAGATCGAAATTATCGGAACTCGTCGCT 360
Query 361 TATTTACGAACCTTGGGAGCCGTTCCTAAAGCTGAGTCTGGTTTCTTATTAGCGAGGAGC 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TATTTACGAACCTTGGGAGCCGTTCCTAAAGCTGAGTCTGGTTTCTTATTAGCGAGGAGC 420
Query 421 ATTTCGTGAATACTGAGCCGAATATCGTAAGACATCCGCGAGCGACTGTAAACTAATCGG 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ATTTCGTGAATACTGAGCCGAATATCGTAAGACACCCGCGAGCGACTGTAAACTAATCGG 480
Query 481 GGAACTTATTATAGAGCCGGTCCAGGTCTTGAACGACGT 519
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GGAACTTATTATAGGGCCGGTCCAGGTCTTGAACGACGT 519
Query= ERCC-00164_genbank |103488726|gb|DQ516779.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-62 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00164
Length=1022
Score = 1812 bits (981), Expect = 0.0
Identities = 994/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGAGCTCCAGTAGTTTTCCCCTCAAAAATTCCTGATAAGATTTCAACTTTATCCTCTTC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGGAGCTCCAGTAGTTTTCCCCTCAAAAATTCCTGATAAGATTTCAACTTTATCCTCTTC 60
Query 61 TTTTCTTGGTGTTGAGAAGATGCTCTGCCCTGGTCTTCTCCTGTCAAGCTCTTTTTGGAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTTTCTTGGTGTTGAGAAGATGCTCTGCCCTGGTCTTCTCCTGTCAAGCTCTTTTTGGAT 120
Query 121 ATCCTCTTCAGATAAAGGCAGATTAGCTGGACATCCATCAACAACTGCTCCAACAGCCTT 180
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATCCTCTTCAGATAAAGGCAGATTAGTTGGACATCCATCAACAACTGCTCCAACAGCCTT 180
Query 181 TCCATGACTTTCTCCAAAAACTGTAACTCTAAACATATCCCCATAGGTGTTCATTAATGT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCCATGACTTTCTCCAAAAACTGTAACTCTAAACATATCCCCATAGGTGTTCATTAATGT 240
Query 241 CACCaaaaatttttaattgcttagttttacatttaaaataaaaattaaaatagtcaaaaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CACCAAAAATTTTTAATTGCTTAGTTTTACATTTAAAATAAAAATTAAAATAGTCAAAAA 300
Query 301 ataaaaaaGGTTTATCTGTAGAGAACATCCAAGTGTGCTGGTTCCTTAACTTTAACTTTC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATAAAAAAGGTTTATCTGTAGAGAACATCCAAGTGTGCTGGTTCCTTAACTTTAACTTTC 360
Query 361 TTTTTCTCCATAATCTTCTCAACTGCCTTTCTAAAGTCATCCATTGTTACATAGTCCCTT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTTTTCTCCATAATCTTCTCAACTGCCTTTCTAAAGTCATCCATTGTTACATAGTCCCTT 420
Query 421 AACTCCCTAATTGCATTCATCCCTGCCTCTGTGCAGATTGCCTTTAACTCAGCCCCTACA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AACTCCCTAATTGCATTCATCCCTGCCTCTGTGCAGATTGCCTTTAACTCAGCCCCTACA 480
Query 481 CATCCTTCAGTCATCTTAGCTATTTCTTCTAAATTGACATCTTCCGCTAAATTCATCTTT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CATCCTTCAGTCATCTTAGCTATTTCTTCTAAATTGACATCTTCCGCTAAATTCATCTTT 540
Query 541 CTTGTATGAATCTTCAATATCTCCAATCTACCCTTCTCATCAGGAGCTGGGACTTCTATG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CTTGTATGAATCTTCAATATCTCCAATCTACCCTTCTCATCAGGAGCTGGGACTTCTATG 600
Query 601 ATTCTATCAAATCTTCCAGGTCTTAATATTGCAGGGTCTAAAATGTCAGGTCTGTTTGTG 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 601 ATTCTATCAAATCTTCCAGGTCTTAATATTGCAGGGTCTAAAATGTCAGGCCTGTTTGCG 660
Query 661 GCCCCAATTATCTTAACATCTCCCCTTGCATCGAATCCATCCATCTCTGCCAACAACTGC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GCCCCAATTATCTTAACATCTCCCCTTGCATCGAATCCATCCATCTCTGCCAACAACTGC 720
Query 721 ATTAATGTTCTCTGAACTTCCCTATCTCCACCAGTTAAAGCGTCTGTTCTCTTTGCTGCA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 ATTAATGTTCTCTGAACTTCCCTATCTCCACCAGTTAAAGCGTCTGTTCTCTTTGCTGCA 780
Query 781 ATAGCATCAATCTCATCTATGAATATGATTGAAGGAGCTTTTTCTTTAGCCAATTTGAAT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 ATAGCATCAATCTCATCTATGAATATGATTGAAGGAGCTTTTTCTTTAGCCAATTTGAAT 840
Query 841 ATATCTTTAACTAACGAAGCCCCCTCTCCAATAAACTTCTTAACCAATTCAGAACCAACA 900
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 ATATCTTTAACTAACGGAGCCCCCTCTCCAATAAACTTCTTAACCAATTCAGAACCAACA 900
Query 901 ACTCTTATAAAGGTAGCATTTGTTTCTGTAGCAACAGCTTTAGCTAATAATGTCTTTCCA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 ACTCTTATAAAGGTAGCATTTGTTTCTGTAGCAACAGCTTTAGCTAATAATGTCTTTCCA 960
Query 961 GTTCCTGGTGGTCCGTAAAGCAGAATACCTTTTGGTGGTT 1000
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 961 GTTCCTGGTGGCCCGTAAAG-AGAATACCTTTTGGTGGTT 999
Query= ERCC-00165_genbank |110339336|gb|DQ668363.1| Synthetic construct
clone TagH microarray control
Length=848
Subject= ERCC-00165
Length=872
Score = 1567 bits (848), Expect = 0.0
Identities = 848/848 (100%), Gaps = 0/848 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATATGCGTTACGTGAGTCTGATAGCAGTTCACTACCTGGATATCTGATCCACTAGCTCG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GATATGCGTTACGTGAGTCTGATAGCAGTTCACTACCTGGATATCTGATCCACTAGCTCG 60
Query 61 ATCATGCTCACCCATAGTTTATCTGCATCACTCGTACTGAAATGCTCACATCGCAGGTAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ATCATGCTCACCCATAGTTTATCTGCATCACTCGTACTGAAATGCTCACATCGCAGGTAG 120
Query 121 AGCAGCATCGTAGAGCGTCAAGCTGCATCCTAGCGTCATGAGTCATAGTACCTCATGCTC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AGCAGCATCGTAGAGCGTCAAGCTGCATCCTAGCGTCATGAGTCATAGTACCTCATGCTC 180
Query 181 ACGTGATCTACCCTAGCTGACCGCTAATGACGGCAGTGCAACCTGAGATACCGACGGCAT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ACGTGATCTACCCTAGCTGACCGCTAATGACGGCAGTGCAACCTGAGATACCGACGGCAT 240
Query 241 ACTGTCGTCAACGTCAGGCAATGTGTCCGAACGGCGAGCTACGTCGCCTCACGGAGTAAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ACTGTCGTCAACGTCAGGCAATGTGTCCGAACGGCGAGCTACGTCGCCTCACGGAGTAAT 300
Query 301 CGCGTCCCTCTAGGTATAGTGCCGTCGGTTCAGGTCATATGTCGCGGGTTCTGCACATAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CGCGTCCCTCTAGGTATAGTGCCGTCGGTTCAGGTCATATGTCGCGGGTTCTGCACATAT 360
Query 361 CACGGACGTATCGCTATCAGACGGACGCTCTCGGACCTAAACCGTAGCTCTCGGCAAGAT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CACGGACGTATCGCTATCAGACGGACGCTCTCGGACCTAAACCGTAGCTCTCGGCAAGAT 420
Query 421 CGTCCTCGTCTCGAATATAGCGCCCTAGTGCTGCAAATGTCACCGCTATCTCGTAAGGGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CGTCCTCGTCTCGAATATAGCGCCCTAGTGCTGCAAATGTCACCGCTATCTCGTAAGGGG 480
Query 481 TCCGTCTGTTGAGTTAGGCCTCCTCTCGTTGGATGTGAGCTCGGTTGCTTGGATGGTGCA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TCCGTCTGTTGAGTTAGGCCTCCTCTCGTTGGATGTGAGCTCGGTTGCTTGGATGGTGCA 540
Query 541 GCTTACTTCGCGTACCTGCTGTTTGCATCAGTCCTCTGCATCTATAATCGCGTATCTCTC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GCTTACTTCGCGTACCTGCTGTTTGCATCAGTCCTCTGCATCTATAATCGCGTATCTCTC 600
Query 601 TCTAGTAGACCATATAGCCATCTAAGCGCTCGATATTCCACCTAAGTGGCGCCTATTGAA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TCTAGTAGACCATATAGCCATCTAAGCGCTCGATATTCCACCTAAGTGGCGCCTATTGAA 660
Query 661 CTAAGTGGCAGCCGAATGGACTATCGCTCCTCGATATGTACGGATAGGCCACGGCATGTA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CTAAGTGGCAGCCGAATGGACTATCGCTCCTCGATATGTACGGATAGGCCACGGCATGTA 720
Query 721 CGAGCATAAGCCGAACTGCACGAGCATACCCGACACTGATCTGAGAGTCGCTTAAATCAT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CGAGCATAAGCCGAACTGCACGAGCATACCCGACACTGATCTGAGAGTCGCTTAAATCAT 780
Query 781 CTGCGTGTCTTAGAGCTTATCGCCATGTCTGTCAACTGTACTGTCATCCTGTAACTGTAG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CTGCGTGTCTTAGAGCTTATCGCCATGTCTGTCAACTGTACTGTCATCCTGTAACTGTAG 840
Query 841 CGTATGTG 848
||||||||
Sbjct 841 CGTATGTG 848
Query= ERCC-00168_genbank |103488723|gb|DQ516776.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-59 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00168
Length=1024
Score = 1825 bits (988), Expect = 0.0
Identities = 997/1001 (99%), Gaps = 2/1001 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCAATGAACTCAGCTATTCTTCTTAACAAATAACTTTCTCCAGAAAATTCAAATGTATCA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CCAATGAACTCAGCTATTCTTCTTAACAAATAACTTTCTCCAGAAAATTCAAATGTATCA 60
Query 61 TCTTCAGGATTCCACCTAAAAACATCATGTAATATAATATCATCAATTTTTGGGTCGTAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCTTCAGGATTCCACCTAAAAACATCATGTAATATAATATCATCAATTTTTGGGTCGTAT 120
Query 121 TCAACAATCTCAGTTATACTCTTAGTTCTTCTAACAAATCTTCCTTTATAAATCAATCTA 180
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCAACAATCTCAGTTATACTCTCAGTTCTTCTAACAAATCTTCCTTTATAAATCAATCTA 180
Query 181 ACCTGCATACATATGGCATTTAGTTGTTCAAGCATAATCTTTGGAATGTTCATTGGTTCA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ACCTGCATACATATGGCATTTAGTTGTTCAAGCATAATCTTTGGAATGTTCATTGGTTCA 240
Query 241 GCATTCAACCTCCTTATAACTGCCTCTGGGGATTTTGCGTGTATCGTTGATAACGCCAAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GCATTCAACCTCCTTATAACTGCCTCTGGGGATTTTGCGTGTATCGTTGATAACGCCAAA 300
Query 301 TGTCCTGTAGTTATTGCTTGAAATAATATCTTCGCCTCCTCACCTCTAACCTCTCCAACA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TGTCCTGTAGTTATTGCTTGAAATAATATCTTCGCCTCCTCACCTCTAACCTCTCCAACA 360
Query 361 ATTAAATAATCTGGTCTTTGCCTTAAAGCCGCTTTTAATAAATCCATCATAGTTATTTCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ATTAAATAATCTGGTCTTTGCCTTAAAGCCGCTTTTAATAAATCCATCATAGTTATTTCA 420
Query 421 TATTCTTCTCCACCGAATCCACTTCTTGTAGTTCCAGCAATCCAGTTTTCATGATACAAC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TATTCTTCTCCACCGAATCCACTTCTTGTAGTTCCAGCAATCCAGTTTTCATGATACAAC 480
Query 481 CTAATTTCTGGAGTATCCTCAATAGATACGATTTTCATTTGAGGAGGGATGAAAAGAGAG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 481 CTAATTTCTGGAGTATCCTCAATAGATACGATTTTCATTTGAGGAAGGATGAAAAGAGAG 540
Query 541 AATGCATTTAAAAGGGTGGTTTTTCCAGTAGCTACCTCTCCAGCAACCATAATAGAATTT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AATGCATTTAAAAGGGTGGTTTTTCCAGTAGCTACCTCTCCAGCAACCATAATAGAATTT 600
Query 601 TTATATTCAATGAGTAACCAAAGATATGCAAGCATCTCTGGAGAAATACTCCCATATCTT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TTATATTCAATGAGTAACCAAAGATATGCAAGCATCTCTGGAGAAATACTCCCATATCTT 660
Query 661 ATTAAATCTGTTGGCAATATAGGAGTGTGTGTGAATTTTCTTATTGTAAATGTTGAACCA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ATTAAATCTGTTGGCAATATAGGAGTGTGTGTGAATTTTCTTATTGTAAATGTTGAACCA 720
Query 721 TATCT-GAGATATCCCTTCCAAGGGTTACATTTAGCCTGCTACCATCTGGGAGAGAACCA 779
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TATCTTGAGATATCCCTTCCAAGGGTTACATTTAGCCTGCTACCATCTGGGAGAGAACCA 780
Query 780 TCCACTATTGGATTAGCCAATGTTAAAGATTTTCCACACCTTTGGGCTAAGGATATACAA 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TCCACTATTGGATTAGCCAATGTTAAAGATTTTCCACACCTTTGGGCTAAGGATATACAA 840
Query 840 AACGAGTCTAATTCTTCATCAGTTTCAAATTTTATATTTGTCTTTAAATGTTCGTATTTT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AACGAGTCTAATTCTTCATCAGTTTCAAATTTTATATTTGTCTTTAAATGTTCGTATTTT 900
Query 900 CTATGAAACACATACACTGGCTTTCCAACACCTGTGCAACTGATATCCTCCAAATTCTCA 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CTATGAAACACATACACTGGCTTTCCAACACCTGTGCAACTGATATCCTCCAAATTCTCA 960
Query 960 TCTTTCATAAGAGCATCTATTTTCCCATATCCAATGAGGTA 1000
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 961 TCTTTCATAAGAGCATCTATTT-CCCATATCCAATGAGGTA 1000
Query= ERCC-00170_genbank |103488720|gb|DQ516773.1| Methanocaldococcus
jannaschii spike-in control MJ-1000-56 genomic sequence
Length=1000
Subject= ERCC-00170
Length=1023
Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0
Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TATTGGTGGAGGGGCACAAGTTGCTGAAGTTGCGAGAGGGGCGATAAGTGAGGCAGACAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TATTGGTGGAGGGGCACAAGTTGCTGAAGTTGCGAGAGGGGCGATAAGTGAGGCAGACAG 60
Query 61 GCATAATATAAGAGGGGAGAGAATTAGCGTAGATACTCTTCCAATAGTTGGTGAAGAAAA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GCATAATATAAGAGGGGAGAGAATTAGCGTAGATACTCTTCCAATAGTTGGTGAAGAAAA 120
Query 121 TTTATATGAGGCTGTTAAAGCTGTAGCAACTCTTCCACGAGTAGGAATTTTAGTTTTAGC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TTTATATGAGGCTGTTAAAGCTGTAGCAACTCTTCCACGAGTAGGAATTTTAGTTTTAGC 180
Query 181 TGGCTCTTTAATGGGAGGGAAGATAACTGAAGCAGTTAAAGAATTAAAGGAAAAGACTGG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TGGCTCTTTAATGGGAGGGAAGATAACTGAAGCAGTTAAAGAATTAAAGGAAAAGACTGG 240
Query 241 CATTCCCGTGATAAGCTTAAAGATGTTTGGCTCTGTTCCTAAGGTTGCTGATTTGGTTGT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CATTCCCGTGATAAGCTTAAAGATGTTTGGCTCTGTTCCTAAGGTTGCTGATTTGGTTGT 300
Query 301 TGGAGACCCATTGCAGGCAGGGGTTTTAGCTGTTATGGCTATTGCTGAAACAGCAAAATT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TGGAGACCCATTGCAGGCAGGGGTTTTAGCTGTTATGGCTATTGCTGAAACAGCAAAATT 360
Query 361 TGATATAAATAAGGTTAAAGGTAGGGTGCTATAAAGATAATTTAATAATTTTTGATGAAA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TGATATAAATAAGGTTAAAGGTAGGGTGCTATAAAGATAATTTAATAATTTTTGATGAAA 420
Query 421 CCGAAGCGTTAGCTTTGGGTTATGAAACTCCATGATTTTCATTTAATTTTTTCCTATTAA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CCGAAGCGTTAGCTTTGGGTTATGAAACTCCATGATTTTCATTTAATTTTTTCCTATTAA 480
Query 481 TTTTCTCCTAAAAAGTTTCTTTAACATAAATAAGGTTAAAGGGAGAGCTCTATGATTGTC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TTTTCTCCTAAAAAGTTTCTTTAACATAAATAAGGTTAAAGGGAGAGCTCTATGATTGTC 540
Query 541 TTCAAAAATACAAAGATTATTGATGTATATACTGGAGAGGTTGTTAAAGGAAATGTTGCA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TTCAAAAATACAAAGATTATTGATGTATATACTGGAGAGGTTGTTAAAGGAAATGTTGCA 600
Query 601 GTTGAGAGGGATAAAATATCCTTTGTGGATTTAAATGATGAAATTGATAAGATAATTGAA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GTTGAGAGGGATAAAATATCCTTTGTGGATTTAAATGATGAAATTGATAAGATAATTGAA 660
Query 661 AAAATAAAGGAGGATGTTAAAGTTATTGACTTAAAAGGAAAATATTTATCTCCAACATTT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AAAATAAAGGAGGATGTTAAAGTTATTGACTTAAAAGGAAAATATTTATCTCCAACATTT 720
Query 721 ATAGATGGGCATATACATATAGAATCTTCCCATCTCATCCCATCAGAGTTTGAGAAATTT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 ATAGATGGGCATATACATATAGAATCTTCCCATCTCATCCCATCAGAGTTTGAGAAATTT 780
Query 781 GTATTAAAAAGCGGAGTTAGCAAAGTAGTTATAGACCCGCATGAAATAGCAAATATTGCT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GTATTAAAAAGCGGAGTTAGCAAAGTAGTTATAGACCCGCATGAAATAGCAAATATTGCT 840
Query 841 GGAAAAGAAGGAATTTTGTTTATGTTGAATGATGCCAAAATTTTAGATGTCTATGTTATG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GGAAAAGAAGGAATTTTGTTTATGTTGAATGATGCCAAAATTTTAGATGTCTATGTTATG 900
Query 901 CTTCCTTCCTGTGTTCCAGCTACAAACTTAGAAACAAGTGGAGCTGAGATTACAGCAGAG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CTTCCTTCCTGTGTTCCAGCTACAAACTTAGAAACAAGTGGAGCTGAGATTACAGCAGAG 960
Query 961 AATATTGAAGAACTCATTCTTTTAGATAATGTCTTAGGTT 1000
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 961 AATATTGAAGAACTCATTCTTTT-GATAATGTCTTAGGTT 999
Query= ERCC-00171_genbank |110586107|gb|DQ854994.1| Synthetic construct
clone AG006.0011 external RNA control sequence
Length=506
Subject= ERCC-00171
Length=505
Score = 889 bits (481), Expect = 0.0
Identities = 481/481 (100%), Gaps = 0/481 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 26 CTGGAGATTGTCTCGTACGGTTAAGAGCCTCCGCCCGTCTCTGGGACTATGGACGGGCAC 85
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTGGAGATTGTCTCGTACGGTTAAGAGCCTCCGCCCGTCTCTGGGACTATGGACGGGCAC 60
Query 86 GCTCATATCAGGCTATATTTGGTCCGGGTTATTATCGTCGCGGTTACCGTAATACTTCAG 145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GCTCATATCAGGCTATATTTGGTCCGGGTTATTATCGTCGCGGTTACCGTAATACTTCAG 120
Query 146 ATCAGTTAAGTAGGGCCATATGCCTCGGGAATAAGCTGACGGTGACAAGGTTTCCCCCTA 205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATCAGTTAAGTAGGGCCATATGCCTCGGGAATAAGCTGACGGTGACAAGGTTTCCCCCTA 180
Query 206 ATCGAGACGCTGCAATAACACAGGGGCATACAGTAACCAGGCAAGAGTTCAATCGCTTAG 265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ATCGAGACGCTGCAATAACACAGGGGCATACAGTAACCAGGCAAGAGTTCAATCGCTTAG 240
Query 266 TTTCGTGGCGGGATTTGAGGAAAACTGCGACTGTTCTTTAACCAAACATCCGTGCGATTC 325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TTTCGTGGCGGGATTTGAGGAAAACTGCGACTGTTCTTTAACCAAACATCCGTGCGATTC 300
Query 326 GTGCCACTCGTAGACGGCATCTCACAGTCACTGAAGGCTATTAAAGAGTTAGCACCCACC 385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GTGCCACTCGTAGACGGCATCTCACAGTCACTGAAGGCTATTAAAGAGTTAGCACCCACC 360
Query 386 ATTGGATGAAGCCCAGGATAAGTGAcccccccGGACCTTGGAGTTTCATGCTAATCAAAG 445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ATTGGATGAAGCCCAGGATAAGTGACCCCCCCGGACCTTGGAGTTTCATGCTAATCAAAG 420
Query 446 AAGAGCTAATCCGACGTAAAGTTGCGGCGTTGATTACGCAGGATTGCGACCAAAGAACGA 505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AAGAGCTAATCCGACGTAAAGTTGCGGCGTTGATTACGCAGGATTGCGACCAAAGAACGA 480
Query 506 G 506
|
Sbjct 481 G 481